FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5001, 1049 aa 1>>>pF1KE5001 1049 - 1049 aa - 1049 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3637+/-0.000524; mu= 16.1897+/- 0.032 mean_var=128.1300+/-27.469, 0's: 0 Z-trim(109.4): 397 B-trim: 798 in 1/53 Lambda= 0.113305 statistics sampled from 17039 (17527) to 17039 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16 Scan time: 12.370 The best scores are: opt bits E(85289) NP_057646 (OMIM: 300365) toll-like receptor 7 prec (1049) 6976 1153.6 0 NP_619542 (OMIM: 300366) toll-like receptor 8 isof (1041) 2470 417.1 2.6e-115 NP_057694 (OMIM: 300366) toll-like receptor 8 isof (1059) 2470 417.1 2.7e-115 XP_011543832 (OMIM: 300366) PREDICTED: toll-like r (1059) 2470 417.1 2.7e-115 XP_011543831 (OMIM: 300366) PREDICTED: toll-like r (1059) 2470 417.1 2.7e-115 NP_059138 (OMIM: 605474) toll-like receptor 9 prec (1032) 1241 216.2 7.9e-55 XP_005273299 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 XP_006711567 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 XP_006711568 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 XP_005273298 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 XP_011508239 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 XP_016857697 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 XP_005273300 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 NP_003259 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) toll ( 858) 628 115.9 1e-24 XP_006711569 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858) 628 115.9 1e-24 NP_001305718 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 525 99.0 1.1e-19 XP_011530518 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 525 99.0 1.1e-19 XP_011530517 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 525 99.0 1.1e-19 XP_016864063 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 525 99.0 1.1e-19 XP_016864064 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 525 99.0 1.1e-19 NP_001305725 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 525 99.0 1.1e-19 XP_016864062 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 525 99.0 1.1e-19 NP_001305720 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 525 99.0 1.1e-19 NP_001305716 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 525 99.0 1.1e-19 XP_016864065 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784) 525 99.0 1.1e-19 NP_001305719 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 525 99.0 1.1e-19 NP_001305724 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 525 99.0 1.1e-19 NP_001305722 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784) 525 99.0 1.1e-19 NP_003255 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-like r ( 784) 525 99.0 1.1e-19 XP_011511915 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 449 86.6 6.1e-16 XP_011511916 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 449 86.6 6.1e-16 NP_006059 (OMIM: 605403) toll-like receptor 6 prec ( 796) 449 86.6 6.1e-16 XP_005262694 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 449 86.6 6.1e-16 XP_011511914 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796) 449 86.6 6.1e-16 NP_001182037 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 797) 438 84.8 2.1e-15 XP_011512062 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 797) 438 84.8 2.1e-15 NP_001182036 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 811) 438 84.8 2.2e-15 NP_001182035 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 811) 438 84.8 2.2e-15 XP_011512063 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 811) 438 84.8 2.2e-15 NP_112218 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 iso ( 811) 438 84.8 2.2e-15 NP_001017388 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 ( 811) 438 84.8 2.2e-15 XP_011512064 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 811) 438 84.8 2.2e-15 XP_011512046 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 406 79.6 7.9e-14 NP_003254 (OMIM: 601194,613223) toll-like receptor ( 786) 406 79.6 7.9e-14 XP_016864061 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 406 79.6 7.9e-14 XP_011512045 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 406 79.6 7.9e-14 XP_016864060 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 406 79.6 7.9e-14 XP_011512044 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 406 79.6 7.9e-14 XP_011512047 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 406 79.6 7.9e-14 XP_005262719 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786) 406 79.6 7.9e-14 >>NP_057646 (OMIM: 300365) toll-like receptor 7 precurso (1049 aa) initn: 6976 init1: 6976 opt: 6976 Z-score: 6171.8 bits: 1153.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6976; 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42.5% identity (72.1% similar) in 1051 aa overlap (5-1049:4-1038) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILIS-KLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEI :. . .. .: .: : .: . . : .. ::: . .. ::..:....: :. NP_619 MENMFLQSSMLTCIFLLISGSCELCAEENFSRSYPCDEKKQ--NDSVIAECSNRRLQEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PGGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKR--LQ : . .:.: :. : : :. ::. :..:..:.. : : ...: :. :. NP_619 PQTVGKYVTELDLSDNFITHITNESFQGLQNLTKINLNHN--PNVQHQNGNPGIQSNGLN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 IKPRSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEIL : .: .: :. : :. ::: .::.::: :: ::: :::..: ::....: :.. : NP_619 ITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEGISRLINLKNL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YLGQNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMI ::. :::. . : . .:: .: .::.:..:::. :... :: :::.: .:.: :..: NP_619 YLAWNCYFNKVCEKT-NIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 AKIQEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRL :.:.::..: .: .::::::::::.::::::.:: ... ..: ::. ::.:. : : NP_619 KYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 HSNSLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYR :.::... ::::. .:. ::: :.:. ::... :: .:: : ::::::. : NP_619 SSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 ASMNLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMF .:.:. ::.: ::. :..:::::.::. ...:: .: :: ...:: :::: ....: NP_619 QHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 KQFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHY-FRYDKYARSCR ..:. :..: :: :.::: ... .. ... :.. .. .. :..: .. . 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NP_619 DLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPRLELLDLRGNKLLFLT 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 ERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNL . ::. . ::..:.:..:.: : . ::... .:..:::::: .. :.:... .. ..: NP_619 DSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKL 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 KMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVN-HTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCE .:: :: : : :::: : :.. : .: :: :. :: :..:: ..:.:..::.: :: NP_619 SMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLV-DVICASPGDQRGKSIVSLELTTCV 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KE5 LDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKGYQRLISPDCCYDAF :.: .::: ... .. ..:. : ::..::::.::. : ::.:::. : . . :::. 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