FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2286, 444 aa 1>>>pF1KE2286 444 - 444 aa - 444 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2831+/-0.000756; mu= 13.9269+/- 0.045 mean_var=98.7418+/-20.585, 0's: 0 Z-trim(111.4): 76 B-trim: 832 in 2/49 Lambda= 0.129070 statistics sampled from 12308 (12389) to 12308 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.381), width: 16 Scan time: 3.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 3086 584.7 6.1e-167 CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 2629 499.6 2.6e-141 CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 1886 361.2 9.1e-100 CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 1880 360.1 2e-99 CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1873 358.9 6e-99 CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1625 312.7 4.5e-85 CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 995 195.2 6.7e-50 CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 937 184.7 2.3e-46 CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 937 184.7 2.4e-46 CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 846 167.6 1.8e-41 CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 846 167.7 3e-41 CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 826 163.9 3.1e-40 CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 814 161.7 1.5e-39 CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 793 157.8 2.2e-38 CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 793 157.8 2.3e-38 CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 793 157.8 2.7e-38 CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 791 157.5 3.4e-38 CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 789 157.1 4.8e-38 CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 789 157.1 4.8e-38 CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 787 156.7 6.2e-38 CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 787 156.7 6.2e-38 CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 757 151.1 2.3e-36 CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 751 150.0 5e-36 CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 739 147.7 2.3e-35 CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 739 147.7 2.3e-35 CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 730 146.0 7.7e-35 CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 695 139.6 8.2e-33 CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 695 139.6 8.2e-33 CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 464 96.4 4.1e-20 CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 429 89.9 3.8e-18 CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 447) 421 88.5 1.5e-17 CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 448) 421 88.5 1.5e-17 CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 405 85.4 8.2e-17 CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 405 85.4 8.6e-17 CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 405 85.4 8.6e-17 CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 401 84.6 1.4e-16 CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 271) 334 72.1 7.5e-13 CCDS82395.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 279) 326 70.7 2.2e-12 CCDS12907.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 287) 322 69.9 3.7e-12 CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 315 68.6 9.1e-12 CCDS55490.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1327) 319 69.8 1.9e-11 CCDS14629.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1336) 319 69.8 1.9e-11 CCDS55491.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1341) 319 69.8 1.9e-11 CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 302 66.2 4.7e-11 CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 302 66.2 4.8e-11 CCDS12909.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 275) 299 65.6 6.9e-11 >>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 (444 aa) initn: 3086 init1: 3086 opt: 3086 Z-score: 3110.6 bits: 584.7 E(32554): 6.1e-167 Smith-Waterman score: 3086; 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85.5% identity (92.1% similar) in 318 aa overlap (119-436:24-341) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI : :::::::::::::::: : ::::::::. CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV 10 20 30 40 50 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA :.::.::.:: :: .:.:. ::::::::::::::: :::::::::::::.:::::: CCDS33 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA ::::::::.:: :::::::::::: : :::::::::::::::::::::::: :::::. : CCDS33 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE ::: :::::::::::::::::::::::: ::::::. :::::::::::::.::::::: CCDS33 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE 180 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS :::..:::::::.:::::::::::::::::::: :: :::::.:::::::::::.: ::: CCDS33 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS 240 250 260 270 280 290 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP :::::.:::::::.:::::::::::::::::::::: :.:::::::.: CCDS33 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP 300 310 320 330 340 >>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa) initn: 1879 init1: 1353 opt: 1880 Z-score: 1898.5 bits: 360.1 E(32554): 2e-99 Smith-Waterman score: 1880; 85.0% identity (91.1% similar) in 326 aa overlap (119-444:24-348) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI : ::::::::::: :::: : ::::::::. CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV 10 20 30 40 50 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA :::::.::.::. .: ::.:. :::::::::::. : :::::::::::::.:::.:: CCDS12 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA ::::::::. : ::::::::: :: : :::.:::::::::::::::::::: :::::::: CCDS12 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE ::: :::::::::::::::::::::::. :::::: :::::::::::::.::::::: CCDS12 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE 180 190 200 210 220 230 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS ::::.:::::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::::: ::::::::::: CCDS12 PSSKTGNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHRWCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDS 240 250 260 270 280 290 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP :::::.::::.::.:::::::::::::::::::::: :.:::::::. :::::::: CCDS12 DEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP 300 310 320 330 340 >>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa) initn: 2500 init1: 1873 opt: 1873 Z-score: 1890.0 bits: 358.9 E(32554): 6e-99 Smith-Waterman score: 2463; 81.8% identity (89.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-427) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML ::: ::::::::.::.: : : ::::::::::: ::.::::::::.:.::::. :::::: CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 YKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGN ::::: ::::::::::::.: :.::: ::::.: ::::.::: :::::::::.::::::: CCDS58 YKEDRSHVPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANF :::::::::::::.:::: ::::::::.::::::::.::::.:::::::::::::::::: CCDS58 HRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESV ::::.: .::::::::::: :.::::::::::::::.:: :::::::::::: :::::.: CCDS58 SIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHS :::::: ::::.::::::: :::::: :: :::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 TLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRAVPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRAL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 PYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLL : ::. ::::::::: : ::::.::::::::.:::::::::: CCDS58 PCVWSNSSDPLLVSVT-----------------GICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLL 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 HLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKT . :::::::::::::::::.::.: .:::::::.:::::::::::: ::::.:::::::: CCDS58 YRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKT 350 360 370 380 390 400 430 440 pF1KE2 PPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP : ::: .:::::::.::::::::: CCDS58 PLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQSGLEGVF 410 420 430 >>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa) initn: 1625 init1: 1625 opt: 1625 Z-score: 1640.8 bits: 312.7 E(32554): 4.5e-85 Smith-Waterman score: 2113; 73.2% identity (85.6% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-408) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML ::::::::::::.::.. ::.::::::::::::..:: .: ::::.:. : ::.: : CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 YKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVTGN ::: . :: ...:::...: :.::: ::::.: : .:::::::::::::::.:::::: CCDS12 SKEDGMPVPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 HRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANF :::::::::::::::::: ::::::::. ::.:.::.:::..:: :::::.::. :..:. CCDS12 HRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESV :.::: ::::::::.::::: ::.::::::::::::.: : :::::::::: :::::.: CCDS12 SMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSAPSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHS :::::::: .:.::::::. : : :: :: .:: ::::.:::::.::::.:::::::: CCDS12 TLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTAVLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRAL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 PYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLL :. :::::::: :::::: :.::.::::::::: : .:::::: CCDS12 PHAWSDPSDPLPVSVTGNS-----------------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLL 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 HLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKT : ::.:::::.:::::::::::.: ::::::::.:::::::.:::::::::::::::::: CCDS12 HRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKT 350 360 370 380 390 400 430 440 pF1KE2 PPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP ::::: CCDS12 PPTDTSV 410 >>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa) initn: 925 init1: 925 opt: 995 Z-score: 1009.4 bits: 195.2 E(32554): 6.7e-50 Smith-Waterman score: 1165; 53.5% identity (62.5% similar) in 368 aa overlap (1-368:3-270) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNF :: :. .::.:.:: : . :.::::::: :::::::::.:::::::::::. :: : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 MLYKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVT :::.: . :: ...::: ..: .:::: ::::.: ::: :::::: :::::::.::::: CCDS42 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 GNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKA : CCDS42 GL---------------------------------------------------------- 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGE ::::::.:.::: :.::: CCDS42 ------------------------------------------YEKPSLTARPGPTVRAGE 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 SVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFR .:::::::.::.:.::::::: ::: ::::: ..: :::::::::::::: ::::::::. CCDS42 NVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFH 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 HSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFF :::::::::::: :::::::::::::::::: :.: :::: .: ::.:::: .: :: CCDS42 GSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFF 210 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 LLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRP ::: :::.:: CCDS42 LLHRWCSKKKMLL 270 >>CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (631 aa) initn: 743 init1: 509 opt: 937 Z-score: 945.7 bits: 184.7 E(32554): 2.3e-46 Smith-Waterman score: 969; 38.9% identity (65.6% similar) in 445 aa overlap (24-444:119-559) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRH : .:: ::: :: :: ::..:::: .. CCDS33 TQHHAGRYRCHYYSSAGWSEPSDPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQK 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 pF1KE2 RFNNFMLYKEDRIHVP------IFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWS ...:.:.:: . ..: .:. :: : ..::: .: .:: . ..: :: CCDS33 GYHHFVLMKEGEHQLPRTLDSQQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWS 150 160 170 180 190 200 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 APSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRL ::.:. :. .: ::::::. ::.. :. . ::: ::. ...: :.::: .: . CCDS33 HPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEG-ERDFLQR 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 VGQI-HDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGP-YEKPS :: . :.:.:::..::. . .: :::::. . . :::::::::..:: :. : CCDS33 PGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA-HNLSSEWSAPSDPLDILITGQIYDTVS 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHER-RLPAVRKVNRTFQADFPLGP ::::::: : .::..:: :.::. .: . :..::.:: :: .. ... .::.::..: CCDS33 LSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLRLRSMYGAHK-YQAEFPMSP 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 AT--HGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHIL .: :.:::::.:: .:. : ::.:: . :.:. ..: :: : : : :.:..: CCDS33 VTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSLPPTGPPSTPGLGRYLEVL 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 pF1KE2 IGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAV----MD-QEPAGNRTANSED-------SDE ::.::...:...::.::: : ..:. . : :.::: .. .: : CCDS33 IGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDFQRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPA 450 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 pF1KE2 QD-PEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP : :: :: . . .. .. :: :. ... :. . ...:: ...: : CCDS33 ADVQEENLYAAVKD-TQSEDRVELDSQSPHDEDPQAVTYAPVKHSSPRREMASPPSSLSG 510 520 530 540 550 560 CCDS33 EFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTLRRKATEPPPSQEGEPPAEPSI 570 580 590 600 610 620 >>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (632 aa) initn: 743 init1: 509 opt: 937 Z-score: 945.7 bits: 184.7 E(32554): 2.4e-46 Smith-Waterman score: 964; 38.9% identity (64.9% similar) in 445 aa overlap (24-444:119-560) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRH : .:: ::: :: :: ::..:::: .. CCDS46 TQHHAGRYRCHYYSSAGWSEPSDPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQK 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 pF1KE2 RFNNFMLYKEDRIHVP------IFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWS ...:.:.:: . ..: .:. :: : ..::: .: .:: . ..: :: CCDS46 GYHHFVLMKEGEHQLPRTLDSQQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWS 150 160 170 180 190 200 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 APSNPMVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRL ::.:. :. .: ::::::. ::.. :. . ::: ::. ...: :.::: .: . CCDS46 HPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEG-ERDFLQR 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 VGQI-HDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGP-YEKPS :: . :.:.:::..::. . .: :::::. . . :::::::::..:: :. : CCDS46 PGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA-HNLSSEWSAPSDPLDILITGQIYDTVS 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHER-RLPAVRKVNRTFQADFPLGP ::::::: : .::..:: :.::. .: . :..::.:: :: .. ... .::.::..: CCDS46 LSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLRLRSMYGAHK-YQAEFPMSP 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 AT--HGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTEPSSKSGNPRHLHIL .: :.:::::.:: .:. : ::.:: . :.:. ..: :: : : : :.:..: CCDS46 VTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSLPPTGPPSTPGLGRYLEVL 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 pF1KE2 IGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAV----MD-QEPAGNRTANSED-------SDE ::.::...:...::.::: : ..:. . : :.::: .. .: : CCDS46 IGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDFQRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPA 450 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 pF1KE2 QD-PEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP : :: :: . .: .: :. ... :. . ...:: ...: : CCDS46 ADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQQSPHDEDPQAVTYAPVKHSSPRREMASPPSSLSG 510 520 530 540 550 560 CCDS46 EFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTLRRKATEPPPSQEGEPPAEPSI 570 580 590 600 610 620 >>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa) initn: 1940 init1: 774 opt: 846 Z-score: 858.0 bits: 167.6 E(32554): 1.8e-41 Smith-Waterman score: 1299; 51.8% identity (60.5% similar) in 438 aa overlap (1-438:3-305) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNF :: :. .::.:.:: : . :.::::::: :::::::::.:::::::::::. :: : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 MLYKEDRIHVPIFHGRIFQEGFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPMVIMVT :::.: . :: ...::: ..: .:::: ::::.: ::: :::::: :::::::.::::: CCDS42 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 GNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKA : CCDS42 G----------------------------------------------------------- 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSAPSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGE ::::::.:.::: :.::: CCDS42 -----------------------------------------LYEKPSLTARPGPTVRAGE 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 SVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPAVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFR .:::::::.::.:.::::::: ::: ::::: ..: :::::::::::::: ::::::::. 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