FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1404, 338 aa 1>>>pF1KE1404 338 - 338 aa - 338 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0674+/-0.0011; mu= 12.4867+/- 0.066 mean_var=106.5678+/-22.280, 0's: 0 Z-trim(106.1): 178 B-trim: 80 in 1/48 Lambda= 0.124240 statistics sampled from 8560 (8768) to 8560 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16 Scan time: 1.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9038.1 LUM gene_id:4060|Hs108|chr12 ( 338) 2224 409.6 1.9e-114 CCDS30976.1 FMOD gene_id:2331|Hs108|chr1 ( 376) 1030 195.6 5.4e-50 CCDS6696.1 OMD gene_id:4958|Hs108|chr9 ( 421) 793 153.2 3.6e-37 CCDS1438.1 PRELP gene_id:5549|Hs108|chr1 ( 382) 775 149.9 3.1e-36 CCDS9037.1 KERA gene_id:11081|Hs108|chr12 ( 352) 747 144.9 9.5e-35 CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 359) 478 96.7 3.2e-20 CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 510) 443 90.5 3.2e-18 CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 512) 443 90.5 3.2e-18 CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 359 75.5 1.1e-13 CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 518) 349 73.7 3.8e-13 CCDS74530.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 519) 349 73.7 3.8e-13 CCDS1966.1 LRRTM1 gene_id:347730|Hs108|chr2 ( 522) 349 73.7 3.8e-13 CCDS46346.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 590) 349 73.7 4.2e-13 CCDS82475.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 591) 349 73.7 4.2e-13 CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 642) 325 69.4 8.8e-12 CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 661) 325 69.4 9e-12 CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 754) 317 68.1 2.7e-11 CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11 ( 674) 306 66.0 9.7e-11 >>CCDS9038.1 LUM gene_id:4060|Hs108|chr12 (338 aa) initn: 2224 init1: 2224 opt: 2224 Z-score: 2168.3 bits: 409.6 E(32554): 1.9e-114 Smith-Waterman score: 2224; 100.0% identity (100.0% similar) in 338 aa overlap (1-338:1-338) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSAMYCDELKLKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSAMYCDELKLKS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 VPMVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRVFSKLKQLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 VPMVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRVFSKLKQLKK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKLGSFEGLVNLTFIHLQHNRLKEDAVSAAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 LHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKLGSFEGLVNLTFIHLQHNRLKEDAVSAAF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 KGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFNALQYLRLSHNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 KGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFNALQYLRLSHNE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKFDIKSFCKILGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 LADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKFDIKSFCKILGP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 LSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS90 LSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN 310 320 330 >>CCDS30976.1 FMOD gene_id:2331|Hs108|chr1 (376 aa) initn: 1216 init1: 920 opt: 1030 Z-score: 1011.0 bits: 195.6 E(32554): 5.4e-50 Smith-Waterman score: 1030; 46.5% identity (79.2% similar) in 318 aa overlap (26-337:61-376) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSP----NCAPECNCPESYPSAM : ::. :: .: ::.:: ..:.:: CCDS30 LRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAM 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 YCDELKLKSVPMVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRV :::. .:: .:.:: .::.:..:::: :.: .:.:.: : :. : : . ..:. .: CCDS30 YCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKV 100 110 120 130 140 150 120 130 140 150 160 pF1KE1 FSKLKQLKKLHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKL--GSFEGLVNLTFIHLQHN ::::..:..:...:::::. ::::.::..:.: ::.:... ...::: ::: ..:::: CCDS30 FSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHN 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 RLKEDAVSAAFKGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFN ...: :.....::.:: ::::.:.. ..:.::: .: ::...:.. ..:: ::. CCDS30 EIQE--VGSSMRGLRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAP 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 ALQYLRLSHNELADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKF : :.::::: :...:. .:.:: :::.:::::::.:..:: :: :::: ::. :....: CCDS30 KLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEF 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 pF1KE1 DIKSFCKILGPLSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN .:.::: .. ...::.. ::::::.:.....: : :::.:. . . CCDS30 SISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI 330 340 350 360 370 >>CCDS6696.1 OMD gene_id:4958|Hs108|chr9 (421 aa) initn: 730 init1: 379 opt: 793 Z-score: 780.8 bits: 153.2 E(32554): 3.6e-37 Smith-Waterman score: 793; 40.8% identity (71.0% similar) in 314 aa overlap (19-329:47-354) 10 20 30 40 pF1KE1 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYP : :: : . : . .:. :: :: ..: CCDS66 KVHCQYETYQWDEDYDQEPDDDYQTGFPFRQNVDYGVP---FHQYTLGCVSECFCPTNFP 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 SAMYCDELKLKSVPMVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIK :.::::. :::..: .: :. :::. :.:. . ..: :.: :. . :.:: ....:: CCDS66 SSMYCDNRKLKTIPNIPMHIQQLYLQFNEIEAVTANSFINATHLKEINLSHNKIKSQKID 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 GRVFSKLKQLKKLHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKL--GSFEGLVNLTFIHL ::.:: .: .::..:::: : ::::::: : : .:.:.:: ....::::::.. : CCDS66 YGVFAKLPNLLQLHLEHNNLEEFPFPLPKSLERLLLGYNEISKLQTNAMDGLVNLTMLDL 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 QHNRLKEDAVS-AAFKGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYF .: :... .. : ...: :.: :.. .: ::: ::. : :.::.::.::..:: CCDS66 CYNYLHDSLLKDKIFAKMEKLMQLNLCSNRLESMPPGLPSSLMYLSLENNSISSIPEKYF 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 KRFNALQYLRLSHNELADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQ .. :. ::.:::.: : :: : ::. ..:::....::::. . .:::. ::. :. CCDS66 DKLPKLHTLRMSHNKLQD--IPYNIFNLPNIVELSVGHNKLKQAFYIPRNLEHLYLQNNE 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 pF1KE1 LEKFDIKSFCKILGPLSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN .::... .: . :: : .. ..:.: :...: . .. :. CCDS66 IEKMNLTVMCPSIDPLHYHHLTYIRVDQNKLKEP-ISSYIFFCFPHIHTIYYGEQRSTNG 320 330 340 350 360 370 CCDS66 QTIQLKTQVFRRFPDDDDESEDHDDPDNAHESPEQEGAEGHFDLHYYENQE 380 390 400 410 420 >>CCDS1438.1 PRELP gene_id:5549|Hs108|chr1 (382 aa) initn: 770 init1: 344 opt: 775 Z-score: 763.9 bits: 149.9 E(32554): 3.1e-36 Smith-Waterman score: 805; 39.8% identity (72.8% similar) in 324 aa overlap (26-337:66-382) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSAMYCDE : ::. :.: :: :: ..:::.::: CCDS14 PRPRPRPTPSFPQPDEPAEPTDLPPPLPPGPPSIF----PDCPRECYCPPDFPSALYCDS 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LKLKSVPMVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRVFSKL .:..::..:: :.::::.:: : .. ..:.:.: :.:. ::.: .. :: ::. :: CCDS14 RNLRKVPVIPPRIHYLYLQNNFITELPVESFQNATGLRWINLDNNRIR--KIDQRVLEKL 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KQLKKLHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKL--GSFEGLVNLTFIHLQHNRLKE : :....:.: : . ::..::.:.:..:.:... : : : :: .. ::::::.. CCDS14 PGLVFLYMEKNQLEEVPSALPRNLEQLRLSQNHISRIPPGVFSKLENLLLLDLQHNRLSD 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 DAVSA-AFKGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFNALQ . . .:.:::.: :.:. : . ..: .:... ::::.::: .::. ::: : : CCDS14 GVFKPDTFHGLKNLMQLNLAHNILRKMPPRVPTAIHQLYLDSNKIETIPNGYFKSFPNLA 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 YLRLSHNELADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKFDIK ..::..:.:.: :.: ::::.:.:. : ::.:.....:..:. ::. ::. :..::.. CCDS14 FIRLNYNKLTDRGLPKNSFNISNLLVLHLSHNRISSVPAINNRLEHLYLNNNSIEKINGT 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 pF1KE1 SFCK--ILGPLSYSK-------IKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN ..: ... ..:. ...:::::: . . .: :.. :.:. . :.. CCDS14 QICPNDLVAFHDFSSDLENVPHLRYLRLDGNYL-KPPIPLDLMMCFRLLQSVVI 330 340 350 360 370 380 >>CCDS9037.1 KERA gene_id:11081|Hs108|chr12 (352 aa) initn: 757 init1: 370 opt: 747 Z-score: 737.3 bits: 144.9 E(32554): 9.5e-35 Smith-Waterman score: 790; 39.4% identity (73.7% similar) in 312 aa overlap (37-337:42-352) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 TLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSAMYCDELKLKSVPMVPP : :: :: :.:.:.::.. :: .: .: CCDS90 LFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIPS 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRVFSKLKQLKKLHINHN : ::::.:: :. : :: :::.:.:.:. :..: . : :. ..:.::.: : .. : CCDS90 RIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLEDN 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 NLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKL--GSFEGLVNLTFIHLQHNRLKEDAVSA-AFKGL .: : .:::.:::.:::..::.... :.: .: :::.. ::.:.: ..: . .:::: CCDS90 ELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKGL 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 KSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFNALQYLRLSHNELAD :.: :... : . .: ::.. . :.::::.: .::..::. . . .:::.::.:.: CCDS90 KNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLSD 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKFDIKSFCKI--LGP- :.:. .:.:::...:.::.:.: ..: .. .:.. .:. :.... ... .: . : CCDS90 EGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSMLPA 260 270 280 290 300 310 310 320 330 pF1KE1 ----LSYS-KIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN .::. ....::::::.: . .: .. :.:. . : . CCDS90 ERDSFSYGPHLRYLRLDGNEI-KPPIPMALMTCFRLLQAVII 320 330 340 350 >>CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 (359 aa) initn: 289 init1: 159 opt: 478 Z-score: 476.6 bits: 96.7 E(32554): 3.2e-20 Smith-Waterman score: 478; 31.5% identity (62.7% similar) in 324 aa overlap (22-337:43-355) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSAM : :: :. .: : .:.: . .. CCDS90 VSWAGPFQQRGLFDFMLEDEASGIGPEVPDDRDFEPSL----GPVCPFRCQC---HLRVV 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 YCDELKLKSVPM-VPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGR :..: : .:: .:: : :.::.: .: . :.:. .:. ::: .: . ::.. CCDS90 QCSDLGLDKVPKDLPPDTTLLDLQNNKITEIKDGDFKNLKNLHALILVNNKI--SKVSPG 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE1 VFSKLKQLKKLHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKLG--SFEGLVNLTFIHLQH .:. : .:..:....:.: : .::.:..:. .:.:::. .:.:: .. :.: CCDS90 AFTPLVKLERLYLSKNQLKELPEKMPKTLQELRAHENEITKVRKVTFNGLNQMIVIELGT 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 NRLKEDAV-SAAFKGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKR : :: ... ..::.:.:.: :. .. ..:. .:.::: :: :.::.:::: . .: CCDS90 NPLKSSGIENGAFQGMKKLSYIRIADTNITSIPQGLPPSLTELHLDGNKISRVDAASLKG 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 FNALQYLRLSHNELADSGIPGNSF-NVSSLVELDLSYNKLKNIP---TVNENLENYYLEV .: : : :: : . :.. ..:. :. : :: :. ::: .: . .. .. ::. CCDS90 LNNLAKLGLSFNSI--SAVDNGSLANTPHLRELHLDNNKLTRVPGGLAEHKYIQVVYLHN 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE1 NQLEKFDIKSFCKILGPLSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN :.. ..:: . .. . . : .: .. . :. ..:. : . . : CCDS90 NNISVVGSSDFCPPGHNTKKASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFRCVYVRSAIQLGNYK 310 320 330 340 350 >>CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 (510 aa) initn: 479 init1: 194 opt: 443 Z-score: 440.6 bits: 90.5 E(32554): 3.2e-18 Smith-Waterman score: 443; 30.7% identity (62.1% similar) in 335 aa overlap (8-330:11-335) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSLSAFTLFLALIGGTS--GQYYDYDFP-LSIYGQSSPNCAP-ECNCPESYPSAMYC :.: :. : . : :: :. : : : .:.::. ... : CCDS54 MGRPTQWPSLLLLLLLPGPPPVAGLEDAAFPHLGESLQPLPRACPLRCSCPRV--DTVDC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 DELKLKSVP-MVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRVF : : :. : . . ..: :.:::.... . . .. :. : : .::. . . ..: CCDS54 DGLDLRVFPDNITRAAQHLSLQNNQLQELPYNELSRLSGLRTLNLHNNLISSEGLPDEAF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 SKLKQLKKLHINHNNLTESVGP--LPKSLEDLQLTHNKITKLG--SFEGLVNLTFIHLQH .: ::..: . ::.: ::.: ::.::. .:. :.. .. .: : ..:.. CCDS54 ESLTQLQHLCVAHNKL--SVAPQFLPRSLRVADLAANQVMEIFPLTFGEKPALRSVYLHN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 NRLKEDAVSA-AFKGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKR :.:.. .. ::.: ... :.:: ::.. :: .:: :: :.:.:: ::..: ..: CCDS54 NQLSNAGLPPDAFRGSEAIATLSLSNNQLSYLPPSLPPSLERLHLQNNLISKVPRGALSR 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 FNALQYLRLSHNELADSGIPGNSFN-VSSLVELDLSYNKLKNIPT-VNENLENYYLEVNQ . :. : :.::.:.:::. ...:. . :: ::::.:.: ..:. . ..: .: :. CCDS54 QTQLRELYLQHNQLTDSGLDATTFSKLHSLEYLDLSHNQLTTVPAGLPRTLAILHLGRNR 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE1 LEKFDIKSFCKILGPLSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN ... . . : ...: :. :... ..:: . :: CCDS54 IRQVEAARLHGARG------LRYLLLQHNQLGSSGLPAGALRPLRGLHTLHLYGNGLDRV 300 310 320 330 340 350 CCDS54 PPALPRRLRALVLPHNHVAALGARDLVATPGLTELNLAYNRLASARVHHRAFRRLRALRS 360 370 380 390 400 410 >>CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 (512 aa) initn: 479 init1: 194 opt: 443 Z-score: 440.6 bits: 90.5 E(32554): 3.2e-18 Smith-Waterman score: 443; 30.7% identity (62.1% similar) in 335 aa overlap (8-330:13-337) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSLSAFTLFLALIGGTS--GQYYDYDFP-LSIYGQSSPNCAP-ECNCPESYPSAM :.: :. : . : :: :. : : : .:.::. ... CCDS12 MAESGLAMWPSLLLLLLLPGPPPVAGLEDAAFPHLGESLQPLPRACPLRCSCPRV--DTV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 YCDELKLKSVP-MVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGR :: : :. : . . ..: :.:::.... . . .. :. : : .::. . . . 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CCDS47 KGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQI--STVKEDAFQGLYKLKELILSS 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 NN---LTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKLGS--FEGLVNLTFIHLQHNRLKEDAVSAAF :. : ... .:..:.:. :....: : :: .: .::. : :. : : CCDS47 NKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRL-F 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE1 KGLKSLEYLDLSFNQIARLP----SGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFNALQYLRL .:::.:::: :.. : .:: ..: :.:..:....: .: :...:. : : CCDS47 WDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGL-IKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 SHNELADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIP-TVNE---NLENYYLEVNQLEKFDIK . :.... : .. ..: .:::. :..: : :: : ::. .. :.:...: : CCDS47 QWNKISNLTC-GMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 SFCKILGPLSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN CCDS47 ILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVH 300 310 320 330 340 350 >>CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 (518 aa) initn: 222 init1: 87 opt: 349 Z-score: 349.5 bits: 73.7 E(32554): 3.8e-13 Smith-Waterman score: 349; 30.7% identity (63.3% similar) in 264 aa overlap (37-286:34-289) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 TLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSAMYCDELKLKSVPM-VP : .: : . .::. . ..: . 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