FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3918, 607 aa 1>>>pF1KE3918 607 - 607 aa - 607 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7353+/-0.000728; mu= 12.9739+/- 0.044 mean_var=94.3276+/-19.081, 0's: 0 Z-trim(111.1): 16 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.132055 statistics sampled from 12093 (12103) to 12093 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16 Scan time: 4.050 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 ( 773) 4028 777.5 0 CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 727) 2125 414.9 1.8e-115 CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 632) 2092 408.6 1.2e-113 CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 720) 2092 408.6 1.4e-113 CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 247) 1011 202.5 5.3e-52 >>CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 (773 aa) initn: 4028 init1: 4028 opt: 4028 Z-score: 4145.6 bits: 777.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4028; 100.0% identity (100.0% similar) in 607 aa overlap (1-607:167-773) 10 20 30 pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDLGEVL :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 EAEQLLGGLQSNSPEGRREALRRLVPLASDMIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDLGEVL 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 ALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSPAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 ALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSPAL 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 GQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQFI 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 YKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFEVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFEVE 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 GESSGAGLSADRRRSLCAREFRKLGFSNSNPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAPSAYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GESSGAGLSADRRRSLCAREFRKLGFSNSNPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAPSAYS 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 RFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSFHELF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSFHELF 440 450 460 470 480 490 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 CVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYGEVLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 CVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYGEVLR 500 510 520 530 540 550 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 LRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQDKLWF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQDKLWF 560 570 580 590 600 610 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 CCLSPNHKLLQYGDMEEGASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGKQNKDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 CCLSPNHKLLQYGDMEEGASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGKQNKDL 620 630 640 650 660 670 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 YELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQLLTMET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQLLTMET 680 690 700 710 720 730 580 590 600 pF1KE3 KLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP 740 750 760 770 >>CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (727 aa) initn: 2158 init1: 1045 opt: 2125 Z-score: 2186.6 bits: 414.9 E(32554): 1.8e-115 Smith-Waterman score: 2150; 51.9% identity (80.2% similar) in 617 aa overlap (3-603:116-727) 10 20 pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDD------- ::.: :. .:...: ..:.: . CCDS54 QQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQK 90 100 110 120 130 140 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 -----LGEVLALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLL .:..:...: :: :::.::.:::.:.:. :..:.. .:: . .: :. .:..: CCDS54 IMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAIL 150 160 170 180 190 200 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 ESVTLSSPALGQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDY ::..:.: : : : .:. . .:. ::: .:..:: ..:...::. : .:..: . CCDS54 ESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANI 210 220 230 240 250 260 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 LWQRNLRQFIYKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQ : :..::..: ..:.. ...::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . CCDS54 LAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIF 270 280 290 300 310 320 210 220 230 240 250 pF1KE3 VLRQAAFEVEGESSGAGLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNML ::. ::..:.: .... : ..:.:. .:...:::: : :::.:. ..:::.::::::: CCDS54 ELRRIAFDAESEPNNSSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNML 330 340 350 360 370 380 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 YFSRNAPSAYSRFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMF ::... .:: :.:::::::::::::::.:.::.:: .:::.:.::: ::: .:: ::: CCDS54 YFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMF 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 FGQDQSFHELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTK : .:.::.:.::. ::::::::::::::.:::.::::::.::. :.:. ::.::. :..: CCDS54 FTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSK 450 460 470 480 490 500 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 VNALTYGEVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKI .. :.: :.:..::.::..:: . :::::.::..::.. ::.:::: :: ::: :::. CCDS54 LQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKL 510 520 530 540 550 560 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 SSRRRQDKLWFCCLSPNHKLLQYGDMEE---GASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCP ..::::::.:.: ::::::.:.:::.:: : : .:: ..:::::..:..:::::: CCDS54 NARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPH--DSLQDKLPVADIKAVVTGKDCP 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 HVREKGSGKQNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSE :..:::. ::::.. :::::: :: . . ::::::.:.:. .:::::.::::. : :. CCDS54 HMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQ---LNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSD 630 640 650 660 670 680 560 570 580 590 600 pF1KE3 QTRLDLEQLLTMETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP :: ::. ::.:: :::::.:::. ::. :::.: :.:..: :::. CCDS54 LTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN 690 700 710 720 >>CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (632 aa) initn: 1728 init1: 985 opt: 2092 Z-score: 2153.6 bits: 408.6 E(32554): 1.2e-113 Smith-Waterman score: 2092; 51.4% identity (80.7% similar) in 605 aa overlap (3-600:28-629) 10 20 30 pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDL----GEVLA :: : :. .:. .: ..:.: : .:.:: CCDS82 MERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEFINMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSEMLA 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 LSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSPALG ..: :: :::.::.:::. .:: :..... ::.. ..:.:. .:..:::..:.: .: CCDS82 FTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLY 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 QLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQFIY : . :. . .:. :::: ::..:: :.::..::. : .:. : . . :..::..: CCDS82 QKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIIL 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 KNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFEVEG ...:.. :. ::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . ::. ::..:. CCDS82 NHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAES 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 pF1KE3 ESSGA-GLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAPSAY . :.: : ....:... ..... :::.: :::.:. ..:::.::::::::... ..: CCDS82 DPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTY 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SRFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSFHEL :.:::::::::::::::.:..:.:: .:::.:.::: .: .:. :::: .:..:.:: CCDS82 IRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEEL 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 FCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYGEVL : . :::::::::::::: :::.:::::::::..:.: ::.::. :..:. .:.:.:.: CCDS82 FGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEIL 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 RLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQDKLW ::::.::. :. .:::.:::::..::.. ::.:::: :::::. ::::..::::...: CCDS82 RLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFW 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 FCCLSPNHKLLQYGDMEEGASPP-TLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGKQNK .: :. :::.:.:::.... . :.::: :..::::..:..:::::::..::.. :::: CCDS82 YCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNK 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 DLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQLLTM .. :::::: :: : ::::::.: :. .: ::::::::. :.:: :. ::. ::.: CCDS82 EVLELAFSILYDPDET---LNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSM 550 560 570 580 590 570 580 590 600 pF1KE3 ETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP : :::::.:::. ::: :::.: :....: : CCDS82 EMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG 600 610 620 630 >>CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (720 aa) initn: 1728 init1: 985 opt: 2092 Z-score: 2152.7 bits: 408.6 E(32554): 1.4e-113 Smith-Waterman score: 2092; 51.4% identity (80.7% similar) in 605 aa overlap (3-600:116-717) 10 20 pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDL----GE :: : :. .:. .: ..:.: : .: CCDS13 RQLMERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEFINMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSE 90 100 110 120 130 140 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 VLALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSP .::..: :: :::.::.:::. .:: :..... ::.. ..:.:. .:..:::..:.: CCDS13 MLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQ 150 160 170 180 190 200 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 ALGQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQ .: : . :. . .:. :::: ::..:: :.::..::. : .:. : . . :..::. CCDS13 SLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRS 210 220 230 240 250 260 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 FIYKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFE .: ...:.. :. ::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . ::. ::. CCDS13 IILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFD 270 280 290 300 310 320 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 VEGESSGA-GLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAP .:.. :.: : ....:... ..... :::.: :::.:. ..:::.::::::::... CCDS13 AESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQ 330 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SAYSRFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSF ..: :.:::::::::::::::.:..:.:: .:::.:.::: .: .:. :::: .:..: CCDS13 DTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAF 390 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 HELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYG .::: . :::::::::::::: :::.:::::::::..:.: ::.::. :..:. .:.:. CCDS13 EELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYS 450 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 EVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQD :.:::::.::. :. .:::.:::::..::.. ::.:::: :::::. ::::..::::. CCDS13 EILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQE 510 520 530 540 550 560 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 KLWFCCLSPNHKLLQYGDMEEGASPP-TLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGK ..:.: :. :::.:.:::.... . :.::: :..::::..:..:::::::..::.. : CCDS13 RFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALK 570 580 590 600 610 620 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 QNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQL :::.. :::::: :: : ::::::.: :. .: ::::::::. :.:: :. ::. : CCDS13 QNKEVLELAFSILYDPDET---LNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTL 630 640 650 660 670 680 570 580 590 600 pF1KE3 LTMETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP :.:: :::::.:::. ::: :::.: :....: : CCDS13 LSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG 690 700 710 720 >>CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (247 aa) initn: 1045 init1: 486 opt: 1011 Z-score: 1047.1 bits: 202.5 E(32554): 5.3e-52 Smith-Waterman score: 1011; 57.9% identity (82.9% similar) in 252 aa overlap (355-603:1-247) 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 SFHELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALT ::::.::. :.:. ::.::. :..:.. :. CCDS54 MQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLS 10 20 30 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 YGEVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRR : :.:..::.::..:: . :::::.::..::.. ::.:::: :: ::: :::...::: CCDS54 YTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRR 40 50 60 70 80 90 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 QDKLWFCCLSPNHKLLQYGDMEE---GASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREK :::.:.: ::::::.:.:::.:: : : .:: ..:::::..:..:::::::..:: CCDS54 QDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPH--DSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEK 100 110 120 130 140 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 GSGKQNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLD :. ::::.. :::::: :: . . ::::::.:.:. .:::::.::::. : :. :: : CCDS54 GALKQNKEVLELAFSILYDSNCQ---LNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRND 150 160 170 180 190 200 570 580 590 600 pF1KE3 LEQLLTMETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP :. ::.:: :::::.:::. ::. :::.: :.:..: :::. CCDS54 LDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN 210 220 230 240 607 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 08:58:14 2016 done: Sun Nov 6 08:58:15 2016 Total Scan time: 4.050 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]