FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6336, 430 aa 1>>>pF1KE6336 430 - 430 aa - 430 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9497+/-0.000592; mu= 0.8588+/- 0.036 mean_var=253.8849+/-51.532, 0's: 0 Z-trim(113.6): 65 B-trim: 365 in 2/52 Lambda= 0.080493 statistics sampled from 22928 (22975) to 22928 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16 Scan time: 6.040 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016856544 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 is ( 430) 2768 335.3 1.9e-91 XP_011539560 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 is ( 430) 2768 335.3 1.9e-91 XP_005270810 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 is ( 430) 2768 335.3 1.9e-91 NP_055281 (OMIM: 608953) tektin-2 [Homo sapiens] ( 430) 2768 335.3 1.9e-91 NP_444515 (OMIM: 609002) tektin-1 [Homo sapiens] ( 418) 720 97.4 7.2e-20 XP_011522290 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 490) 659 90.4 1.1e-17 XP_011522291 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 490) 659 90.4 1.1e-17 NP_114104 (OMIM: 612683) tektin-3 [Homo sapiens] ( 490) 659 90.4 1.1e-17 XP_016880443 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 490) 659 90.4 1.1e-17 XP_016880444 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 324) 574 80.4 7.6e-15 XP_011522292 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 324) 574 80.4 7.6e-15 XP_011522329 (OMIM: 609002) PREDICTED: tektin-1 is ( 348) 442 65.1 3.3e-10 >>XP_016856544 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 isofor (430 aa) initn: 2768 init1: 2768 opt: 2768 Z-score: 1762.8 bits: 335.3 E(85289): 1.9e-91 Smith-Waterman score: 2768; 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NP_444 EKRIGIDLVHDTVEHELIKEAEIIQGIMALLTRTLEEASEQIRMNRSAKYNLEKDLKDKF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR .: :: :.::: :::: . . .:. .:..:..: ::: : ..:. . . . :. NP_444 VALTIDDICFSLNNNSPNIRYSENAVRIEPNSVSLEDWLDFSSTNVEKADKQRNNSLMLK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL . ...: :.:. : ... ::.. :.. . . ..: . ...:::: ...: : NP_444 ALVDRILSQTANDLRKQCDVVDTAFKNGLKDTKDARDKLADHLAKVMEEIASQEKNITAL 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ :. . . :..:::::.::.::::::::: ::: : ::... ..: ::. ::::: NP_444 EKAILDQEGPAKVAHTRLETRTHRPNVELCRDVAQYRLMKEVQEITHNVARLKETLAQAQ 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLD-TKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTL : .: .. :: .: : :.. .: . ::. :... 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