FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6714, 1184 aa 1>>>pF1KE6714 1184 - 1184 aa - 1184 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7726+/-0.000536; mu= 8.9658+/- 0.033 mean_var=159.1295+/-31.879, 0's: 0 Z-trim(111.5): 158 B-trim: 7 in 2/55 Lambda= 0.101671 statistics sampled from 19923 (20083) to 19923 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16 Scan time: 12.650 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003604 (OMIM: 603489,603932) cartilage intermed (1184) 8123 1205.4 0 XP_016878167 (OMIM: 603489,603932) PREDICTED: cart (1211) 7997 1187.0 0 XP_016878168 (OMIM: 603489,603932) PREDICTED: cart (1160) 7968 1182.7 0 NP_694953 (OMIM: 612419) cartilage intermediate la (1156) 3576 538.5 9.3e-152 >>NP_003604 (OMIM: 603489,603932) cartilage intermediate (1184 aa) initn: 8123 init1: 8123 opt: 8123 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