FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5918, 532 aa 1>>>pF1KB5918 532 - 532 aa - 532 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0801+/-0.00034; mu= 15.4991+/- 0.021 mean_var=95.1397+/-19.187, 0's: 0 Z-trim(116.9): 92 B-trim: 25 in 1/54 Lambda= 0.131490 statistics sampled from 28297 (28401) to 28297 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16 Scan time: 11.250 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000192 (OMIM: 147840,611162) intercellular adhe ( 532) 3549 683.6 4e-196 NP_002153 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mo ( 547) 1577 309.5 1.7e-83 NP_001307535 (OMIM: 146631) intercellular adhesion ( 470) 1464 288.0 4.2e-77 XP_011526531 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellul ( 924) 1458 287.1 1.6e-76 NP_003250 (OMIM: 601852) intercellular adhesion mo ( 924) 1458 287.1 1.6e-76 NP_001307534 (OMIM: 146631) intercellular adhesion ( 451) 722 147.3 9.5e-35 NP_001307537 (OMIM: 146631) intercellular adhesion ( 286) 660 135.4 2.3e-31 XP_016882674 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellul ( 586) 488 103.0 2.7e-21 NP_001093259 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14 NP_001093257 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14 NP_000864 (OMIM: 146630) intercellular adhesion mo ( 275) 366 79.6 1.4e-14 NP_001093256 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14 NP_001093258 (OMIM: 146630) intercellular adhesion ( 275) 366 79.6 1.4e-14 NP_001535 (OMIM: 111250,614088) intercellular adhe ( 271) 209 49.8 1.3e-05 NP_542413 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion pr ( 647) 181 44.7 0.001 NP_001155179 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-lik ( 600) 173 43.2 0.0027 XP_011541335 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 766) 173 43.3 0.0033 NP_001288026 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-lik ( 766) 173 43.3 0.0033 XP_011541334 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 772) 173 43.3 0.0033 XP_011541333 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 778) 173 43.3 0.0033 NP_115920 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-like p ( 778) 173 43.3 0.0033 XP_016873909 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 778) 173 43.3 0.0033 XP_011541332 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 784) 173 43.3 0.0033 XP_016873908 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 791) 173 43.3 0.0034 XP_011541329 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 803) 173 43.3 0.0034 XP_011541330 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 803) 173 43.3 0.0034 XP_016873907 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 803) 173 43.3 0.0034 XP_011541328 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin ( 809) 173 43.3 0.0034 >>NP_000192 (OMIM: 147840,611162) intercellular adhesion (532 aa) initn: 3549 init1: 3549 opt: 3549 Z-score: 3642.1 bits: 683.6 E(85289): 4e-196 Smith-Waterman score: 3549; 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NP_002 LQLNATESDDGRSFFCSATLEVDGEFLHRNSSVQLRVLYGPKIDRATCPQHLKWKDKTRH 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 TPMCQAWGNPLPELKCLKDGTF-PLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNV . .::: ::: :::.:::.:. .:.: :. .::: :.: :..:. : :.... NP_002 VLQCQARGNPYPELRCLKEGSSREVPVGIPFFVNVTHNGTYQCQASSSRGKYTLVVVMDI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 LSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLST---YLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATP . ..: . ::. . .:.. . :.. .... .:.... . :. NP_002 EAGSSHFVPV-FVAVLLTLGVVTIVLALMYVFREHQRSGSYHVREESTYLPLTSMQPTEA 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 P NP_002 MGEEPSRAE 540 >>NP_001307535 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mol (470 aa) initn: 1386 init1: 1386 opt: 1464 Z-score: 1505.3 bits: 288.0 E(85289): 4.2e-77 Smith-Waterman score: 1464; 49.3% identity (76.8% similar) in 452 aa overlap (79-523:6-453) 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 STSCDQPKLLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLT ..:::: .:. .: : .: :... .: NP_001 MGWAAFNLSNVTGNSRILCSVYCNGSQITGSSNIT 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 VYWTPERVELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEPAE :: :::::::::: :::::.:.::::::: :.::..::::::: :.::.:.::: :::: NP_001 VYRLPERVELAPLPPWQPVGQNFTLRCQVEDGSPRTSLTVVLLRWEEELSRQPAVEEPAE 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 VTTTVLVRRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVLE ::.:::. :: ::: ::::::::..:::: :: ::::: ::.:::::.:::.::.:: :: NP_001 VTATVLASRDDHGAPFSCRTELDMQPQGLGLFVNTSAPRQLRTFVLPVTPPRLVAPRFLE 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 VDTQGTVVCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRL :.:. : :.::::::.:::::.:::::: :: :: .:...: :.... :..::.... 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NP_001 LVVVMDIEAGSSHFVPVFVAVLLTLGVVTIVLALM----YVFREHQRSGSYHVREESTYL 400 410 420 430 440 450 530 pF1KB5 PMKPNTQATPP :. NP_001 PLTSMQPTEAMGEEPSRAE 460 470 >>XP_011526531 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellular a (924 aa) initn: 1562 init1: 1018 opt: 1458 Z-score: 1494.9 bits: 287.1 E(85289): 1.6e-76 Smith-Waterman score: 1467; 49.0% identity (73.0% similar) in 488 aa overlap (1-474:1-487) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAPSSP--RPALPALLVLLG-ALFPGPGNAQ----TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCD : :: : :: .: . :: .:: . .: ....: ... ::::. ..:::.: XP_011 MPGPSPGLRRALLGLWAALGLGLFGLSAVSQEPFWADLQPRVAFVERGGSLWLNCSTNCP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 QPKLLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQE-DSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWT .:. :.:: : ... : . .: ...: ..::.:. : :. .. .. XP_011 RPERGGLETSL-RRNGTQRGLRWLARQLVDIREPETQPVCFFRCARRTLQARGLIRTFQR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 PERVELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEP-----A :.:::: ::: :::::.:.:: :.: :..:::.::..:::: .:: :. .::: : XP_011 PDRVELMPLPPWQPVGENFTLSCRVPGAGPRASLTLTLLRGAQELIRRSFAGEPPRARGA 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 EVTTTVLVRRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVL .:.:::.::. ::::::::.::::::.:: ::::.::: .:.:: : :.:..::.: XP_011 VLTATVLARREDHGANFSCRAELDLRPHGLGLFENSSAPRELRTFSLSPDAPRLAAPRLL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 EVDTQGTVVCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQR :: .. : :.::::::.:::.:.:::::: :.: :: .:.: : :.....::.::... XP_011 EVGSERPVSCTLDGLFPASEARVYLALGDQNLSPDVTLEGDAFVATATATASAEQEGARQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 LTCAVILGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPA :.: : ::....:: ..::::::::: . :..: :::: ::: : : .: :::.:::: XP_011 LVCNVTLGGENRETRENVTIYSFPAPLLTLSEPSVSEGQMVTVTCAAGAQALVTLEGVPA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 QPLGPRAQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNW : ::: :.:: .:. ::: :.:::.: :. . ::.. ::::::.::::. ::: .: XP_011 AVPGQPAQLQLNATENDDRRSFFCDATLDVDGETLIKNRSAELRVLYAPRLDDSDCPRSW 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 TWPENSQQTPMCQAWGNPLPELKCLK-DGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEV ::::. .:: :.: ::: : ..: . :: : .: ::: : ::: :.: . :::. XP_011 TWPEGPEQTLRCEARGNPEPSVHCARSDGGAVLALGLLGPVTRALSGTYRCKAANDQGEA 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 TRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPN .. ::..: XP_011 VKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAVIEGL 480 490 500 510 520 530 >-- initn: 235 init1: 166 opt: 265 Z-score: 271.8 bits: 60.8 E(85289): 2.1e-08 Smith-Waterman score: 265; 33.9% identity (58.2% similar) in 165 aa overlap (324-477:506-665) 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 LGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPR ::::....: :: . : . :: XP_011 QGEAVKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAV 480 490 500 510 520 530 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 AQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENS . ::... : : .. : :: . :. :: . . : ::::..: .::.:::: :.: XP_011 IEGLLRVAREHAG-TYRCEAT-NPRGSAA-KNVA--VTVEYGPRFEEPSCPSNWTWVEGS 540 550 560 570 580 590 420 430 440 450 460 pF1KB5 QQTPMCQAWGNPLPELKCLKDG------TFPL----PIGESVTVTRDLE-GTYLCRARST . :.. :.: : .::. .: .:: : .. . : : : :.: : . XP_011 GRLFSCEVDGKPQPSVKCVGSGGATEGVLLPLAPPDPSPRAPRIPRVLAPGIYVCNATNR 600 610 620 630 640 650 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 QGEVTRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTP .: :.. :.:.. :: XP_011 HGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGRPSPGVRCSREGIPWP 660 670 680 690 700 710 >-- initn: 133 init1: 65 opt: 199 Z-score: 204.1 bits: 48.3 E(85289): 0.00012 Smith-Waterman score: 199; 35.8% identity (65.3% similar) in 95 aa overlap (396-489:666-754) 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 GRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQTPM-CQAWGN :..:: ::.. :: :... . . : : : XP_011 RVLAPGIYVCNATNRHGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGR 640 650 660 670 680 690 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 PLPELKCLKDGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLSPRYEIVII : : ..: ..: .: : :. :.:. ::: : : ...: .: :::.: .:. :. XP_011 PSPGVRCSREG-IPWP--EQQRVSREDAGTYHCVATNAHGTDSRTVTVGV---EYRPVVA 700 710 720 730 740 490 500 510 520 530 pF1KB5 TVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATPP ..:. XP_011 ELAASPPGGVRPGGNFTLTCRAEAWPPAQISWRAPPGALNIGLSSNNSTLSVAGAMGSHG 750 760 770 780 790 800 >>NP_003250 (OMIM: 601852) intercellular adhesion molecu (924 aa) initn: 1562 init1: 1018 opt: 1458 Z-score: 1494.9 bits: 287.1 E(85289): 1.6e-76 Smith-Waterman score: 1467; 49.0% identity (73.0% similar) in 488 aa overlap (1-474:1-487) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAPSSP--RPALPALLVLLG-ALFPGPGNAQ----TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCD : :: : :: .: . :: .:: . .: ....: ... ::::. ..:::.: NP_003 MPGPSPGLRRALLGLWAALGLGLFGLSAVSQEPFWADLQPRVAFVERGGSLWLNCSTNCP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 QPKLLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQE-DSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWT .:. :.:: : ... : . .: ...: ..::.:. : :. .. .. NP_003 RPERGGLETSL-RRNGTQRGLRWLARQLVDIREPETQPVCFFRCARRTLQARGLIRTFQR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 PERVELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEP-----A :.:::: ::: :::::.:.:: :.: :..:::.::..:::: .:: :. .::: : NP_003 PDRVELMPLPPWQPVGENFTLSCRVPGAGPRASLTLTLLRGAQELIRRSFAGEPPRARGA 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 EVTTTVLVRRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVL .:.:::.::. ::::::::.::::::.:: ::::.::: .:.:: : :.:..::.: NP_003 VLTATVLARREDHGANFSCRAELDLRPHGLGLFENSSAPRELRTFSLSPDAPRLAAPRLL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 EVDTQGTVVCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQR :: .. : :.::::::.:::.:.:::::: :.: :: .:.: : :.....::.::... NP_003 EVGSERPVSCTLDGLFPASEARVYLALGDQNLSPDVTLEGDAFVATATATASAEQEGARQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 LTCAVILGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPA :.: : ::....:: ..::::::::: . :..: :::: ::: : : .: :::.:::: NP_003 LVCNVTLGGENRETRENVTIYSFPAPLLTLSEPSVSEGQMVTVTCAAGAQALVTLEGVPA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 QPLGPRAQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNW : ::: :.:: .:. ::: :.:::.: :. . ::.. ::::::.::::. ::: .: NP_003 AVPGQPAQLQLNATENDDRRSFFCDATLDVDGETLIKNRSAELRVLYAPRLDDSDCPRSW 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 TWPENSQQTPMCQAWGNPLPELKCLK-DGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEV ::::. .:: :.: ::: : ..: . :: : .: ::: : ::: :.: . :::. NP_003 TWPEGPEQTLRCEARGNPEPSVHCARSDGGAVLALGLLGPVTRALSGTYRCKAANDQGEA 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 TRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPN .. ::..: NP_003 VKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAVIEGL 480 490 500 510 520 530 >-- initn: 235 init1: 166 opt: 265 Z-score: 271.8 bits: 60.8 E(85289): 2.1e-08 Smith-Waterman score: 265; 33.9% identity (58.2% similar) in 165 aa overlap (324-477:506-665) 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 LGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPR ::::....: :: . : . :: NP_003 QGEAVKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAV 480 490 500 510 520 530 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 AQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENS . ::... : : .. : :: . :. :: . . : ::::..: .::.:::: :.: NP_003 IEGLLRVAREHAG-TYRCEAT-NPRGSAA-KNVA--VTVEYGPRFEEPSCPSNWTWVEGS 540 550 560 570 580 590 420 430 440 450 460 pF1KB5 QQTPMCQAWGNPLPELKCLKDG------TFPL----PIGESVTVTRDLE-GTYLCRARST . :.. :.: : .::. .: .:: : .. . : : : :.: : . NP_003 GRLFSCEVDGKPQPSVKCVGSGGATEGVLLPLAPPDPSPRAPRIPRVLAPGIYVCNATNR 600 610 620 630 640 650 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 QGEVTRKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTP .: :.. :.:.. :: NP_003 HGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGRPSPGVRCSREGIPWP 660 670 680 690 700 710 >-- initn: 133 init1: 65 opt: 199 Z-score: 204.1 bits: 48.3 E(85289): 0.00012 Smith-Waterman score: 199; 35.8% identity (65.3% similar) in 95 aa overlap (396-489:666-754) 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 GRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQTPM-CQAWGN :..:: ::.. :: :... . . : : : NP_003 RVLAPGIYVCNATNRHGSVAKTVVVSAESPPEMDESTCPSHQTWLEGAEASALACAARGR 640 650 660 670 680 690 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 PLPELKCLKDGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLSPRYEIVII : : ..: ..: .: : :. :.:. ::: : : ...: .: :::.: .:. :. NP_003 PSPGVRCSREG-IPWP--EQQRVSREDAGTYHCVATNAHGTDSRTVTVGV---EYRPVVA 700 710 720 730 740 490 500 510 520 530 pF1KB5 TVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATPP ..:. NP_003 ELAASPPGGVRPGGNFTLTCRAEAWPPAQISWRAPPGALNIGLSSNNSTLSVAGAMGSHG 750 760 770 780 790 800 >>NP_001307534 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mol (451 aa) initn: 628 init1: 603 opt: 722 Z-score: 744.8 bits: 147.3 E(85289): 9.5e-35 Smith-Waterman score: 1037; 37.8% identity (59.0% similar) in 529 aa overlap (1-523:4-434) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAPSSPRPALPALLVLLGALFPGPGNAQ--TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCDQP :.:: : :.. : :: . . : :.. .: :::..:.:::.: . NP_001 MATMVPSVLWPRACWTLLVCCLLTPGVQGQEFLLRVEPQNPVLSAGGSLFVNCSTDCPSS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 KLLGIETPLPKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQPMCYSNCPDGQSTAKTFLTVYWTPER . ...:: : .:::. : . ...:::: .:. .: : .: :... .::: ::: NP_001 EKIALETSL-SKELVASGMGWAAFNLSNVTGNSRILCSVYCNGSQITGSSNITVYRLPER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VELAPLPSWQPVGKNLTLRCQVEGGAPRANLTVVLLRGEKELKREPAVGEPAEVTTTVLV ::::::: :::::.:.::::::: :.::..::::::: :.::.:.::: ::::::.:::. NP_001 VELAPLPPWQPVGQNFTLRCQVEDGSPRTSLTVVLLRWEEELSRQPAVEEPAEVTATVLA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 RRDHHGANFSCRTELDLRPQGLELFENTSAPYQLQTFVLPATPPQLVSPRVLEVDTQGTV :: ::: ::::::::..:::: :: ::::: ::.:: NP_001 SRDDHGAPFSCRTELDMQPQGLGLFVNTSAPRQLRTF----------------------- 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 VCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRLTCAVILG NP_001 ------------------------------------------------------------ 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 NQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPRAQ .: .: : :..: . ::. :::.: : :..:::.:::: : :: NP_001 -------------GFLGPIVNLSEPTAHEGSTVTVSCMAGARVQVTLDGVPAAAPGQPAQ 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 LLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQ : :.:: :.:::: ::::::: :...:.:.. .:::::::..:. :: . : ..... NP_001 LQLNATESDDGRSFFCSATLEVDGEFLHRNSSVQLRVLYGPKIDRATCPQHLKWKDKTRH 270 280 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 TPMCQAWGNPLPELKCLKDGTF-PLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNV . .::: ::: :::.:::.:. .:.: :. .::: :.: :..:. : :.... NP_001 VLQCQARGNPYPELRCLKEGSSREVPVGIPFFVNVTHNGTYQCQASSSRGKYTLVVVMDI 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 LSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLST---YLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATP . ..: . ::. . .:.. . :.. .... .:.... . :. NP_001 EAGSSHFVPV-FVAVLLTLGVVTIVLALMYVFREHQRSGSYHVREESTYLPLTSMQPTEA 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 P NP_001 MGEEPSRAE 450 >>NP_001307537 (OMIM: 146631) intercellular adhesion mol (286 aa) initn: 582 init1: 582 opt: 660 Z-score: 684.1 bits: 135.4 E(85289): 2.3e-31 Smith-Waterman score: 660; 37.9% identity (71.7% similar) in 269 aa overlap (259-523:2-269) 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 VDTQGTVVCSLDGLFPVSEAQVHLALGDQRLNPTVTYGNDSFSAKASVSVTAEDEGTQRL :: :: .:...: :.... :..::.... NP_001 MLNATVMNHGDTLTATATATARADQEGAREI 10 20 30 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 TCAVILGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQ .: : ::.. .:. ...:..:: .: : :..: . ::. :::.: : :..:::.:::: NP_001 VCNVTLGGERREARENLTVFSFLGPIVNLSEPTAHEGSTVTVSCMAGARVQVTLDGVPAA 40 50 60 70 80 90 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 PLGPRAQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWT : ::: :.:: :.:::: ::::::: :...:.:.. .:::::::..:. :: . NP_001 APGQPAQLQLNATESDDGRSFFCSATLEVDGEFLHRNSSVQLRVLYGPKIDRATCPQHLK 100 110 120 130 140 150 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 WPENSQQTPMCQAWGNPLPELKCLKDGTF-PLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVT : ...... .::: ::: :::.:::.:. .:.: :. .::: :.: :..:. : NP_001 WKDKTRHVLQCQARGNPYPELRCLKEGSSREVPVGIPFFVNVTHNGTYQCQASSSRGKYT 160 170 180 190 200 210 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 RKVTVNVLSPRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLST---YLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMK :.... . ..: . ::. . .:.. . :.. .... .:.... . :. NP_001 LVVVMDIEAGSSHFVPV-FVAVLLTLGVVTIVLALMYVFREHQRSGSYHVREESTYLPLT 220 230 240 250 260 270 530 pF1KB5 PNTQATPP NP_001 SMQPTEAMGEEPSRAE 280 >>XP_016882674 (OMIM: 601852) PREDICTED: intercellular a (586 aa) initn: 546 init1: 394 opt: 488 Z-score: 503.3 bits: 103.0 E(85289): 2.7e-21 Smith-Waterman score: 488; 52.7% identity (71.6% similar) in 148 aa overlap (328-474:2-149) 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 SQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPRAQLL ::: : : .: :::.:::: : ::: XP_016 MVTVTCAAGAQALVTLEGVPAAVPGQPAQLQ 10 20 30 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 LKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENSQQTP :.:: .:. ::: :.:::.: :. . ::.. ::::::.::::. ::: .:::::. .:: XP_016 LNATENDDRRSFFCDATLDVDGETLIKNRSAELRVLYAPRLDDSDCPRSWTWPEGPEQTL 40 50 60 70 80 90 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 MCQAWGNPLPELKCLK-DGTFPLPIGESVTVTRDLEGTYLCRARSTQGEVTRKVTVNVLS :.: ::: : ..: . :: : .: ::: : ::: :.: . :::... ::..: XP_016 RCEARGNPEPSVHCARSDGGAVLALGLLGPVTRALSGTYRCKAANDQGEAVKDVTLTVEY 100 110 120 130 140 150 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 PRYEIVIITVVAAAVIMGTAGLSTYLYNRQRKIKKYRLQQAQKGTPMKPNTQATPP XP_016 APALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAVIEGLLRVAREHAGT 160 170 180 190 200 210 >-- initn: 235 init1: 166 opt: 265 Z-score: 274.6 bits: 60.6 E(85289): 1.5e-08 Smith-Waterman score: 265; 33.9% identity (58.2% similar) in 165 aa overlap (324-477:168-327) 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 LGNQSQETLQTVTIYSFPAPNVILTKPEVSEGTEVTVKCEAHPRAKVTLNGVPAQPLGPR ::::....: :: . : . :: XP_016 QGEAVKDVTLTVEYAPALDSVGCPERITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVRSGELGAV 140 150 160 170 180 190 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 AQLLLKATPEDNGRSFSCSATLEVAGQLIHKNQTRELRVLYGPRLDERDCPGNWTWPENS . ::... : : .. : :: . :. :: . . : ::::..: .::.:::: :.: XP_016 IEGLLRVAREHAG-TYRCEAT-NPRGSAA-KNVA--VTVEYGPRFEEPSCPSNWTWVEGS 200 210 220 230 240 250 420 430 440 450 460 pF1KB5 QQTPMCQAWGNPLPELKCLKDG------TFPL----PIGESVTVTRDLE-GTYLCRARST . :.. :.: : .::. .: .:: : .. . : : : :.: : . 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XP_016 ELAASPPGGVRPGGNFTLTCRAEAWPPAQISWRAPPGALNIGLSSNNSTLSVAGAMGSHG 420 430 440 450 460 470 >>NP_001093259 (OMIM: 146630) intercellular adhesion mol (275 aa) initn: 326 init1: 170 opt: 366 Z-score: 382.9 bits: 79.6 E(85289): 1.4e-14 Smith-Waterman score: 366; 35.0% identity (62.7% similar) in 220 aa overlap (13-222:9-225) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAPSSPRPALPALLVLLGALFPGPGNAQ----TSVSPSKVILPRGGSVLVTCSTSCDQPK : : : .:. ::. . . : :.:. . ::. :.:::.:.::. 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