Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2352
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2352, 311 aa
  1>>>pF1KE2352 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2779+/-0.000761; mu= 16.2905+/- 0.045
 mean_var=71.4070+/-14.721, 0's: 0 Z-trim(109.3): 67  B-trim: 714 in 1/49
 Lambda= 0.151776
 statistics sampled from 10736 (10808) to 10736 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.332), width:  16
 Scan time:  2.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1174.1 CD1A gene_id:909|Hs108|chr1             ( 327) 2145 478.5  3e-135
CCDS1176.1 CD1B gene_id:910|Hs108|chr1             ( 333) 1314 296.5 1.8e-80
CCDS1175.1 CD1C gene_id:911|Hs108|chr1             ( 333) 1267 286.2 2.3e-77
CCDS41418.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 376) 1213 274.4 9.2e-74
CCDS41417.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 388) 1213 274.5 9.4e-74
CCDS1173.1 CD1D gene_id:912|Hs108|chr1             ( 335) 1143 259.1 3.5e-69
CCDS41421.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 290) 1012 230.4 1.3e-60
CCDS53387.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 289)  932 212.8 2.5e-55
CCDS41419.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 321)  888 203.2 2.1e-52
CCDS53386.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 286)  629 146.5 2.3e-35
CCDS53385.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 298)  629 146.5 2.4e-35
CCDS41420.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 187)  612 142.6 2.2e-34
CCDS53390.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 199)  612 142.7 2.3e-34
CCDS41422.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 101)  411 98.5 2.4e-21
CCDS1342.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1             ( 341)  393 94.9 9.6e-20
CCDS34373.1 A gene_id:3105|Hs108|chr6              ( 365)  347 84.8 1.1e-16
CCDS5680.1 AZGP1 gene_id:563|Hs108|chr7            ( 298)  336 82.3 4.9e-16
CCDS4668.1 G gene_id:3135|Hs108|chr6               ( 338)  330 81.1 1.4e-15
CCDS12770.1 FCGRT gene_id:2217|Hs108|chr19         ( 365)  319 78.7 7.6e-15
CCDS34379.1 E gene_id:3133|Hs108|chr6              ( 358)  316 78.0 1.2e-14
CCDS34393.1 C gene_id:3107|Hs108|chr6              ( 366)  310 76.7   3e-14
CCDS53384.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 231)  304 75.3 5.2e-14
CCDS47387.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6            ( 325)  304 75.4 6.8e-14
CCDS75412.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6            ( 337)  304 75.4   7e-14
CCDS4578.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6             ( 348)  304 75.4 7.2e-14
CCDS43438.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6              ( 346)  299 74.3 1.5e-13
CCDS43437.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6              ( 442)  299 74.4 1.9e-13
CCDS53389.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 132)  287 71.4 4.3e-13
CCDS53388.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1            ( 144)  287 71.4 4.7e-13
CCDS34394.1 B gene_id:3106|Hs108|chr6              ( 362)  285 71.2 1.3e-12
CCDS4580.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6             ( 260)  277 69.4 3.4e-12
CCDS53442.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1            ( 296)  275 69.0 5.1e-12


>>CCDS1174.1 CD1A gene_id:909|Hs108|chr1                  (327 aa)
 initn: 2145 init1: 2145 opt: 2145  Z-score: 2541.5  bits: 478.5 E(32554): 3e-135
Smith-Waterman score: 2145; 99.3% identity (99.3% similar) in 307 aa overlap (5-311:21-327)

                               10        20        30        40    
pF1KE2                 MWNWLKEPLSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSDLQTHTWDSN
                           ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MLFLLLPLLAVLPGDGNADGLKEPLSFHVTWIASFYNHSWKQNLVSGWLSDLQTHTWDSN
               10        20        30        40        50        60

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE2 SSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPFEIQVTGGCE
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSTIVFLCPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPFEIQVTGGCE
               70        80        90       100       110       120

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE2 LHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHENDITHNLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHENDITHNLLS
              130       140       150       160       170       180

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE2 DTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPKPVWVMWMRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPKPVWVMWMRG
              190       200       210       220       230       240

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE2 EQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIVLYWEHHSSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIVLYWEHHSSV
              250       260       270       280       290       300

          290       300       310 
pF1KE2 GFIILAVIVPLLLLIGLALWFRKRCFC
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GFIILAVIVPLLLLIGLALWFRKRCFC
              310       320       

>>CCDS1176.1 CD1B gene_id:910|Hs108|chr1                  (333 aa)
 initn: 1338 init1: 1270 opt: 1314  Z-score: 1558.0  bits: 296.5 E(32554): 1.8e-80
Smith-Waterman score: 1314; 62.6% identity (80.8% similar) in 302 aa overlap (8-308:25-326)

                                10        20        30        40   
pF1KE2                  MWNWLKEPLSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSDLQTHTWDS
                               : :::::  .:: : .: :.  ::::.::: : :::
CCDS11 MLLLPFQLLAVLFPGGNSEHAFQGPTSFHVIQTSSFTNSTWAQTQGSGWLDDLQIHGWDS
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80        90       100   
pF1KE2 NSSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPFEIQVTGGC
       .:.: .:: :::.::::..:  ::: .::.  .   . .. .: ..:..::::::  .::
CCDS11 DSGTAIFLKPWSKGNFSDKEVAELEEIFRVYIFGFAREVQDFAGDFQMKYPFEIQGIAGC
               70        80        90       100       110       120

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE2 ELHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHENDITHNLL
       ::::: .  :::. :  : ::.: .: : .: : .:. :..:: .. : :   . .. ::
CCDS11 ELHSGGAIVSFLRGALGGLDFLSVKNASCVPSPEGGSRAQKFCALIIQYQGIMETVRILL
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE2 SDTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPKPVWVMWMR
        .::::..::.:.:::: :::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS11 YETCPRYLLGVLNAGKADLQRQVKPEAWLSSGPSPGPGRLQLVCHVSGFYPKPVWVMWMR
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE2 GEQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIVLYWEHHSS
       ::::::::: :::::.:. ::::::::.:: :::: :::::::::::::::.:::.. .:
CCDS11 GEQEQQGTQLGDILPNANWTWYLRATLDVADGEAAGLSCRVKHSSLEGQDIILYWRNPTS
              250       260       270       280       290       300

           290        300       310     
pF1KE2 VGFIILAVIVP-LLLLIGLALWFRKRCFC    
       .: :.::.::: ::::. ::::. .:       
CCDS11 IGSIVLAIIVPSLLLLLCLALWYMRRRSYQNIP
              310       320       330   

>>CCDS1175.1 CD1C gene_id:911|Hs108|chr1                  (333 aa)
 initn: 1277 init1: 748 opt: 1267  Z-score: 1502.4  bits: 286.2 E(32554): 2.3e-77
Smith-Waterman score: 1267; 59.2% identity (82.0% similar) in 306 aa overlap (6-309:23-327)

                                10        20        30        40   
pF1KE2                  MWNWLKEPLSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSDLQTHTWDS
                             .: .::::: : :: :.:: ..  ::::..:::: :::
CCDS11 MLFLQFLLLALLLPGGDNADASQEHVSFHVIQIFSFVNQSWARGQGSGWLDELQTHGWDS
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80        90       100   
pF1KE2 NSSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPFEIQVTGGC
       .:.::.::  ::.::::::: ..:: :::.  .   . :. .: .   .::::.:: .::
CCDS11 ESGTIIFLHNWSKGNFSNEELSDLELLFRFYLFGLTREIQDHASQDYSKYPFEVQVKAGC
               70        80        90       100       110       120

           110       120       130       140       150         160 
pF1KE2 ELHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHEN--DITHN
       ::::::   .:.:.:..: :..::::..:.: :  :..:.  :..::. :.:.  . ..:
CCDS11 ELHSGKSPEGFFQVAFNGLDLLSFQNTTWVPSPGCGSLAQSVCHLLNH-QYEGVTETVYN
              130       140       150       160        170         

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE2 LLSDTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPKPVWVMW
       :. .:::::.:::::::: ...:::.::::::  :: : :.: ::::.:::::::::: :
CCDS11 LIRSTCPRFLLGLLDAGKMYVHRQVRPEAWLSSRPSLGSGQLLLVCHASGFYPKPVWVTW
     180       190       200       210       220       230         

             230       240       250       260       270       280 
pF1KE2 MRGEQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIVLYWEHH
       ::.:::: ::..:::::.:::::::.. ::::. : : :::::.:::: ::::.::: ::
CCDS11 MRNEQEQLGTKHGDILPNADGTWYLQVILEVASEEPAGLSCRVRHSSLGGQDIILYWGHH
     240       250       260       270       280       290         

             290       300       310     
pF1KE2 SSVGFIILAVIVPLLLLIGLALWFRKRCFC    
        :...: :.:::::..:: :.:::.:.:      
CCDS11 FSMNWIALVVIVPLVILIVLVLWFKKHCSYQDIL
     300       310       320       330   

>>CCDS41418.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1                 (376 aa)
 initn: 1210 init1: 854 opt: 1213  Z-score: 1437.7  bits: 274.4 E(32554): 9.2e-74
Smith-Waterman score: 1213; 58.6% identity (82.7% similar) in 295 aa overlap (6-299:32-323)

                                        10        20        30     
pF1KE2                          MWNWLKEPLSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSD
                                     .: :::...  .:: :::: ..  ::::.:
CCDS41 LLLFLLFEGLCCPGENTAAPQALQSYHLAAEEQLSFRMLQTSSFANHSWAHSEGSGWLGD
              10        20        30        40        50        60 

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE2 LQTHTWDSNSSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPF
       :::: ::.  .:: :: :::.::::..: :.:..::..     .. ..  : ..:.::::
CCDS41 LQTHGWDTVLGTIRFLKPWSHGNFSKQELKNLQSLFQLYFHSFIQIVQASAGQFQLEYPF
              70        80        90       100       110       120 

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE2 EIQVTGGCELHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHE
       :::. .::.... ..   ::..:::::::.:::. :: : : ::  :...:::::.    
CCDS41 EIQILAGCRMNAPQI---FLNMAYQGSDFLSFQGISWEPSPGAGIRAQNICKVLNRYLDI
             130          140       150       160       170        

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE2 NDITHNLLSDTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPK
       ..: ..::. :::::. ::..::...:.:.:::::::: :::::::.:::::::::::::
CCDS41 KEILQSLLGHTCPRFLAGLMEAGESELKRKVKPEAWLSCGPSPGPGRLQLVCHVSGFYPK
      180       190       200       210       220       230        

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE2 PVWVMWMRGEQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIV
       :::::::::::::.::::::.::.:: ::::::::.::::::: :::::::::: :.:..
CCDS41 PVWVMWMRGEQEQRGTQRGDVLPNADETWYLRATLDVAAGEAAGLSCRVKHSSLGGHDLI
      240       250       260       270       280       290        

         280        290       300       310                        
pF1KE2 LYWEHHSSVGFII-LAVIVPLLLLIGLALWFRKRCFC                       
       ..:  .:   ..: :.::: :..:.                                   
CCDS41 IHWGGYSIFLILICLTVIVTLVILVVVDSRLKKQSPVFLMGANTQDTKNSRHQFCLAQVS
      300       310       320       330       340       350        

>>CCDS41417.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1                 (388 aa)
 initn: 1210 init1: 854 opt: 1213  Z-score: 1437.5  bits: 274.5 E(32554): 9.4e-74
Smith-Waterman score: 1213; 58.6% identity (82.7% similar) in 295 aa overlap (6-299:32-323)

                                        10        20        30     
pF1KE2                          MWNWLKEPLSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSD
                                     .: :::...  .:: :::: ..  ::::.:
CCDS41 LLLFLLFEGLCCPGENTAAPQALQSYHLAAEEQLSFRMLQTSSFANHSWAHSEGSGWLGD
              10        20        30        40        50        60 

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE2 LQTHTWDSNSSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPF
       :::: ::.  .:: :: :::.::::..: :.:..::..     .. ..  : ..:.::::
CCDS41 LQTHGWDTVLGTIRFLKPWSHGNFSKQELKNLQSLFQLYFHSFIQIVQASAGQFQLEYPF
              70        80        90       100       110       120 

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE2 EIQVTGGCELHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHE
       :::. .::.... ..   ::..:::::::.:::. :: : : ::  :...:::::.    
CCDS41 EIQILAGCRMNAPQI---FLNMAYQGSDFLSFQGISWEPSPGAGIRAQNICKVLNRYLDI
             130          140       150       160       170        

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE2 NDITHNLLSDTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPK
       ..: ..::. :::::. ::..::...:.:.:::::::: :::::::.:::::::::::::
CCDS41 KEILQSLLGHTCPRFLAGLMEAGESELKRKVKPEAWLSCGPSPGPGRLQLVCHVSGFYPK
      180       190       200       210       220       230        

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE2 PVWVMWMRGEQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIV
       :::::::::::::.::::::.::.:: ::::::::.::::::: :::::::::: :.:..
CCDS41 PVWVMWMRGEQEQRGTQRGDVLPNADETWYLRATLDVAAGEAAGLSCRVKHSSLGGHDLI
      240       250       260       270       280       290        

         280        290       300       310                        
pF1KE2 LYWEHHSSVGFII-LAVIVPLLLLIGLALWFRKRCFC                       
       ..:  .:   ..: :.::: :..:.                                   
CCDS41 IHWGGYSIFLILICLTVIVTLVILVVVDSRLKKQSSNKNILSPHTPSPVFLMGANTQDTK
      300       310       320       330       340       350        

>>CCDS1173.1 CD1D gene_id:912|Hs108|chr1                  (335 aa)
 initn: 1097 init1: 1097 opt: 1143  Z-score: 1355.6  bits: 259.1 E(32554): 3.5e-69
Smith-Waterman score: 1143; 52.1% identity (80.5% similar) in 313 aa overlap (2-308:16-328)

                                10        20        30        40   
pF1KE2               MWNWLKEP---LSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSDLQTHTWDS
                      :.  . :   . .. . :.:: : :: ..   .::..::::.:..
CCDS11 MGCLLFLLLWALLQAWGSAEVPQRLFPLRCLQISSFANSSWTRTDGLAWLGELQTHSWSN
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80        90       100   
pF1KE2 NSSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPFEIQVTGGC
       .:.:.  : :::.:.::...:. :. .::.      . ....:. :.. ::.:.::..::
CCDS11 DSDTVRSLKPWSQGTFSDQQWETLQHIFRVYRSSFTRDVKEFAKMLRLSYPLELQVSAGC
               70        80        90       100       110       120

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE2 ELHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHENDITHNLL
       :.: :..:..:...:.::.:..:::..:: :   :   ..   .::::..   . .. ::
CCDS11 EVHPGNASNNFFHVAFQGKDILSFQGTSWEPTQEAPLWVNLAIQVLNQDKWTRETVQWLL
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE2 SDTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPKPVWVMWMR
       . :::.:. :::..::..:..::::.::::.:::::::.: ::::::::::::::: :::
CCDS11 NGTCPQFVSGLLESGKSELKKQVKPKAWLSRGPSPGPGRLLLVCHVSGFYPKPVWVKWMR
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260       270        280  
pF1KE2 GEQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIVLYWE-HHS
       ::::::::: :::::.:: ::::::::.:.::::: :::::::::::::::::::   ..
CCDS11 GEQEQQGTQPGDILPNADETWYLRATLDVVAGEAAGLSCRVKHSSLEGQDIVLYWGGSYT
              250       260       270       280       290       300

            290         300       310     
pF1KE2 SVGFIILAVIVPLL--LLIGLALWFRKRCFC    
       :.:.: :::.. ::  :..:..  :...       
CCDS11 SMGLIALAVLACLLFLLIVGFTSRFKRQTSYQGVL
              310       320       330     

>>CCDS41421.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1                 (290 aa)
 initn: 1034 init1: 678 opt: 1012  Z-score: 1201.5  bits: 230.4 E(32554): 1.3e-60
Smith-Waterman score: 1012; 57.7% identity (82.6% similar) in 241 aa overlap (6-246:32-269)

                                        10        20        30     
pF1KE2                          MWNWLKEPLSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSD
                                     .: :::...  .:: :::: ..  ::::.:
CCDS41 LLLFLLFEGLCCPGENTAAPQALQSYHLAAEEQLSFRMLQTSSFANHSWAHSEGSGWLGD
              10        20        30        40        50        60 

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE2 LQTHTWDSNSSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPF
       :::: ::.  .:: :: :::.::::..: :.:..::..     .. ..  : ..:.::::
CCDS41 LQTHGWDTVLGTIRFLKPWSHGNFSKQELKNLQSLFQLYFHSFIQIVQASAGQFQLEYPF
              70        80        90       100       110       120 

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE2 EIQVTGGCELHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHE
       :::. .::.... ..   ::..:::::::.:::. :: : : ::  :...:::::.    
CCDS41 EIQILAGCRMNAPQI---FLNMAYQGSDFLSFQGISWEPSPGAGIRAQNICKVLNRYLDI
             130          140       150       160       170        

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE2 NDITHNLLSDTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPK
       ..: ..::. :::::. ::..::...:.:.:::::::: :::::::.:::::::::::::
CCDS41 KEILQSLLGHTCPRFLAGLMEAGESELKRKVKPEAWLSCGPSPGPGRLQLVCHVSGFYPK
      180       190       200       210       220       230        

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE2 PVWVMWMRGEQEQQGTQRGDILPSADGTWYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIV
       :::::::::::::.::::::.::.:: ::..                             
CCDS41 PVWVMWMRGEQEQRGTQRGDVLPNADETWWIFHLSHPDLFDCDSYPGHIGCS        
      240       250       260       270       280       290        

         280       290       300       310 
pF1KE2 LYWEHHSSVGFIILAVIVPLLLLIGLALWFRKRCFC

>>CCDS53387.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1                 (289 aa)
 initn: 935 init1: 854 opt: 932  Z-score: 1106.9  bits: 212.8 E(32554): 2.5e-55
Smith-Waterman score: 932; 63.8% identity (86.0% similar) in 207 aa overlap (94-299:21-224)

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE2 WKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPFEIQVTGGCELHSGKVSGSFLQLAYQGSD
                                     :::::. .::.... ..   ::..::::::
CCDS53           MLLLFLLFEGLCCPGENTADPFEIQILAGCRMNAPQI---FLNMAYQGSD
                         10        20        30           40       

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE2 FVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHENDITHNLLSDTCPRFILGLLDAGKAHLQ
       :.:::. :: : : ::  :...:::::.    ..: ..::. :::::. ::..::...:.
CCDS53 FLSFQGISWEPSPGAGIRAQNICKVLNRYLDIKEILQSLLGHTCPRFLAGLMEAGESELK
        50        60        70        80        90       100       

           190       200       210       220       230       240   
pF1KE2 RQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPKPVWVMWMRGEQEQQGTQRGDILPSADGT
       :.:::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::.::.:: :
CCDS53 RKVKPEAWLSCGPSPGPGRLQLVCHVSGFYPKPVWVMWMRGEQEQRGTQRGDVLPNADET
       110       120       130       140       150       160       

           250       260       270       280        290       300  
pF1KE2 WYLRATLEVAAGEAADLSCRVKHSSLEGQDIVLYWEHHSSVGFII-LAVIVPLLLLIGLA
       :::::::.::::::: :::::::::: :.:....:  .:   ..: :.::: :..:.   
CCDS53 WYLRATLDVAAGEAAGLSCRVKHSSLGGHDLIIHWGGYSIFLILICLTVIVTLVILVVVD
       170       180       190       200       210       220       

            310                                                    
pF1KE2 LWFRKRCFC                                                   
                                                                   
CCDS53 SRLKKQSSNKNILSPHTPSPVFLMGANTQDTKNSRHQFCLAQVSWIKNRVLKKWKTRLNQ
       230       240       250       260       270       280       

>>CCDS41419.1 CD1E gene_id:913|Hs108|chr1                 (321 aa)
 initn: 884 init1: 554 opt: 888  Z-score: 1054.1  bits: 203.2 E(32554): 2.1e-52
Smith-Waterman score: 888; 56.2% identity (81.3% similar) in 219 aa overlap (6-224:32-247)

                                        10        20        30     
pF1KE2                          MWNWLKEPLSFHVIWIASFYNHSWKQNLVSGWLSD
                                     .: :::...  .:: :::: ..  ::::.:
CCDS41 LLLFLLFEGLCCPGENTAAPQALQSYHLAAEEQLSFRMLQTSSFANHSWAHSEGSGWLGD
              10        20        30        40        50        60 

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE2 LQTHTWDSNSSTIVFLWPWSRGNFSNEEWKELETLFRIRTIRSFEGIRRYAHELQFEYPF
       :::: ::.  .:: :: :::.::::..: :.:..::..     .. ..  : ..:.::::
CCDS41 LQTHGWDTVLGTIRFLKPWSHGNFSKQELKNLQSLFQLYFHSFIQIVQASAGQFQLEYPF
              70        80        90       100       110       120 

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE2 EIQVTGGCELHSGKVSGSFLQLAYQGSDFVSFQNNSWLPYPVAGNMAKHFCKVLNQNQHE
       :::. .::.... ..   ::..:::::::.:::. :: : : ::  :...:::::.    
CCDS41 EIQILAGCRMNAPQI---FLNMAYQGSDFLSFQGISWEPSPGAGIRAQNICKVLNRYLDI
             130          140       150       160       170        

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE2 NDITHNLLSDTCPRFILGLLDAGKAHLQRQVKPEAWLSHGPSPGPGHLQLVCHVSGFYPK
       ..: ..::. :::::. ::..::...:.:.:::::::: :::::::.:::::::::::::
CCDS41 KEILQSLLGHTCPRFLAGLMEAGESELKRKVKPEAWLSCGPSPGPGRLQLVCHVSGFYPK
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       :::::::::                                                   
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                                     .: :::...  .:: :::: ..  ::::.:
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       :::: ::.  .:: :: :::.::::..: :.:..::..           : :        
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                        ::.:.. :.:                                 
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       :::::::::::::.::::::.::.:: ::::::::.::::::: :::::::::: :.:..
CCDS53 PVWVMWMRGEQEQRGTQRGDVLPNADETWYLRATLDVAAGEAAGLSCRVKHSSLGGHDLI
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pF1KE2 LYWEHHSSVGFII-LAVIVPLLLLIGLALWFRKRCFC                       
       ..:  .:   ..: :.::: :..:.                                   
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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