FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3909, 296 aa 1>>>pF1KE3909 296 - 296 aa - 296 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8609+/-0.00103; mu= 13.2218+/- 0.063 mean_var=83.7434+/-17.221, 0's: 0 Z-trim(105.8): 173 B-trim: 526 in 2/48 Lambda= 0.140152 statistics sampled from 8406 (8600) to 8406 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16 Scan time: 2.360 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6261.1 GEM gene_id:2669|Hs108|chr8 ( 296) 1978 409.7 1.3e-114 CCDS10824.1 RRAD gene_id:6236|Hs108|chr16 ( 308) 1073 226.7 1.7e-59 CCDS13181.1 REM1 gene_id:28954|Hs108|chr20 ( 298) 881 187.9 7.9e-48 CCDS45082.1 REM2 gene_id:161253|Hs108|chr14 ( 340) 768 165.1 6.6e-41 CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 236) 417 94.0 1.1e-19 CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 219) 413 93.2 1.9e-19 CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 217) 408 92.2 3.7e-19 CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7 ( 206) 387 87.9 6.8e-18 CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 ( 206) 371 84.7 6.4e-17 CCDS58036.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 183) 355 81.4 5.5e-16 CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 188) 355 81.4 5.6e-16 CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 189) 354 81.2 6.5e-16 CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 204) 350 80.4 1.2e-15 CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 ( 183) 339 78.2 5.2e-15 CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 189) 339 78.2 5.3e-15 CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1 ( 189) 338 78.0 6.1e-15 CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 ( 183) 332 76.8 1.4e-14 CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 ( 199) 331 76.6 1.7e-14 CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX ( 183) 330 76.4 1.8e-14 CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19 ( 218) 331 76.6 1.8e-14 CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3 ( 208) 324 75.2 4.7e-14 CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 ( 184) 321 74.5 6.5e-14 CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 184) 316 73.5 1.3e-13 CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 ( 199) 309 72.1 3.7e-13 CCDS7699.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 170) 301 70.5 1e-12 CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 ( 198) 294 69.1 3e-12 CCDS641.1 DIRAS3 gene_id:9077|Hs108|chr1 ( 229) 294 69.1 3.4e-12 CCDS53603.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 169) 285 67.2 9.4e-12 CCDS53753.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 ( 180) 284 67.1 1.1e-11 CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 284 67.1 1.3e-11 CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3 ( 208) 282 66.7 1.7e-11 CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 279 66.1 2.6e-11 CCDS62431.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 153) 275 65.2 3.5e-11 CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2 ( 212) 273 64.9 6.1e-11 >>CCDS6261.1 GEM gene_id:2669|Hs108|chr8 (296 aa) initn: 1978 init1: 1978 opt: 1978 Z-score: 2171.0 bits: 409.7 E(32554): 1.3e-114 Smith-Waterman score: 1978; 100.0% identity (100.0% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MTLNNVTMRQGTVGMQPQQQRWSIPADGRHLMVQKEPHQYSHRNRHSATPEDHCRRSWSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 MTLNNVTMRQGTVGMQPQQQRWSIPADGRHLMVQKEPHQYSHRNRHSATPEDHCRRSWSS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DSTDSVISSESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSDCEVLGEDTYERTLMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 DSTDSVISSESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSDCEVLGEDTYERTLMV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 DGESATIILLDMWENKGENEWLHDHCMQVGDAYLIVYSITDRASFEKASELRIQLRRARQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 DGESATIILLDMWENKGENEWLHDHCMQVGDAYLIVYSITDRASFEKASELRIQLRRARQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 TEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 TEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LRRDSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWGKIVAKNNKNMAFKLKSKSCHDLSVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 LRRDSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWGKIVAKNNKNMAFKLKSKSCHDLSVL 250 260 270 280 290 >>CCDS10824.1 RRAD gene_id:6236|Hs108|chr16 (308 aa) initn: 1007 init1: 814 opt: 1073 Z-score: 1181.8 bits: 226.7 E(32554): 1.7e-59 Smith-Waterman score: 1073; 57.9% identity (79.8% similar) in 292 aa overlap (9-296:23-308) 10 20 30 40 pF1KE3 MTLNNVTMRQGTV--GMQPQQQRWSIPADGRHLMVQKEPHQYSHRN :.:.. : : .: :.:.: : :.. : . CCDS10 MTLNGGGSGAGGSRGGGQERERRRGSTPWGPAPPLHRRSMPVDERDLQAALTPGALTAAA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 RHSATPEDHCRRSWSSDSTDSVIS--SESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSM ..: : .: :: ::. : :.: .. :.:.:.: :::::.:: ::.::.:. CCDS10 AGTGTQGP--RLDWPEDSEDSLSSGGSDSDESVYKVLLLGAPGVGKSALARIFGGVEDGP 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 DSDCEVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKGENEWLHDHCMQVGDAYLIVYSITDR .. :. :. ::.:...:::: :.... :.::. : ..:: ::: .::::.::::.::. CCDS10 EA--EAAGH-TYDRSIVVDGEEASLMVYDIWEQDG-GRWLPGHCMAMGDAYVIVYSVTDK 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 ASFEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSA .:::::::::.::::::::.:.::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::: CCDS10 GSFEKASELRVQLRRARQTDDVPIILVGNKSDLVRSREVSVDEGRACAVVFDCKFIETSA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 AVQHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWGKIVAKNNKNMA :..:::. ::::.:::.:::::::: : :: : .:.::. .::.:: :.:::.:...:: CCDS10 ALHHNVQALFEGVVRQIRLRRDSKEANARRQAGTRRRESLGKKAKRFLGRIVARNSRKMA 240 250 260 270 280 290 290 pF1KE3 FKLKSKSCHDLSVL :. ::::::::::: CCDS10 FRAKSKSCHDLSVL 300 >>CCDS13181.1 REM1 gene_id:28954|Hs108|chr20 (298 aa) initn: 748 init1: 540 opt: 881 Z-score: 972.2 bits: 187.9 E(32554): 7.9e-48 Smith-Waterman score: 894; 51.0% identity (76.9% similar) in 286 aa overlap (14-296:27-298) 10 20 30 40 pF1KE3 MTLNNVTMRQGTVGMQPQQQRWSIPA-DGRHLMVQKEPHQYSHRNRH : :: . ..:. ...: . . .. CCDS13 MTLNTEQEAKTPLHRRASTPLPLSPRGHQPGRLS-TVPSTQSQHPRLGQSASLNPPTQKP 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 SATPEDHCRRSWSSDSTDSVISSESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSDC : .:.: :::.:.:: : :. :::::.:. ::::..::..::: ... : CCDS13 SPAPDD-----WSSESSDSEGSWEA---LYRVVLLGDPGVGKTSLASLFAG---KQERDL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 -EVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWE-NKGENEWLHDHCMQVGDAYLIVYSITDRAS : ::::.::::: ::::..:....: :: .: .. : .. :.: :.::.:::::.::.: CCDS13 HEQLGEDVYERTLTVDGEDTTLVVVDTWEAEKLDKSWSQESCLQGGSAYVIVYSIADRGS 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 FEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAAV ::.::::::::::..:.. .::::::::.::.::::::: ::::::::::::::::::.. CCDS13 FESASELRIQLRRTHQADHVPIILVGNKADLARCREVSVEEGRACAVVFDCKFIETSATL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 QHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWGKIVAKNNKNMAFK :::: :::::.:::.:::: ... .. .: :. ..:::: ....:.. . :.: CCDS13 QHNVAELFEGVVRQLRLRR--RDSAAKEPPAPRRPASLAQRARRFLARLTARSARRRALK 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LKSKSCHDLSVL .:::::.:.:: CCDS13 ARSKSCHNLAVL 290 >>CCDS45082.1 REM2 gene_id:161253|Hs108|chr14 (340 aa) initn: 724 init1: 545 opt: 768 Z-score: 847.8 bits: 165.1 E(32554): 6.6e-41 Smith-Waterman score: 768; 46.0% identity (71.4% similar) in 287 aa overlap (23-296:58-340) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MTLNNVTMRQGTVGMQPQQQRWSIPADGRHLMVQKEPHQYSHRNRHSATPED : :. :. . :.... : ... : CCDS45 PPGTPTPEADATLLKKSEKLLAELDRSGLPSAPGAPRRRGSMPVPYKHQLRRAQAVDELD 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 pF1KE3 HCRRSWSSDSTDSVISSESG----NTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSDCEV .. :: :.::. :.:.. . ..:.:.::.::::::::. :.:.. :: : CCDS45 WPPQASSSGSSDSLGSGEAAPAQKDGIFKVMLVGESGVGKSTLAGTFGGLQG--DSAHEP 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 LG-EDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKGENEWLHDHCMQVGDAYLIVYSITDRASFEK . :::::: .::: : .:... :.::. . ::.:::.:.:::.:::.:.::: :: : CCDS45 ENPEDTYERRIMVDKEEVTLVVYDIWEQGDAGGWLRDHCLQTGDAFLIVFSVTDRRSFSK 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 ASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAAVQHN . : ..:: .: .:.:.:::::::::.: ::::. ::: : ...:: ::::::..:: CCDS45 VPETLLRLRAGRPHHDLPVILVGNKSDLARSREVSLEEGRHLAGTLSCKHIETSAALHHN 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 pF1KE3 VKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRL--------AYQKRKESMPRKARRFWGKIVAKNNK ..::::: :::.:::: .. . .: : :.::. .::.:: ...: .: : CCDS45 TRELFEGAVRQIRLRRGRNHAGGQRPDPGSPEGPAPPARRESLTKKAKRFLANLVPRNAK 270 280 290 300 310 320 280 290 pF1KE3 NMAFKLKSKSCHDLSVL :: .:.:::::::: CCDS45 --FFKQRSRSCHDLSVL 330 340 >>CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 (236 aa) initn: 308 init1: 267 opt: 417 Z-score: 466.6 bits: 94.0 E(32554): 1.1e-19 Smith-Waterman score: 420; 36.0% identity (67.1% similar) in 228 aa overlap (51-273:11-224) 30 40 50 60 70 pF1KE3 RWSIPADGRHLMVQKEPHQYSHRNRHSATPEDHCRRSWSSDS--TDSVISSESG-NTYYR :. .:. .: . . : :: .: . :. CCDS58 MERWLFLGATEEGPKRTMDSGTRPVGSCCSSPAGLSREYK 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 VVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSDCEVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKG .:..: :::::... : . . : : . ::.:. . .: : :. ::. .. : CCDS58 LVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTI--EDAYKIRIRIDDEPAN---LDILDTAG 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 ENEW--LHDHCMQVGDAYLIVYSITDRASFEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDL . :. ..:. :..:....: :::::: ::... :.. . :.:.:.: :..:::::::: CCDS58 QAEFTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDL 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 VRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAY . :.:. :: : : :.: :.::::: .. . ..:...::..: ::: : ::. CCDS58 KQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIR----RKEK-EAVLAM 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 pF1KE3 QKRKESMPRKARRFWGKIVAKNNKNMAFKLKSKSCHDLSVL .:. : :... : .. CCDS58 EKK--SKPKNS--VWKRLKSPFRKKKDSVT 220 230 >>CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 (219 aa) initn: 308 init1: 267 opt: 413 Z-score: 462.7 bits: 93.2 E(32554): 1.9e-19 Smith-Waterman score: 416; 37.3% identity (67.9% similar) in 212 aa overlap (65-273:10-207) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 KEPHQYSHRNRHSATPEDHCRRSWSSDSTDSVISSESG-NTYYRVVLIGEQGVGKSTLAN : :: .: . :..:..: :::::... CCDS11 MDSGTRPVGSCCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTM 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 IFAGVHDSMDSDCEVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKGENEW--LHDHCMQVGD : . . : : . ::.:. . .: : :. ::. .. :. :. ..:. :..:. CCDS11 QFISHRFPEDHDPTI--EDAYKIRIRIDDEPAN---LDILDTAGQAEFTAMRDQYMRAGE 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 AYLIVYSITDRASFEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAV ...: :::::: ::... :.. . :.:.:.: :..:::::::: . :.:. :: : : CCDS11 GFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAR 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 VFDCKFIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWG :.: :.::::: .. . ..:...::..: ::: : ::..:. : :... : CCDS11 EFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIR----RKEK-EAVLAMEKK--SKPKNS--VWK 160 170 180 190 200 280 290 pF1KE3 KIVAKNNKNMAFKLKSKSCHDLSVL .. CCDS11 RLKSPFRKKKDSVT 210 >>CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 (217 aa) initn: 339 init1: 251 opt: 408 Z-score: 457.3 bits: 92.2 E(32554): 3.7e-19 Smith-Waterman score: 408; 34.7% identity (69.0% similar) in 216 aa overlap (68-281:13-216) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 HQYSHRNRHSATPEDHCRRSWSSDSTDSVISSESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAG :. .:. :.::..: :::::... : . CCDS11 MEVENEASCSPGSASGGSREYKVVMLGAGGVGKSAMTMQFIS 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 VHDSMDSDCEVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKGENEW--LHDHCMQVGDAYLI :. : .. ::.:. . .:.: : ::. .. :. :. .... :. :....: CCDS11 -HQFPDYHDPTI-EDAYKTQVRIDNEPA---YLDILDTAGQAEFTAMREQYMRGGEGFII 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 VYSITDRASFEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDC ::.::: ::..:.... . ..:.: .::..::::: :: . :.::. :: . : ..: CCDS11 CYSVTDRQSFQEAAKFKELIFQVRHTYEIPLVLVGNKIDLEQFRQVSTEEGLSLAQEYNC 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 KFIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWGKIVA :.:::::.. . . :.:.::..: ... :..: :::.:. .: . :.. CCDS11 GFFETSAALRFCIDDAFHGLVREIRKKESMPSLMEKKL---KRKDSLWKKLK---GSL-K 160 170 180 190 200 210 280 290 pF1KE3 KNNKNMAFKLKSKSCHDLSVL :. .:: CCDS11 KKRENMT >>CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7 (206 aa) initn: 312 init1: 217 opt: 387 Z-score: 434.7 bits: 87.9 E(32554): 6.8e-18 Smith-Waterman score: 387; 34.7% identity (69.9% similar) in 196 aa overlap (76-267:15-200) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 HSATPEDHCRRSWSSDSTDSVISSESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSD ..:...: :::::.:. : ..: . : CCDS54 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQF--MYDEFVED 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 CEVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKGENEW--LHDHCMQVGDAYLIVYSITDRA : :.:.. ...::: . : .:: . :.... ..:. .. :...: :.:::. CCDS54 YEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILD---TAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEME 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 SFEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAA :: ....: :. :... :..:..:::::::: :.::: :.. : .. ...:::: CCDS54 SFAATADFREQILRVKEDENVPFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAK 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 VQHNVKELFEGIVRQVRLRR--DSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWGKIVAKNNKNM .. :: ..: ..:..: :. :::::: . :...:. .. : CCDS54 TRANVDKVFFDLMREIRARKMEDSKEKNGK-----KKRKSLAKRIRERCCIL 160 170 180 190 200 290 pF1KE3 AFKLKSKSCHDLSVL >>CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 (206 aa) initn: 291 init1: 176 opt: 371 Z-score: 417.2 bits: 84.7 E(32554): 6.4e-17 Smith-Waterman score: 371; 33.2% identity (70.4% similar) in 199 aa overlap (70-265:9-202) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 YSHRNRHSATPEDHCRRSWSSDSTDSVISSESGNTYYRVVLIGEQGVGKSTLANIFAGVH .:. . ..:...: :::::.:. : .. CCDS21 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQF--MY 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 DSMDSDCEVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKGENEW--LHDHCMQVGDAYLIVY : . : : :.:.. ...::: . : .:: . :.... ..:. .. :...:.:. CCDS21 DEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGEEVQIDILD---TAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVF 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 SITDRASFEKASELRIQLRRARQTED-IPIILVGNKSDLVRCREVSVSEGRACAVVFDCK :::.. :: ..:.: :. :.. :: ::...::::::: . :.: : :.:. : . . CCDS21 SITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDKIPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQ 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 FIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAYQKRKESMPRKARRFWGKIVAK ..:::: .. :: ..: ..:..: .. :..:.. .: :.:. .. CCDS21 YVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKKMSENKDKNGKKSSKNKKSFKERCCLL 160 170 180 190 200 280 290 pF1KE3 NNKNMAFKLKSKSCHDLSVL >>CCDS58036.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 (183 aa) initn: 307 init1: 267 opt: 355 Z-score: 400.5 bits: 81.4 E(32554): 5.5e-16 Smith-Waterman score: 358; 38.8% identity (70.9% similar) in 165 aa overlap (111-273:19-171) 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 IGEQGVGKSTLANIFAGVHDSMDSDCEVLGEDTYERTLMVDGESATIILLDMWENKGENE ::.:. . .: : :. ::. .. :. : CCDS58 MTMQFISHRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPAN---LDILDTAGQAE 10 20 30 40 150 160 170 180 190 pF1KE3 W--LHDHCMQVGDAYLIVYSITDRASFEKASELRIQLRRARQTEDIPIILVGNKSDLVRC . ..:. :..:....: :::::: ::... :.. . :.:.:.: :..:::::::: . CCDS58 FTAMRDQYMRAGEGFIICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQL 50 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 REVSVSEGRACAVVFDCKFIETSAAVQHNVKELFEGIVRQVRLRRDSKEKNERRLAYQKR :.:. :: : : :.: :.::::: .. . ..:...::..: ::: : ::..:. CCDS58 RQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAYRYYIDDVFHALVREIR----RKEK-EAVLAMEKK 110 120 130 140 150 160 260 270 280 290 pF1KE3 KESMPRKARRFWGKIVAKNNKNMAFKLKSKSCHDLSVL : :... : .. CCDS58 --SKPKNS--VWKRLKSPFRKKKDSVT 170 180 296 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 09:03:03 2016 done: Sun Nov 6 09:03:04 2016 Total Scan time: 2.360 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]