FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1368, 672 aa 1>>>pF1KE1368 672 - 672 aa - 672 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3475+/-0.000317; mu= 19.6528+/- 0.020 mean_var=75.1571+/-15.120, 0's: 0 Z-trim(116.0): 73 B-trim: 1450 in 1/58 Lambda= 0.147941 statistics sampled from 26790 (26872) to 26790 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16 Scan time: 11.830 The best scores are: opt bits E(85289) NP_075571 (OMIM: 601283,605286) calpain-10 isoform ( 672) 4751 1023.7 0 NP_075573 (OMIM: 601283,605286) calpain-10 isoform ( 517) 3167 685.5 1.3e-196 NP_775110 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 729) 640 146.3 3.9e-34 NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 638 145.8 5.1e-34 NP_001185798 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 638 145.8 5.1e-34 NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalyti ( 714) 638 145.8 5.1e-34 XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 638 145.8 5.1e-34 XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 638 145.8 5.1e-34 XP_006715050 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 650) 636 145.4 6.4e-34 XP_006715048 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 724) 636 145.4 6.9e-34 NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens] ( 739) 636 145.4 7e-34 XP_006715047 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 740) 636 145.4 7e-34 XP_011512577 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 743) 636 145.4 7.1e-34 XP_011512576 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 744) 636 145.4 7.1e-34 XP_011542588 (OMIM: 114230) PREDICTED: calpain-2 c ( 447) 619 141.7 5.9e-33 NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subun ( 700) 619 141.8 8.3e-33 XP_016881850 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 604) 583 134.1 1.5e-30 XP_016881849 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 652) 583 134.1 1.6e-30 XP_016881848 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 676) 583 134.1 1.7e-30 XP_016881845 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 702) 583 134.1 1.7e-30 XP_016881844 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 723) 583 134.1 1.8e-30 XP_016881852 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 565) 569 131.1 1.1e-29 NP_006606 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 1 [Homo ( 690) 570 131.3 1.2e-29 XP_016881846 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 699) 570 131.3 1.2e-29 XP_016881851 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 590) 569 131.1 1.2e-29 XP_011542319 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 721) 570 131.3 1.2e-29 XP_016881847 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 698) 569 131.1 1.4e-29 NP_653292 (OMIM: 608839) calpain-12 [Homo sapiens] ( 719) 569 131.1 1.4e-29 XP_016881854 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 503) 543 125.5 4.9e-28 NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic su ( 622) 534 123.6 2.2e-27 XP_011531465 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 433) 523 121.2 8.4e-27 XP_016860755 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 665) 523 121.3 1.2e-26 XP_011531463 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 523 121.3 1.2e-26 XP_011531462 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 523 121.3 1.2e-26 NP_653176 (OMIM: 610228) calpain-13 [Homo sapiens] ( 669) 523 121.3 1.2e-26 XP_011531461 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 523 121.3 1.2e-26 XP_016860754 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 523 121.3 1.2e-26 XP_016860753 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 523 121.3 1.2e-26 NP_057536 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 2 [Homo ( 664) 496 115.5 6.4e-25 XP_011542320 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 695) 496 115.5 6.6e-25 NP_004046 (OMIM: 193235,602537) calpain-5 [Homo sa ( 640) 490 114.2 1.5e-24 XP_016873712 (OMIM: 193235,602537) PREDICTED: calp ( 676) 490 114.2 1.6e-24 XP_011543527 (OMIM: 193235,602537) PREDICTED: calp ( 680) 490 114.2 1.6e-24 NP_077320 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 815) 489 114.1 2.1e-24 NP_000061 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 821) 489 114.1 2.1e-24 XP_011531167 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 454 106.6 3.3e-22 NP_001138594 (OMIM: 610229) calpain-14 isoform 1 [ ( 684) 454 106.6 3.3e-22 XP_011531166 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 454 106.6 3.3e-22 XP_011531165 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 454 106.6 3.3e-22 NP_005623 (OMIM: 603267) calpain-15 [Homo sapiens] (1086) 455 106.9 4.1e-22 >>NP_075571 (OMIM: 601283,605286) calpain-10 isoform a [ (672 aa) initn: 4751 init1: 4751 opt: 4751 Z-score: 5476.4 bits: 1023.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4751; 100.0% identity (100.0% similar) in 672 aa overlap (1-672:1-672) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 GLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 FLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 FLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPT 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE1 NPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPSDTEFHPIGFHIFQVPEGGRSQDAPPLLLQEPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 NPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPSDTEFHPIGFHIFQVPEGGRSQDAPPLLLQEPL 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE1 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF 610 620 630 640 650 660 670 pF1KE1 LQEVSVMAVMKT :::::::::::: NP_075 LQEVSVMAVMKT 670 >>NP_075573 (OMIM: 601283,605286) calpain-10 isoform c [ (517 aa) initn: 3064 init1: 3064 opt: 3167 Z-score: 3650.9 bits: 685.5 E(85289): 1.3e-196 Smith-Waterman score: 3340; 76.9% identity (76.9% similar) in 672 aa overlap (1-672:1-517) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 GLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGE ::::::: NP_075 GLHLWKV----------------------------------------------------- 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 FLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPT NP_075 ------------------------------------------------------------ 550 560 570 580 590 600 pF1KE1 NPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPSDTEFHPIGFHIFQVPEGGRSQDAPPLLLQEPL :::::::::::::::::: NP_075 ------------------------------------------PEGGRSQDAPPLLLQEPL 430 440 610 620 630 640 650 660 pF1KE1 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_075 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF 450 460 470 480 490 500 670 pF1KE1 LQEVSVMAVMKT :::::::::::: NP_075 LQEVSVMAVMKT 510 >>NP_775110 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform c [H (729 aa) initn: 720 init1: 270 opt: 640 Z-score: 733.9 bits: 146.3 E(85289): 3.9e-34 Smith-Waterman score: 806; 34.1% identity (58.8% similar) in 498 aa overlap (13-490:74-530) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDIT :. : :: ..::: . . :. :: . NP_775 SAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFPPDETSLFYSQKFPI-QF----V 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 WRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWAD :.:: ::: .::.. : . .. :: ::::::: : : : ..::: .::: : :. . NP_775 WKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLNQHLLFRVIPHDQ-SFIE 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 QEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSY . : : : ..:..:.::.:. :: :: ..: :.. .... :: ::::.:::.:::: NP_775 N-YAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRNEFWSALLEKAYAKLHGSY 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 EHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISC : : .:....:. :.:::.:: .... : :. .. .. .. :..: NP_775 EALKGGNTTEAMEDFTGGVAEFFEIR---------DAPSDM-YKIMKKA--IERGSLMGC 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 pF1KE1 CV--LSPRAGARELG----EFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWRE . . : ... . ::. :. : :. . :. . :.:..::::. :.: : . NP_775 SIDTIIPVQYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVPFK-GEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSD 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 GGEGWSQVDAAVASELLSQLQE-GEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL . :: :: ..: :. : ::::. :.:. .: .: . ...: ::: ..: NP_775 RWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYHFTKLEICNLTADA--LQS---DKL 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRAL-PGAWVKGQSAGGCRN-NSGFPSNPKFWLRVSE----P--SEVY----IAVLQ : .. : ::.: ::::::: . : .::.. :.. : : ::: .:..: NP_775 QTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSEVICSFLVALMQ 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 RSRLHAADWAGRARALVGDSHT-SWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP ..: . : : .. : ... .: :.... :: : : NP_775 KNRR-------KDRKLGASLFTIGFAIYEVP-KEMHGNKQHLQK--------DFFLYNAS 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN : . . ::: : .: :. :. ::::. :::.::::: : NP_775 KARSKTYINMREVSQRFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLSEEVENTISV 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH NP_775 DRPVPQPGSSDQESEEQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHKDLKTHGFTL 550 560 570 580 590 600 >>NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic (714 aa) initn: 860 init1: 264 opt: 638 Z-score: 731.7 bits: 145.8 E(85289): 5.1e-34 Smith-Waterman score: 799; 33.1% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (13-487:55-515) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI :::: ::: . .:: . ::. : .. : NP_001 ELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLG-PNSSKTYGI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA :.:: :. ..:... : . .. :: :::::.: : :.: . :: .:.: :: :. NP_001 KWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQ-SFQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS . : : : ..::::.::.:..:: :: :.: : . . . :: ::::.::::.:: NP_001 NG-YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAEGNEFWSALLEKAYAKVNGS 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS :: : .:...... :.:::..: ..:. . .. : : :. :.. NP_001 YEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQI------------ILKALERGSLLG 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KE1 CC-----VLSPRAGA-RELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWR : ::. .: . ..: . ::. :. .... . :: . :.:..::::. : : : NP_001 CSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYR-GQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 EGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL ... :..:: ..: ....::::. ..:.::: .: . . .: :.: .. NP_001 DSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDA--LKSRTIRKW 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSE---PSEV---------YIAVL .: :.: .:..:::::: . : ::.: .:..: :.. .:.. NP_001 --NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALM 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 QRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP :. : . . :: .: .. .: . ..:: : . .: :. : NP_001 QKHRRRERRF-GRDMETIG-----FAVYEVPPELVGQPAVHL-KRDFFLANASRARSEQF 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN . ::: : .: :: :..::::: . :.:.:: :: NP_001 INL-------REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH NP_001 NLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESC 540 550 560 570 580 590 >>NP_001185798 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic (714 aa) initn: 860 init1: 264 opt: 638 Z-score: 731.7 bits: 145.8 E(85289): 5.1e-34 Smith-Waterman score: 799; 33.1% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (13-487:55-515) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI :::: ::: . .:: . ::. : .. : NP_001 ELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLG-PNSSKTYGI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA :.:: :. ..:... : . .. :: :::::.: : :.: . :: .:.: :: :. NP_001 KWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQ-SFQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS . : : : ..::::.::.:..:: :: :.: : . . . :: ::::.::::.:: NP_001 NG-YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAEGNEFWSALLEKAYAKVNGS 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS :: : .:...... :.:::..: ..:. . .. : : :. :.. NP_001 YEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQI------------ILKALERGSLLG 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KE1 CC-----VLSPRAGA-RELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWR : ::. .: . ..: . ::. :. .... . :: . :.:..::::. : : : NP_001 CSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYR-GQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 EGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL ... :..:: ..: ....::::. ..:.::: .: . . .: :.: .. NP_001 DSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDA--LKSRTIRKW 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSE---PSEV---------YIAVL .: :.: .:..:::::: . : ::.: .:..: :.. .:.. NP_001 --NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALM 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 QRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP :. : . . :: .: .. .: . ..:: : . .: :. : NP_001 QKHRRRERRF-GRDMETIG-----FAVYEVPPELVGQPAVHL-KRDFFLANASRARSEQF 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN . ::: : .: :: :..::::: . :.:.:: :: NP_001 INL-------REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH NP_001 NLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESC 540 550 560 570 580 590 >>NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic su (714 aa) initn: 860 init1: 264 opt: 638 Z-score: 731.7 bits: 145.8 E(85289): 5.1e-34 Smith-Waterman score: 799; 33.1% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (13-487:55-515) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI :::: ::: . .:: . ::. : .. : NP_005 ELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLG-PNSSKTYGI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA :.:: :. ..:... : . .. :: :::::.: : :.: . :: .:.: :: :. NP_005 KWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQ-SFQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS . : : : ..::::.::.:..:: :: :.: : . . . :: ::::.::::.:: NP_005 NG-YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAEGNEFWSALLEKAYAKVNGS 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS :: : .:...... :.:::..: ..:. . .. : : :. :.. NP_005 YEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQI------------ILKALERGSLLG 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KE1 CC-----VLSPRAGA-RELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWR : ::. .: . ..: . ::. :. .... . :: . :.:..::::. : : : NP_005 CSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYR-GQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 EGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL ... :..:: ..: ....::::. ..:.::: .: . . .: :.: .. NP_005 DSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDA--LKSRTIRKW 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSE---PSEV---------YIAVL .: :.: .:..:::::: . : ::.: .:..: :.. .:.. NP_005 --NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALM 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 QRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP :. : . . :: .: .. .: . ..:: : . .: :. : NP_005 QKHRRRERRF-GRDMETIG-----FAVYEVPPELVGQPAVHL-KRDFFLANASRARSEQF 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN . ::: : .: :: :..::::: . :.:.:: :: NP_005 INL-------REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH NP_005 NLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESC 540 550 560 570 580 590 >>XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calpain- (714 aa) initn: 860 init1: 264 opt: 638 Z-score: 731.7 bits: 145.8 E(85289): 5.1e-34 Smith-Waterman score: 799; 33.1% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (13-487:55-515) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI :::: ::: . .:: . ::. : .. : XP_006 ELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLG-PNSSKTYGI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA :.:: :. ..:... : . .. :: :::::.: : :.: . :: .:.: :: :. XP_006 KWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQ-SFQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS . : : : ..::::.::.:..:: :: :.: : . . . :: ::::.::::.:: XP_006 NG-YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAEGNEFWSALLEKAYAKVNGS 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS :: : .:...... :.:::..: ..:. . .. : : :. :.. XP_006 YEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQI------------ILKALERGSLLG 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KE1 CC-----VLSPRAGA-RELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWR : ::. .: . ..: . ::. :. .... . :: . :.:..::::. : : : XP_006 CSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYR-GQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 EGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL ... :..:: ..: ....::::. ..:.::: .: . . .: :.: .. XP_006 DSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDA--LKSRTIRKW 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSE---PSEV---------YIAVL .: :.: .:..:::::: . : ::.: .:..: :.. .:.. XP_006 --NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALM 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 QRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP :. : . . :: .: .. .: . ..:: : . .: :. : XP_006 QKHRRRERRF-GRDMETIG-----FAVYEVPPELVGQPAVHL-KRDFFLANASRARSEQF 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN . ::: : .: :: :..::::: . :.:.:: :: XP_006 INL-------REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH XP_006 NLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESC 540 550 560 570 580 590 >>XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calpain- (714 aa) initn: 860 init1: 264 opt: 638 Z-score: 731.7 bits: 145.8 E(85289): 5.1e-34 Smith-Waterman score: 799; 33.1% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (13-487:55-515) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI :::: ::: . .:: . ::. : .. : XP_011 ELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLG-PNSSKTYGI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA :.:: :. ..:... : . .. :: :::::.: : :.: . :: .:.: :: :. XP_011 KWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQ-SFQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS . : : : ..::::.::.:..:: :: :.: : . . . :: ::::.::::.:: XP_011 NG-YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAEGNEFWSALLEKAYAKVNGS 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS :: : .:...... :.:::..: ..:. . .. : : :. :.. XP_011 YEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQI------------ILKALERGSLLG 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KE1 CC-----VLSPRAGA-RELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWR : ::. .: . ..: . ::. :. .... . :: . :.:..::::. : : : XP_011 CSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYR-GQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 EGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL ... :..:: ..: ....::::. ..:.::: .: . . .: :.: .. XP_011 DSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDA--LKSRTIRKW 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSE---PSEV---------YIAVL .: :.: .:..:::::: . : ::.: .:..: :.. .:.. XP_011 --NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALM 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 QRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP :. : . . :: .: .. .: . ..:: : . .: :. : XP_011 QKHRRRERRF-GRDMETIG-----FAVYEVPPELVGQPAVHL-KRDFFLANASRARSEQF 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN . ::: : .: :: :..::::: . :.:.:: :: XP_011 INL-------REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH XP_011 NLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESC 540 550 560 570 580 590 >>XP_006715050 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 isof (650 aa) initn: 810 init1: 269 opt: 636 Z-score: 730.0 bits: 145.4 E(85289): 6.4e-34 Smith-Waterman score: 853; 33.9% identity (58.8% similar) in 493 aa overlap (12-487:79-541) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFRED :::.: ::: ::: : ::. : .. .. XP_006 KAKGVGQHDNAQNFGNQSFEELRAACLRKGELFEDPLFPAEPSSLGFKDLG-PNSKNVQN 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ITWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSW :.:.::..: .: .. : .. ::.:::::.: : ..: .:: .:.: :: :. XP_006 ISWQRPKDIINNPLFIMDGISPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQ-SF 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHG ..: : : .:::::.::.:..::::: .: : . ... :: ::::.:::. : XP_006 K-KNYAGIFHFQIWQFGQWVNVVVDDRLPTKNDKLVFVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSG 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 SYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLI ::: : .:.. ..: :.:::.:. ..:. :: . : :. .. . :. XP_006 SYEALSGGSTMEGLEDFTGGVAQSFQLQ----------RPPQNLLRLLRKA--VERSSLM 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 pF1KE1 SCCVLSPRAGARE------LGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLW .: . . : : . ::. :. :.... . :. :.:..::::: :.: : XP_006 GCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDVHYR-GKMETLIRVRNPWGRIEWNGAW 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 REGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGY--PVTEAGHLQSLYT .... : .: . . .:: . ..::::. ..:: .: : . : : .: .: . XP_006 SDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFLNNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYW- 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAAD :: :.: .:.:::::::. : : .::.: . . : .. . : XP_006 -----HTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQFKISLPEGDD--------PEDDAEG 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 WAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRV-LSMPPVAGTACHA . ::. . .: : : . :..:. :. : :. :. : :. . :. XP_006 NVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQDVHLKKEFFTKYQDHG 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 pF1KE1 YD------REVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTT .. ::: . .: :: :. .:::: ..::::::. XP_006 FSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTEKHSESWELDEVNYAEQ 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 PGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQH XP_006 LQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIKFKSFKTKGFGLDACRC 560 570 580 590 600 610 >>XP_006715048 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 isof (724 aa) initn: 810 init1: 269 opt: 636 Z-score: 729.3 bits: 145.4 E(85289): 6.9e-34 Smith-Waterman score: 853; 33.9% identity (58.8% similar) in 493 aa overlap (12-487:79-541) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFRED :::.: ::: ::: : ::. : .. .. XP_006 KAKGVGQHDNAQNFGNQSFEELRAACLRKGELFEDPLFPAEPSSLGFKDLG-PNSKNVQN 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ITWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSW :.:.::..: .: .. : .. ::.:::::.: : ..: .:: .:.: :: :. XP_006 ISWQRPKDIINNPLFIMDGISPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQ-SF 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHG ..: : : .:::::.::.:..::::: .: : . ... :: ::::.:::. : XP_006 K-KNYAGIFHFQIWQFGQWVNVVVDDRLPTKNDKLVFVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSG 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 SYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLI ::: : .:.. ..: :.:::.:. ..:. :: . : :. .. . :. XP_006 SYEALSGGSTMEGLEDFTGGVAQSFQLQ----------RPPQNLLRLLRKA--VERSSLM 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 pF1KE1 SCCVLSPRAGARE------LGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLW .: . . : : . ::. :. :.... . :. :.:..::::: :.: : XP_006 GCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDVHYR-GKMETLIRVRNPWGRIEWNGAW 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 REGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGY--PVTEAGHLQSLYT .... : .: . . .:: . ..::::. ..:: .: : . : : .: .: . XP_006 SDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFLNNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYW- 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAAD :: :.: .:.:::::::. : : .::.: . . : .. . : XP_006 -----HTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQFKISLPEGDD--------PEDDAEG 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 WAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRV-LSMPPVAGTACHA . ::. . .: : : . :..:. :. : :. :. : :. . :. XP_006 NVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQDVHLKKEFFTKYQDHG 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 pF1KE1 YD------REVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTT .. ::: . .: :: :. .:::: ..::::::. XP_006 FSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTEKHSESWELDEVNYAEQ 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 PGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQH XP_006 LQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIKFKSFKTKGFGLDACRC 560 570 580 590 600 610 672 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:18:40 2016 done: Sun Nov 6 23:18:42 2016 Total Scan time: 11.830 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]