FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2162, 283 aa 1>>>pF1KE2162 283 - 283 aa - 283 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0293+/-0.000447; mu= 15.6413+/- 0.027 mean_var=56.3767+/-11.124, 0's: 0 Z-trim(107.4): 35 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.170814 statistics sampled from 15397 (15421) to 15397 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16 Scan time: 6.720 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016865312 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1843 462.9 3e-130 XP_005272132 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1843 462.9 3e-130 NP_003365 (OMIM: 604492) voltage-dependent anion-s ( 283) 1843 462.9 3e-130 XP_016865310 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1843 462.9 3e-130 XP_016865311 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-dep ( 283) 1843 462.9 3e-130 NP_003366 (OMIM: 193245) voltage-dependent anion-s ( 294) 1484 374.5 1.3e-103 NP_001171752 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 294) 1484 374.5 1.3e-103 NP_001311017 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 294) 1484 374.5 1.3e-103 NP_001171712 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 309) 1484 374.5 1.4e-103 NP_005653 (OMIM: 610029) voltage-dependent anion-s ( 283) 1318 333.5 2.7e-91 NP_001129166 (OMIM: 610029) voltage-dependent anio ( 284) 1308 331.1 1.5e-90 NP_001311018 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 255) 1280 324.2 1.6e-88 NP_001311019 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 255) 1280 324.2 1.6e-88 NP_001311016 (OMIM: 193245) voltage-dependent anio ( 255) 1280 324.2 1.6e-88 XP_006716457 (OMIM: 610029) PREDICTED: voltage-dep ( 251) 1140 289.6 3.9e-78 >>XP_016865312 (OMIM: 604492) PREDICTED: voltage-depende (283 aa) initn: 1843 init1: 1843 opt: 1843 Z-score: 2459.3 bits: 462.9 E(85289): 3e-130 Smith-Waterman score: 1843; 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NP_005 HTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLDCRTSLSAKVNNA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 SLIGLGYTQTLKPGIKLTLSALLDGKNVNAGGHKLGLGLEFQA :::::::::::.::.:::::::.:::: .:::::.:::.:..: NP_005 SLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA 250 260 270 280 283 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:11:45 2016 done: Sun Nov 6 23:11:46 2016 Total Scan time: 6.720 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]