FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1368, 672 aa 1>>>pF1KE1368 672 - 672 aa - 672 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4484+/-0.000765; mu= 19.2548+/- 0.046 mean_var=74.7606+/-14.956, 0's: 0 Z-trim(108.8): 26 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.148333 statistics sampled from 10408 (10431) to 10408 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16 Scan time: 3.230 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 672) 4750 1026.0 0 CCDS33420.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 517) 3167 687.2 1.5e-197 CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1 ( 703) 642 146.9 8.9e-35 CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 729) 640 146.5 1.2e-34 CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 ( 714) 638 146.1 1.6e-34 CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6 ( 739) 636 145.7 2.3e-34 CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 700) 619 142.0 2.7e-33 CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 690) 570 131.5 3.8e-30 CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19 ( 719) 569 131.3 4.6e-30 CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 622) 534 123.8 7.3e-28 CCDS46252.1 CAPN13 gene_id:92291|Hs108|chr2 ( 669) 523 121.5 4e-27 CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 664) 496 115.7 2.2e-25 CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11 ( 640) 490 114.4 5.1e-25 CCDS32207.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 815) 489 114.2 7.2e-25 CCDS45245.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 821) 489 114.2 7.3e-25 CCDS46254.1 CAPN14 gene_id:440854|Hs108|chr2 ( 684) 454 106.7 1.1e-22 CCDS10410.1 CAPN15 gene_id:6650|Hs108|chr16 (1086) 455 107.1 1.4e-22 CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX ( 641) 431 101.8 3.2e-21 CCDS81431.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 627) 374 89.6 1.5e-17 >>CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 (672 aa) initn: 4750 init1: 4750 opt: 4750 Z-score: 5489.2 bits: 1026.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4750; 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CCDS73 NHIDPRRKEELDKKVEDGEFWMSLSDFVRQFSRLEICNLSPDSLSSEEVHKWNLV----L 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 pF1KE1 LPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSEPSE------------VYIAVLQRSRLH . : :..:..::::.: . . .::.: .:..: .: : ....:..: CCDS73 FNGHWTRGSTAGGCQNYPATYWTNPQFKIRLDEVDEDQEESIGEPCCTVLLGLMQKNR-- 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 AADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTAC : : : : ... ..: . . . :: . :.. : : :. CCDS73 --RW--RKRIGQGMLSIGYAVYQVPKELESHTDAHLGR--------DFFLAYQPSARTST 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 HAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRV-SLSAIRAVAKNTTPGA .. ::: : .: :: ::.::::: ::: ::::: .. .: .:: : CCDS73 YVNLREVSGRARLPPGEYLVVPSTFEPFKDGEFCLRVFSEKKAQALEIGDVVAGNPYEPH 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 ALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRP CCDS73 PSEVDQEDDQFRRLFEKLAGKDSEITANALKILLNEAFSKRTDIKFDGFNINTCREMISL 530 540 550 560 570 580 >>CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 (729 aa) initn: 720 init1: 270 opt: 640 Z-score: 735.3 bits: 146.5 E(32554): 1.2e-34 Smith-Waterman score: 806; 34.1% identity (58.8% similar) in 498 aa overlap (13-490:74-530) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDIT :. : :: ..::: . . :. :: . CCDS10 SAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFPPDETSLFYSQKFPI-QF----V 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 WRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWAD :.:: ::: .::.. : . .. :: ::::::: : : : ..::: .::: : :. . CCDS10 WKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLNQHLLFRVIPHDQ-SFIE 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 QEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSY . : : : ..:..:.::.:. :: :: ..: :.. .... :: ::::.:::.:::: CCDS10 N-YAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRNEFWSALLEKAYAKLHGSY 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 EHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISC : : .:....:. :.:::.:: .... : :. .. .. .. :..: CCDS10 EALKGGNTTEAMEDFTGGVAEFFEIR---------DAPSDM-YKIMKKA--IERGSLMGC 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 pF1KE1 CV--LSPRAGARELG----EFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWRE . . : ... . ::. :. : :. . :. . :.:..::::. :.: : . CCDS10 SIDTIIPVQYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVPFK-GEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSD 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 GGEGWSQVDAAVASELLSQLQE-GEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL . :: :: ..: :. : ::::. :.:. .: .: . ...: ::: ..: CCDS10 RWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYHFTKLEICNLTADA--LQS---DKL 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRAL-PGAWVKGQSAGGCRN-NSGFPSNPKFWLRVSE----P--SEVY----IAVLQ : .. : ::.: ::::::: . : .::.. :.. : : ::: .:..: CCDS10 QTWTVSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSEVICSFLVALMQ 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 RSRLHAADWAGRARALVGDSHT-SWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP ..: . : : .. : ... .: :.... :: : : CCDS10 KNRR-------KDRKLGASLFTIGFAIYEVP-KEMHGNKQHLQK--------DFFLYNAS 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN : . . ::: : .: :. :. ::::. :::.::::: : CCDS10 KARSKTYINMREVSQRFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLSEEVENTISV 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH CCDS10 DRPVPQPGSSDQESEEQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHKDLKTHGFTL 550 560 570 580 590 600 >>CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 (714 aa) initn: 860 init1: 264 opt: 638 Z-score: 733.1 bits: 146.1 E(32554): 1.6e-34 Smith-Waterman score: 799; 33.1% identity (59.2% similar) in 495 aa overlap (13-487:55-515) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFREDI :::: ::: . .:: . ::. : .. : CCDS44 ELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLG-PNSSKTYGI 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 TWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWA :.:: :. ..:... : . .. :: :::::.: : :.: . :: .:.: :: :. CCDS44 KWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQ-SFQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 DQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGS . : : : ..::::.::.:..:: :: :.: : . . . :: ::::.::::.:: CCDS44 NG-YAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHSAEGNEFWSALLEKAYAKVNGS 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 YEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLIS :: : .:...... :.:::..: ..:. . .. : : :. :.. CCDS44 YEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQI------------ILKALERGSLLG 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KE1 CC-----VLSPRAGA-RELGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWR : ::. .: . ..: . ::. :. .... . :: . :.:..::::. : : : CCDS44 CSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYR-GQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWS 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 EGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL ... :..:: ..: ....::::. ..:.::: .: . . .: :.: .. CCDS44 DSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDA--LKSRTIRKW 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSE---PSEV---------YIAVL .: :.: .:..:::::: . : ::.: .:..: :.. .:.. CCDS44 --NTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALM 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 QRSRLHAADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPP :. : . . :: .: .. .: . ..:: : . .: :. : CCDS44 QKHRRRERRF-GRDMETIG-----FAVYEVPPELVGQPAVHL-KRDFFLANASRARSEQF 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 VAGTACHAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKN . ::: : .: :: :..::::: . :.:.:: :: CCDS44 INL-------REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 TTPGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLH CCDS44 NLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESC 540 550 560 570 580 590 >>CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6 (739 aa) initn: 810 init1: 269 opt: 636 Z-score: 730.5 bits: 145.7 E(32554): 2.3e-34 Smith-Waterman score: 853; 33.9% identity (58.8% similar) in 493 aa overlap (12-487:78-540) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFRED :::.: ::: ::: : ::. : .. .. CCDS47 KAKGVGQHDNAQNFGNQSFEELRAACLRKGELFEDPLFPAEPSSLGFKDLG-PNSKNVQN 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 ITWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSW :.:.::..: .: .. : .. ::.:::::.: : ..: .:: .:.: :: :. CCDS47 ISWQRPKDIINNPLFIMDGISPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQ-SF 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHG ..: : : .:::::.::.:..::::: .: : . ... :: ::::.:::. : CCDS47 K-KNYAGIFHFQIWQFGQWVNVVVDDRLPTKNDKLVFVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSG 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 SYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLI ::: : .:.. ..: :.:::.:. ..:. :: . : :. .. . :. CCDS47 SYEALSGGSTMEGLEDFTGGVAQSFQLQ----------RPPQNLLRLLRKA--VERSSLM 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 pF1KE1 SCCVLSPRAGARE------LGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLW .: . . : : . ::. :. :.... . :. :.:..::::: :.: : CCDS47 GCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDVHYR-GKMETLIRVRNPWGRIEWNGAW 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 REGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGY--PVTEAGHLQSLYT .... : .: . . .:: . ..::::. ..:: .: : . : : .: .: . CCDS47 SDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFLNNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYW- 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSG-FPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAAD :: :.: .:.:::::::. : : .::.: . . : .. . : CCDS47 -----HTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQFKISLPEGDD--------PEDDAEG 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 WAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRV-LSMPPVAGTACHA . ::. . .: : : . :..:. :. : :. :. : :. . :. CCDS47 NVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQDVHLKKEFFTKYQDHG 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 pF1KE1 YD------REVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTT .. ::: . .: :: :. .:::: ..::::::. CCDS47 FSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTEKHSESWELDEVNYAEQ 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 PGAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQH CCDS47 LQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIKFKSFKTKGFGLDACRC 560 570 580 590 600 610 >>CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 (700 aa) initn: 880 init1: 269 opt: 619 Z-score: 711.2 bits: 142.0 E(32554): 2.7e-33 Smith-Waterman score: 786; 31.1% identity (57.9% similar) in 501 aa overlap (10-496:42-512) 10 20 30 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSL-FCDLSTPLAQFR : ::.: .::: :.: : .:. : .. CCDS31 REAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGFKELG-PYSSKT 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 EDITWRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQP . : :.:: :::: :... . .. :: :::::.: : :.: ....: .:.: .: CCDS31 RGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEILARVVPLNQS 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 SWADQEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKV ...: : : ..::.:.::::..::::: :.: : . . . :: ::::.:::. CCDS31 F--QENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKI 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 HGSYEHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQC .: :: : .: ..... :.:::.:: ..:: .: . .. : . CCDS31 NGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELK----------KPPPNLFKIIQKAL--QKGS 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 LISCCVLSPRAGARELGEF------HAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQG :..: . :. : : ::. :. .:.... :. :.::.::::. : : CCDS31 LLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESN-GSLQKLIRIRNPWGEVEWTG 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 LWREGGEGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYT : .. .:. .: .: . ..::::. .:::....: . .: .. : CCDS31 RWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICN-LTPDTLTSDTYK 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ERLLCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNNSGFPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADW . : . . : : .:..:::::: .:.. ::. .:. :. :.. : CCDS31 KWKLTK---MDGNWRRGSTAGGCRN---YPNT--FWM---NPQ--YLIKLEEEDEDEEDG 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 pF1KE1 AGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKR-----RVNLPRVLSMPPVAGTA . ::: . :. ....:. ...: .. ..: . . . : CCDS31 ESGCTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARER 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 CHAYD--REVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTP .. ::: : .: :: :. ::::: . :.: .:::: ... .:. CCDS31 SDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLE 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 GAALPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHC CCDS31 EFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMV 530 540 550 560 570 580 >>CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 (690 aa) initn: 727 init1: 255 opt: 570 Z-score: 654.6 bits: 131.5 E(32554): 3.8e-30 Smith-Waterman score: 733; 32.3% identity (57.1% similar) in 489 aa overlap (13-487:42-487) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDIT ::.:: :::..:::: . : : . CCDS15 AHPVPKDARITHSSGQSFEQMRQECLQRGTLFEDADFPASNSSLFYS-ERPQIPF----V 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 WRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWAD :.:: :: .:... . .. :: :::::.: : :.: ... : .::: : :.. CCDS15 WKRPGEIVKNPEFILGGATRTDICQGELGDCWLLAAIASLTLNQKALARVIPQDQ-SFGP 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 QEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSY : : : ..:: ..:..:. ::::: . :: : . .. :: ::::.:::..::: CCDS15 G-YAGIFHFQFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSADHNEFWSALLEKAYAKLNGSY 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 EHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLHLKDQCLISC : : .:.. .:. :.:::.:: .. : . : . . . : : :..: CCDS15 EALKGGSAIEAMEDFTGGVAETFQTK---------EAPENFYEILEKAL---KRGSLLGC 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE1 CVLSPRAGARE------LGEFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWRE . . :. : : . ::. :. . ... . :: : :.::.::::. :.: : . CCDS15 FIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVSFR-GQRIELIRIRNPWGQVEWNGSWSD 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 GGEGWSQVDAAVASELL-SQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERL .. : .: : ..: . :..::::. ..: .::.. . . .: . .... .. CCDS15 SSPEWRSVGPAEQKRLCHTALDDGEFWMAFKDFKAHFDKVEICNLTPDALEEDAIHKWEV 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 pF1KE1 LCHTRALPGAWVKGQSAGGCRNN-SGFPSNPKFWLRVSEPSE------VYIAVLQRSRLH : :.::.:..:::::: . : .::.. : ..: .: .:..:..: . CCDS15 TVHQ----GSWVRGSTAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDEGQEECSFLVALMQKDRRK 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 AADWAGRARALVGDSHTSWSPASIPGKHYQAVGLHLWKVEKRRVNLPRVLSMPPVAGTAC . : .: .. : : :: : . : . :. : . CCDS15 LKRF-GANVLTIG-----YAIYECPDKDE-----HLNK-DFFRYHASRARSKTFINL--- 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 HAYDREVHLRCELSPGYYLAVPSTFLKDAPGEFLLRVFSTGRVSLSAIRAVAKNTTPGAA ::: : .: :: :. .:::: ..: ::.:: CCDS15 ----REVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPP 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 LPAGEWGTVQLRGSWRVGQTAGGSRNFASYPTNPCFPFSVPEGPGPRCVRITLHQHCRPS CCDS15 KPTPPDQETEEEQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQKKKDIKFKKLSLISCKN 510 520 530 540 550 560 >>CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19 (719 aa) initn: 816 init1: 294 opt: 569 Z-score: 653.2 bits: 131.3 E(32554): 4.6e-30 Smith-Waterman score: 860; 32.8% identity (57.7% similar) in 537 aa overlap (13-519:45-555) 10 20 30 40 pF1KE1 MRAGRGATPARELFRDAAFPAADSSLFCDLSTPLAQFREDIT :::: :::. ..: : : .. . . CCDS12 EEAGVGAGRLQLFRGQSYEAIRAACLDSGILFRDPYFPAGPDALGYDQLGPDSEKAKGVK 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 WRRPQEICATPRLFPDDPREGQVKQGLLGDCWFLCACAALQKSRHLLDQVIPPGQPSWAD : ::.:.:: :... .: . .: :: ::.:::: : :.: .:: .:.:::: . CCDS12 WMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLAAAASLTLYPRLLRRVVPPGQD--FQ 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 QEYRGSFTCRIWQFGRWVEVTTDDRLPCLAGRLCFSRCQREDVFWLPLLEKVYAKVHGSY . : : : ..::::::..:..::::: :.: : : .... :: :::::.:::.:::: CCDS12 HGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVRSEQRNEFWAPLLEKAYAKLHGSY 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 EHLWAGQVADALVDLTGGLAERWNLKGVAGSGGQQDRPGRWEHRTCRQLLH-LKDQCLIS : . .:.. .:.::.:::..: :. :. : . : : : . :.. CCDS12 EVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLR--------QNSMGLFS-----ALRHALAKESLVG 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE1 CCVLSPRAGAR-ELG--EFHAFIVSDLRELQGQAGQCILLLRIQNPWGRRCWQGLWREGG .:: :. : : : . ::. .. ... . . :::..:::: : : : .. CCDS12 ATALSDRGEYRTEEGLVKGHAYSITGTHKVFLGFTK-VRLLRLRNPWGCVEWTGAWSDSC 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 EGWSQVDAAVASELLSQLQEGEFWVEEEEFLREFDELTVGYPVTEAGHLQSLYTERLLCH :. . . . :: . ..::::.: ..:: .:: . . . . .. . : : CCDS12 PRWDTLPTECRDALLVKKEDGEFWMELRDFLLHFDTVQI---CSLSPEVLGPSPEGGGWH 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 TRALPGAWVKGQSAGGCRNNS-GFPSNPKFWLRVSEPSEVYIAVLQRSRLHAADWAGRAR .... : ::.: ..:: . :. : .::.: : . ::.: . .. . . :.: . 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