FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4534, 599 aa 1>>>pF1KE4534 599 - 599 aa - 599 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1467+/-0.00106; mu= 19.4856+/- 0.063 mean_var=65.6879+/-13.270, 0's: 0 Z-trim(103.1): 43 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.158246 statistics sampled from 7231 (7271) to 7231 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 3.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 4080 940.9 0 CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 2152 500.8 2.1e-141 CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 2147 499.7 4.8e-141 CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 2106 490.3 3.1e-138 CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 1741 407.0 3.7e-113 CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 1741 407.0 4.2e-113 CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 1696 396.7 4.7e-110 CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 1598 374.3 2.1e-103 CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 1587 371.8 1.5e-102 CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 1561 365.8 7.6e-101 CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1374 323.2 7.7e-88 CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 1285 302.9 8.2e-82 CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 1257 296.5 7e-80 CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 1253 295.5 1.1e-79 CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 1253 295.6 1.3e-79 CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 1253 295.6 1.3e-79 CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1201 283.7 4.9e-76 CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1201 283.7 5e-76 CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1201 283.7 5.4e-76 CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 1167 275.9 1.1e-73 CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 1015 241.2 3e-63 CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 980 233.2 7.6e-61 CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 975 232.1 1.6e-60 CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 930 221.9 2.3e-57 CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 912 217.7 4e-56 CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 675 163.6 6.9e-40 CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 623 151.4 1.1e-36 CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 607 147.9 1.7e-35 CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 604 147.4 6e-35 CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 599 146.2 1e-34 CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 576 140.7 1.7e-33 >>CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 (599 aa) initn: 4080 init1: 4080 opt: 4080 Z-score: 5031.1 bits: 940.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4080; 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CCDS85 EIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKI 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 APMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRCF---- :.:.:.: :. .. . ::.:::....::..::..::: ::: : . :::..:. 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CCDS85 ATPRTSLLRLTELESHC 590 600 >>CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 (632 aa) initn: 2124 init1: 1040 opt: 2147 Z-score: 2645.7 bits: 499.7 E(32554): 4.8e-141 Smith-Waterman score: 2147; 54.4% identity (77.6% similar) in 553 aa overlap (36-577:42-594) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 SKVADGQISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLPDRDTWKGRFDFLMSCVGYAIGLG :. . .: :... .:..: .: :::: CCDS26 GKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFVLSVAGEIIGLG 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 NVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLAPMFKG ::::::::: ::::::::::: . .: :.:.:.:: .:::.:: ::. : :. :.:.: CCDS26 NVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGITCWRKVCPLFEG 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 pF1KE4 VGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRCF-------SNY .: :. :. ::.:::.:..:::.:: : ::: ::: : . :::. : ::: CCDS26 IGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENCVEFQKLNVSNY 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 SMVNTTNMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTG : :. : :: :.::::. . ..::... :..:: ::. : :: . :::::::. :: CCDS26 SHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICYFCIWKGTKSTG 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 KVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYG :::: .::.:::::.::..::::::::.::: ::. :.. .::: .::.::.:::::::. CCDS26 KVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWVDAGTQIFFSYA 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVA . :: : ::::::...:: ::: :..::.:: ::. :::.:::..::::. ::.:: CCDS26 ICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMAYEQGVPIAEVA 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 ASGPGLAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLR :::::::.:::.:::..:.::::: ::: ::..::.:::: ::...::.:: ::...: CCDS26 ESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLVTAVVDMYPKVFR 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 N--RRELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFY ::::.: :. .:::..:: .:.::.:.:.::: :.:::: :::...:::. :.: : CCDS26 RGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVAIFECICIGWVY 440 450 460 470 480 490 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 GVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTQLTMGN-YVFPKWGQ : :::::::..:.: :: : :: ..:: : ::.::: ... : ..: :..: :: CCDS26 GSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKYNNIYTYPAWGY 500 510 520 530 540 550 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTS :.:::::::::. :: .. .:.: ...: .. :: :. CCDS26 GIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKLGVSPRMVTVND 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 KEAYI CCDS26 CDAKLKSDGTIAAITEKETHF 620 630 >>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 (614 aa) initn: 2102 init1: 966 opt: 2106 Z-score: 2595.3 bits: 490.3 E(32554): 3.1e-138 Smith-Waterman score: 2106; 49.7% identity (78.1% similar) in 585 aa overlap (10-584:2-586) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MATNGSKVADGQISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLPDRDTWKGRFDFLMSCVGY ::..... :... :. :. .. :: : ....:..: .: CCDS85 MDGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 AIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLA ::::::::::::: :::::::.::::. .. :.:.:.:: .:::::: :.. .: :. CCDS85 IIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKIC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRC--FSNY :.:.:.:::..:. .::.:::.:..::..::..:::. ::: :.: :::..: : :. CCDS85 PLFQGIGLASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 SMVNTT----NMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGV : ..:. :.:: :.::::: . .:.:. :..:: ::. : .::.. :::::::: CCDS85 SGAGTVTPFENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 GWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIF :::::::.::.::.::.::..:::::::: .::..:. :.. .:.: .::.::.:::: CCDS85 KSTGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 FSYGLGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSI ::... : : ::::::..::: :.: : .: .:: ::. ::::.:::.:::.. : CCDS85 FSFAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 ADVAASGPGLAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYP ..:: :::::::.:.:.:::..:.: ::. ::: ::..::.:::: :: ..:: .: .: CCDS85 SEVAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 RLLRN--RRELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSI : ::. ::::.: .. .. ::::: .:.::.:.:.:::::..::. :::: .:: : : CCDS85 RQLRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 SWFYGVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTQLTMGN-YVFP :: ::..::::::..:.: :: :. : :.:: . ..:.:: ..: : ..: ::.: CCDS85 SWVYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYP 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 KWGQGVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAG :: ..::..:::::: .: ... .: .: ...:.. .. :. .. .:.. : CCDS85 PWGYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSA 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 SSTSKEAYI CCDS85 GRNFGPSPTREGLIAGEKETHL 600 610 >>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (620 aa) initn: 2024 init1: 986 opt: 1741 Z-score: 2144.9 bits: 407.0 E(32554): 3.7e-113 Smith-Waterman score: 2075; 52.6% identity (79.7% similar) in 546 aa overlap (42-575:39-584) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 QISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLPDRDTWKGRFDFLMSCVGYAIGLGNVWRFP :.:. :....::..: .: .::::::::: CCDS33 CLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFP 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 YLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLAPMFKGVGLAAA ::: ::::::::::::. :. .:.:.:.:: .::::: ::. : :. :.:.:.: :.. CCDS33 YLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASV 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 pF1KE4 VLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRCF-----SNYSM---VNT :. ::.:::::..:: :::..:: ::: .:.. ::: .:. .: :. ... CCDS33 VIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 TNMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTGKVVYF ::.:: :.::::::. ... :.:.::...: ::. : ..:.. .::::::: ::::::: CCDS33 TNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVYF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 SATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYGLGLGS .::.:. ::..:. ::.::::: :: ::. :.. .: : .::.::.:::::::.. ::. CCDS33 TATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 LIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVAASGPG . .:::::... : ::: ... :.:: ::. .::.::::.::::. .::::: :::: CCDS33 MTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 LAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLRN--RR :::.:::.:::..:. .:.:::: :::.::.:::: ::: ::.::: :: .::. :: CCDS33 LAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYRR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 ELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFYGVNRF :.::: :: ::::.::. .:.::.:::.:::::.:::. ::...:::: :.:.:: . . CCDS33 EIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDNL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 YDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTQLTMGN-YVFPKWGQGVGWL ::.:..:.: :: : : :. .::.. .: :::: :... ::... ::.:.:. :.:: CCDS33 YDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGWS 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 MALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTSKEAYI .:::::. .: .. . .: . :.. .. : : CCDS33 LALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGAL 550 560 570 580 590 600 CCDS33 VKPTHIIVETMM 610 620 >>CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (721 aa) initn: 2024 init1: 986 opt: 1741 Z-score: 2144.0 bits: 407.0 E(32554): 4.2e-113 Smith-Waterman score: 2075; 52.6% identity (79.7% similar) in 546 aa overlap (42-575:140-685) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 QISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLPDRDTWKGRFDFLMSCVGYAIGLGNVWRFP :.:. :....::..: .: .::::::::: CCDS77 CLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFP 110 120 130 140 150 160 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 YLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLAPMFKGVGLAAA ::: ::::::::::::. :. .:.:.:.:: .::::: ::. : :. :.:.:.: :.. CCDS77 YLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASV 170 180 190 200 210 220 140 150 160 170 180 pF1KE4 VLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRCF-----SNYSM---VNT :. ::.:::::..:: :::..:: ::: .:.. ::: .:. .: :. ... CCDS77 VIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISS 230 240 250 260 270 280 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 TNMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTGKVVYF ::.:: :.::::::. ... :.:.::...: ::. : ..:.. .::::::: ::::::: CCDS77 TNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVYF 290 300 310 320 330 340 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 SATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYGLGLGS .::.:. ::..:. ::.::::: :: ::. :.. .: : .::.::.:::::::.. ::. CCDS77 TATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLGA 350 360 370 380 390 400 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 LIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVAASGPG . .:::::... : ::: ... :.:: ::. .::.::::.::::. .::::: :::: CCDS77 MTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGPG 410 420 430 440 450 460 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 LAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLRN--RR :::.:::.:::..:. .:.:::: :::.::.:::: ::: ::.::: :: .::. :: CCDS77 LAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYRR 470 480 490 500 510 520 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 ELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFYGVNRF :.::: :: ::::.::. .:.::.:::.:::::.:::. ::...:::: :.:.:: . . CCDS77 EIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDNL 530 540 550 560 570 580 490 500 510 520 530 pF1KE4 YDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTQLTMGN-YVFPKWGQGVGWL ::.:..:.: :: : : :. .::.. .: :::: :... ::... ::.:.:. :.:: CCDS77 YDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGWS 590 600 610 620 630 640 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 MALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTSKEAYI .:::::. .: .. . .: . :.. .. : : CCDS77 LALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGAL 650 660 670 680 690 700 CCDS77 VKPTHIIVETMM 710 720 >>CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 (630 aa) initn: 1130 init1: 769 opt: 1696 Z-score: 2089.3 bits: 396.7 E(32554): 4.7e-110 Smith-Waterman score: 1733; 43.1% identity (73.7% similar) in 585 aa overlap (3-573:33-614) 10 20 pF1KE4 MATNGSKVADGQISTEVSEAP---VANDKPKT : :.:: .::::. : .: ...: .. CCDS11 TTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHS 10 20 30 40 50 60 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 LVVKVQKKAADLP--DRDTWKGRFDFLMSCVGYAIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYF . . . .:.: .:.:: . :::.: .:::. :::::::::.: .:::::::.:: CCDS11 IPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYT 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 LTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLAPMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISW . ::.:.::: .: .:::: : ...: :. :.:::.: : ...:.. :: .:..: CCDS11 IMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAW 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 AIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRC---FSNYSMVNTTNMTSAVVEFWERNMHQM--T :.::: .::: ::: .: : ::: : ::. ... : . :: . ::. :.. :. . CCDS11 ALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLHSTSPAEEFYTRHVLQIHRS 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 DGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTL ::. : : : ::. . . . ..:: ::::: .::::. .::.:::.: .:. ::.:: CCDS11 KGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATL 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 PGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYGLGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSI ::: .:.:::. ::..:: .. ::.:::.::::: : :.: :.:..:::.:.:: :.:.. CCDS11 PGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDAL 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 IVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVAA-SGPGLAFLAYPEAVTQLPISPL .. .: ::. .:::::...:.::.. ......:: .::.: :..: ::....: : . CCDS11 VTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTF 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 WAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLRNRRELFIAAVCIISYLIGLSNIT .::.:: ::. ::.:: : .:: :::..::.:.. .::: :. :: : .. .: ..: CCDS11 FAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVTLT 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 QGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFYGVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCW :: :: ::.. : :.: ..: ....: :..:::::...: ...::.: : .:..:: CCDS11 FGGAYVVKLLEEY-ATGPAVLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICW 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 pF1KE4 SFFTPIIVAGVFIFSAVQMT--QLTMGNYVFPKWGQGVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLT ..:... .::. . :. :: . .: .: :. .:. .. ::.. :: :.:: .. CCDS11 VAISPLFL--LFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLII 550 560 570 580 590 560 570 580 590 pF1KE4 LKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTSKEAYI :..:.:: . : CCDS11 TPGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV 600 610 620 630 >>CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 (510 aa) initn: 1733 init1: 994 opt: 1598 Z-score: 1969.7 bits: 374.3 E(32554): 2.1e-103 Smith-Waterman score: 1602; 44.2% identity (68.0% similar) in 584 aa overlap (13-592:1-495) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MATNGSKVADGQISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLP-DRDTWKGRFDFLMSCVG ....:: . ..: . : . ..:: : .: :.....:..: .: CCDS53 MDSRVS-GTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 YAIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVWKLA ::::::::::::: :::: .: : :. :.:. CCDS53 EIIGLGNVWRFPYLCYKNGGE--------------------HCMEFQKTN-GSLN----- 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 PMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRCFSNYSM :. CCDS53 ----GT------------------------------------------------------ 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 VNTTNMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTGKV . : :: :.::::: . ...::... : .:: ::. : .::.. :::::::: :::: CCDS53 --SENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKV 90 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYGLG :::.::.::.::..:..:::::::: .:: ::. ::. .: : .::.::.::::::... CCDS53 VYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAIC 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVAAS :: : ::::::..::: ::: : .: .:: ::. :::.::::.:::.. :..:: : CCDS53 LGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAES 210 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 GPGLAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLR-- ::::::.:::.::..::.::::: :: :...::.:::: ::...::::: ::...: CCDS53 GPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKK 270 280 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 NRRELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFYGV ::::..: .: ..:.:.:: .:.::.:::.:::::.:::: :::...:: . ..: ::. CCDS53 NRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGA 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 NRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTQLTMGN-YVFPKWGQGV .::::::..:.: :: : :: :.:: . ...:.:: ...: ::... :..: ::... CCDS53 KRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDAL 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GWLMALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTSKE :::.:::::: ::.. : . :::: ...::. .. :.::. :. .: :.: .. CCDS53 GWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDL--PQRNPAGPSAPATPRTS 450 460 470 480 490 pF1KE4 AYI CCDS53 LLRLTELESHC 500 510 >>CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (635 aa) initn: 1534 init1: 967 opt: 1587 Z-score: 1954.8 bits: 371.8 E(32554): 1.5e-102 Smith-Waterman score: 2138; 52.1% identity (76.5% similar) in 570 aa overlap (20-573:30-597) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MATNGSKVADGQISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLPDRDTWKGR ::. .: : : . . : .: :.:: . CCDS14 MAKKSAENGIYSVSGDEKKGPLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLA--VPPRETWTRQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 FDFLMSCVGYAIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSI .::.:::::.:.:::::::::::: :::::.::::: : . .:.:.:.:: ::::. . CCDS14 MDFIMSCVGFAVGLGNVWRFPYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 GGLGVWKLAPMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNT :...::.. :.:::.: :. :. :. : :::....:..::: .:::::::: : . ::: CCDS14 GSINVWNICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 DRCF--------SNYSMVNTT-----NMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAIT : .: :..: : . : :.:::: .. ... ::. :: . : ... CCDS14 PDCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLC 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LAIAWILVYFCIWKGVGWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFR : :.:::::.:::: :::.:::.::.::..:..:. ::: :::: .::..:. :.. CCDS14 LLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWS 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 KLSDSEVWLDAATQIFFSYGLGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFV ::.. .::.::.:::::::..:::.: :::::: :.:: :.:.::. ::: ::.::::: CCDS14 KLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFV 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 IFSIVGFMAHVTKRSIADVAASGPGLAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQ .:::.:::: :. :: :::::::.:::.::: .:..:::: ::: :::.::.::: CCDS14 VFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQ 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 FCTVEGFITALVDEYP--RLLRNRRELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSA : ::::::.:.: : .: .::. .: : . ..: :: .:.::.:::.::::::: CCDS14 FVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSA 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 SGMSLLFLVFFECVSISWFYGVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFS :: .::. .:.::: ..: ::..::.:.: :.: ::: : : :::::::.. :.:::. CCDS14 SGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFN 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE4 AVQMTQLTMGN-YVFPKWGQGVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPS .: . :...: ::.: ::...:: .:::::. .: .. .: ::.. .: : ..:: CCDS14 VVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPI 540 550 560 570 580 590 580 590 pF1KE4 EDIVRPENGPEQPQAGSSTSKEAYI CCDS14 WGLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKVVVVESVM 600 610 620 630 >>CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (520 aa) initn: 1534 init1: 967 opt: 1561 Z-score: 1924.0 bits: 365.8 E(32554): 7.6e-101 Smith-Waterman score: 1783; 51.6% identity (76.6% similar) in 479 aa overlap (111-573:4-482) 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 AFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVWKLAPMFKGVGLAAAVLSFWLNIYY :...::.. :.:::.: :. :. :. : :: CCDS48 MKAGSINVWNICPLFKGLGYASMVIVFYCNTYY 10 20 30 150 160 170 180 pF1KE4 IVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRCF--------SNYSMVNTT-----NMTS :....:..::: .:::::::: : . ::: : .: :..: : . : CCDS48 IMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRRS 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 AVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGVGWTGKVVYFSATYP :.:::: .. ... ::. :: . : ... : :.:::::.:::: :::.:::.::.: CCDS48 PVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATFP 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 YIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIFFSYGLGLGSLIALG :..:..:. ::: :::: .::..:. :.. ::.. .::.::.:::::::..:::.: ::: CCDS48 YVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTALG 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSIADVAASGPGLAFLA ::: :.:: :.:.::. ::: ::.:::::.:::.:::: :. :: :::::::.: CCDS48 SYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFIA 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 YPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYP--RLLRNRRELFIA ::.::: .:..:::: ::: :::.::.:::: ::::::.:.: : .: .::. .: CCDS48 YPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISVA 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 AVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFYGVNRFYDNIQ : . ..: :: .:.::.:::.::::::::: .::. .:.::: ..: ::..::.:.: CCDS48 LCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYGADRFMDDIA 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 EMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTQLTMGN-YVFPKWGQGVGWLMALSS :.: ::: : : :::::::.. :.:::..: . :...: ::.: ::...:: .:::: CCDS48 CMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAMGWAFALSS 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 pF1KE4 MVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTSKEAYI :. .: .. .: ::.. .: : ..:: CCDS48 MLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGLTTLTPVSESSKV 460 470 480 490 500 510 599 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 17:28:10 2016 done: Mon Nov 7 17:28:10 2016 Total Scan time: 3.110 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]