FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2194, 255 aa 1>>>pF1KE2194 255 - 255 aa - 255 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6889+/-0.000867; mu= 11.8840+/- 0.052 mean_var=59.2132+/-11.535, 0's: 0 Z-trim(105.3): 16 B-trim: 48 in 1/47 Lambda= 0.166673 statistics sampled from 8323 (8330) to 8323 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16 Scan time: 2.300 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11001.1 YWHAE gene_id:7531|Hs108|chr17 ( 255) 1641 402.9 1.1e-112 CCDS6290.1 YWHAZ gene_id:7534|Hs108|chr8 ( 245) 1060 263.2 1.2e-70 CCDS13339.1 YWHAB gene_id:7529|Hs108|chr20 ( 246) 1024 254.6 4.7e-68 CCDS5584.1 YWHAG gene_id:7532|Hs108|chr7 ( 247) 1003 249.5 1.6e-66 CCDS1666.1 YWHAQ gene_id:10971|Hs108|chr2 ( 245) 999 248.6 3e-66 CCDS13901.1 YWHAH gene_id:7533|Hs108|chr22 ( 246) 986 245.4 2.7e-65 CCDS288.1 SFN gene_id:2810|Hs108|chr1 ( 248) 949 236.5 1.3e-62 >>CCDS11001.1 YWHAE gene_id:7531|Hs108|chr17 (255 aa) initn: 1641 init1: 1641 opt: 1641 Z-score: 2136.8 bits: 402.9 E(32554): 1.1e-112 Smith-Waterman score: 1641; 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CCDS16 YYEILNNPELACTLAKTAFDEAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDSAGEEC 180 190 200 210 220 230 250 pF1KE2 EQNKEALQDVEDENQ CCDS16 DAAEGAEN 240 >>CCDS13901.1 YWHAH gene_id:7533|Hs108|chr22 (246 aa) initn: 1010 init1: 579 opt: 986 Z-score: 1285.8 bits: 245.4 E(32554): 2.7e-65 Smith-Waterman score: 986; 63.8% identity (82.5% similar) in 240 aa overlap (1-238:1-240) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW : :::.:. .:.:::::::::.:. .:: :. .. :. :.:::::::::::.::::.:: CCDS13 MGDREQLLQRARLAEQAERYDDMASAMKAVTELNEPLSNEDRNLLSVAYKNVVGARRSSW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANT--GESK :.::::::: :.: ::. .. ::. .: ::. .: :.:..::: :: : ::: CCDS13 RVISSIEQKTMADGNEKKLEKVKAYREKIEKELETVCNDVLSLLDKFLIKNCNDFQYESK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 VFYYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFS ::: ::::::.::::: :.:. .. ..: : .::: : .:. .. :::::::::::::: CCDS13 VFYLKMKGDYYRYLAEVASGEKKNSVVEASEAAYKEAFEISKEQMQPTHPIRLGLALNFS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VFYYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGD :::::: :.:..:: ::: ::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.: . CCDS13 VFYYEIQNAPEQACLLAKQAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDQQDE 190 200 210 220 230 240 240 250 pF1KE2 GEEQNKEALQDVEDENQ CCDS13 EAGEGN >>CCDS288.1 SFN gene_id:2810|Hs108|chr1 (248 aa) initn: 927 init1: 927 opt: 949 Z-score: 1237.7 bits: 236.5 E(32554): 1.3e-62 Smith-Waterman score: 949; 60.7% identity (82.8% similar) in 244 aa overlap (3-245:2-245) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDDREDLVYQAKLAEQAERYDEMVESMKKVAGMDVELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASW .: .:. .::::::::::..:. :: .. ::. :::::::::::::.:..::.: CCDS28 MERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 RIISSIEQKEENKGGEDKLKMIREYRQMVETELKLICCDILDVLDKHLIPAANTGESKVF :..:::::: ...:.:.: .::::. :::::. .: .: .::.::: :. .::.:: CCDS28 RVLSSIEQKSNEEGSEEKGPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 YYKMKGDYHRYLAEFATGNDRKEAAENSLVAYKAASDIAMTELPPTHPIRLGLALNFSVF : ::::::.::::: :::.:.:. ... ::. : ::. :.:::.::::::::::::: CCDS28 YLKMKGDYYRYLAEVATGDDKKRIIDSARSAYQEAMDISKKEMPPTNPIRLGLALNFSVF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE2 YYEILNSPDRACRLAKAAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDMQGD-G .::: :::..: :::..::.:.:.: ::::.::::::::::::::::::::.: :. : CCDS28 HYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTADNAGEEG 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 EEQNKEALQDVEDENQ : .: CCDS28 GEAPQEPQS 240 255 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:38:55 2016 done: Sun Nov 6 23:38:55 2016 Total Scan time: 2.300 Total Display time: -0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]