Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6411, 602 aa
  1>>>pF1KE6411 602 - 602 aa - 602 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1721+/- 0.001; mu= 19.4874+/- 0.060
 mean_var=65.1836+/-13.440, 0's: 0 Z-trim(104.1): 19  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.158857
 statistics sampled from 7729 (7742) to 7729 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.238), width:  16
 Scan time:  2.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 602) 3992 924.2       0
CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 555) 3695 856.1       0
CCDS54470.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 552) 2085 487.1 2.5e-137
CCDS54469.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 520) 1958 458.0 1.4e-128
CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17       ( 592) 1719 403.3 4.6e-112
CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17       ( 641) 1452 342.1 1.3e-93
CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 525) 1258 297.6 2.7e-80
CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 551) 1258 297.6 2.8e-80
CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 568) 1258 297.6 2.9e-80
CCDS5786.1 SLC13A1 gene_id:6561|Hs108|chr7         ( 595) 1077 256.1 9.1e-68
CCDS5840.1 SLC13A4 gene_id:26266|Hs108|chr7        ( 626) 1055 251.1 3.1e-66
CCDS45593.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 522)  622 151.8   2e-36


>>CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20           (602 aa)
 initn: 3992 init1: 3992 opt: 3992  Z-score: 4940.5  bits: 924.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3992; 99.8% identity (100.0% similar) in 602 aa overlap (1-602:1-602)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 AAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 SASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 YGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 PKFVPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKK
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKFIPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 AQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 FASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 VKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFR
              550       560       570       580       590       600

         
pF1KE6 TL
       ::
CCDS13 TL
         

>>CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20           (555 aa)
 initn: 3695 init1: 3695 opt: 3695  Z-score: 4573.2  bits: 856.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3695; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (48-602:1-555)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE6 LVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42                               MAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
                                             10        20        30

        80        90       100       110       120       130       
pF1KE6 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
               40        50        60        70        80        90

       140       150       160       170       180       190       
pF1KE6 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
              100       110       120       130       140       150

       200       210       220       230       240       250       
pF1KE6 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
              160       170       180       190       200       210

       260       270       280       290       300       310       
pF1KE6 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
              220       230       240       250       260       270

       320       330       340       350       360       370       
pF1KE6 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFVPGWASLFNPGFLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS42 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWASLFNPGFLS
              280       290       300       310       320       330

       380       390       400       410       420       430       
pF1KE6 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
              340       350       360       370       380       390

       440       450       460       470       480       490       
pF1KE6 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
              400       410       420       430       440       450

       500       510       520       530       540       550       
pF1KE6 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
              460       470       480       490       500       510

       560       570       580       590       600  
pF1KE6 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
              520       530       540       550     

>>CCDS54470.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20           (552 aa)
 initn: 3235 init1: 2085 opt: 2085  Z-score: 2579.1  bits: 487.1 E(32554): 2.5e-137
Smith-Waterman score: 3148; 83.7% identity (86.6% similar) in 606 aa overlap (1-602:1-552)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
              130       140       150       160       170       180

                190       200       210       220       230        
pF1KE6 AAVR--RNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISI
       : .   :. .: .            .  ::.                 : ::        
CCDS54 AKTTLGRQRFHWI-----------CRLTPGR-----------------RMNI--------
              190                  200                             

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE6 PYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLA--GWLW
          .. .: :. .. .:.  .::      :.            : ::    : .  ::::
CCDS54 ---VGTSGRAS-SSPSPTQPVLGAQ----PHSR----------AQPLTSSCLASSRGWLW
             210        220                     230       240      

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE6 ISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILL
        250       260       270       280       290       300      

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE6 FTRDPKFVPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLL
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FTRDPKFIPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLL
        310       320       330       340       350       360      

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE6 TWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIA
        370       380       390       400       410       420      

        480       490       500       510       520       530      
pF1KE6 FFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFAS
        430       440       450       460       470       480      

        540       550       560       570       580       590      
pF1KE6 GHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLAN
        490       500       510       520       530       540      

        600  
pF1KE6 DTFRTL
       ::::::
CCDS54 DTFRTL
        550  

>>CCDS54469.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20           (520 aa)
 initn: 1952 init1: 1952 opt: 1958  Z-score: 2422.2  bits: 458.0 E(32554): 1.4e-128
Smith-Waterman score: 3368; 93.7% identity (93.7% similar) in 555 aa overlap (48-602:1-520)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE6 LVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54                               MAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
                                             10        20        30

        80        90       100       110       120       130       
pF1KE6 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
               40        50        60        70        80        90

       140       150       160       170       180       190       
pF1KE6 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
              100       110       120       130       140       150

       200       210       220       230       240       250       
pF1KE6 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
              160       170       180       190       200       210

       260       270       280       290       300       310       
pF1KE6 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
              220       230       240       250       260       270

       320       330       340       350       360       370       
pF1KE6 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFVPGWASLFNPGFLS
       :::::::::::::::::::::::                                   ::
CCDS54 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKF-----------------------------------LS
              280       290                                        

       380       390       400       410       420       430       
pF1KE6 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
         300       310       320       330       340       350     

       440       450       460       470       480       490       
pF1KE6 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
         360       370       380       390       400       410     

       500       510       520       530       540       550       
pF1KE6 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
         420       430       440       450       460       470     

       560       570       580       590       600  
pF1KE6 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
         480       490       500       510       520

>>CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17            (592 aa)
 initn: 1611 init1: 670 opt: 1719  Z-score: 2125.3  bits: 403.3 E(32554): 4.6e-112
Smith-Waterman score: 1729; 45.1% identity (75.0% similar) in 616 aa overlap (4-598:1-588)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
          .:.  . .:. :  :...:.:. :::. . .: ::. : ..:.:::..::::::::.
CCDS11    MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLA
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
       ::::.:..:::.:::. ...:  .:. :.:.::..::..: :.:.::::.::::..:..:
CCDS11 VTALFPLILFPMMGIVDASEVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIV
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160             170    
pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQK------EVRKDPS-
       ::.:: ::::.:..:.:::::.::::..:::.:::.:.: .: ...      :  ..:. 
CCDS11 GVRPAPLILGFMLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTF
       120       130       140       150       160       170       

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE6 --QESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIW
         ::   .  ... .. ...:.     ::.:.. : .. .. :                 
CCDS11 ELQEPSPQKEVTKLDNGQALPVTS---ASSEGRAHLSQKHLHLT----------------
       180       190       200          210                        

             240       250       260       270        280       290
pF1KE6 KGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFL
       . . . . ::::::: ::::::::::.: ::..:.:::  .::::.::: :::: :...:
CCDS11 QCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILL
      220       230       240       250       260       270        

              300       310         320       330       340        
pF1KE6 LAGWLWISFLYGGLSFRGWRKN--KSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFIL
       : .:::...:. :..:   :::   .:   . .. :  ::. :.. :::. :::.:. ::
CCDS11 LLAWLWLQILFLGFNF---RKNFGIGEKMQEQQQAAYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISIL
      280       290          300       310       320       330     

      350       360       370            380       390       400   
pF1KE6 FCMFAILLFTRDPKFVPGWASLFNPG-----FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWF
       : ....: :::.: :  ::..:  :.     ..::..... :  :.:..::. :.:    
CCDS11 FVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQ--
         340       350       360       370       380       390     

           410         420       430       440       450       460 
pF1KE6 DFKAPNTETEPL--LTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLEN
       : . :.    ::  : :: ... .::::.::::::.:.::: :.:::: :.:..: ::..
CCDS11 DPENPGKLKAPLGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQS
           400       410       420       430       440       450   

              470       480       490       500       510       520
pF1KE6 VP-PALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFA
       :: ::.:..: ....: ::: .::.::  ::::.:: .:  . .::::.:.: :.. :.:
CCDS11 VPAPAIAIIL-SLLVATFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLA
           460        470       480       490       500       510  

              530       540       550       560       570       580
pF1KE6 FMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWA
       :::::.::::.:.:. : : : ::.:.:.:.:..:::...::.:.:.  .:.: .::.::
CCDS11 FMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWA
            520       530       540       550       560       570  

              590        600  
pF1KE6 DMYSVNVTALP-PTLANDTFRTL
          . :.::   :.::: :    
CCDS11 ---QSNTTAQCLPSLANTTTPSP
               580       590  

>>CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17            (641 aa)
 initn: 1673 init1: 670 opt: 1452  Z-score: 1794.1  bits: 342.1 E(32554): 1.3e-93
Smith-Waterman score: 1610; 42.7% identity (69.9% similar) in 654 aa overlap (15-598:12-637)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
                     :  :...:.:. :::. . .: ::. : ..:.:::..::::::::.
CCDS54    MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLA
                  10        20        30        40        50       

               70                                             80   
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGIL----------PSN---------------------------KVCP
       ::::.:..:::.:::.          ::.                           .: :
CCDS54 VTALFPLILFPMMGIVDASEIIQRPFPSSFESPGECQSVGMSVTASHNLGGTVGDSRVFP
        60        70        80        90       100       110       

                        90       100       110       120       130 
pF1KE6 ------------QYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGM
                   .:. :.:.::..::..: :.:.::::.::::..:..:::.:: ::::.
CCDS54 PLSHVSTCQVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVRPAPLILGF
       120       130       140       150       160       170       

             140       150       160             170          180  
pF1KE6 MVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQK------EVRKDPS---QESEENTAA
       :..:.:::::.::::..:::.:::.:.: .: ...      :  ..:.   ::   .  .
CCDS54 MLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTFELQEPSPQKEV
       180       190       200       210       220       230       

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE6 VRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSA
       .. .. ...:.     ::.:.. : .. .. :                 . . . . :::
CCDS54 TKLDNGQALPVTS---ASSEGRAHLSQKHLHLT----------------QCMSLCVCYSA
       240       250          260                       270        

            250       260       270        280       290       300 
pF1KE6 SIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLY
       :::: ::::::::::.: ::..:.:::  .::::.::: :::: :...:: .:::...:.
CCDS54 SIGGIATLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILF
      280       290       300       310       320       330        

             310         320       330       340       350         
pF1KE6 GGLSFRGWRKN--KSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTR
        :..::   ::   .:   . .. :  ::. :.. :::. :::.:. ::: ....: :::
CCDS54 LGFNFR---KNFGIGEKMQEQQQAAYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTR
      340          350       360       370       380       390     

     360       370            380       390       400       410    
pF1KE6 DPKFVPGWASLFNPG-----FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEP
       .: :  ::..:  :.     ..::..... :  :.:..::. :.:    : . :.    :
CCDS54 EPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQ--DPENPGKLKAP
         400       410       420       430       440         450   

            420       430       440       450       460        470 
pF1KE6 L--LTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVP-PALAVLLI
       :  : :: ... .::::.::::::.:.::: :.:::: :.:..: ::..:: ::.:..: 
CCDS54 LGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIIL-
           460       470       480       490       500       510   

             480       490       500       510       520       530 
pF1KE6 TVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNS
       ....: ::: .::.::  ::::.:: .:  . .::::.:.: :.. :.::::::.::::.
CCDS54 SLLVATFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNA
            520       530       540       550       560       570  

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE6 IAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALP
       :.:. : : : ::.:.:.:.:..:::...::.:.:.  .:.: .::.::   . :.::  
CCDS54 IVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWA---QSNTTAQC
            580       590       600       610       620            

              600  
pF1KE6 -PTLANDTFRTL
        :.::: :    
CCDS54 LPSLANTTTPSP
     630       640 

>>CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17          (525 aa)
 initn: 1326 init1: 699 opt: 1258  Z-score: 1555.1  bits: 297.6 E(32554): 2.7e-80
Smith-Waterman score: 1612; 47.6% identity (76.3% similar) in 532 aa overlap (66-585:21-523)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE6 PKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLS
                                     :..:.:.. ..:. ::: ::. :::.:::.
CCDS67           MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPA-KVCVQYMKDTNMLFLG
                         10        20        30         40         

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE6 GLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIA
       :::.: :.:.::::.::::. :. ::..::::.::.: .:..::::.::::.::::.::.
CCDS67 GLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAKPARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIV
      50        60        70        80        90       100         

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE6 NAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLD
       .:::...               : :.:. . ::. :        . .::. :: ..: ..
CCDS67 EAILQQM---------------EATSAATEAGLELVD-------KGKAKELPG-SQVIFE
     110                      120       130              140       

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE6 LPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVN
        :. ...::. :. . :.. . : :.::::::::::::.::..::::.. .::.  :.::
CCDS67 GPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNELFPDSKDLVN
        150       160       170       180       190       200      

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pF1KE6 FGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQN
       :.::: :::: ::..:: .:::..:.:  ..:.       : . : :  :  :..:::..
CCDS67 FASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN-EKAALKVLQEEYRK
        210       220       230       240       250        260     

          340       350       360       370           380       390
pF1KE6 LGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFVPGWASL-FNPG---FLSDAVTGVAIVTILF
       :::..:::  :.: : ...:: :.::: :.::: .. .  :   ..:::.... ..:.::
CCDS67 LGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVAIFVATLLF
         270       280       290       300       310       320     

              400       410              420       430       440   
pF1KE6 FFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETE-------PLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGC
       . :::.:.    :.:.. . : .       ::: :: .:: :::.:.::::::::.::: 
CCDS67 IVPSQKPK----FNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFALAKGS
         330           340       350       360       370       380 

           450       460       470       480       490       500   
pF1KE6 EESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLR
       : ::::::.: :..::. ::::  .:......: ::: .::.::  .:::..: ..  . 
CCDS67 EASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMSRSIG
             390       400       410       420       430       440 

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pF1KE6 VHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAM
       ..:::.:.: :.. ::::::::.::::.:.:. ::: : :::.::..::..::. . ::.
CCDS67 LNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCVFLAV
             450       460       470       480       490       500 

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pF1KE6 NTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
       :::...::.:  :::::..  .                 
CCDS67 NTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET               
             510       520                    

>>CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17          (551 aa)
 initn: 1489 init1: 699 opt: 1258  Z-score: 1554.8  bits: 297.6 E(32554): 2.8e-80
Smith-Waterman score: 1727; 46.4% identity (74.3% similar) in 595 aa overlap (4-585:1-549)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
          .:.: . : . . ...:. ::: :::.:. .: :  :: .::.:::.:::::..::.
CCDS67    MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLA
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
       ::.:.:..:::.. :: : .:: ::. :::.:::.:::.: :.:.::::.::::. :. :
CCDS67 VTSLMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWV
        60        70        80        90       100       110       

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pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
       :..:::                 :::.::::.::..:::...               : :
CCDS67 GAKPAR-----------------NTATTAMMVPIVEAILQQM---------------EAT
       120                        130       140                    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 AAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPY
       .:. . ::. :        . .::. :: ..: .. :. ...::. :. . :.. . : :
CCDS67 SAATEAGLELVD-------KGKAKELPG-SQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICY
         150              160        170       180       190       

              250       260       270        280       290         
pF1KE6 SASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISF
       .::::::::::::.::..::::.. .::.  :.:::.::: :::: ::..:: .:::..:
CCDS67 AASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQF
       200       210       220       230       240       250       

     300        310       320       330       340       350        
pF1KE6 LYGGLSFR-GWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFT
       .:  ..:. .:  .  : . : :  :  :..:::..:::..:::  :.: : ...:: :.
CCDS67 VYMRFNFKKSWGCGL-ESKKN-EKAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFS
       260       270         280       290       300       310     

      360       370           380       390       400       410    
pF1KE6 RDPKFVPGWASL-FNPG---FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETE-
       ::: :.::: .. .  :   ..:::.... ..:.::. :::.:.    :.:.. . : . 
CCDS67 RDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVAIFVATLLFIVPSQKPK----FNFRSQTEEERK
         320       330       340       350           360       370 

                 420       430       440       450       460       
pF1KE6 ------PLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALA
             ::: :: .:: :::.:.::::::::.::: : ::::::.: :..::. ::::  
CCDS67 TPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAI
             380       390       400       410       420       430 

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pF1KE6 VLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVST
       .:......: ::: .::.::  .:::..: ..  . ..:::.:.: :.. ::::::::.:
CCDS67 TLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVAT
             440       450       460       470       480       490 

       530       540       550       560       570       580       
pF1KE6 PPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNV
       :::.:.:. ::: : :::.::..::..::. . ::.:::...::.:  :::::..  .  
CCDS67 PPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
             500       510       520       530       540       550 

       590       600  
pF1KE6 TALPPTLANDTFRTL

>>CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17          (568 aa)
 initn: 1572 init1: 699 opt: 1258  Z-score: 1554.6  bits: 297.6 E(32554): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 1840; 48.1% identity (77.0% similar) in 595 aa overlap (4-585:1-566)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
          .:.: . : . . ...:. ::: :::.:. .: :  :: .::.:::.:::::..::.
CCDS11    MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLA
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
       ::.:.:..:::.. :: : .:: ::. :::.:::.:::.: :.:.::::.::::. :. :
CCDS11 VTSLMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWV
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
       :..::::.::.: .:..::::.::::.::::.::..:::...               : :
CCDS11 GAKPARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQM---------------EAT
       120       130       140       150                      160  

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 AAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPY
       .:. . ::. :        . .::. :: ..: .. :. ...::. :. . :.. . : :
CCDS11 SAATEAGLELVD-------KGKAKELPG-SQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICY
            170              180        190       200       210    

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pF1KE6 SASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISF
       .::::::::::::.::..::::.. .::.  :.:::.::: :::: ::..:: .:::..:
CCDS11 AASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQF
          220       230       240       250       260       270    

     300        310       320       330       340       350        
pF1KE6 LYGGLSFR-GWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFT
       .:  ..:. .:  .  : . : :  :  :..:::..:::..:::  :.: : ...:: :.
CCDS11 VYMRFNFKKSWGCGL-ESKKN-EKAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFS
          280        290        300       310       320       330  

      360       370           380       390       400       410    
pF1KE6 RDPKFVPGWASL-FNPG---FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETE-
       ::: :.::: .. .  :   ..:::.... ..:.::. :::.:.    :.:.. . : . 
CCDS11 RDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVAIFVATLLFIVPSQKPK----FNFRSQTEEERK
            340       350       360       370           380        

                 420       430       440       450       460       
pF1KE6 ------PLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALA
             ::: :: .:: :::.:.::::::::.::: : ::::::.: :..::. ::::  
CCDS11 TPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAI
      390       400       410       420       430       440        

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pF1KE6 VLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVST
       .:......: ::: .::.::  .:::..: ..  . ..:::.:.: :.. ::::::::.:
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       ..   .::.   . . . .   . : .:        :.    ..:  .:  . .:: .  
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CCDS57 ALIILLLSWIWLQWLFLGFNFKEMFKC-GKTKTVQQKACAEVIKQEYQKLGPIRYQEIVT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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