FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4555, 675 aa 1>>>pF1KE4555 675 - 675 aa - 675 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1530+/-0.00127; mu= 20.7626+/- 0.077 mean_var=82.4373+/-16.844, 0's: 0 Z-trim(101.8): 86 B-trim: 15 in 1/49 Lambda= 0.141258 statistics sampled from 6594 (6685) to 6594 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16 Scan time: 3.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 675) 4419 911.4 0 CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 676) 4407 909.0 0 CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 ( 678) 3518 727.8 1.2e-209 CCDS55913.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 298) 434 99.0 1.1e-20 CCDS9663.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 299) 434 99.0 1.1e-20 CCDS13744.1 SLC25A18 gene_id:83733|Hs108|chr22 ( 315) 391 90.2 4.8e-18 CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 ( 323) 390 90.0 5.6e-18 CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 290) 354 82.7 8.4e-16 CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 322) 354 82.7 9e-16 CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 325) 354 82.7 9.1e-16 CCDS31967.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 291) 346 81.0 2.6e-15 CCDS3753.1 UCP1 gene_id:7350|Hs108|chr4 ( 307) 332 78.2 2e-14 CCDS82138.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 336) 332 78.2 2.1e-14 CCDS11482.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 351) 332 78.2 2.2e-14 CCDS45700.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 359) 332 78.3 2.2e-14 CCDS32882.1 SLC25A23 gene_id:79085|Hs108|chr19 ( 468) 332 78.4 2.7e-14 CCDS41670.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 288) 316 74.9 1.8e-13 CCDS45937.1 SLC25A41 gene_id:284427|Hs108|chr19 ( 370) 316 75.0 2.1e-13 CCDS6890.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 469) 314 74.7 3.4e-13 CCDS35151.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 503) 314 74.7 3.6e-13 CCDS83420.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 515) 314 74.7 3.6e-13 CCDS786.1 SLC25A24 gene_id:29957|Hs108|chr1 ( 458) 306 73.0 1e-12 CCDS41361.1 SLC25A24 gene_id:29957|Hs108|chr1 ( 477) 306 73.1 1.1e-12 CCDS2905.2 SLC25A26 gene_id:115286|Hs108|chr3 ( 274) 303 72.2 1.1e-12 CCDS32156.1 SLC25A29 gene_id:123096|Hs108|chr14 ( 303) 294 70.4 4.2e-12 CCDS76431.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 226) 291 69.7 5.1e-12 CCDS41671.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 246) 291 69.7 5.5e-12 CCDS60850.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 264) 291 69.8 5.7e-12 CCDS5610.1 SLC25A40 gene_id:55972|Hs108|chr7 ( 338) 292 70.1 6e-12 CCDS14577.1 SLC25A43 gene_id:203427|Hs108|chrX ( 341) 287 69.1 1.2e-11 CCDS2779.1 SLC25A20 gene_id:788|Hs108|chr3 ( 301) 285 68.6 1.5e-11 CCDS7280.1 SLC25A16 gene_id:8034|Hs108|chr10 ( 332) 279 67.4 3.7e-11 CCDS9959.1 SLC25A47 gene_id:283600|Hs108|chr14 ( 308) 276 66.8 5.3e-11 CCDS66539.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 240) 272 65.9 7.8e-11 >>CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 (675 aa) initn: 4419 init1: 4419 opt: 4419 Z-score: 4869.5 bits: 911.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4419; 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CCDS33 IHHHIPFNWDCEFIRLHFGHNRKKHLNYTEFTQFLQELQLEHARQAFALKDKSKSGMISG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IDFRDIMVTIRPHVLTPFVEECLVAAAGGTTSHQVSFSYFNGFNSLLNNMELIRKIYSTL .:: ::::::: :.::::::: ::.::::. ::::::::::.::::::::::.::::::: CCDS33 LDFSDIMVTIRSHMLTPFVEENLVSAAGGSISHQVSFSYFNAFNSLLNNMELVRKIYSTL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 AGTRKDVEVTKEEFVLAAQKFGQVTPMEVDILFQLADLYEPRGRMTLADIERIAPLEEGT ::::::::::::::. .: ..:::::.:.:::.::::::. ::.::::::::::: ::. 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CCDS55 LALYKGLLPKIMRLGPGGAVMLLVYEYTYSWLQEN 270 280 290 640 650 660 670 pF1KE4 HVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPLFKPSVSTSKAIGGGP >>CCDS9663.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 (299 aa) initn: 386 init1: 134 opt: 434 Z-score: 485.1 bits: 99.0 E(32554): 1.1e-20 Smith-Waterman score: 434; 30.8% identity (59.9% similar) in 302 aa overlap (317-607:2-295) 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LADIERIAPLEEGTLPFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAV ::.: . : :.. .. :. :: : . CCDS96 MSAKPEVSLVREASRQIVAGGSAGLVEICLM 10 20 30 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 YPIDLVKTRMQNQRSTGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKA .:.:.::::.: :: . . ::. : :. ....::.::.:.:.:: .:. .:..: CCDS96 HPLDVVKTRFQIQRCA---TDPNSYKSLVDSFRMIFQMEGLFGFYKGILPPILAETPKRA 40 50 60 70 80 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 IKLTVNDFVRDKFMHKDGSVPLAAEI---LAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEIT .:. :. ... . : : :. . .:: .: ...: .::.:.::. :: :.. : CCDS96 VKF----FTFEQYKKLLGYVSLSPALTFAIAGLGSGLTEAIVVNPFEVVKVGLQ-ANRNT 90 100 110 120 130 140 470 480 490 500 510 pF1KE4 TGPRVSALSVVRDL------GFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASF-ANEDG . . :... .:.. :. :. :: : . : :. .:: : .:: . .:.: CCDS96 FAEQPSTVGYARQIIKKEGWGLQGLNKGLTATLGRHGVFNMVYFGFYYNVKNMIPVNKDP 150 160 170 180 190 200 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 QVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP . . : ..: :. . : :: :.:.: . :. : . . . .::: CCDS96 ILEFWRKFGIGLLSGTIASVINIPFDVAKSRIQGPQPVPGEIKYRTCFKTMATVYQEEGI 210 220 230 240 250 260 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 KALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPD ::.:: ...: .: .: ::.:: :. CCDS96 LALYKGLLPKIMRLGPGGAVMLLVYEYTYSWLQENW 270 280 290 640 650 660 670 pF1KE4 HVGGYKLAVATFAGIENKFGLYLPLFKPSVSTSKAIGGGP >>CCDS13744.1 SLC25A18 gene_id:83733|Hs108|chr22 (315 aa) initn: 477 init1: 292 opt: 391 Z-score: 437.5 bits: 90.2 E(32554): 4.8e-18 Smith-Waterman score: 687; 43.4% identity (66.1% similar) in 295 aa overlap (335-600:15-302) 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 LAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGS :.::: ::.: :.::::.:::.:::. CCDS13 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQH---- 10 20 30 40 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 FVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDG :. :::. .::. :. : :::::.::: .: :.:::::::..::: : ... .:: CCDS13 --GKAMYKGMIDCLMKTARAEGFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFR-RLLMEDG 50 60 70 80 90 430 440 450 460 pF1KE4 -SVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEI-----------------TTG- . : :.::: :: ::. : :.:..::.:: ::.. ::: CCDS13 MQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGS 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 pF1KE4 ------PRVS--ALSVVRDLGFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKA-SFANEDG : .. : ..: :. :.:.: : .::::::: :::: .:... .: . : CCDS13 ASTHRRPSATLIAWELLRTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAG 160 170 180 190 200 210 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 QVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP ..: . ...: .:: :: ::: ::.:::.:. .. :. :::. :: ::. .::: CCDS13 KASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGP 220 230 240 250 260 270 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 KALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPD .:. :::: :.. .: ::.. .: CCDS13 SAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQGVYFIGIGERILKCFD 280 290 300 310 >>CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 (323 aa) initn: 726 init1: 270 opt: 390 Z-score: 436.2 bits: 90.0 E(32554): 5.6e-18 Smith-Waterman score: 707; 43.3% identity (67.0% similar) in 300 aa overlap (335-602:15-308) 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 LAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGS :..:: .:.: :.::::.:::.:::.. CCDS77 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQN--- 10 20 30 40 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 FVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDG :. .: . ::. :..: ::.::.::: .: :.:::::::..::: : . . ::: CCDS77 --GQRVYTSMSDCLIKTVRSEGYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQ-LSKDG 50 60 70 80 90 430 440 450 460 pF1KE4 S-VPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITT------------------- . . : :.::: :: ::: :.:.:..::.:: ::.:.. CCDS77 QKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIVTTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQP 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 pF1KE4 ------GPRVSALSVVRDL----GFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANE .:: .: ...::: :. :.::: : .:::.:::..::: .:... CCDS77 SVEAPAAPRPTATQLTRDLLRSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPA 160 170 180 190 200 210 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 DGQVSPGSL-LLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILRE . . :: . .::: .:: :: :.: ::.::::: :. .. ::::..:: :::::. CCDS77 SEEKSPFYVSFLAGCVAGSAAAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRH 220 230 240 250 260 270 580 590 600 610 620 630 pF1KE4 EGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAP :::.:. ::: :.. .: ::.. ..: : CCDS77 EGPSAFLKGAYCRALVIAPLFGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA 280 290 300 310 320 >>CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (290 aa) initn: 234 init1: 131 opt: 354 Z-score: 397.2 bits: 82.7 E(32554): 8.4e-16 Smith-Waterman score: 354; 26.8% identity (58.9% similar) in 280 aa overlap (332-605:9-287) 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 PFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQ-R : :..:. :. ...:.::.:::.: : . CCDS76 MSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQ 10 20 30 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM : . :. :.. : . .. . :: ..:: :. : :: : .::. . . .. :. CCDS76 SIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFV 40 50 60 70 80 90 430 440 450 460 470 pF1KE4 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRV-SALSVVRDLGF .. . : ... : .: . ..:: ...:::.:. : . : . : ... .. : CCDS76 ERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSLFQGSMIGSFIDIYQQEGT 100 110 120 130 140 150 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 FGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSL--LLAGAIAGMPAASL :...:. : .. .: : .: . .:... : .... :. .: CCDS76 RGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLI-LSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALA 160 170 180 190 200 210 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VTPADVIKTRL--QVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGV .:.::..::. : : . :.:..: . :. ..:: ::.:: .: .: . CCDS76 SNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNII 220 230 240 250 260 270 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 TLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFG ..::: :.: CCDS76 FFITYEQLKRLQI 280 290 >>CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (322 aa) initn: 234 init1: 131 opt: 354 Z-score: 396.6 bits: 82.7 E(32554): 9e-16 Smith-Waterman score: 354; 26.8% identity (58.9% similar) in 280 aa overlap (332-605:41-319) 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 PFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQ-R : :..:. :. ...:.::.:::.: : . CCDS14 FLRVKFATAAVIHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQ 20 30 40 50 60 70 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM : . :. :.. : . .. . :: ..:: :. : :: : .::. . . .. :. CCDS14 SIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFV 80 90 100 110 120 130 430 440 450 460 470 pF1KE4 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRV-SALSVVRDLGF .. . : ... : .: . ..:: ...:::.:. : . : . : ... .. : CCDS14 ERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSLFQGSMIGSFIDIYQQEGT 140 150 160 170 180 190 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 FGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSL--LLAGAIAGMPAASL :...:. : .. .: : .: . .:... : .... :. .: CCDS14 RGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLI-LSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALA 200 210 220 230 240 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VTPADVIKTRL--QVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGV .:.::..::. : : . :.:..: . :. ..:: ::.:: .: .: . CCDS14 SNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNII 250 260 270 280 290 300 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 TLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFG ..::: :.: CCDS14 FFITYEQLKRLQI 310 320 >>CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (325 aa) initn: 234 init1: 131 opt: 354 Z-score: 396.5 bits: 82.7 E(32554): 9.1e-16 Smith-Waterman score: 354; 26.8% identity (58.9% similar) in 280 aa overlap (332-605:44-322) 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 PFNLAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQ-R : :..:. :. ...:.::.:::.: : . CCDS14 VKFATAAVIVSGHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQ 20 30 40 50 60 70 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 STGSFVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFM : . :. :.. : . .. . :: ..:: :. : :: : .::. . . .. :. CCDS14 SIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFV 80 90 100 110 120 130 430 440 450 460 470 pF1KE4 HKDGSVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITTGPRV-SALSVVRDLGF .. . : ... : .: . ..:: ...:::.:. : . : . : ... .. : CCDS14 ERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSLFQGSMIGSFIDIYQQEGT 140 150 160 170 180 190 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 FGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANEDGQVSPGSL--LLAGAIAGMPAASL :...:. : .. .: : .: . .:... : .... :. .: CCDS14 RGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLI-LSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALA 200 210 220 230 240 250 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VTPADVIKTRL--QVAARAGQTTYSGVIDCFRKILREEGPKALWKGAGARVFRSSPQFGV .:.::..::. : : . :.:..: . :. ..:: ::.:: .: .: . CCDS14 SNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNII 260 270 280 290 300 310 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 TLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPDHVGGYKLAVATFAGIENKFG ..::: :.: CCDS14 FFITYEQLKRLQI 320 675 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 23:58:56 2016 done: Sat Nov 5 23:58:57 2016 Total Scan time: 3.590 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]