FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9689, 490 aa 1>>>pF1KE9689 490 - 490 aa - 490 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8731+/-0.000883; mu= 12.5996+/- 0.053 mean_var=133.4589+/-26.437, 0's: 0 Z-trim(111.2): 54 B-trim: 163 in 1/53 Lambda= 0.111020 statistics sampled from 12104 (12157) to 12104 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16 Scan time: 2.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 3283 537.1 1.6e-152 CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 2145 354.9 1.2e-97 CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 898 155.1 1.5e-37 CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 873 151.1 2.3e-36 CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 866 149.8 3.9e-36 CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 845 146.6 5.2e-35 CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 782 136.7 7.9e-32 CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 726 127.6 3.5e-29 CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 726 127.6 3.7e-29 CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 643 114.4 4.5e-25 CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 631 112.3 9.3e-25 CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 593 106.4 1e-22 CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 593 106.4 1.1e-22 CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 593 106.4 1.1e-22 CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 593 106.5 1.2e-22 CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 587 105.5 2.5e-22 CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 556 100.3 4.1e-21 CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 556 100.3 4.2e-21 CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 552 99.6 6.1e-21 CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 552 99.7 7e-21 CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 550 99.3 8.2e-21 CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 543 98.2 1.9e-20 CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 546 98.9 2.1e-20 CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 539 97.9 5.4e-20 CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 539 98.0 7.1e-20 CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 517 94.1 3.4e-19 CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 523 95.4 4.4e-19 CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 505 92.3 1.8e-18 CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 505 92.3 1.9e-18 CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 505 92.3 2e-18 CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 499 91.1 2.3e-18 CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 499 91.2 2.4e-18 CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 484 89.0 2.1e-17 CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 478 88.2 5.6e-17 CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 478 88.2 5.8e-17 CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 437 81.4 3.8e-15 CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 344 66.5 9.7e-11 >>CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 (490 aa) initn: 3283 init1: 3283 opt: 3283 Z-score: 2851.7 bits: 537.1 E(32554): 1.6e-152 Smith-Waterman score: 3283; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 RPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 RPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 FDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 FDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 PTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 PTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADI 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 TNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKY 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 EKWMVEFGSA :::::::::: CCDS31 EKWMVEFGSA 490 >>CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 (491 aa) initn: 2117 init1: 1781 opt: 2145 Z-score: 1866.7 bits: 354.9 E(32554): 1.2e-97 Smith-Waterman score: 2145; 67.9% identity (85.1% similar) in 495 aa overlap (1-489:1-490) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL :.: : .:.: .:::::::::::.:::::::..:.... ::.: .. ::::: ::. CCDS52 MSLLMISENVKLAREYALLGNYDSAMVYYQGVLDQMNKYLYSVKDTYLQQKWQQVWQEIN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV : ..::.:..::::::.:. : . .. .: : . :: :::.:.: : : .. CCDS52 VEAKHVKDIMKTLESFKLDSTP-LKAAQHDLPASEGEVWSMPVPVERRPSPG---PRKRQ 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE9 RPLRKEMAGVGARGPVG-RAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGR--DDKGR--KNMQDGA-S .. . : : . :.: :.... ..: : : : . ..::: :: . .: . CCDS52 SSQYSDPKSHGNRPSTTVRVHR-SSAQNVHNDRGKAVRCREKKEQNKGREEKNKSPAAVT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 DGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFF . : :::..::::::::::::::.:.::...::::::: ::::::.::::::::::.:: CCDS52 EPETNKFDSTGYDKDLVEALERDIISQNPNVRWDDIADLVEAKKLLKEAVVLPMWMPEFF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 KGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFE :::::::::::::::::::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 KGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTLLAKAVATECKTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 MARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMV :::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::. ::::::::::: CCDS52 MARFYSPATIFIDEIDSICSRRGTSEEHEASRRVKAELLVQMDGVGGTSENDDPSKMVMV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 LAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEG :::::::::::::::::::::::::::.:::: :::.:.:::.:: :..: .:::..:: CCDS52 LAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPSAKGREELLRISLRELELADDVDLASIAENMEG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 YSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSA ::::::::::::::::::::::.::.::::: :::::..::.: :::.::::..::::: CCDS52 YSGADITNVCRDASLMAMRRRIEGLTPEEIRNLSKEEMHMPTTMEDFEMALKKVSKSVSA 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 ADLEKYEKWMVEFGSA ::.:.::::. :::: CCDS52 ADIERYEKWIFEFGSC 480 490 >>CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 820 init1: 573 opt: 898 Z-score: 787.5 bits: 155.1 E(32554): 1.5e-37 Smith-Waterman score: 898; 46.5% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (188-489:162-465) 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 ARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAK ..:. .. ::: .::.:.:.:: :. :: CCDS32 LALNTFDHNPDPSERLLKPLSAFIGMNSEMRELAAVVSRDIYLHNPNIKWNDIIGLDAAK 140 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 KLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTL .:..:::: :. .:..: :: ::::.:. ::::::::.::::::::: :::::.:.::. CCDS32 QLVKEAVVYPIRYPQLFTGILSPWKGLLLYGPPGTGKTLLAKAVATECKTTFFNISASTI 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 TSKYRGESEKLVRLLFEMARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTSD--EHEASRRVKSELLIQ .::.::.::::::.:::.::..::.:::.::..:. :.:::.. :::.: :.:.:::.: CCDS32 VSKWRGDSEKLVRVLFELARYHAPSTIFLDELESVMSQRGTASGGEHEGSLRMKTELLVQ 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 MDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINL- :::.. ...: .:.::::.:.::..: :. ::::::: . ::. ..: .. : CCDS32 MDGLA---RSED---LVFVLAASNLPWELDCAMLRRLEKRILVDLPSREARQAMIYHWLP 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 pF1KE9 -----REVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSK : .:: ... .... :::::.:: :::.:.. .:. ...: .. .. . CCDS32 PVSKSRALELHTELEYSVLSQETEGYSGSDIKLVCREAAMRPVRKIFDALENHQSESSDL 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 pF1KE9 EELQMP-VTKGDFELALKKIAKSVSAADL-EKYEKWMVEFGSA ..:. :: .:: .: . :: .: ..: :. :: : CCDS32 PRIQLDIVTTADFLDVLTHTKP--SAKNLAQRYSDWQREFESV 430 440 450 460 >>CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 (437 aa) initn: 562 init1: 332 opt: 873 Z-score: 766.3 bits: 151.1 E(32554): 2.3e-36 Smith-Waterman score: 873; 45.6% identity (72.8% similar) in 320 aa overlap (154-460:71-381) 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 RKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDG ::: :... .:.: .... :.:. :. CCDS45 HAIKYEAHSDKAKESIRAKCVQYLDRAEKLKDY-LRSKEKHGKKPVKENQSEGKGSDSDS 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 AGYD---KDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP : . : : : : .: ..:.:.:.:.: :: ::. :.:::.::. .: .: : : : CCDS45 EGDNPEKKKLQEQLMGAVVMEKPNIRWNDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFPHLFTGKRTP 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 pF1KE9 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECG-TTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFY :.:.:. :::::::..:::::::: . .:::.:::: : ::. :::::::. :::.:: . CCDS45 WRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSVSSSDLMSKWLGESEKLVKNLFELARQH 160 170 180 190 200 210 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 APTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATN :. :::::.::.:. :. .: ::.::.:.:.:.::.:::. :.: . .::.::: CCDS45 KPSIIFIDEVDSLCGSRNE-NESEAARRIKTEFLVQMQGVGN---NNDGT---LVLGATN 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 FPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELD-PDIQLEDIAEKIEGYSGA .:: .: :.:::.::::::::: .::......: . . : .....:.: :::::: CCDS45 IPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEEAARAQMFRLHLGSTPHNLTDANIHELARKTEGYSGA 280 290 300 310 320 330 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 DITNVCRDASLMAMRRRINGLS-------PEEIR-ALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAK ::. . :: ::: :.... . : . .. ..: : . :: CCDS45 DISIIVRD-SLMQPVRKVQSATHFKKVCGPSRTNPSMMIDDLLTPCSPGDPGAMEMTWMD 340 350 360 370 380 390 480 490 pF1KE9 SVSAADLEKYEKWMVEFGSA CCDS45 VPGDKLLEPVVCMSDMLRSLATTRPTVNADDLLKVKKFSEDFGQES 400 410 420 430 >>CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 (311 aa) initn: 1233 init1: 863 opt: 866 Z-score: 762.3 bits: 149.8 E(32554): 3.9e-36 Smith-Waterman score: 1104; 53.4% identity (68.1% similar) in 382 aa overlap (1-382:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIKGKWQQVRQELL :.: : .:.: .:::::::::::.:::::::..:.... ::.: .. ::::: ::. CCDS56 MSLLMISENVKLAREYALLGNYDSAMVYYQGVLDQMNKYLYSVKDTYLQQKWQQVWQEIN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 EEYEQVKSIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREV : ..::.:..::::::.:. : . .. .: : . :: :::.:.: : :. CCDS56 VEAKHVKDIMKTLESFKLDSTP-LKAAQHDLPASEGEVWSMPVPVERRPSPGPRK----- 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 RPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPK : . : :....:::. :.. :.. :. .: CCDS56 ------------RQSSQYSDPKSHGNRPSTT----VRVH------RSSAQNVHND----- 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 FDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRP :. ... .: :. :: : CCDS56 --------------------RGKAVR------CREKKEQN--------------KG--RE 150 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 WKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYA ::::::::::::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS56 EKGVLMVGPPGTGKTLLAKAVATECKTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYS 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 PTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNF :.:::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::. ::::::::::::::::: CCDS56 PATIFIDEIDSICSRRGTSEEHEASRRVKAELLVQMDGVGGTSENDDPSKMVMVLAATNF 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADI :::::::::::::::::::::. CCDS56 PWDIDEALRRRLEKRIYIPLPSGMRP 290 300 310 >>CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 (444 aa) initn: 610 init1: 331 opt: 845 Z-score: 742.0 bits: 146.6 E(32554): 5.2e-35 Smith-Waterman score: 845; 43.0% identity (72.6% similar) in 328 aa overlap (142-460:76-388) 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 QIRRPNREVRPLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQD ....:: . . :. . :.:: : .: CCDS11 KYEAQGDKAKQSIRAKCTEYLDRAEKLKEYLKNKEKKAQKPVKEGQPSPADEKG--NDSD 50 60 70 80 90 100 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 GASDGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMP : .... :. : : . :. :: . :...:.:.: :: ::. :.:::.::. .: CCDS11 GEGESDDPE------KKKLQNQLQGAIVIERPNVKWSDVAGLEGAKEALKEAVILPIKFP 110 120 130 140 150 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 DFFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECG-TTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVR .: : : ::.:.:. :::::::..:::::::: . .:::..::: :.::. :::::::. CCDS11 HLFTGKRTPWRGILLFGPPGTGKSYLAKAVATEANNSTFFSISSSDLVSKWLGESEKLVK 160 170 180 190 200 210 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 LLFEMARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSK ::..:: :. ::::::::.:. : . .: ::.::.:.:.:.::.::: ..:: CCDS11 NLFQLARENKPSIIFIDEIDSLCGSR-SENESEAARRIKTEFLVQMQGVG--VDNDG--- 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 pF1KE9 MVMVLAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELD-PDIQLEDIA ..::.:::.:: .: :.:::.::::::::: ..:: ..:..: .. . . ...... CCDS11 -ILVLGATNIPWVLDSAIRRRFEKRIYIPLPEPHARAAMFKLHLGTTQNSLTEADFRELG 280 290 300 310 320 330 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 EKIEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSK-------EELQMPVTKGDFE .: .:::::::. . ::: .. .:. .. ...:. :. ..: : . :: CCDS11 RKTDGYSGADISIIVRDALMQPVRKVQSATHFKKVRGPSRADPNHLVDDLLTPCSPGDPG 340 350 360 370 380 390 470 480 490 pF1KE9 LALKKIAKSVSAADLEKYEKWMVEFGSA CCDS11 AIEMTWMDVPGDKLLEPVVSMSDMLRSLSNTKPTVNEHDLLKLKKFTEDFGQEG 400 410 420 430 440 >>CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 (674 aa) initn: 725 init1: 428 opt: 782 Z-score: 684.9 bits: 136.7 E(32554): 7.9e-32 Smith-Waterman score: 862; 39.3% identity (66.5% similar) in 397 aa overlap (98-488:302-671) 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 SIVSTLESFKIDKPPDFPVSCQDEPFRDPAVWPPPVPAEHRAPPQIRRPNREVRPLRKEM .: :. :: : . ..: . CCDS55 PILNKACSKTEDNGPKEDSSLPTFKTAKEQLWVDQQKKYHQ--PQ-RASGSSYGGVKKSL 280 290 300 310 320 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 AGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDGAGYD .. .:: .:. : : ..: :... : . ::. : : CCDS55 GASRSRGILGKFVP------PIPKQDG-----GEQNGGMQCKPYGAGPTE-PAHPVDERL 330 340 350 360 370 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 KDL----VEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKG :.: .: . .:....: ..:.::: .: :: ..: :: :: ::.: :.: : :: CCDS55 KNLEPKMIELIMNEIMDHGPPVNWEDIAGVEFAKATIKEIVVWPMLRPDIFTGLRGPPKG 380 390 400 410 420 430 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 VLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYAPTT .:. ::::::::...: .:.. :.:::..:.:.::::. ::.::.:: :: .:: :.. CCDS55 ILLFGPPGTGKTLIGKCIASQSGATFFSISASSLTSKWVGEGEKMVRALFAVARCQQPAV 440 450 460 470 480 490 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 IFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNFPWD ::::::::. :.:: . :::.:::.:.:.:.:.::. . :. ..:..::: : . CCDS55 IFIDEIDSLLSQRGDG-EHESSRRIKTEFLVQLDGATTSSEDR-----ILVVGATNRPQE 500 510 520 530 540 550 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 IDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINL--REVELDPDIQLEDIAEKIEGYSGADIT :::: :::: ::.::::: :..: ... ::: .: . ..:.:... ...::::.: CCDS55 IDEAARRRLVKRLYIPLPEASARKQIV-INLMSKEQCCLSEEEIEQIVQQSDAFSGADMT 560 570 580 590 600 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 NVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKYE ..::.::: .: .:. .: ... .... :.. ::: :.. . ::: ::: :: CCDS55 QLCREASLGPIR----SLQTADIATITPDQVR-PIAYIDFENAFRTVRPSVSPKDLELYE 610 620 630 640 650 660 490 pF1KE9 KWMVEFGSA .: :: CCDS55 NWNKTFGCGK 670 >>CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (584 aa) initn: 794 init1: 432 opt: 726 Z-score: 637.3 bits: 127.6 E(32554): 3.5e-29 Smith-Waterman score: 824; 43.5% identity (69.3% similar) in 336 aa overlap (159-488:258-580) 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 GVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRARGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDGAGY-- .: .: : . . . : : .. CCDS17 LSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRN 230 240 250 260 270 280 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 -DKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKGVL :..:.. . .::. . ....:::: . ::. :.: :.:: :..: :.: : .:.: CCDS17 VDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLL 290 300 310 320 330 340 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 MVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYAPTTIF . ::::.::::::::::.: ..::::.:...::::: ::.::::: :: .:: :. :: CCDS17 LFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIF 350 360 370 380 390 400 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 IDEIDSI-CSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNFPWDI :::.::. : :: ::.::::.:.:.::..::: .: .:: :.:..::: : .. CCDS17 IDEVDSLLCERR--EGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSA--GDD---RVLVMGATNRPQEL 410 420 430 440 450 460 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 DEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQ--LEDIAEKIEGYSGADITN :::. ::. ::.:. ::. . : ::: :: . .: : : ..:. .::::.:.: CCDS17 DEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLLK-NLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTA 470 480 490 500 510 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 VCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKYEK . .::.: .:. :.::... .: :.. . .:: .:::: .::: :: : . CCDS17 LAKDAALGPIRE----LKPEQVKNMSASEMRN-IRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIR 520 530 540 550 560 570 490 pF1KE9 WMVEFGSA : .:: CCDS17 WNKDFGDTTV 580 >>CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 (616 aa) initn: 794 init1: 432 opt: 726 Z-score: 637.0 bits: 127.6 E(32554): 3.7e-29 Smith-Waterman score: 832; 34.9% identity (62.4% similar) in 490 aa overlap (20-488:140-612) 10 20 30 40 pF1KE9 MNLAEICDNAKKGREYALLGNYDSSMVYYQGVMQQIQRHCQSVRDPAIK :. .... .:. ...... . . CCDS17 GGEAERVRVFHKQAFEYISIALRIDEDEKAGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVI----VT 110 120 130 140 150 160 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 GKWQQVRQELLEEYEQVKSIVSTLESFKI-DK-PPDFPVS-CQDEPFRDP---AVWPPPV :. .: .. . ... ..: . . ... .: : .: : : . . : : . CCDS17 GQGEQCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLEKMQPVLPFSKSQTDVYNDSTNLACRNGHL 170 180 190 200 210 220 110 120 130 140 150 pF1KE9 PAEHRAPPQIRRPNREVR---PLRKEMAGVGARGPVGRAHPISKSEKPSTSRDKDYRA-- .: : :. . : .. : : . .:. : :. . : : .: :. . CCDS17 QSESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGLSMVSGVKQGSGPA 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 ----RGRDDKGRKNMQDGASDGEMPKFDGAGY---DKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIA .: .: : . . . : : .. :..:.. . .::. . ....:::: CCDS17 PTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIA 290 300 310 320 330 340 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 DLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFN . ::. :.: :.:: :..: :.: : .:.:. ::::.::::::::::.: ..:::: CCDS17 GQDLAKQALQEIVILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFN 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 VSSSTLTSKYRGESEKLVRLLFEMARFYAPTTIFIDEIDSI-CSRRGTSDEHEASRRVKS .:...::::: ::.::::: :: .:: :. :::::.::. : :: ::.::::.:. CCDS17 ISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSIIFIDEVDSLLCERR--EGEHDASRRLKT 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 ELLIQMDGVGGALENDDPSKMVMVLAATNFPWDIDEALRRRLEKRIYIPLPTAKGRAELL :.::..::: .: .:: :.:..::: : ..:::. ::. ::.:. ::. . : :: CCDS17 EFLIEFDGVQSA--GDD---RVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLL 470 480 490 500 510 400 410 420 430 440 pF1KE9 KINLREVELDPDIQ--LEDIAEKIEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALS : :: . .: : : ..:. .::::.:.: . .::.: .:. :.::... .: CCDS17 K-NLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRE----LKPEQVKNMS 520 530 540 550 560 570 450 460 470 480 490 pF1KE9 KEELQMPVTKGDFELALKKIAKSVSAADLEKYEKWMVEFGSA :.. . .:: .:::: .::: :: : .: .:: CCDS17 ASEMRN-IRLSDFTESLKKIKRSVSPQTLEAYIRWNKDFGDTTV 580 590 600 610 >>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 (806 aa) initn: 581 init1: 262 opt: 643 Z-score: 563.6 bits: 114.4 E(32554): 4.5e-25 Smith-Waterman score: 643; 40.1% identity (66.9% similar) in 299 aa overlap (196-481:465-756) 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 RKNMQDGASDGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVV :. : . :.. :.::. ::..:. :.: : CCDS65 ETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQ 440 450 460 470 480 490 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 LPMWMPD-FFKGIRRPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGE :. :: :.: : ::::. :::: :::.::::.:.:: ..:..... : . . :: CCDS65 YPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGE 500 510 520 530 540 550 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 SEKLVRLLFEMARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTS--DEHEASRRVKSELLIQMDGVGGA :: :: .:. :: :: ..:.::.::: . :: . : :. :: ...: .:::. CCDS65 SEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGM--- 560 570 580 590 600 610 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 LENDDPSKMVMVLAATNFPWDIDEALRR--RLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELD . .: :....::: : :: :. : ::.. :::::: :.:. .:: :::. . CCDS65 ----STKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVA 620 630 640 650 660 410 420 430 440 450 pF1KE9 PDIQLEDIAEKIEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRING-LSPEEIRALS------KEELQ :..:: .:. .:.::::.:..:. : .:.:. :.. . :. : . .:. CCDS65 KDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDP 670 680 690 700 710 720 460 470 480 490 pF1KE9 MPVTKGD-FELALKKIAKSVSAADLEKYEKWMVEFGSA .: . : :: :.. .::: :..::: CCDS65 VPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGS 730 740 750 760 770 780 >-- initn: 539 init1: 228 opt: 593 Z-score: 520.3 bits: 106.4 E(32554): 1.2e-22 Smith-Waterman score: 593; 38.6% identity (70.0% similar) in 267 aa overlap (205-467:201-458) 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 DGEMPKFDGAGYDKDLVEALERDIVSRNPSIHWDDIADLEEAKKLLREAVVLPMWMPDFF . .:::. .. ..: : ::. : .: CCDS65 SPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 KGIR-RPWKGVLMVGPPGTGKTMLAKAVATECGTTFFNVSSSTLTSKYRGESEKLVRLLF :.: .: .:.:. ::::::::..:.:::.: :. :: ... . :: ::::. .: : CCDS65 KAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 EMARFYAPTTIFIDEIDSICSRRGTSDEHEASRRVKSELLIQMDGVGGALENDDPSKMVM : :. ::. :::::.:.: .: . . :. ::. :.:: :::. :. CCDS65 EEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKR-EKTHGEVERRIVSQLLTLMDGL-------KQRAHVI 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 VLAATNFPWDIDEALRR--RLEKRIYIPLPTAKGRAELLKINLREVELDPDIQLEDIAEK :.:::: : .:: :::: :..... : .: : :: :.:.:. ....: :..::..:.. CCDS65 VMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANE 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 IEGYSGADITNVCRDASLMAMRRRINGLSPEEIRALSKEELQ-MPVTKGDFELALKKIAK .:. :::.. .: .:.:.:.:.... .. :. .... : .. . :: ::. ::.. CCDS65 THGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLED-ETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNP 410 420 430 440 450 460 480 490 pF1KE9 SVSAADLEKYEKWMVEFGSA CCDS65 SALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPG 470 480 490 500 510 520 490 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 10:41:14 2016 done: Tue Nov 8 10:41:14 2016 Total Scan time: 2.220 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]