Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1434
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1434, 784 aa
1>>>pF1KE1434 784 - 784 aa - 784 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7763+/-0.00125; mu= 18.1354+/- 0.074
mean_var=109.6179+/-22.727, 0's: 0 Z-trim(101.8): 183 B-trim: 254 in 1/52
Lambda= 0.122499
statistics sampled from 6535 (6752) to 6535 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 1.760
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs109|chr4 ( 784) 5157 923.8 0
CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs109|chr4 ( 811) 1205 225.3 3.1e-58
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs109|chr4 ( 786) 1182 221.3 5.1e-57
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs109|chr4 ( 796) 1174 219.8 1.4e-56
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX (1041) 529 106.0 3.4e-22
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs109|chrX (1059) 529 106.0 3.5e-22
CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs109|chrX (1049) 525 105.3 5.6e-22
CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs109|chr9 ( 839) 512 102.9 2.4e-21
CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs109|chr4 ( 904) 404 83.8 1.4e-15
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs109|chr1 ( 858) 358 75.7 3.7e-13
>>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs109|chr4 (784 aa)
initn: 5157 init1: 5157 opt: 5157 Z-score: 4933.9 bits: 923.8 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5157; 100.0% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-784)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
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CCDS37 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTFHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IDASDLQSYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTFHFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGNFRASDN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLSQHLK
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CCDS37 DRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLVPCLLSQHLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLKNLTNIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLTLKNLTNIDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SKNSFHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SKNSFHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIHSVTGCIPKTLEILDVSNNNLNLFSLNLPQLK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 ELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTLKTLEAGGNNFICSCE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 FLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSECHRTALVSGMCCALFL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAPSRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 QELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 HFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 HFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRA
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 AIKS
::::
CCDS37 AIKS
>>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs109|chr4 (811 aa)
initn: 812 init1: 515 opt: 1205 Z-score: 1159.1 bits: 225.3 E(33420): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 1234; 30.9% identity (62.7% similar) in 789 aa overlap (13-782:9-775)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
.. :. .. : .:. . . :. :: ..:. :: :. .::::
CCDS34 MRLIRNIYIFCSIVMTAEGDAPELPEERELMTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDLS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
: . ...::.. .:..:.: : :. .. .: :..:::: : :. : .:.
CCDS34 YNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLKTFEFNKELRYLDLSNNRLK--SVTWY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLE--E
:..: .:.: : . :. .....:.:: ... .:::..:: .. :.
CCDS34 L-LAGLRYLDLSFNDFDTMPICEEAGNMSHLEILGLSG----AKIQKSDFQKIAHLHLNT
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LEIDASDLQSYEPKSLKSIQNVS-HLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECLELRDTDLDTF
. . : :: :: ..... :..: : .. .: . : .. . ::. . : .
CCDS34 VFLGFRTLPHYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWVL--LRDGIKTSKILEMTNIDGKSQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 HFS-ELSTGET--NSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGVGN
: :.. . . :. . . . .: . ..:: ..... . : . .... . :..:
CCDS34 FVSYEMQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTS-VEHFQIRNVTFGG---
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFY-DLSTLYSLTER--VKRITVENSKVFLV
.: . .: ... ::. :. .: .:: . . .: : . .. .:. :...
CCDS34 -KAYLDHNSFDYSNTVMRTIKLEHV-HFRVFYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQM---
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PCLLSQHLKS-LEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLL
: .: . . ..::....:....: .: . : :.:::: :.: .: .. .
CCDS34 PHMLFPNYPTKFQYLNFANNILTDELFKRTI---QLPHLKTLILNGNKLETLSLVS-CFA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KE1 TLKNLTNIDISKNSF-HSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRIH-SVTGCIPKTLEILDVSNNN
. : ..:.:.: . :. :.:.::: . .::: ... :: :.::...:::..::.
CCDS34 NNTPLEHLDLSQNLLQHKNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSDSVFRCLPKSIQILDLNNNQ
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 LNLF---SLNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTL
.. ...: :.:: :. : : :: : . : ::.: : : . : . ..: . .
CCDS34 IQTVPKETIHLMALRELNIAFNFLTDLPGCSHFSRLSVLNIEMNFILSPSLDFVQSCQEV
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSEC
:::.:: : : :.::. .: : . ... : .: :. : ..:: ...::.: :
CCDS34 KTLNAGRNPFRCTCELKNFIQLETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLKDVHLHELSC
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 HRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMM----WAWLQAKRKPRKAPSRNICY
. . :. . ...: : .. : .: ::..:. .: .... .. .::. .
CCDS34 NTALLIVTIVVIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRF
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 DAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVF
::.::::.:. ::.: .. .::. . . .::.. : ::: : .::.. ::::.:..:
CCDS34 HAFISYSEHDSLWVKNELIPNLEKEDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIF
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 VLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTY
::: :::..:::.::. :.: :: ::.: :::::::: :: :. ::. ... :.:
CCDS34 VLSPNFVQNEWCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAY
700 710 720 730 740 750
770 780
pF1KE1 LEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
:::: :. . ::.::::::
CCDS34 LEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL
760 770 780 790 800 810
>>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs109|chr4 (786 aa)
initn: 975 init1: 467 opt: 1182 Z-score: 1137.3 bits: 221.3 E(33420): 5.1e-57
Smith-Waterman score: 1248; 30.3% identity (65.2% similar) in 775 aa overlap (28-782:21-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
:: . . . :...: .:. :.. . :..:
CCDS33 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
.: :. . .::. .:. :... : :. .. . :. ::.::::.: : ..:
CCDS33 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISC---
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
.: .: :.: : . .: . :.....:..: ... . : . .: :.. . :
CCDS33 HPTVNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTH-LEKSSVLPIAHLNISKVLL
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE1 IDASDL-QSYEPKSLKSIQNVS-HLILHM-KQHILLLEIFVDVT-----SSVECLELRDT
. . .. .:..:..... : :... :. ..:.. : .. :...:. :.:.
CCDS33 VLGETYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCV-LEDN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGV
. : .: :. .:: ....:. :.. : .:......:. . . . . ... :.:
CCDS33 KCSYF-LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTT-VWYFSISNVKLQGQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GNFRASD-NDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLV
.:: : . . ... .. . .:. :.. .:.. .: .:: ... .:
CCDS33 LDFRDFDYSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNM-----NIKNFTVSGTR--MV
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLT
: .... . .::.:.::... ..: : :.::::..:.: : : .:
CCDS33 HMLCPSKISPFLHLDFSNNLLTDTVFEN--C-GHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQ
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KE1 LKNLTNIDISKNS--FHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLEILDVSNNN
.:.: ..:::.:: . :.: ... ::.::. . .. :.: ...::. .:.
CCDS33 MKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNK
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 LNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTL
.. . ..: :.:: .. :.: :: . . : :: :..:... : . ..: . .
CCDS33 IKSIPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKM
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSE
....:: : : :.::. :... .:. ..:: :: .: :: : :: ..: ..:
CCDS33 RSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELS
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 CHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP----SRNIC
:. : :. . ....: . . :: . ::..:. : :..:. :. : .::.
CCDS33 CNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQ
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 YDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTV
. ::.::: .:..::.: .. .:: . ...:::.:.:.::: :..::: ::::.:..
CCDS33 FHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE--KEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSI
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 FVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKT
:::: :::.::::.::: :.: :: :.... :::::::: . .::. . ::...: .:
CCDS33 FVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRT
700 710 720 730 740 750
770 780
pF1KE1 YLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
::::: ....: ::.::::::
CCDS33 YLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK
760 770 780
>>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs109|chr4 (796 aa)
initn: 1016 init1: 462 opt: 1174 Z-score: 1129.6 bits: 219.8 E(33420): 1.4e-56
Smith-Waterman score: 1265; 31.5% identity (64.8% similar) in 793 aa overlap (11-781:17-780)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAV
: .:: .. . :. .. :. :. .: .:. : .
CCDS34 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDK------SKRGLIHVPKDLPLKT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN
: ::.:.: :. .. ::.. .: .: :. : :. .. . :. .::.::::.: :..
CCDS34 KVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLT
.: .:. :. :.: : .:.: . :..:..:..: .. : :.:. :. ..
CCDS34 ISC---HPIVSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAM----KLQKLDLLPIA
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 FLEELEIDASDLQSYEPKS--LKSIQNVSHLILHMKQHIL-LLEIFVDVT-SSVECLELR
:. : ::..: : .:.: .. ::. : :. : :... ... ::.:
CCDS34 HLH-LSYILLDLRNYYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE1 DTDLD-----TF--HFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELE
. :. .: .:::. : : . .::. ... : . : .:...: . . :.
CCDS34 NIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGST---LLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFL-WPKPVEYLN
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 FDDCTLNGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITV
. . :. . ..: ..: . . ...:::. :: .... ..::.. ... . .
CCDS34 IYNLTI--IESIR--EEDFTYSKTTLKALTIE--HITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMML
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ENSKVFLVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLE
: . .. : . .....:....:.... ... : .. .:.::::..: : .:
CCDS34 TISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNVFTDSIFEK--C-STLVKLETLILQKNGLKDLF
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pF1KE1 KTGETLLTLKNLTNIDISKNSFHS--MPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLE
:.: . .: .:.: ::..: :.: : :.. :::::. . :: :.: ..
CCDS34 KVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIK
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.::. .:... ..: :.:: .. :.: :: . . : :: :..:... : .
CCDS34 VLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSAD
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..: . .....:: : : :.::. :... .:. ..:: :: .: :: : ::. ..
CCDS34 FFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLK
520 530 540 550 560 570
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pF1KE1 DVRLSVSECHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP-
: ..: :. : :. . ....: . . :: . ::..:. : :..:. :. :
CCDS34 DFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPL
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pF1KE1 ---SRNICYDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDS
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CCDS34 EELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKSELVPYLEKED--IQICLHERNFVPGKSIVENIINC
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CCDS34 IEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKL
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. ... : ::.: . .:.. . :. :..: .:.. . .. .. : .
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: .: :.: :.. ::. : . . :.. .:. :.::.: .
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. . : .. :..... .. .. .:. ::.::. .:.: ... .: . :
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:.:.. .: . .. .: : .. .: ::. ::... ...:.. ::.. .
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..:. ...:... : :. : . ... :: : :. . . :::..::. .::
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:: : . .:: . . :::..::. :: ::::...::..:.::::::.....
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. . : .. :..... .. .. .:. ::.::. .:.: ... .: . :
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:.:.. .: . .. .: : .. .: ::. ::... ...:.. ::.. .
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..:. ...:... : :. : . ... :: : :. . . :::..::. .::
CCDS14 FTFFITTMVMLAALAHHLFY--WDVWFIYNVCLAKVKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDA
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CCDS14 PKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
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CCDS14 DDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAF-DALTE-LKVLRLHSN
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CCDS14 YLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL-KN
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CCDS14 LETLDLSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQ
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CCDS14 MIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVW-WVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGA
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pF1KE1 VRGQQVQDVRLSVSECHRTALVS---GMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQ
.::.: .. : . : : :. .. .:::....:. . : .::. . . .
CCDS14 HKGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLY-FWDVWYI---YHFCK
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pF1KE1 AKRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERD---AYWVENLMVQELEN-FNPPFKLCLHKRDFIP
:: : .. : . :::::. :. .: . :: .: .::. . :.:::..::..:
CCDS14 AKIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLP
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pF1KE1 GKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLE-PI
:. ...:. .::. :.:::::......:.: : . .:: ::.::. :. :::.:: :.
CCDS14 GQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPF
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pF1KE1 EKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
.:. .: .::: . .. :::: . . :: :. :. .
CCDS14 QKS----KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
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pF1KE1 GLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLS
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CCDS68 EPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLS
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pF1KE1 YNYLSNLSSSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK
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CCDS68 RCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLA-LGAFSGLSSLQKL-VAVETNLASLENF
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pF1KE1 DFAGLTFLEELEIDASDLQSYE-PKSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEIFVDVTSSVECL
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CCDS68 PIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNK-----------IQSIYCT
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pF1KE1 ELRDT-DLDTFHFS-ELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESL---FQVMKLLNQ-ISGLLE
.:: .. ...: .:: . : .:. .:..... .: :. ..... :.::
CCDS68 DLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMN-FIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAG
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CCDS68 LEVHRLVL---GEFRNEGNLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCLTN
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:. .:.: : : :: : ..: .::::. : .. :
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:. : :::. : : .: :. : : : .: :..:
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..:........: : . ... ::..: :. . . . : . .::.: ...:..
CCDS68 EHLDFQHSNLKQMSEFSVFLSLRNLIYLDISHTHTRVAFNGIFNGLSSLEVLKMAGNSFQ
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pF1KE1 ------------NLFSLNLPQ----------------LKELYISRNKLMTLPD--ASLLP
:: :.: : :. : .:.:....: . :
CCDS68 ENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTAFNSLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKCLN
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: :: : : : : .:..:. : .: :. :.: :.:: :: : . ..:..
CCDS68 SLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVEV
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. : .:: .:. : . :... :. . . :. :.. ...:: ..:. ...
CCDS68 E-RMECATPSDKQGMPV--LSLNIT-CQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFY--FHL
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.. . .. : ..:: ::::: :: .: ::.: .:..::. :::.:::: ::
CCDS68 MLLAGCIKYGR------GENI-YDAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPPFQLCLHYRD
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pF1KE1 FIPGKWIIDNII-DSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILL
:::: : ::: ....::.:.. :.:..:..:.:: .: .... : . . :.:.:
CCDS68 FIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVL
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740 750 760 770 780
pF1KE1 EPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS
. .:: . :. .: .... .::::: . :. :: :: :.
CCDS68 QKVEKTLLRQQV-ELYRLLSRNTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTG
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CCDS68 CNWQEATSI
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. .:: : :: . .. ...: .::... :: . :..:. :. . :.
CCDS38 VGNDSFAWLPQLEYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRY--LNLKRS------FTKQSISL
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CCDS38 ASLP----KIDDFSFQWLKCLE-----------HLNMEDNDIPGIKS--NMFTGLINLKY
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. . :. ..:. :. .. : .. .:: .. . : :. : : ...
CCDS38 LSLS-NSFTSLRTLTNETFVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNE
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: : : .:. ..:: . . : ..::. . : :::: :.::. :
CCDS38 IGQE---------LTGQEWRGLENI-FEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVAL
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..... . :.::: .:.:.:.. .. . . ::.. :.:. . . :. :
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: . :.::.. .:... . . .: .:: . .. :.: ::: ::.. .
CCDS38 G-PIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNTLP-ASVFNNQV
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:: ...: ::. :. . .:..: :. : : :.:: .. :.. . . .
CCDS38 SLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCTCESIAWFVNWINETHTNIPE
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CCDS38 LSSHYLCNTPPHYHGFPVR--LFDTSSCKDSAPFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEG-
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: ....: ....: : .... : :.. .. .: :: . . .:. . .:
CCDS38 WRISFYWN-VSVHRVLGFKEIDRQTEQFEYAAYIIHAYKDKDWVWE-HFSSMEKEDQSLK
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.::..::: : . .. :..::..:.: .::......:. :: ... . . ...: :
CCDS38 FCLEERDFEAGVFELEAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLD
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CCDS38 SIILVFLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSKNSVH
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CCDS31 RFCNLTQVPQVLNTTERLLLSFNYIRTVTASSFP--FLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAF
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CCDS31 RNLPNLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLD
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CCDS31 LSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQGKT-LSFFSLAANSLYS
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CCDS31 RVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFG
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pF1KE1 ----RDTDLDTF---------HFSELSTGETNSLIKKF--TFRNVKITDESLFQVMKLLN
.: : .:: :. .:: : . :: .. :....:. . . .. :. .
CCDS31 FHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHL-DLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIAD
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. . :: .:. . . : .:.. .:. :: . ... :: .. : . ..
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. :... . ... . . ..: . :: ..: .: ..:. :: . :. :.:
CCDS31 FLEKLQTLDLRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLPKINLTANLIHLSENRLENLDIL
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CCDS31 YFLLRVPHLQILILNQNRFSSC--SGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELC-WD--
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. .:: : :..: ...: :: .:: .: :. : .. :.: .:
CCDS31 -VFEGLS----H---------LQVLYLNHNYLNSLPPGVFS-HLTALRGLSLNSNRLTVL
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CCDS31 VTIAGPPADIYCVYPDSFSG--VSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMT
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CCDS31 ILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLD
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CCDS31 TQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQ
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CCDS31 GRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQL-MKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQ
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CCDS31 ILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS
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784 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]