Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1431
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1431, 764 aa
  1>>>pF1KE1431 764 - 764 aa - 764 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8827+/-0.00104; mu= 17.6237+/- 0.063
 mean_var=106.6322+/-21.871, 0's: 0 Z-trim(106.2): 168  B-trim: 216 in 1/49
 Lambda= 0.124202
 statistics sampled from 8630 (8844) to 8630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.272), width:  16
 Scan time:  3.200

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4729.1 CFB gene_id:629|Hs108|chr6              ( 764) 5255 953.3       0
CCDS4728.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6               ( 752) 1846 342.5 1.5e-93
CCDS54991.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6              ( 620) 1434 268.6 2.2e-71
CCDS75428.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6              ( 506) 1099 208.5 2.2e-53
CCDS75427.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6              ( 328)  752 146.1 8.3e-35


>>CCDS4729.1 CFB gene_id:629|Hs108|chr6                   (764 aa)
 initn: 5255 init1: 5255 opt: 5255  Z-score: 5094.2  bits: 953.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5255; 99.9% identity (99.9% similar) in 764 aa overlap (1-764:1-764)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MGSNLSPQLCLMPFILGLLSGGVTTTPWSLAWPQGSCSLEGVEIKGGSFRLLQEGQALEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGSNLSPQLCLMPFILGLLSGGVTTTPWSLARPQGSCSLEGVEIKGGSFRLLQEGQALEY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 VCPSGFYPYPVQTRTCRSTGSWSTLKTQDQKTVRKAECRAIHCPRPHDFENGEYWPRSPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VCPSGFYPYPVQTRTCRSTGSWSTLKTQDQKTVRKAECRAIHCPRPHDFENGEYWPRSPY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 YNVSDEISFHCYDGYTLRGSANRTCQVNGRWSGQTAICDNGAGYCSNPGIPIGTRKVGSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YNVSDEISFHCYDGYTLRGSANRTCQVNGRWSGQTAICDNGAGYCSNPGIPIGTRKVGSQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 YRLEDSVTYHCSRGLTLRGSQRRTCQEGGSWSGTEPSCQDSFMYDTPQEVAEAFLSSLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YRLEDSVTYHCSRGLTLRGSQRRTCQEGGSWSGTEPSCQDSFMYDTPQEVAEAFLSSLTE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 TIEGVDAEDGHGPGEQQKRKIVLDPSGSMNIYLVLDGSDSIGASNFTGAKKCLVNLIEKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TIEGVDAEDGHGPGEQQKRKIVLDPSGSMNIYLVLDGSDSIGASNFTGAKKCLVNLIEKV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 ASYGVKPRYGLVTYATYPKIWVKVSEADSSNADWVTKQLNEINYEDHKLKSGTNTKKALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASYGVKPRYGLVTYATYPKIWVKVSEADSSNADWVTKQLNEINYEDHKLKSGTNTKKALQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 AVYSMMSWPDDVPPEGWNRTRHVIILMTDGLHNMGGDPITVIDEIRDLLYIGKDRKNPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AVYSMMSWPDDVPPEGWNRTRHVIILMTDGLHNMGGDPITVIDEIRDLLYIGKDRKNPRE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 DYLDVYVFGVGPLVNQVNINALASKKDNEQHVFKVKDMENLEDVFYQMIDESQSLSLCGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DYLDVYVFGVGPLVNQVNINALASKKDNEQHVFKVKDMENLEDVFYQMIDESQSLSLCGM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 VWEHRKGTDYHKQPWQAKISVIRPSKGHESCMGAVVSEYFVLTAAHCFTVDDKEHSIKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VWEHRKGTDYHKQPWQAKISVIRPSKGHESCMGAVVSEYFVLTAAHCFTVDDKEHSIKVS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 VGGEKRDLEIEVVLFHPNYNINGKKEAGIPEFYDYDVALIKLKNKLKYGQTIRPICLPCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGGEKRDLEIEVVLFHPNYNINGKKEAGIPEFYDYDVALIKLKNKLKYGQTIRPICLPCT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 EGTTRALRLPPTTTCQQQKEELLPAQDIKALFVSEEEKKLTRKEVYIKNGDKKGSCERDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGTTRALRLPPTTTCQQQKEELLPAQDIKALFVSEEEKKLTRKEVYIKNGDKKGSCERDA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 QYAPGYDKVKDISEVVTPRFLCTGGVSPYADPNTCRGDSGGPLIVHKRSRFIQVGVISWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QYAPGYDKVKDISEVVTPRFLCTGGVSPYADPNTCRGDSGGPLIVHKRSRFIQVGVISWG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760    
pF1KE1 VVDVCKNQKRQKQVPAHARDFHINLFQVLPWLKEKLQDEDLGFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVDVCKNQKRQKQVPAHARDFHINLFQVLPWLKEKLQDEDLGFL
              730       740       750       760    

>>CCDS4728.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6                    (752 aa)
 initn: 1524 init1: 548 opt: 1846  Z-score: 1793.0  bits: 342.5 E(32554): 1.5e-93
Smith-Waterman score: 1846; 39.8% identity (69.6% similar) in 757 aa overlap (30-764:17-750)

               10        20        30        40        50          
pF1KE1 MGSNLSPQLCLMPFILGLLSGGVTTTPWSLAWPQGSCSLEGVEIKGGSFRLLQ---EGQA
                                    ::    ::  ..:.:.::.: : .    :. 
CCDS47              MGPLMVLFCLLFLYPGLADSAPSCP-QNVNISGGTFTLSHGWAPGSL
                            10        20         30        40      

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 LEYVCPSGFYPYPVQTRTCRSTGSWSTLKTQDQKTVRKAECRAIHCPRPHDFENGEYWPR
       : : ::.:.:: :. .: :.:.:.:.:      ... :: :. ..:: : .:::: : ::
CCDS47 LTYSCPQGLYPSPA-SRLCKSSGQWQT--PGATRSLSKAVCKPVRCPAPVSFENGIYTPR
         50        60         70          80        90       100   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE1 SPYYNVSDEISFHCYDGYTLRGSANRTCQVNGRWSGQTAICDNGAGYCSNPGIPIGTRKV
          : :. ..::.: ::. ::::  : :. :: :.:.::.::::::.: :::: .:. ..
CCDS47 LGSYPVGGNVSFECEDGFILRGSPVRQCRPNGMWDGETAVCDNGAGHCPNPGISLGAVRT
           110       120       130       140       150       160   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 GSQYRLEDSVTYHCSRGLTLRGSQRRTCQEGGSWSGTEPSCQDSFMYDTPQEVAEAFLSS
       : ..   :.: :.:: .:.: ::..: :: .: :::::: :.. . :: :..:: :. .:
CCDS47 GFRFGHGDKVRYRCSSNLVLTGSSERECQGNGVWSGTEPICRQPYSYDFPEDVAPALGTS
           170       180       190       200       210       220   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE1 LTETIEGVDAEDGHGPGEQQKRKIVLDPSGSMNIYLVLDGSDSIGASNFTGAKKCLVNLI
       ... . ...    .   :.  ::: .. :: .:.::.:: :.:.. ..:   :.    ..
CCDS47 FSHMLGATNPT--QKTKESLGRKIQIQRSGHLNLYLLLDCSQSVSENDFLIFKESASLMV
           230         240       250       260       270       280 

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE1 EKVASYGVKPRYGLVTYATYPKIWVKVSEADSSNADWVTKQLNEINYEDHKLKSGTNTKK
       ... :. ..   ...:.:. ::. ..: . .: .   : ..:.. ::.::.  .::::  
CCDS47 DRIFSFEINVSVAIITFASEPKVLMSVLNDNSRDMTEVISSLENANYKDHENGTGTNTYA
             290       300       310       320       330       340 

       360       370          380       390       400       410    
pF1KE1 ALQAVYSMMSWPD---DVPPEGWNRTRHVIILMTDGLHNMGGDPITVIDEIRDLLYIGKD
       ::..:: ::.       .   .:.. ::.:::.:::  ::::.: :..:.::..: :.. 
CCDS47 ALNSVYLMMNNQMRLLGMETMAWQEIRHAIILLTDGKSNMGGSPKTAVDHIREILNINQK
             350       360       370       380       390       400 

          420       430        440       450       460       470   
pF1KE1 RKNPREDYLDVYVFGVGPL-VNQVNINALASKKDNEQHVFKVKDMENLEDVFYQMIDESQ
       :    .::::.:..::: : :.  ..: :.::::.:.:.: ..: . :..:: .:.: :.
CCDS47 R----NDYLDIYAIGVGKLDVDWRELNELGSKKDGERHAFILQDTKALHQVFEHMLDVSK
                 410       420       430       440       450       

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE1 -SLSLCGMVWEHRKGTDYHKQPWQAKISVIRPSKGHESCMGAVVSEYFVLTAAHCFTVDD
        . ..::.     ...: .. ::..   .:.: :..:.: ::..:. .::::::::  : 
CCDS47 LTDTICGVGNMSANASDQERTPWHV---TIKP-KSQETCRGALISDQWVLTAAHCFR-DG
       460       470       480           490       500       510   

             540           550       560       570       580       
pF1KE1 KEHSI-KVSVGGEK----RDLEIEVVLFHPNYNINGKKEAGIPEFYDYDVALIKLKNKLK
       ..::. .:.::  :    ... :: ... :.... .::. :: :::  :.::.:: .:.:
CCDS47 NDHSLWRVNVGDPKSQWGKEFLIEKAVISPGFDVFAKKNQGILEFYGDDIALLKLAQKVK
            520       530       540       550       560       570  

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE1 YGQTIRPICLPCTEGTTRALRLPPTTTCQQQKEELLPAQDIKALFVSEEEKKLTRKEVYI
       ..   ::::::::  .. ::: :  .::.....:::  :.. : ::. . .::   .. .
CCDS47 MSTHARPICLPCTMEANLALRRPQGSTCRDHENELLNKQSVPAHFVALNGSKL---NINL
            580       590       600       610       620            

       650        660       670       680       690       700      
pF1KE1 KNGDKKGSC-ERDAQYAPGYDKVKDISEVVTPRFLCTGGVSPYADPNTCRGDSGGPLIVH
       : : .  :: :  .:    . .. :. :::: .:::.:      : . :.:.::: ....
CCDS47 KMGVEWTSCAEVVSQEKTMFPNLTDVREVVTDQFLCSG---TQEDESPCKGESGGAVFLE
     630       640       650       660          670       680      

        710       720            730          740       750        
pF1KE1 KRSRFIQVGVISWGVVDVC-----KNQKRQ---KQVPAHARDFHINLFQVLPWLKEKLQD
       .: ::.:::..:::. . :     ::....   ..::   ::::::::.. :::...: :
CCDS47 RRFRFFQVGLVSWGLYNPCLGSADKNSRKRAPRSKVPP-PRDFHINLFRMQPWLRQHLGD
        690       700       710       720        730       740     

      760      
pF1KE1 EDLGFL  
         :.::  
CCDS47 V-LNFLPL
          750  

>>CCDS54991.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6                   (620 aa)
 initn: 1351 init1: 266 opt: 1434  Z-score: 1395.2  bits: 268.6 E(32554): 2.2e-71
Smith-Waterman score: 1434; 38.6% identity (69.9% similar) in 622 aa overlap (162-764:16-618)

             140       150       160       170       180       190 
pF1KE1 YDGYTLRGSANRTCQVNGRWSGQTAICDNGAGYCSNPGIPIGTRKVGSQYRLEDSVTYHC
                                     ::.: :::: .:. ..: ..   :.: :.:
CCDS54                MGPLMVLFCLLFLYPAGHCPNPGISLGAVRTGFRFGHGDKVRYRC
                              10        20        30        40     

             200       210       220       230       240       250 
pF1KE1 SRGLTLRGSQRRTCQEGGSWSGTEPSCQDSFMYDTPQEVAEAFLSSLTETIEGVDAEDGH
       : .:.: ::..: :: .: :::::: :.. . :: :..:: :. .:... . ...    .
CCDS54 SSNLVLTGSSERECQGNGVWSGTEPICRQPYSYDFPEDVAPALGTSFSHMLGATNPT--Q
          50        60        70        80        90       100     

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE1 GPGEQQKRKIVLDPSGSMNIYLVLDGSDSIGASNFTGAKKCLVNLIEKVASYGVKPRYGL
          :.  ::: .. :: .:.::.:: :.:.. ..:   :.    ..... :. ..   ..
CCDS54 KTKESLGRKIQIQRSGHLNLYLLLDCSQSVSENDFLIFKESASLMVDRIFSFEINVSVAI
           110       120       130       140       150       160   

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE1 VTYATYPKIWVKVSEADSSNADWVTKQLNEINYEDHKLKSGTNTKKALQAVYSMMSWPD-
       .:.:. ::. ..: . .: .   : ..:.. ::.::.  .::::  ::..:: ::.    
CCDS54 ITFASEPKVLMSVLNDNSRDMTEVISSLENANYKDHENGTGTNTYAALNSVYLMMNNQMR
           170       180       190       200       210       220   

                380       390       400       410       420        
pF1KE1 --DVPPEGWNRTRHVIILMTDGLHNMGGDPITVIDEIRDLLYIGKDRKNPREDYLDVYVF
          .   .:.. ::.:::.:::  ::::.: :..:.::..: :.. :    .::::.:..
CCDS54 LLGMETMAWQEIRHAIILLTDGKSNMGGSPKTAVDHIREILNINQKR----NDYLDIYAI
           230       240       250       260       270             

      430        440       450       460       470        480      
pF1KE1 GVGPL-VNQVNINALASKKDNEQHVFKVKDMENLEDVFYQMIDESQ-SLSLCGMVWEHRK
       ::: : :.  ..: :.::::.:.:.: ..: . :..:: .:.: :. . ..::.     .
CCDS54 GVGKLDVDWRELNELGSKKDGERHAFILQDTKALHQVFEHMLDVSKLTDTICGVGNMSAN
     280       290       300       310       320       330         

        490       500       510       520       530        540     
pF1KE1 GTDYHKQPWQAKISVIRPSKGHESCMGAVVSEYFVLTAAHCFTVDDKEHSI-KVSVGGEK
       ..: .. ::..   .:.: :..:.: ::..:. .::::::::  : ..::. .:.::  :
CCDS54 ASDQERTPWHV---TIKP-KSQETCRGALISDQWVLTAAHCFR-DGNDHSLWRVNVGDPK
     340       350           360       370        380       390    

             550       560       570       580       590       600 
pF1KE1 ----RDLEIEVVLFHPNYNINGKKEAGIPEFYDYDVALIKLKNKLKYGQTIRPICLPCTE
           ... :: ... :.... .::. :: :::  :.::.:: .:.:..   :::::::: 
CCDS54 SQWGKEFLIEKAVISPGFDVFAKKNQGILEFYGDDIALLKLAQKVKMSTHARPICLPCTM
          400       410       420       430       440       450    

             610       620       630       640       650        660
pF1KE1 GTTRALRLPPTTTCQQQKEELLPAQDIKALFVSEEEKKLTRKEVYIKNGDKKGSC-ERDA
        .. ::: :  .::.....:::  :.. : ::. . .::.   . .: : .  :: :  .
CCDS54 EANLALRRPQGSTCRDHENELLNKQSVPAHFVALNGSKLN---INLKMGVEWTSCAEVVS
          460       470       480       490          500       510 

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 QYAPGYDKVKDISEVVTPRFLCTGGVSPYADPNTCRGDSGGPLIVHKRSRFIQVGVISWG
       :    . .. :. :::: .:::.:      : . :.:.::: .....: ::.:::..:::
CCDS54 QEKTMFPNLTDVREVVTDQFLCSG---TQEDESPCKGESGGAVFLERRFRFFQVGLVSWG
             520       530          540       550       560        

                   730          740       750       760      
pF1KE1 VVDVC-----KNQKRQ---KQVPAHARDFHINLFQVLPWLKEKLQDEDLGFL  
       . . :     ::....   ..::   ::::::::.. :::...: :  :.::  
CCDS54 LYNPCLGSADKNSRKRAPRSKVPP-PRDFHINLFRMQPWLRQHLGDV-LNFLPL
      570       580       590        600       610        620

>>CCDS75428.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6                   (506 aa)
 initn: 894 init1: 256 opt: 1099  Z-score: 1071.9  bits: 208.5 E(32554): 2.2e-53
Smith-Waterman score: 1099; 39.0% identity (70.0% similar) in 484 aa overlap (300-764:38-504)

     270       280       290       300       310       320         
pF1KE1 NIYLVLDGSDSIGASNFTGAKKCLVNLIEKVASYGVKPRYGLVTYATYPKIWVKVSEADS
                                     . :. ..   ...:.:. ::. ..: . .:
CCDS75 AAPRILCSRGLRSGSARATGSGVERSPSAAIFSFEINVSVAIITFASEPKVLMSVLNDNS
        10        20        30        40        50        60       

     330       340       350       360       370          380      
pF1KE1 SNADWVTKQLNEINYEDHKLKSGTNTKKALQAVYSMMSWPD---DVPPEGWNRTRHVIIL
        .   : ..:.. ::.::.  .::::  ::..:: ::.       .   .:.. ::.:::
CCDS75 RDMTEVISSLENANYKDHENGTGTNTYAALNSVYLMMNNQMRLLGMETMAWQEIRHAIIL
        70        80        90       100       110       120       

        390       400       410       420       430        440     
pF1KE1 MTDGLHNMGGDPITVIDEIRDLLYIGKDRKNPREDYLDVYVFGVGPL-VNQVNINALASK
       .:::  ::::.: :..:.::..: :.. :.    ::::.:..::: : :.  ..: :.::
CCDS75 LTDGKSNMGGSPKTAVDHIREILNINQKRN----DYLDIYAIGVGKLDVDWRELNELGSK
       130       140       150           160       170       180   

         450       460       470        480       490       500    
pF1KE1 KDNEQHVFKVKDMENLEDVFYQMIDESQ-SLSLCGMVWEHRKGTDYHKQPWQAKISVIRP
       ::.:.:.: ..: . :..:: .:.: :. . ..::.     ...: .. ::..   .:.:
CCDS75 KDGERHAFILQDTKALHQVFEHMLDVSKLTDTICGVGNMSANASDQERTPWHV---TIKP
           190       200       210       220       230          240

          510       520       530        540           550         
pF1KE1 SKGHESCMGAVVSEYFVLTAAHCFTVDDKEHSI-KVSVGGEK----RDLEIEVVLFHPNY
        :..:.: ::..:. .::::::::  : ..::. .:.::  :    ... :: ... :..
CCDS75 -KSQETCRGALISDQWVLTAAHCFR-DGNDHSLWRVNVGDPKSQWGKEFLIEKAVISPGF
               250       260        270       280       290        

     560       570       580       590       600       610         
pF1KE1 NINGKKEAGIPEFYDYDVALIKLKNKLKYGQTIRPICLPCTEGTTRALRLPPTTTCQQQK
       .. .::. :: :::  :.::.:: .:.:..   ::::::::  .. ::: :  .::....
CCDS75 DVFAKKNQGILEFYGDDIALLKLAQKVKMSTHARPICLPCTMEANLALRRPQGSTCRDHE
      300       310       320       330       340       350        

     620       630       640       650        660       670        
pF1KE1 EELLPAQDIKALFVSEEEKKLTRKEVYIKNGDKKGSC-ERDAQYAPGYDKVKDISEVVTP
       .:::  :.. : ::. . .::   .. .: : .  :: :  .:    . .. :. :::: 
CCDS75 NELLNKQSVPAHFVALNGSKL---NINLKMGVEWTSCAEVVSQEKTMFPNLTDVREVVTD
      360       370          380       390       400       410     

      680       690       700       710       720            730   
pF1KE1 RFLCTGGVSPYADPNTCRGDSGGPLIVHKRSRFIQVGVISWGVVDVC-----KNQKRQ--
       .:::.:      : . :.:.::: .....: ::.:::..:::. . :     ::....  
CCDS75 QFLCSG---TQEDESPCKGESGGAVFLERRFRFFQVGLVSWGLYNPCLGSADKNSRKRAP
         420          430       440       450       460       470  

              740       750       760      
pF1KE1 -KQVPAHARDFHINLFQVLPWLKEKLQDEDLGFL  
        ..::   ::::::::.. :::...: :  :.::  
CCDS75 RSKVPP-PRDFHINLFRMQPWLRQHLGDV-LNFLPL
             480       490       500       

>>CCDS75427.1 C2 gene_id:717|Hs108|chr6                   (328 aa)
 initn: 840 init1: 543 opt: 752  Z-score: 738.3  bits: 146.1 E(32554): 8.3e-35
Smith-Waterman score: 752; 41.2% identity (69.0% similar) in 274 aa overlap (30-300:17-284)

               10        20        30        40        50          
pF1KE1 MGSNLSPQLCLMPFILGLLSGGVTTTPWSLAWPQGSCSLEGVEIKGGSFRLLQ---EGQA
                                    ::    ::  ..:.:.::.: : .    :. 
CCDS75              MGPLMVLFCLLFLYPGLADSAPSCP-QNVNISGGTFTLSHGWAPGSL
                            10        20         30        40      

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE1 LEYVCPSGFYPYPVQTRTCRSTGSWSTLKTQDQKTVRKAECRAIHCPRPHDFENGEYWPR
       : : ::.:.:: :. .: :.:.:.:.:      ... :: :. ..:: : .:::: : ::
CCDS75 LTYSCPQGLYPSPA-SRLCKSSGQWQT--PGATRSLSKAVCKPVRCPAPVSFENGIYTPR
         50        60         70          80        90       100   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE1 SPYYNVSDEISFHCYDGYTLRGSANRTCQVNGRWSGQTAICDNGAGYCSNPGIPIGTRKV
          : :. ..::.: ::. ::::  : :. :: :.:.::.::::::.: :::: .:. ..
CCDS75 LGSYPVGGNVSFECEDGFILRGSPVRQCRPNGMWDGETAVCDNGAGHCPNPGISLGAVRT
           110       120       130       140       150       160   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 GSQYRLEDSVTYHCSRGLTLRGSQRRTCQEGGSWSGTEPSCQDSFMYDTPQEVAEAFLSS
       : ..   :.: :.:: .:.: ::..: :: .: :::::: :.. . :: :..:: :. .:
CCDS75 GFRFGHGDKVRYRCSSNLVLTGSSERECQGNGVWSGTEPICRQPYSYDFPEDVAPALGTS
           170       180       190       200       210       220   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE1 LTETIEGVDAEDGHGPGEQQKRKIVLDPSGSMNIYLVLDGSDSIGASNFTGAKKCLVNLI
       ... . ...    .   :.  ::: .. :: .:.::.:: :.:.. ..:   :.    ..
CCDS75 FSHMLGATNPT--QKTKESLGRKIQIQRSGHLNLYLLLDCSQSVSENDFLIFKESASLMV
           230         240       250       260       270       280 

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE1 EKVASYGVKPRYGLVTYATYPKIWVKVSEADSSNADWVTKQLNEINYEDHKLKSGTNTKK
       ..:                                                         
CCDS75 DRVRNQESACSRGLPVLTISLCLLPLLRTPLTAHLLQEVFSDYTHAM             
             290       300       310       320                     




764 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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