Result of FASTA (omim) for pFN21AE5001
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5001, 1049 aa
  1>>>pF1KE5001 1049 - 1049 aa - 1049 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3637+/-0.000524; mu= 16.1897+/- 0.032
 mean_var=128.1300+/-27.469, 0's: 0 Z-trim(109.4): 397  B-trim: 798 in 1/53
 Lambda= 0.113305
 statistics sampled from 17039 (17527) to 17039 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.206), width:  16
 Scan time: 12.370

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_057646 (OMIM: 300365) toll-like receptor 7 prec (1049) 6976 1153.6       0
NP_619542 (OMIM: 300366) toll-like receptor 8 isof (1041) 2470 417.1 2.6e-115
NP_057694 (OMIM: 300366) toll-like receptor 8 isof (1059) 2470 417.1 2.7e-115
XP_011543832 (OMIM: 300366) PREDICTED: toll-like r (1059) 2470 417.1 2.7e-115
XP_011543831 (OMIM: 300366) PREDICTED: toll-like r (1059) 2470 417.1 2.7e-115
NP_059138 (OMIM: 605474) toll-like receptor 9 prec (1032) 1241 216.2 7.9e-55
XP_005273299 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
XP_006711567 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
XP_006711568 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
XP_005273298 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
XP_011508239 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
XP_016857697 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
XP_005273300 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
NP_003259 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) toll ( 858)  628 115.9   1e-24
XP_006711569 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) P ( 858)  628 115.9   1e-24
NP_001305718 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784)  525 99.0 1.1e-19
XP_011530518 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784)  525 99.0 1.1e-19
XP_011530517 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784)  525 99.0 1.1e-19
XP_016864063 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784)  525 99.0 1.1e-19
XP_016864064 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784)  525 99.0 1.1e-19
NP_001305725 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784)  525 99.0 1.1e-19
XP_016864062 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784)  525 99.0 1.1e-19
NP_001305720 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784)  525 99.0 1.1e-19
NP_001305716 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784)  525 99.0 1.1e-19
XP_016864065 (OMIM: 246300,603028,607948) PREDICTE ( 784)  525 99.0 1.1e-19
NP_001305719 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784)  525 99.0 1.1e-19
NP_001305724 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784)  525 99.0 1.1e-19
NP_001305722 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-lik ( 784)  525 99.0 1.1e-19
NP_003255 (OMIM: 246300,603028,607948) toll-like r ( 784)  525 99.0 1.1e-19
XP_011511915 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796)  449 86.6 6.1e-16
XP_011511916 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796)  449 86.6 6.1e-16
NP_006059 (OMIM: 605403) toll-like receptor 6 prec ( 796)  449 86.6 6.1e-16
XP_005262694 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796)  449 86.6 6.1e-16
XP_011511914 (OMIM: 605403) PREDICTED: toll-like r ( 796)  449 86.6 6.1e-16
NP_001182037 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10  ( 797)  438 84.8 2.1e-15
XP_011512062 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 797)  438 84.8 2.1e-15
NP_001182036 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10  ( 811)  438 84.8 2.2e-15
NP_001182035 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10  ( 811)  438 84.8 2.2e-15
XP_011512063 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 811)  438 84.8 2.2e-15
NP_112218 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10 iso ( 811)  438 84.8 2.2e-15
NP_001017388 (OMIM: 606270) toll-like receptor 10  ( 811)  438 84.8 2.2e-15
XP_011512064 (OMIM: 606270) PREDICTED: toll-like r ( 811)  438 84.8 2.2e-15
XP_011512046 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786)  406 79.6 7.9e-14
NP_003254 (OMIM: 601194,613223) toll-like receptor ( 786)  406 79.6 7.9e-14
XP_016864061 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786)  406 79.6 7.9e-14
XP_011512045 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786)  406 79.6 7.9e-14
XP_016864060 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786)  406 79.6 7.9e-14
XP_011512044 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786)  406 79.6 7.9e-14
XP_011512047 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786)  406 79.6 7.9e-14
XP_005262719 (OMIM: 601194,613223) PREDICTED: toll ( 786)  406 79.6 7.9e-14


>>NP_057646 (OMIM: 300365) toll-like receptor 7 precurso  (1049 aa)
 initn: 6976 init1: 6976 opt: 6976  Z-score: 6171.8  bits: 1153.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6976; 100.0% identity (100.0% similar) in 1049 aa overlap (1-1049:1-1049)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILISKLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MVFPMWTLKRQILILFNIILISKLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEIP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 GGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKRLQIKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKRLQIKP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 RSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEILYLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEILYLG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 QNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 QEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 KRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 EASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 EASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 LAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 LMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEELDISKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEELDISKN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE5 SLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETLDLSHNQLTTVPERLSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETLDLSHNQLTTVPERLSN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE5 CSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLKMLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 CSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLKMLLL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE5 HHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELDLTNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 HHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELDLTNL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE5 ILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE5 DPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 DPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE5 YAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 YAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040         
pF1KE5 AHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
       :::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 AHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
             1030      1040         

>>NP_619542 (OMIM: 300366) toll-like receptor 8 isoform   (1041 aa)
 initn: 2619 init1: 1331 opt: 2470  Z-score: 2191.1  bits: 417.1 E(85289): 2.6e-115
Smith-Waterman score: 2766; 42.5% identity (72.1% similar) in 1051 aa overlap (5-1049:4-1038)

               10        20         30        40        50         
pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILIS-KLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEI
           :.  . ..  .: .:  : .: . . : .. :::   .  .. ::..:....: :.
NP_619  MENMFLQSSMLTCIFLLISGSCELCAEENFSRSYPCDEKKQ--NDSVIAECSNRRLQEV
                10        20        30        40          50       

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       :  .   .:.: :. : :  :.  ::. :..:..:..  :  :    ...:  :.   :.
NP_619 PQTVGKYVTELDLSDNFITHITNESFQGLQNLTKINLNHN--PNVQHQNGNPGIQSNGLN
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       :   .: .:  :. : :. ::: .::.::: ::  :::  :::..: ::....: :.. :
NP_619 ITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEGISRLINLKNL
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       ::. :::. . :  . .::  .: .::.:..:::. :... ::  :::.: .:.: :..:
NP_619 YLAWNCYFNKVCEKT-NIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQI
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         :.:.::..: .: .::::::::::.::::::.:: ... ..:   ::. ::.:. : :
NP_619 KYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNL
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        :.::...   ::::. .:. :::  :.:. ::... :: .:: :  ::::::.    : 
NP_619 SSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYP
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         .:.:. ::.: ::. :..:::::.::.  ...:: .: :: ...:: ::::  ....:
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       :         .. .:  ::..:::: :::::.  ..:..:  . :::::.:  .:.:.:.
NP_619 FTRPL-----IKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGT
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       ::. . ...:::..:::::. ...:. ::  :::::.: :::::.  :.:: :.: .:. 
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        :. : .. :.: . :.. ..::.::  : : ::.::.:: . ::::...::.: .: .:
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NP_619 DSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKL
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       .:: :: : : ::::   :  :.. : .: :: :. :: :..:: ..:.:..::.: :: 
NP_619 SMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLV-DVICASPGDQRGKSIVSLELTTCV
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        :.: .::: ... .. ..:.   : ::..::::.::. : ::.:::. : . .  :::.
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       : ::::: .::.::. ::  .::. :.:.  :::::::: ::  ...:: :::. :::::
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NP_057 PKLPSSLRKLFLSNTQIKYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASIN
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NP_057 FRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDD
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NP_057 DNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQF
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         :: :::  :.:  . . ::. . ::..:.:..:.:  : . ::... .:..:::::: 
NP_057 PRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNL
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       .. :.:...  .. ..:.:: :: : : ::::   :  :.. : .: :: :. :: :..:
NP_057 LKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLV-DVICASP
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NP_057 GDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVCLAK
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       ::::...::.: .: .::.: : :. .:. .: ..: .: .: .  : :: :.:  :: .
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       : ..:.:..::.: ::  :.: .::: ... .. ..:.   : ::..::::.::. : ::
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       .: .  : . :.: :. :. .. ......: : . : : .::  .: :... ::  :  .
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       .:..:.::: . . .  .  .   .: ::.. ..:  ..:..: . . ....  : .. .
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       . . : .  .: .: . .. :  ::: .. ...    :   :..    ..        . 
XP_005 RNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFS---LILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQN
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pF1KE5 SFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLA
       .: .. .:  ..   ::::.. .: ..:  :. :. :: :::. : :.. .    :  : 
XP_005 TFAGLARSSVRH---LDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINK-IADEAFYGLD
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pF1KE5 ELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLM
       .:. :..: : :  :.:. :  : :.  .:...: :     .: .  .: : :. :: : 
XP_005 NLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGLPKVAYIDLQKN-HI----AIIQDQTF-KFLEKLQTLD
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pF1KE5 MNDNDIS------SSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRY--LQLFKNLLKLEE
       . :: ..      :  .  . ...: ::  . :    : . ..::   :...  ::.. .
XP_005 LRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLP-KINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPH
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pF1KE5 LDISKNSLSFLPSGVFDGMP---PNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQC------LKNLETLD
       :.:   . . . :   :  :   :.:..: :..: :. ..:.   :      :..:..: 
XP_005 LQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQ-LAWETELCWDVFEGLSHLQVLY
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       :.:: :...:  . .   .:..: :..:..  :..  :    .:. ::.: :  :..  .
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         :. :. .:..: . ::.:.: :.   :. :.:::.:::    .:. :: : . .: :.
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pF1KE5 ISLDLYTC-ELDLTNLILFSL----SISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKG
       .::.   : : .. . . :::    .....::::...:....          ::    : 
XP_005 FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFR--------GFCFICYKT
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pF1KE5 YQRLI--------SPDCC-YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPR--EKHFNLCLE
        :::.         ::   :::.. ...::     ::   :. .:.     ...::::.:
XP_005 AQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKD---FTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFE
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pF1KE5 ERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILI
       :::..::.  . :....:  :.: : ... .. .      ::  .. : ...  ...:..
XP_005 ERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMV
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pF1KE5 FLEK--PFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKE
        . .   .:  :  ..:  .  .. :.:: . :   .: . :.. .              
XP_005 VVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIP
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pF1KE5 TV      
               
XP_005 LQTVATIS
               

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XP_006 LLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTT-ERLLLSFNYIRTVTASS
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pF1KE5 FNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQH
       :  :.:::.:.:...    :            .:: :  .::  : .:..: : :...  
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pF1KE5 VPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQ
       . :  :... .: :: :    :.  .    ... : .: .:::: :   :.   :. :  
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       .:..:.::: . . .  .  .   .: ::.. ..:  ..:..: . . ....  : .. .
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       . . : .  .: .: . .. :  ::: .. ...    :   :..    ..        . 
XP_006 RNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFS---LILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQN
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       .: .. .:  ..   ::::.. .: ..:  :. :. :: :::. : :.. .    :  : 
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       . :: ..      :  .  . ...: ::  . :    : . ..::   :...  ::.. .
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       :.:   . . . :   :  :   :.:..: :..: :. ..:.   :      :..:..: 
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XP_006 FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFR--------GFCFICYKT
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pF1KE5 YQRLI--------SPDCC-YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPR--EKHFNLCLE
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XP_006 AQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKD---FTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFE
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pF1KE5 ERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILI
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XP_006 ERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMV
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pF1KE5 FLEK--PFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKE
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XP_006 VVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIP
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pF1KE5 TV      
               
XP_006 LQTVATIS
               

>>XP_006711568 (OMIM: 601744,603031,608556,615557) PREDI  (858 aa)
 initn: 415 init1: 180 opt: 628  Z-score: 564.9  bits: 115.9 E(85289): 1e-24
Smith-Waterman score: 752; 27.1% identity (57.0% similar) in 856 aa overlap (215-1033:37-836)

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pF1KE5 YRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKIQEDD
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XP_006 LLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTT-ERLLLSFNYIRTVTASS
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XP_006 FPFLEQLQLLELGSQ----Y------------TPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYF
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pF1KE5 VPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQ
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XP_006 LHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKN---QIR--SLYLHP
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XP_006 SFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQG-KTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPF
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       . . : .  .: .: . .. :  ::: .. ...    :   :..    ..        . 
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       .: .. .:  ..   ::::.. .: ..:  :. :. :: :::. : :.. .    :  : 
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       .:. :..: : :  :.:. :  : :.  .:...: :     .: .  .: : :. :: : 
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       . :: ..      :  .  . ...: ::  . :    : . ..::   :...  ::.. .
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       .::.   : : .. . . :::    .....::::...:....          ::    : 
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        :::.         ::   :::.. ...::     ::   :. .:.     ...::::.:
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pF1KE5 FLEK--PFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKE
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pF1KE5 TV      
               
XP_006 LQTVATIS
               

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       :  :.:::.:.:...    :            .:: :  .::  : .:..: : :...  
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       . :  :... .: :: :    :.  .    ... : .: .:::: :   :.   :. :  
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       .:..:.::: . . .  .  .   .: ::.. ..:  ..:..: . . ....  : .. .
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 start: Tue Nov  8 04:02:06 2016 done: Tue Nov  8 04:02:08 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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