Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1368
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1368, 672 aa
  1>>>pF1KE1368 672 - 672 aa - 672 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4484+/-0.000765; mu= 19.2548+/- 0.046
 mean_var=74.7606+/-14.956, 0's: 0 Z-trim(108.8): 26  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.148333
 statistics sampled from 10408 (10431) to 10408 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.32), width:  16
 Scan time:  3.230

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2        ( 672) 4750 1026.0       0
CCDS33420.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2        ( 517) 3167 687.2 1.5e-197
CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1        ( 703)  642 146.9 8.9e-35
CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15          ( 729)  640 146.5 1.2e-34
CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11          ( 714)  638 146.1 1.6e-34
CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6        ( 739)  636 145.7 2.3e-34
CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1           ( 700)  619 142.0 2.7e-33
CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1          ( 690)  570 131.5 3.8e-30
CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19      ( 719)  569 131.3 4.6e-30
CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1           ( 622)  534 123.8 7.3e-28
CCDS46252.1 CAPN13 gene_id:92291|Hs108|chr2        ( 669)  523 121.5   4e-27
CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1         ( 664)  496 115.7 2.2e-25
CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11           ( 640)  490 114.4 5.1e-25
CCDS32207.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15          ( 815)  489 114.2 7.2e-25
CCDS45245.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15          ( 821)  489 114.2 7.3e-25
CCDS46254.1 CAPN14 gene_id:440854|Hs108|chr2       ( 684)  454 106.7 1.1e-22
CCDS10410.1 CAPN15 gene_id:6650|Hs108|chr16        (1086)  455 107.1 1.4e-22
CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX           ( 641)  431 101.8 3.2e-21
CCDS81431.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1         ( 627)  374 89.6 1.5e-17


>>CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2             (672 aa)
 initn: 4750 init1: 4750 opt: 4750  Z-score: 5489.2  bits: 1026.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4750; 99.9% identity (100.0% similar) in 672 aa overlap (1-672:1-672)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 GLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 FLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 NPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPSDTEFHPIGFHIFQVPEGGRSQDAPPLLLQEPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPSDTEFHPIGFHIFQVPEGGRSQDAPPLLLQEPL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF
              610       620       630       640       650       660

              670  
pF1KE1 LQEVSVMAVMKT
       :::::.::::::
CCDS42 LQEVSIMAVMKT
              670  

>>CCDS33420.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2             (517 aa)
 initn: 3064 init1: 3064 opt: 3167  Z-score: 3660.0  bits: 687.2 E(32554): 1.5e-197
Smith-Waterman score: 3339; 76.8% identity (76.9% similar) in 672 aa overlap (1-672:1-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDITWRRPQEICATPRLFPDDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISCCVLSPRAGARELGEFHAF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 GLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGE
       :::::::                                                     
CCDS33 GLHLWKV-----------------------------------------------------
                                                                   

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 FLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPT
                                                                   
CCDS33 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 NPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPSDTEFHPIGFHIFQVPEGGRSQDAPPLLLQEPL
                                                 ::::::::::::::::::
CCDS33 ------------------------------------------PEGGRSQDAPPLLLQEPL
                                                 430       440     

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LSCVPHRYAQEVSRLCLLPAGTYKVVPSTYLPDTEGAFTVTIATRIDRPSIHSQEMLGQF
         450       460       470       480       490       500     

              670  
pF1KE1 LQEVSVMAVMKT
       :::::.::::::
CCDS33 LQEVSIMAVMKT
         510       

>>CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1             (703 aa)
 initn: 702 init1: 272 opt: 642  Z-score: 737.8  bits: 146.9 E(32554): 8.9e-35
Smith-Waterman score: 820; 32.1% identity (59.0% similar) in 505 aa overlap (13-502:45-521)

                                 10        20         30        40 
pF1KE1                   MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI
                                     ::.:  :::  :.: . ::. : .   . :
CCDS73 TQGLGSNQNALKYLGQDFKTLRQQCLDSGVLFKDPEFPACPSALGYKDLG-PGSPQTQGI
           20        30        40        50        60         70   

              50        60        70        80        90       100 
pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA
        :.:: :.: .:...     . .. :: :::::.: : :.:  ...:: .:.:  :    
CCDS73 IWKRPTELCPSPQFIVGGATRTDICQGGLGDCWLLAAIASLTLNEELLYRVVPRDQDF--
            80        90       100       110       120       130   

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS
       ...: : :  ..::.:.::::. :::::   :.: : . .. . ::  ::::.:::..: 
CCDS73 QENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVIDDRLPTKNGQLLFLHSEQGNEFWSALLEKAYAKLNGC
             140       150       160       170       180       190 

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS
       :: : .:...... :.:::..: ..::   ..  :  : .      :   : :  .  .:
CCDS73 YEALAGGSTVEGFEDFTGGISEFYDLKKPPANLYQIIRKA-----LCAGSL-LGCSIDVS
             200       210       220       230             240     

             230       240       250       260       270       280 
pF1KE1 CCVLSPRAGARELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGW
         . .    ...: . ::. :. ..:.. : :.   :.:..::::.  :.: : . .  :
CCDS73 SAAEAEAITSQKLVKSHAYSVTGVEEVNFQ-GHPEKLIRLRNPWGEVEWSGAWSDDAPEW
         250       260       270        280       290       300    

             290       300       310       320       330       340 
pF1KE1 SQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRA
       ...:     :: .....::::.   .:.:.:..: .     ..   . ..   :.     
CCDS73 NHIDPRRKEELDKKVEDGEFWMSLSDFVRQFSRLEICNLSPDSLSSEEVHKWNLV----L
          310       320       330       340       350           360

             350       360        370                   380        
pF1KE1 LPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSEPSE------------VYIAVLQRSRLH
       . : :..:..::::.:  . . .::.: .:..: .:            : ....:..:  
CCDS73 FNGHWTRGSTAGGCQNYPATYWTNPQFKIRLDEVDEDQEESIGEPCCTVLLGLMQKNR--
              370       380       390       400       410          

      390       400       410       420       430       440        
pF1KE1 AADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTAC
          :  : :   :    ...  ..: .  . .  :: .           :.. : : :. 
CCDS73 --RW--RKRIGQGMLSIGYAVYQVPKELESHTDAHLGR--------DFFLAYQPSARTST
        420         430       440       450               460      

      450       460       470       480       490        500       
pF1KE1 HAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRV-SLSAIRAVAKNTTPGA
       ..  :::  : .: :: ::.:::::     ::: :::::  .. .:    .:: :     
CCDS73 YVNLREVSGRARLPPGEYLVVPSTFEPFKDGEFCLRVFSEKKAQALEIGDVVAGNPYEPH
        470       480       490       500       510       520      

       510       520       530       540       550       560       
pF1KE1 ALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRP
                                                                   
CCDS73 PSEVDQEDDQFRRLFEKLAGKDSEITANALKILLNEAFSKRTDIKFDGFNINTCREMISL
        530       540       550       560       570       580      

>>CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15               (729 aa)
 initn: 720 init1: 270 opt: 640  Z-score: 735.3  bits: 146.5 E(32554): 1.2e-34
Smith-Waterman score: 806; 34.1% identity (58.8% similar) in 498 aa overlap (13-490:74-530)

                                 10        20        30        40  
pF1KE1                   MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDIT
                                     :. :  ::  ..::: . . :. ::    .
CCDS10 SAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFPPDETSLFYSQKFPI-QF----V
            50        60        70        80        90             

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE1 WRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWAD
       :.:: ::: .::.. :   . .. :: ::::::: : : :  ..::: .:::  : :. .
CCDS10 WKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLNQHLLFRVIPHDQ-SFIE
      100       110       120       130       140       150        

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE1 QEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSY
       . : : :  ..:..:.::.:. :: ::   ..: :.. .... ::  ::::.:::.::::
CCDS10 N-YAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRNEFWSALLEKAYAKLHGSY
        160       170       180       190       200       210      

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE1 EHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISC
       : : .:....:. :.:::.:: ....         : :.   ..  ..   ..   :..:
CCDS10 EALKGGNTTEAMEDFTGGVAEFFEIR---------DAPSDM-YKIMKKA--IERGSLMGC
        220       230       240                 250         260    

              230           240       250       260       270      
pF1KE1 CV--LSPRAGARELG----EFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWRE
        .  . :     ...    . ::. :. : :.  . :. . :.:..::::.  :.: : .
CCDS10 SIDTIIPVQYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVPFK-GEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSD
          270       280       290        300       310       320   

        280       290        300       310       320       330     
pF1KE1 GGEGWSQVDAAVASELLSQLQE-GEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL
         . :: ::    ..:  :. : ::::.  :.:. .: .: .   ...:  :::   ..:
CCDS10 RWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYHFTKLEICNLTADA--LQS---DKL
           330       340       350       360       370             

         340        350        360       370                 380   
pF1KE1 LCHTRAL-PGAWVKGQSAGGCRN-NSGFPSNPKFWLRVSE----P--SEVY----IAVLQ
          : ..  : ::.: :::::::  . : .::.. :.. :    :  :::     .:..:
CCDS10 QTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSEVICSFLVALMQ
      380       390       400       410       420       430        

           390       400        410       420       430       440  
pF1KE1 RSRLHAADWAGRARALVGDSHT-SWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP
       ..:        . : : ..  : ...   .: :....   :: :           :    
CCDS10 KNRR-------KDRKLGASLFTIGFAIYEVP-KEMHGNKQHLQK--------DFFLYNAS
      440              450       460        470               480  

            450       460       470       480       490       500  
pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN
        : .  .   :::  : .: :. :. ::::.     :::.:::::  :            
CCDS10 KARSKTYINMREVSQRFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLSEEVENTISV
            490       500       510       520       530       540  

            510       520       530       540       550       560  
pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH
                                                                   
CCDS10 DRPVPQPGSSDQESEEQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHKDLKTHGFTL
            550       560       570       580       590       600  

>>CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11               (714 aa)
 initn: 860 init1: 264 opt: 638  Z-score: 733.1  bits: 146.1 E(32554): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 799; 33.1% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (13-487:55-515)

                                 10        20         30        40 
pF1KE1                   MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI
                                     :::: ::: . .:: . ::. : ..    :
CCDS44 ELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLG-PNSSKTYGI
           30        40        50        60        70         80   

              50        60        70        80        90       100 
pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA
        :.:: :. ..:... :   . .. :: :::::.: : :.:  .  :: .:.: :: :. 
CCDS44 KWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQ-SFQ
            90       100       110       120       130        140  

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS
       .  : : :  ..::::.::.:..:: ::   :.: : .  . . ::  ::::.::::.::
CCDS44 NG-YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAEGNEFWSALLEKAYAKVNGS
             150       160       170       180       190       200 

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS
       :: : .:...... :.:::..: ..:. . ..  :              :  :.   :..
CCDS44 YEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQI------------ILKALERGSLLG
             210       220       230                   240         

                  230        240       250       260       270     
pF1KE1 CC-----VLSPRAGA-RELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWR
       :      ::. .: . ..: . ::. :.  .... . :: . :.:..::::.  : : : 
CCDS44 CSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYR-GQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS
     250       260       270       280        290       300        

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE1 EGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL
       ...  :..::    ..:  ....::::.  ..:.::: .: .   . .:  :.:   .. 
CCDS44 DSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDA--LKSRTIRKW
      310       320       330       340       350         360      

         340       350       360        370                   380  
pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSE---PSEV---------YIAVL
         .:    :.: .:..::::::  . :  ::.: .:..:   :..           .:..
CCDS44 --NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALM
          370       380       390       400       410       420    

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE1 QRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP
       :. : .   . ::    .:     ..   .: .     ..:: : .   .:  :. :   
CCDS44 QKHRRRERRF-GRDMETIG-----FAVYEVPPELVGQPAVHL-KRDFFLANASRARSEQF
          430        440            450       460        470       

            450       460       470       480       490       500  
pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN
       .         :::  : .: :: :..:::::  .  :.:.:: ::               
CCDS44 INL-------REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQA
       480              490       500       510       520       530

            510       520       530       540       550       560  
pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH
                                                                   
CCDS44 NLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESC
              540       550       560       570       580       590

>>CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6             (739 aa)
 initn: 810 init1: 269 opt: 636  Z-score: 730.5  bits: 145.7 E(32554): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 853; 33.9% identity (58.8% similar) in 493 aa overlap (12-487:78-540)

                                  10        20         30        40
pF1KE1                    MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFRED
                                     :::.:  :::  ::: : ::. : ..  ..
CCDS47 KAKGVGQHDNAQNFGNQSFEELRAACLRKGELFEDPLFPAEPSSLGFKDLG-PNSKNVQN
        50        60        70        80        90        100      

               50        60        70        80        90       100
pF1KE1 ITWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSW
       :.:.::..:  .: .. :     .. ::.:::::.: : ..:    .:: .:.: :: :.
CCDS47 ISWQRPKDIINNPLFIMDGISPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQ-SF
        110       120       130       140       150       160      

              110       120       130       140       150       160
pF1KE1 ADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHG
         ..: : :  .:::::.::.:..:::::    .: : .  ... ::  ::::.:::. :
CCDS47 K-KNYAGIFHFQIWQFGQWVNVVVDDRLPTKNDKLVFVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSG
          170       180       190       200       210       220    

              170       180       190       200       210       220
pF1KE1 SYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLI
       ::: : .:.. ..: :.:::.:. ..:.          :: .   :  :.   .. . :.
CCDS47 SYEALSGGSTMEGLEDFTGGVAQSFQLQ----------RPPQNLLRLLRKA--VERSSLM
          230       240       250                 260         270  

              230             240       250       260       270    
pF1KE1 SCCVLSPRAGARE------LGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLW
       .: .     .  :      : . ::. :. :.... . :.   :.:..:::::  :.: :
CCDS47 GCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDVHYR-GKMETLIRVRNPWGRIEWNGAW
            280       290       300        310       320       330 

          280       290       300       310         320       330  
pF1KE1 REGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGY--PVTEAGHLQSLYT
        .... : .: . .  .:: . ..::::.  ..:: .:  : .    : : .:  .: . 
CCDS47 SDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFLNNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYW-
             340       350       360       370       380       390 

            340       350       360        370       380       390 
pF1KE1 ERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAAD
            ::    :.: .:.:::::::. : : .::.: . . : ..         .  :  
CCDS47 -----HTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQFKISLPEGDD--------PEDDAEG
                   400       410       420       430               

             400       410       420       430        440       450
pF1KE1 WAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRV-LSMPPVAGTACHA
        .     ::.  . .:  :   : . :..:. :. : :.  :.  : :.    .    :.
CCDS47 NVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQDVHLKKEFFTKYQDHG
       440       450       460       470       480       490       

                    460       470       480       490       500    
pF1KE1 YD------REVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTT
       ..      :::  . .: :: :. .::::     ..::::::.                 
CCDS47 FSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTEKHSESWELDEVNYAEQ
       500       510       520       530       540       550       

          510       520       530       540       550       560    
pF1KE1 PGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQH
                                                                   
CCDS47 LQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIKFKSFKTKGFGLDACRC
       560       570       580       590       600       610       

>>CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1                (700 aa)
 initn: 880 init1: 269 opt: 619  Z-score: 711.2  bits: 142.0 E(32554): 2.7e-33
Smith-Waterman score: 786; 31.1% identity (57.9% similar) in 501 aa overlap (10-496:42-512)

                                    10        20         30        
pF1KE1                      MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFR
                                     :  ::.: .:::  :.: : .:. : ..  
CCDS31 REAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGFKELG-PYSSKT
              20        30        40        50        60         70

       40        50        60        70        80        90        
pF1KE1 EDITWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQP
       . : :.:: :::: :...     . .. :: :::::.: : :.:  ....: .:.: .: 
CCDS31 RGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEILARVVPLNQS
               80        90       100       110       120       130

      100       110       120       130       140       150        
pF1KE1 SWADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKV
          ...: : :  ..::.:.::::..:::::   :.: : .  . . ::  ::::.:::.
CCDS31 F--QENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKI
                140       150       160       170       180        

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE1 HGSYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQC
       .: :: : .: ..... :.:::.:: ..::          .:     .  .. :  .   
CCDS31 NGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELK----------KPPPNLFKIIQKAL--QKGS
      190       200       210                 220       230        

      220       230             240       250       260       270  
pF1KE1 LISCCVLSPRAGARELGEF------HAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQG
       :..: .    :.  :   :      ::. :.  .:.... :.   :.::.::::.  : :
CCDS31 LLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESN-GSLQKLIRIRNPWGEVEWTG
        240       250       260       270        280       290     

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE1 LWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYT
        : ..  .:. .:     .:  . ..::::.   .:::....: .   .:     .. : 
CCDS31 RWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICN-LTPDTLTSDTYK
         300       310       320       330       340        350    

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE1 ERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSGFPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADW
       .  : .   . : : .:..::::::   .:..  ::.   .:.  :.  :..      : 
CCDS31 KWKLTK---MDGNWRRGSTAGGCRN---YPNT--FWM---NPQ--YLIKLEEEDEDEEDG
          360          370          380              390       400 

            400       410       420       430            440       
pF1KE1 AGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKR-----RVNLPRVLSMPPVAGTA
        .    :::  .         :. ....:. ...: ..      ..: . . .   :   
CCDS31 ESGCTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARER
             410       420       430       440       450       460 

       450         460       470       480       490       500     
pF1KE1 CHAYD--REVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTP
         ..   :::  : .: :: :. :::::  .  :.: .::::  ... .:.         
CCDS31 SDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLE
             470       480       490       500       510       520 

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE1 GAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHC
                                                                   
CCDS31 EFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMV
             530       540       550       560       570       580 

>>CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1               (690 aa)
 initn: 727 init1: 255 opt: 570  Z-score: 654.6  bits: 131.5 E(32554): 3.8e-30
Smith-Waterman score: 733; 32.3% identity (57.1% similar) in 489 aa overlap (13-487:42-487)

                                 10        20        30        40  
pF1KE1                   MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDIT
                                     ::.:: :::..:::: .   :   :    .
CCDS15 AHPVPKDARITHSSGQSFEQMRQECLQRGTLFEDADFPASNSSLFYS-ERPQIPF----V
              20        30        40        50         60          

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE1 WRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWAD
       :.:: ::  .:...     . .. :: :::::.: : :.:  ... : .:::  : :.. 
CCDS15 WKRPGEIVKNPEFILGGATRTDICQGELGDCWLLAAIASLTLNQKALARVIPQDQ-SFGP
         70        80        90       100       110       120      

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE1 QEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSY
         : : :  ..:: ..:..:. ::::: .  :: : .   .. ::  ::::.:::..:::
CCDS15 G-YAGIFHFQFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSADHNEFWSALLEKAYAKLNGSY
          130       140       150       160       170       180    

            170       180       190       200       210       220  
pF1KE1 EHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISC
       : : .:.. .:. :.:::.:: .. :         . :  . .   . :   :   :..:
CCDS15 EALKGGSAIEAMEDFTGGVAETFQTK---------EAPENFYEILEKAL---KRGSLLGC
          190       200       210                220          230  

            230             240       250       260       270      
pF1KE1 CVLSPRAGARE------LGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWRE
        . .  :.  :      : . ::. :. . ... . :: : :.::.::::.  :.: : .
CCDS15 FIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVSFR-GQRIELIRIRNPWGQVEWNGSWSD
            240       250       260        270       280       290 

        280       290        300       310       320       330     
pF1KE1 GGEGWSQVDAAVASELL-SQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL
       ..  : .:  :  ..:  . :..::::.  ..:  .::.. .   . .: . ....  ..
CCDS15 SSPEWRSVGPAEQKRLCHTALDDGEFWMAFKDFKAHFDKVEICNLTPDALEEDAIHKWEV
             300       310       320       330       340       350 

         340       350        360       370             380        
pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNN-SGFPSNPKFWLRVSEPSE------VYIAVLQRSRLH
         :     :.::.:..::::::  . : .::.. : ..: .:        .:..:..: .
CCDS15 TVHQ----GSWVRGSTAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDEGQEECSFLVALMQKDRRK
                 360       370       380       390       400       

      390       400       410       420       430       440        
pF1KE1 AADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTAC
          . :     .:     ..    : :       :: : .  : .  :. :   .     
CCDS15 LKRF-GANVLTIG-----YAIYECPDKDE-----HLNK-DFFRYHASRARSKTFINL---
       410             420       430             440       450     

      450       460       470       480       490       500        
pF1KE1 HAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAA
           :::  : .: :: :. .::::     ..: ::.::                     
CCDS15 ----REVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPP
                460       470       480       490       500        

      510       520       530       540       550       560        
pF1KE1 LPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPS
                                                                   
CCDS15 KPTPPDQETEEEQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQKKKDIKFKKLSLISCKN
      510       520       530       540       550       560        

>>CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19           (719 aa)
 initn: 816 init1: 294 opt: 569  Z-score: 653.2  bits: 131.3 E(32554): 4.6e-30
Smith-Waterman score: 860; 32.8% identity (57.7% similar) in 537 aa overlap (13-519:45-555)

                                 10        20        30        40  
pF1KE1                   MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDIT
                                     ::::  :::. ..:  :   : ..  . . 
CCDS12 EEAGVGAGRLQLFRGQSYEAIRAACLDSGILFRDPYFPAGPDALGYDQLGPDSEKAKGVK
           20        30        40        50        60        70    

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE1 WRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWAD
       : ::.:.:: :... .:  . .: :: ::.:::: : :.:    .:: .:.::::    .
CCDS12 WMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLAAAASLTLYPRLLRRVVPPGQD--FQ
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pF1KE1 QEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSY
       . : : :  ..::::::..:..:::::   :.: : : .... :: :::::.:::.::::
CCDS12 HGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVRSEQRNEFWAPLLEKAYAKLHGSY
            140       150       160       170       180       190  

            170       180       190       200       210        220 
pF1KE1 EHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLH-LKDQCLIS
       : . .:.. .:.::.:::..:   :.        :.  : .       : : :  . :..
CCDS12 EVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLR--------QNSMGLFS-----ALRHALAKESLVG
            200       210               220            230         

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pF1KE1 CCVLSPRAGAR-ELG--EFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGG
         .:: :.  : : :  . ::. ..  ...     . . :::..::::   : : : .. 
CCDS12 ATALSDRGEYRTEEGLVKGHAYSITGTHKVFLGFTK-VRLLRLRNPWGCVEWTGAWSDSC
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pF1KE1 EGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCH
         :. . .   . :: . ..::::.: ..:: .:: . .    . . .. .   :    :
CCDS12 PRWDTLPTECRDALLVKKEDGEFWMELRDFLLHFDTVQI---CSLSPEVLGPSPEGGGWH
      300       310       320       330          340       350     

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pF1KE1 TRALPGAWVKGQSAGGCRNNS-GFPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRAR
       .... : ::.: ..:: . :.  : .::.: : . ::.:      . .. . . :.: . 
CCDS12 VHTFQGRWVRGFNSGGSQPNAETFWTNPQFRLTLLEPDE------EDDEDEEGPWGGWGA
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pF1KE1 ALV-GDSHTSWSPASI---------------PGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNL---PRVL
       : . : .. . .:                   :  : .::.:.... .. ..:   ::  
CCDS12 AGARGPARGGRTPKCTVLLSLIQRNRRRLRAKGLTYLTVGFHVFQIPEELLGLWDSPRSH
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pF1KE1 SMPPV---AGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGR---VS
       .. :    :  .  .  :.:  :: : ::.::.::::      ..: :::::  :   : 
CCDS12 ALLPRLLRADRSPLSARRDVTRRCCLRPGHYLVVPSTAHAGDEADFTLRVFSERRHTAVE
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pF1KE1 LSAIRAVAKNTTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGP
       .. . ..  ..  :  ::  : :  ::                                 
CCDS12 IDDVISADLQSLQGPYLPL-ELGLEQLFQELAGEEEELNASQLQALLSIALEPARAHTST
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                                     :::: :...     . .. :: :::::.: 
CCDS53                              MEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
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pF1KE1 ACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCF
       : :.:  ....: .:.: .:    ...: : :  ..::.:.::::..:::::   :.: :
CCDS53 AIASLTLNEEILARVVPLNQSF--QENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLF
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pF1KE1 SRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQ
        .  . . ::  ::::.:::..: :: : .: ..... :.:::.:: ..::         
CCDS53 VHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELK---------
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        .:     .  ..   :.   :..: .    :.  :   :      ::. :.  .:....
CCDS53 -KPPPNLFKIIQKA--LQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESN
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pF1KE1 AGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLRE
        :.   :.::.::::.  : : : ..  .:. .:     .:  . ..::::.   .:::.
CCDS53 -GSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRH
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pF1KE1 FDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSGFPSNPKFWLRV
       ...: .   .:     .. : .  : .   . : : .:..::::::   .:..  ::.  
CCDS53 YSRLEICN-LTPDTLTSDTYKKWKLTK---MDGNWRRGSTAGGCRN---YPNT--FWM--
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pF1KE1 SEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKR-
        .:.  :.  :..      :  .    :::  .         :. ....:. ...: .. 
CCDS53 -NPQ--YLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEEL
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            ..: . . .   :     ..   :::  : .: :: :. :::::  .  :.: .:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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