Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6142
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6142, 638 aa
  1>>>pF1KB6142 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5181+/-0.000942; mu= 17.9005+/- 0.057
 mean_var=63.7129+/-12.637, 0's: 0 Z-trim(104.0): 25  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.160679
 statistics sampled from 7666 (7685) to 7666 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.236), width:  16
 Scan time:  2.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13125.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20         ( 638) 4347 1016.8       0
CCDS56180.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20         ( 619) 4205 983.9       0
CCDS56179.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20         ( 603) 3703 867.5       0
CCDS4081.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5           ( 753) 1800 426.4 6.7e-119
CCDS54881.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5          ( 706) 1751 415.1 1.7e-115
CCDS73789.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15         ( 956) 1730 410.2 6.4e-114
CCDS73790.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15         ( 969) 1730 410.2 6.4e-114
CCDS73791.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15         ( 623) 1657 393.2 5.4e-109
CCDS73793.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15         ( 652) 1657 393.3 5.6e-109
CCDS73792.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15         ( 664) 1657 393.3 5.7e-109
CCDS10364.1 FURIN gene_id:5045|Hs108|chr15         ( 794) 1637 388.7 1.7e-107
CCDS6652.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9           ( 913) 1623 385.4 1.8e-106
CCDS55320.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9          (1860) 1623 385.5 3.4e-106
CCDS12069.2 PCSK4 gene_id:54760|Hs108|chr19        ( 755) 1590 377.7  3e-104
CCDS8382.1 PCSK7 gene_id:9159|Hs108|chr11          ( 785) 1307 312.2 1.8e-84


>>CCDS13125.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20              (638 aa)
 initn: 4347 init1: 4347 opt: 4347  Z-score: 5440.2  bits: 1016.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4347; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKGGCVSQWKAAAGFLFCVMVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVRKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKGGCVSQWKAAAGFLFCVMVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVRKL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 PFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDPRVKMALQQEGFDRKKRGYRDINEIDIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDPRVKMALQQEGFDRKKRGYRDINEIDIN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 MNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPDLASN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPDLASN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRCAGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVAGIRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRCAGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVAGIRM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPTDNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKGRGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPTDNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKGRGGK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSIYVWASGDGGSYDDCNCDGYASSMWTISINSAINDGRTALYDESCSSTLASTFSNGRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSIYVWASGDGGSYDDCNCDGYASSMWTISINSAINDGRTALYDESCSSTLASTFSNGRK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 RNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQHLTVLTSKRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQHLTVLTSKRN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 QLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMAKDWKTVPERFHCVGGSVQDPEKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMAKDWKTVPERFHCVGGSVQDPEKIP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 STGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPMGTKSILLSRRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPMGTKSILLSRRP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 RDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLELGFVGSAPQKGVLKEWTLMLHGTQSAPYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLELGFVGSAPQKGVLKEWTLMLHGTQSAPYI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630        
pF1KB6 DQVVRDYQSKLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DQVVRDYQSKLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN
              610       620       630        

>>CCDS56180.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20              (619 aa)
 initn: 4205 init1: 4205 opt: 4205  Z-score: 5262.5  bits: 983.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4205; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (20-638:1-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKGGCVSQWKAAAGFLFCVMVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVRKL
                          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56                    MVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVRKL
                                  10        20        30        40 

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 PFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDPRVKMALQQEGFDRKKRGYRDINEIDIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDPRVKMALQQEGFDRKKRGYRDINEIDIN
              50        60        70        80        90       100 

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 MNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPDLASN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPDLASN
             110       120       130       140       150       160 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRCAGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVAGIRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRCAGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVAGIRM
             170       180       190       200       210       220 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPTDNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKGRGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPTDNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKGRGGK
             230       240       250       260       270       280 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSIYVWASGDGGSYDDCNCDGYASSMWTISINSAINDGRTALYDESCSSTLASTFSNGRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GSIYVWASGDGGSYDDCNCDGYASSMWTISINSAINDGRTALYDESCSSTLASTFSNGRK
             290       300       310       320       330       340 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 RNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQHLTVLTSKRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQHLTVLTSKRN
             350       360       370       380       390       400 

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 QLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMAKDWKTVPERFHCVGGSVQDPEKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMAKDWKTVPERFHCVGGSVQDPEKIP
             410       420       430       440       450       460 

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 STGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPMGTKSILLSRRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 STGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPMGTKSILLSRRP
             470       480       490       500       510       520 

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 RDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLELGFVGSAPQKGVLKEWTLMLHGTQSAPYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLELGFVGSAPQKGVLKEWTLMLHGTQSAPYI
             530       540       550       560       570       580 

              610       620       630        
pF1KB6 DQVVRDYQSKLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQVVRDYQSKLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN
             590       600       610         

>>CCDS56179.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20              (603 aa)
 initn: 3695 init1: 3695 opt: 3703  Z-score: 4633.7  bits: 867.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4020; 94.5% identity (94.5% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-603)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKGGCVSQWKAAAGFLFCVMVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVRKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS56 MKGGCVSQWKAAAGFLFCVMVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVRK-
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 PFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDPRVKMALQQEGFDRKKRGYRDINEIDIN
                                         ::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ----------------------------------VKMALQQEGFDRKKRGYRDINEIDIN
                                        60        70        80     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 MNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPDLASN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPDLASN
          90       100       110       120       130       140     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRCAGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVAGIRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRCAGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVAGIRM
         150       160       170       180       190       200     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPTDNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKGRGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPTDNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKGRGGK
         210       220       230       240       250       260     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 GSIYVWASGDGGSYDDCNCDGYASSMWTISINSAINDGRTALYDESCSSTLASTFSNGRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GSIYVWASGDGGSYDDCNCDGYASSMWTISINSAINDGRTALYDESCSSTLASTFSNGRK
         270       280       290       300       310       320     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 RNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQHLTVLTSKRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQHLTVLTSKRN
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              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 QLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMAKDWKTVPERFHCVGGSVQDPEKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMAKDWKTVPERFHCVGGSVQDPEKIP
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pF1KB6 STGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPMGTKSILLSRRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 STGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPMGTKSILLSRRP
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pF1KB6 RDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLELGFVGSAPQKGVLKEWTLMLHGTQSAPYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLELGFVGSAPQKGVLKEWTLMLHGTQSAPYI
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              610       620       630        
pF1KB6 DQVVRDYQSKLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQVVRDYQSKLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN
         570       580       590       600   

>>CCDS4081.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5                (753 aa)
 initn: 785 init1: 709 opt: 1800  Z-score: 2248.1  bits: 426.4 E(32554): 6.7e-119
Smith-Waterman score: 1800; 45.8% identity (73.4% similar) in 624 aa overlap (17-629:19-630)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB6   MKGGCVSQWKAAAGFLFCVMVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVR
                         .:..  :.:.:  :.:.. .:.  :: . :  .: : :. . 
CCDS40 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQ-FVNEWAAEI-PGGPEAASAIAEELGYDLL
               10        20        30          40        50        

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 -KLPFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDPRVKMALQQEGFDRKKRG-YRDINE
        ..   :. : : :..  . .:: ..:  ..:  : ::  : ::   .:.::.  :: . 
CCDS40 GQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRD-SA
       60        70        80        90       100       110        

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pF1KB6 IDINMNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPD
       ... .:::....:::: .: .. . : :::.:  .:. : :::::.: ..:::... : :
CCDS40 LNL-FNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTD
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pF1KB6 LASNYNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRCAGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVA
       . .::. ::::::..::  :.:::     :.::::::::..  :::. :::::::::::.
CCDS40 IYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVG
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        240       250       260       270       280       290      
pF1KB6 GIRMLDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPTDNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKG
       ::::::  ..:: ::::::.  :  .:::::::::.:.::::.:: .:. .:.  ::..:
CCDS40 GIRMLDG-IVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQG
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pF1KB6 RGGKGSIYVWASGDGGSY-DDCNCDGYASSMWTISINSAINDGRTALYDESCSSTLASTF
       : :::::.:::::.::   :.:.::::..:..::::.:: ..: .  : :.::::::...
CCDS40 RQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSY
         300       310       320       330       340       350     

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pF1KB6 SNGRKRNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQHLTVL
       :.:   . .  ....::...::  :.::::.:: :::.:::::::: .:::::::::.: 
CCDS40 SSGDYTDQR--ITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVW
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pF1KB6 TSKRNQLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMA--KDWKTVPERFHCVGGSV
       ::. . : ..   :..::.::  :  ::.:.:.: :.: .:  . :..:::. .::   :
CCDS40 TSEYDPLANN-PGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECV---V
           420        430       440       450       460            

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pF1KB6 QD----PEKIPSTGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPM
       .:    :. . ..:.... . : ::::.:: .. :::::   :.. .:::::....::  
CCDS40 KDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAA
     470       480       490       500       510       520         

     530       540       550       560       570        580        
pF1KB6 GTKSILLSRRPRDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLEL-GFVGSAPQKGVLKEWT
       ::...::..: ::  :  :: .: ::..:::::.  :::::..  . :   ..: . .: 
CCDS40 GTSTVLLAERERDT-SPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQNEGRIVNWK
     530       540        550       560       570       580        

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pF1KB6 LMLHGTQSAPYIDQVVRDYQS-KLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN         
       :.::::.: :   .  : : : . ... .. .:. .: . :.                  
CCDS40 LILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEKMVDPGEEQPTQENPKENTLVSKSPSS
      590       600       610       620       630       640        

CCDS40 SSVGGRRDELEEGAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPKQSPKKSPSAKLNIPYENFYEALEKLN
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>>CCDS54881.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5               (706 aa)
 initn: 785 init1: 709 opt: 1751  Z-score: 2187.2  bits: 415.1 E(32554): 1.7e-115
Smith-Waterman score: 1751; 47.4% identity (74.5% similar) in 576 aa overlap (64-629:18-583)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB6 FLVELHKGGEDKARQVAAEHGFGVRKLPFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDP
                                     :. : : :..  . .:: ..:  ..:  : 
CCDS54              MGKGSISFLFFSQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDD
                            10        20        30        40       

           100       110        120       130       140       150  
pF1KB6 RVKMALQQEGFDRKKRG-YRDINEIDINMNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAW
       ::  : ::   .:.::.  :: . ... .:::....:::: .: .. . : :::.:  .:
CCDS54 RVIWAEQQYEKERSKRSALRD-SALNL-FNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVW
        50        60         70         80        90       100     

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 ELGYTGKGVTIGIMDDGIDYLHPDLASNYNAEASYDFSSNDPYPYPRYTDDWFNSHGTRC
       . : :::::.: ..:::... : :. .::. ::::::..::  :.:::     :.:::::
CCDS54 QKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRC
         110       120       130       140       150       160     

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB6 AGEVSAAANNNICGVGVAYNSKVAGIRMLDQPFMTDIIEASSISHMPQLIDIYSASWGPT
       :::..  :::. :::::::::::.::::::  ..:: ::::::.  :  .:::::::::.
CCDS54 AGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDG-IVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPN
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pF1KB6 DNGKTVDGPRELTLQAMADGVNKGRGGKGSIYVWASGDGGSY-DDCNCDGYASSMWTISI
       :.::::.:: .:. .:.  ::..:: :::::.:::::.::   :.:.::::..:..::::
CCDS54 DDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISI
          230       240       250       260       270       280    

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 NSAINDGRTALYDESCSSTLASTFSNGRKRNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAA
       .:: ..: .  : :.::::::...:.:   . .  ....::...::  :.::::.:: ::
CCDS54 SSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQR--ITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAA
          290       300       310         320       330       340  

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB6 GVFALALEANLGLTWRDMQHLTVLTSKRNQLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGA
       :.:::::::: .:::::::::.: ::. . : ..   :..::.::  :  ::.:.:.: :
CCDS54 GIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPLANN-PGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKA
            350       360       370        380       390       400 

               460       470           480       490       500     
pF1KB6 MVKMA--KDWKTVPERFHCVGGSVQD----PEKIPSTGKLVLTLTTDACEGKENFVRYLE
       .: .:  . :..:::. .::   :.:    :. . ..:.... . : ::::.:: .. ::
CCDS54 LVDLADPRTWRSVPEKKECV---VKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEGQENAIKSLE
             410       420          430       440       450        

         510       520       530       540       550       560     
pF1KB6 HVQAVITVNATRRGDLNINMTSPMGTKSILLSRRPRDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDAR
       :::   :.. .:::::....::  ::...::..: ::  :  :: .: ::..:::::.  
CCDS54 HVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAGTSTVLLAERERDT-SPNGFKNWDFMSVHTWGENPI
      460       470       480       490        500       510       

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pF1KB6 GTWTLEL-GFVGSAPQKGVLKEWTLMLHGTQSAPYIDQVVRDYQS-KLAMSKKEELEEEL
       :::::..  . :   ..: . .: :.::::.: :   .  : : : . ... .. .:. .
CCDS54 GTWTLRITDMSGRIQNEGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEKMV
       520       530       540       550       560       570       

           630                                                     
pF1KB6 DEAVERSLKSILNKN                                             
       : . :.                                                      
CCDS54 DPGEEQPTQENPKENTLVSKSPSSSSVGGRRDELEEGAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPKQS
       580       590       600       610       620       630       

>>CCDS73789.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15              (956 aa)
 initn: 973 init1: 512 opt: 1730  Z-score: 2158.8  bits: 410.2 E(32554): 6.4e-114
Smith-Waterman score: 1730; 47.3% identity (70.2% similar) in 605 aa overlap (23-620:63-658)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB6         MKGGCVSQWKAAAGFLFCVMVFASAERPVFTNHFLVELHKGGEDKARQVAAE
                                     :   :::.:::. :..  ::  .: .::: 
CCDS73 AGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQVL-GGPAEADRVAAA
             40        50        60        70         80        90 

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB6 HGF-GVRKLPFAEGLYHFYHNGLAKAKRRRSLHHKQQLERDPRVKMALQQEGFDRKKRGY
       ::. .. ..   :  :::::.   : .   :   .  :. ::.::   :::   : ::  
CCDS73 HGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRMDPQVKWLQQQEVKRRVKRQV
             100       110       120       130       140       150 

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB6 RDINEIDINMNDPLFTKQWYLINTGQADGTPGLDLNVAEAWELGYTGKGVTIGIMDDGID
       :. .   . .:::.....::: . :. ..    ..::  ::. :::::.:.. :.::::.
CCDS73 RS-DPQALYFNDPIWSNMWYL-HCGDKNSRCRSEMNVQAAWKRGYTGKNVVVTILDDGIE
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       :..::: : :::.:::::.::   : :.::::..:..:::..:: ..:    : : :.::
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CCDS73 NAKIGGIRMLDGD-VTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWGPDDDGKTVDGPGRLAKQAFEY
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>>CCDS73791.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15              (623 aa)
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CCDS73 HGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRMDPQVKWLQQQEVKRRVKRQV
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pF1KB6 LASTFSNGRKRNPEAGVATTDLYGNCTLRHSGTSAAAPEAAGVFALALEANLGLTWRDMQ
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CCDS73 LATTYSSGAFY--ERKIVTTDLRQRCTDGHTGTSVSAPMVAGIIALALEANSQLTWRDVQ
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pF1KB6 HLTVLTSKRNQLHDEVHQWRRNGVGLEFNHLFGYGVLDAGAMVKMAKDWKTVPERFHCVG
       :: : ::.    : .. .:. ::.: . .:..:.:..:: :.:  :: : .:: .  ::.
CCDS73 HLLVKTSR--PAHLKASDWKVNGAGHKVSHFYGFGLVDAEALVVEAKKWTAVPSQHMCVA
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pF1KB6 GSVQDPEKIPSTGKLVLTLTTDAC-EGKENFVRYLEHVQAVITVNATRRGDLNINMTSPM
       .: . :..:: .  :  :  :.:: : ... : ::::: .  ...  :::::.: ..:: 
CCDS73 ASDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVRTSISHPRRGDLQIYLVSPS
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pF1KB6 GTKSILLSRRPRDDDSKVGFDKWPFMTTHTWGEDARGTWTLELGFVGSAPQKGVLKEWTL
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CCDS73 GTKSQLLAKRLLDL-SNEGFTNWEFMTVHCWGEKAEGQWTLEIQDLPSQVRNPEKQGNLD
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pF1KB6 MLHGTQSAPYIDQVVRDYQSKLAMSKKEELEEELDEAVERSLKSILNKN

>>CCDS73793.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15              (652 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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