FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5001, 1049 aa 1>>>pF1KE5001 1049 - 1049 aa - 1049 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4855+/-0.00139; mu= 15.5613+/- 0.083 mean_var=118.2383+/-24.427, 0's: 0 Z-trim(102.6): 178 B-trim: 50 in 1/48 Lambda= 0.117949 statistics sampled from 6810 (7015) to 6810 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16 Scan time: 4.050 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049) 6976 1199.9 0 CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 2470 433.1 1.5e-120 CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 2470 433.1 1.5e-120 CCDS2848.1 TLR9 gene_id:54106|Hs108|chr3 (1032) 1241 224.0 1.3e-57 CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 628 119.6 2.9e-26 CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 525 102.0 5.2e-21 CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 ( 796) 449 89.1 4.1e-17 CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 ( 811) 438 87.2 1.5e-16 CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 406 81.8 6.5e-15 >>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049 aa) initn: 6976 init1: 6976 opt: 6976 Z-score: 6421.6 bits: 1199.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6976; 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CCDS14 MENMFLQSSMLTCIFLLISGSCELCAEENFSRSYPCDEKKQ--NDSVIAECSNRRLQEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PGGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKR--LQ : . .:.: :. : : :. ::. :..:..:.. : : ...: :. :. CCDS14 PQTVGKYVTELDLSDNFITHITNESFQGLQNLTKINLNHN--PNVQHQNGNPGIQSNGLN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 IKPRSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEIL : .: .: :. : :. ::: .::.::: :: ::: :::..: ::....: :.. : CCDS14 ITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEGISRLINLKNL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YLGQNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMI ::. :::. . : . .:: .: .::.:..:::. :... :: :::.: .:.: :..: CCDS14 YLAWNCYFNKVCEKT-NIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 AKIQEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRL :.:.::..: .: .::::::::::.::::::.:: ... ..: ::. ::.:. : : CCDS14 KYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 HSNSLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYR :.::... ::::. .:. ::: :.:. ::... :: .:: : ::::::. : CCDS14 SSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 ASMNLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMF .:.:. ::.: ::. :..:::::.::. ...:: .: :: ...:: :::: ....: CCDS14 QHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 KQFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHY-FRYDKYARSCR ..:. :..: :: :.::: ... .. ... :.. .. .. :..: .. . CCDS14 QNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS-----SFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYH 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 FKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGS : .. .: ::..:::: :::::. ..:..: . :::::.: .:.:.:. CCDS14 FTRPL-----IKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGT 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 EFQPLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLK ::. . ...:::..:::::. ...:. :: :::::.: :::::. :.:: :.: .:. CCDS14 EFSAIPHVKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFT 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 VLQKLMMNDNDISSSTSR-TMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEEL :. : .. :.: . :.. ..::.:: : : ::.::.:: . ::::...::.: .: .: CCDS14 NLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRL 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 DISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETLDLSHNQLTTVP :.: : :. .:. .: ..: .: .: . : :: :.: :: . :: ::: :.: . CCDS14 DLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPRLELLDLRGNKLLFLT 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 ERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNL . ::. . ::..:.:..:.: : . ::... .:..:::::: .. :.:... .. ..: CCDS14 DSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKL 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 KMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVN-HTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCE .:: :: : : :::: : :.. : .: :: :. :: :..:: ..:.:..::.: :: CCDS14 SMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLV-DVICASPGDQRGKSIVSLELTTCV 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KE5 LDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKGYQRLISPDCCYDAF :.: .::: ... .. ..:. : ::..::::.::. : ::.:::. : . . :::. CCDS14 SDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVCLAKVKGYRSLSTSQTFYDAY 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 pF1KE5 IVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTV : ::::: .::.::. :: .::. :.:. :::::::: :: ...:: :::. ::::: CCDS14 ISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTV 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE5 FVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLE ::.: ::::. ::: ::::. ::::::..::::.:.:: .:.:..:.::.:.: ::.:. CCDS14 FVLTKKYAKSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHSQYLRLRQRICKSSILQ 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 pF1KE5 WPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV :: ::.:. ::: :.:.. :.: :.... ... CCDS14 WPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY 1010 1020 1030 1040 >>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059 aa) initn: 2619 init1: 1331 opt: 2470 Z-score: 2277.6 bits: 433.1 E(32554): 1.5e-120 Smith-Waterman score: 2766; 42.5% identity (72.1% similar) in 1051 aa overlap (5-1049:22-1056) 10 20 30 40 pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILIS-KLLGARWFPKTLPCDVTLDV :. . .. .: .: : .: . . : .. ::: . CCDS14 MKESSLQNSSCSLGKETKKENMFLQSSMLTCIFLLISGSCELCAEENFSRSYPCDEKKQ- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 PKNHVIVDCTDKHLTEIPGGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVP .. ::..:....: :.: . .:.: :. : : :. ::. :..:..:.. : : CCDS14 -NDSVIAECSNRRLQEVPQTVGKYVTELDLSDNFITHITNESFQGLQNLTKINLNHN--P 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 IPLGSKNNMCIKR--LQIKPRSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNI ...: :. :.: .: .: :. : :. ::: .::.::: :: ::: ::: CCDS14 NVQHQNGNPGIQSNGLNITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 FSIRKENLTELANIEILYLGQNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVP ..: ::....: :.. :::. :::. . : . .:: .: .::.:..:::. :... :: CCDS14 YNITKEGISRLINLKNLYLAWNCYFNKVCEKT-NIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 TVLPSTLTELYLYNNMIAKIQEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQ :::.: .:.: :..: :.:.::..: .: .::::::::::.::::::.:: ... .. CCDS14 PKLPSSLRKLFLSNTQIKYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASIN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 IPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLP : ::. ::.:. : : :.::... ::::. .:. ::: :.:. ::... :: .:: CCDS14 IDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLP 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 SLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLE : ::::::. : .:.:. ::.: ::. :..:::::.::. ...:: .: :: CCDS14 RLEILDLSFNYIKGSYPQHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLS 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 VLDLGTNFIKIANLSMFKQFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVL ...:: :::: ....:..:. :..: :: :.::: ... .. ... :.. .. CCDS14 TINLGINFIKQIDFKLFQNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS-----SFQRHIR 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE5 EQLHY-FRYDKYARSCRFKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFL .. :..: .. .: .. .: ::..:::: :::::. ..:..: . CCDS14 KRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPL-----IKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDI 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 KCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHY :::::.: .:.:.:.::. . ...:::..:::::. ...:. :: :::::.: :::: CCDS14 ACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHY 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 FQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSR-TMESESLRTLEFRGNHLDVLWREG :. :.:: :.: .:. :. : .. :.: . :.. ..::.:: : : ::.::.:: . CCDS14 FRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDD 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KE5 DNRYLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL ::::...::.: .: .::.: : :. .:. .: ..: .: .: . : :: :.: :: . CCDS14 DNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQF 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 KNLETLDLSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNK :: ::: :.: . . ::. . ::..:.:..:.: : . ::... .:..:::::: CCDS14 PRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNL 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE5 IQMIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVN-HTEVTIPYLATDVTCVGP .. :.:... .. ..:.:: :: : : :::: : :.. : .: :: :. :: :..: CCDS14 LKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLV-DVICASP 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE5 GAHKGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAK : ..:.:..::.: :: :.: .::: ... .. ..:. : ::..::::.::. : :: CCDS14 GDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVCLAK 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE5 IKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQ .:::. : . . :::.: ::::: .::.::. :: .::. :.:. :::::::: :: CCDS14 VKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGL 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KE5 PVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQK ...:: :::. :::::::.: ::::. ::: ::::. ::::::..::::.:.:: .:. CCDS14 AIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQH 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE5 SKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV :..:.::.:.: ::.:.:: ::.:. ::: :.:.. :.: :.... ... CCDS14 SQYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY 1010 1020 1030 1040 1050 >>CCDS2848.1 TLR9 gene_id:54106|Hs108|chr3 (1032 aa) initn: 1613 init1: 430 opt: 1241 Z-score: 1147.5 bits: 224.0 E(32554): 1.3e-57 Smith-Waterman score: 2028; 36.1% identity (64.5% similar) in 1043 aa overlap (14-1045:13-1025) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILISKLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEIP .: . :... :. .: :::.. . : .:.:. : .: CCDS28 MGFCRSALHPLSLLVQAIMLAMTLALGTLPAFLPCEL-----QPHGLVNCNWLFLKSVP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE5 G---GIPT-NTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKRL . : :.:.:.:. :.: . ..: .: : ..... :: :. :. . : .. CCDS28 HFSMAAPRGNVTSLSLSSNRIHHLHDSDFAHLPSLRHLNLKWNCPPVGLSPMHFPC--HM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 QIKPRSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEI :.: .: .. :. : :. :... .: .:: :: ::: .::. . . .:. : ... CCDS28 TIEPSTFLAVPTLEELNLSYNNIMTVP-ALPKSLISLSLSHTNILMLDSASLAGLHALRF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LYLGQNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNM :.. ::::.::: . . :.:.: .: :::: ::.:.:: :::.: : : : CCDS28 LFMDGNCYYKNPCRQALEVAPGALLGLGNLTHLSLKYNNLTVVPRNLPSSLEYLLLSYNR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IAKIQEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLR :.:. .:. ::. :..::..::: :: .:: :: : . : :. ..:. :..:. : CCDS28 IVKLAPEDLANLTALRVLDVGGNCRRCDHAPNPCMECPRHFP-QLHPDTFSHLSRLEGLV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LHSNSLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVY :...::. . ::.....:. ::::.::: : : .: .. : .: .:.::::.. .: CCDS28 LKDSSLSWLNASWFRGLGNLRVLDLSENFLYKCITKTKAFQGLTQLRKLNLSFNYQKRVS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 RASMNLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSM : ..:. .:.:: .:: : ..: :. : .: :: : :..: : :::. :.:.. CCDS28 FAHLSLAPSFGSLVALKELDMHGIFFRSLDETTLRPLARLPMLQTLRLQMNFINQAQLGI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 FKQFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCR :. : :. .::: :.:: ... . . ... .: .: : : : CCDS28 FRAFPGLRYVDLSDNRISGASELTATMGEADGGEKVW-LQPGDLAPAP---VDT-PSSED 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 FKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGS :. .: . :::::.:.. :. : .:: :.:: :: : :::..::: CCDS28 FR----------PNCSTLNFTLDLSRNNLVTVQPEMFAQLSHLQCLRLSHNCISQAVNGS 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 EFQPLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLK .: ::. :. ::.:.:.::: : .: :: .::.::.: ::. : .:. : ..:. .:. CCDS28 QFLPLTGLQVLDLSHNKLDLYHEHSFTELPRLEALDLSYNSQPFGMQGVGHNFSFVAHLR 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 VLQKLMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEELD .:..: . :.: :..:. . : :::.:.: :: : .: ::: ::..:..: : :: CCDS28 TLRHLSLAHNNIHSQVSQQLCSTSLRALDFSGNALGHMWAEGD-LYLHFFQGLSGLIWLD 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 ISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETLDLSHNQLTTVPE .:.: : : .. ..: .:. : : : : :.: .:. : .::.:::. ::: .. . CCDS28 LSQNRLHTLLPQTLRNLPKSLQVLRLRDNYLAFFKWWSLHFLPKLEVLDLAGNQLKALTN 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 RLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLK . :. : .. :.: .. :.. : .:: :.::.: .. .... : . . :. CCDS28 GSLPAGTRLRRLDVSCNSISFVAPGFFSKAKELRELNLSANALKTVDHSWFGP-LASALQ 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 MLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELD .: . : . :.: :. :. .. ......: : . : : .:: .: :... :: : . CCDS28 ILDVSANPLHCACGAA-FMDFLLEVQAAVPGLPSRVKCGSPGQLQGLSIFAQDLRLCLDE 760 770 780 790 800 810 840 850 860 870 880 890 pF1KE5 LTNLILFSLSI-SVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKI--KGYQRLISPDCC-YD . :.::. .:.: : : : :: ::.:: .:.: : . .: : . : :: CCDS28 ALSWDCFALSLLAVALGLGVPML-HHLCGWDLWYCFHLCLAWLPWRGRQSGRDEDALPYD 820 830 840 850 860 870 900 910 920 930 940 950 pF1KE5 AFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREK-HFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSK ::.:.: . ::..:: :: ..::. : . . :::::::::::. ..::: :. :. CCDS28 AFVVFDKTQSAVADWVYNELRGQLEECRGRWALRLCLEERDWLPGKTLFENLWASVYGSR 880 890 900 910 920 930 960 970 980 990 1000 pF1KE5 KTVFVM--TDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQKSKFLQLRKRLCG ::.::. ::. . .. .: :..:::.... ::..:..: ..:....::.::: CCDS28 KTLFVLAHTDRVSGL--LRASFLLAQQRLLEDRKDVVVLVILSPDGRRSRYVRLRQRLCR 940 950 960 970 980 1010 1020 1030 1040 pF1KE5 SSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV .::: :: .:... :: : ::. ::: :.. : CCDS28 QSVLLWPHQPSGQRSFWAQLGMALTRDNHHFYNRNFCQGPTAE 990 1000 1010 1020 1030 >>CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 (858 aa) initn: 415 init1: 180 opt: 628 Z-score: 584.9 bits: 119.6 E(32554): 2.9e-26 Smith-Waterman score: 752; 27.1% identity (57.0% similar) in 856 aa overlap (215-1033:37-836) 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKIQEDD :.: :: :: .: .: : :.: . .. CCDS31 LLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTT-ERLLLSFNYIRTVTASS 10 20 30 40 50 60 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQH : :.:::.:.:... : .:: : .:: : .:..: : :... CCDS31 FPFLEQLQLLELGSQ----Y------------TPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYF 70 80 90 100 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 VPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQ . : :... .: :: : :. . ... : .: .:::: : :. :. : CCDS31 LHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKN---QIR--SLYLHP 110 120 130 140 150 160 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 AFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTN-FIKIANLSMFKQFKRL .:..:.::: . . . . . .: ::.. ..: ..:..: . . .... : .. . CCDS31 SFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQG-KTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPF 170 180 190 200 210 220 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KVIDLSVNKISPSGDSSEV-GFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNKEA . . : . .: .: . .. : ::: .. ... : :.. .. . CCDS31 RNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFS---LILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQN 230 240 250 260 270 280 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 SFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLA .: .. .: .. ::::.. .: ..: :. :. :: :::. : :.. . : : CCDS31 TFAGLARSSVRH---LDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINK-IADEAFYGLD 290 300 310 320 330 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 ELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLM .:. :..: : : :.:. : : :. .:...: : .: . .: : :. :: : CCDS31 NLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGLPKVAYIDLQKN-HI----AIIQDQTF-KFLEKLQTLD 340 350 360 370 380 390 610 620 630 640 650 pF1KE5 MNDNDIS------SSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRY--LQLFKNLLKLEE . :: .. : . . ...: :: . : : . ..:: :... ::.. . CCDS31 LRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLP-KINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPH 400 410 420 430 440 660 670 680 690 700 pF1KE5 LDISKNSLSFLPSGVFDGMP---PNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQC------LKNLETLD :.: . . . : : : :.:..: :..: :. ..:. : :..:..: CCDS31 LQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQ-LAWETELCWDVFEGLSHLQVLY 450 460 470 480 490 500 710 720 730 740 750 760 pF1KE5 LSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKT :.:: :...: . . .:..: :..:.. :.. : .:. ::.: : :.. . CCDS31 LNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPA--NLEILDISRN--QLLAPN 510 520 530 540 550 560 770 780 790 800 810 820 pF1KE5 SFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSV :. :. .:..: . ::.:.: :. :. :.:::.::: .:. :: : . .: :. CCDS31 --PD-VFVSLSVLDITHNKFICECELSTFINWLNHTNVTIAGPPADIYCVYPDSFSGVSL 570 580 590 600 610 620 830 840 850 860 870 880 pF1KE5 ISLDLYTC-ELDLTNLILFSL----SISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKG .::. : : .. . . ::: .....::::...:.... :: : CCDS31 FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFR--------GFCFICYKT 630 640 650 660 670 890 900 910 920 pF1KE5 YQRLI--------SPDCC-YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPR--EKHFNLCLE :::. :: :::.. ...:: :: :. .:. ...::::.: CCDS31 AQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKD---FTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFE 680 690 700 710 720 730 930 940 950 960 970 980 pF1KE5 ERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILI :::..::. . :....: :.: : ... .. . :: .. : ... ...:.. CCDS31 ERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMV 740 750 760 770 780 790 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE5 FLEK--PFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKE . . .: : ..: . .. :.:: . : .: . :.. . CCDS31 VVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIP 800 810 820 830 840 850 pF1KE5 TV CCDS31 LQTVATIS >>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 (784 aa) initn: 325 init1: 213 opt: 525 Z-score: 490.7 bits: 102.0 E(32554): 5.2e-21 Smith-Waterman score: 700; 28.4% identity (57.9% similar) in 793 aa overlap (273-1035:36-784) 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 DDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDA-LTE-LKVLRLHSN ::..: .:.. . ::: .: : : .: CCDS37 WMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSG---SLNSIPSGLTEAVKSLDLSNN 10 20 30 40 50 60 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM . .. .. .:: : :..: . . : . .: : :: .::::.: : ... CCDS37 RITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGI-NTIEEDSFSS-LGSLEHLDLSYN-----YLSNL 70 80 90 100 110 370 380 390 400 410 pF1KE5 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNL-SPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQ . :. :. :.:: .: . : .: : .: : : .:: :.: .. : : :: . : CCDS37 S-SSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDT-FTKIQRKD-FAG 120 130 140 150 160 170 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 FKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKN . :. ...... .. : . . . .:. . .. ..: :. : . : .. CCDS37 LTFLEELEIDASDLQ-SYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHIL-LLEIFVDVTSSVEC-LEL 180 190 200 210 220 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 KEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFF-VKSSDFQHLSFLKCLN-LSGNLISQ----TL ..... . . : . :.: .: :. : :: .: . .. .: :: .:: : . :: CCDS37 RDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTL 230 240 250 260 270 280 540 550 560 570 580 pF1KE5 NG-SEFQPLAELRYLDFSN-NRLDL--LHSTAFEELHKLEVL-DISSNSHYFQSEGITHM :: ..:. . : .: .. . : . :: : .. : .: ... . . :. . CCDS37 NGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVF 290 300 310 320 330 340 590 600 610 620 630 640 pF1KE5 LN---FTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESE----SLRTLEFRGNHLDVLWREGDNR : ....:: :. : ...: . .. : ::.:: .: ::: : . :.. CCDS37 LVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET- 350 360 370 380 390 400 650 660 670 680 690 700 pF1KE5 YLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL-KN : .::: ..::::::. .: : ..: :.:... ..: . :. :. CCDS37 -LLTLKNLT---NIDISKNSFHSMPETC--QWPEKMKYLNLSSTRIHSVT----GCIPKT 410 420 430 440 450 710 720 730 740 750 760 pF1KE5 LETLDLSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQ :: ::.:.:.:. : . ::.: .. :.. .: : .: : .: : : CCDS37 LEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----LKELYISRNKLMTLPDASLLP--MLLVLKISRNAIT 460 470 480 490 500 510 770 780 790 800 810 820 pF1KE5 MIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAH ..: .. . ...:: : : :.:.:. . :. . .. .. : .:. CCDS37 TFSKEQL--DSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHV 520 530 540 550 560 570 830 840 850 860 870 pF1KE5 KGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLY-FWDVWYI---YHFCKA .::.: .. : . : : :. .. .:::....:. . : .::. . . .: CCDS37 RGQQVQDVRLSVSECHRTALV---SGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQA 580 590 600 610 620 880 890 900 910 920 930 pF1KE5 KIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPG : : .. : . :::::. :. .: . :: .: .::. . :.:::..::..:: CCDS37 KRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERD---AYWVENLMVQELEN-FNPPFKLCLHKRDFIPG 630 640 650 660 670 680 940 950 960 970 980 990 pF1KE5 QPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQ . ...:. .::. :.:::::......:.: : . .:: ::.::. :. :::.:: :.. CCDS37 KWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLE-PIE 690 700 710 720 730 740 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE5 KS----KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV :. .: .::: . .. :::: . . :: :. :. . CCDS37 KKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS 750 760 770 780 >>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 (796 aa) initn: 425 init1: 170 opt: 449 Z-score: 420.7 bits: 89.1 E(32554): 4.1e-17 Smith-Waterman score: 527; 24.6% identity (54.4% similar) in 793 aa overlap (279-1033:67-781) 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 NQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQHVPPR ::. .: :.:: :::: : .: . CCDS34 DKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSF--LSELTVLRLSHNRIQLLDLS 40 50 60 70 80 90 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 WFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQAFSS :: . :. ::::.: : : :. : . :. .:::::: ..: . . . :.. CCDS34 VFKFNQDLEYLDLSHNQLQK-IS----CHPIVSFRHLDLSFN----DFKA-LPICKEFGN 100 110 120 130 140 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQ-NLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQFKRLKVID :..:..: : .:....: :. .:. . .::: . .:: : . :. :.. CCDS34 LSQLNFL---GLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIK-ENETESLQILNAKTLH 150 160 170 180 190 200 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 LSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNKEASFMSV : . : : .. ::.. : :. .:. : : .. CCDS34 LVFHPTS--------LFAIQVNISVNT-----LGCLQLTNIKLNDDNCQVFIKFLSELTR 210 220 230 240 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 NESCYKYGQTLDLSKNSI-FFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQ-PLAELR . . .. ::. ... .:. .: . .. ::. . : ... .: . :. CCDS34 GSTLLNF--TLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFTYSKTTLK 250 260 270 280 290 300 550 560 570 580 590 pF1KE5 YLDFSN--NRLDLLHSTA----FEELHKLEVLDISSNS--HYF--QSEGITHMLNFTKN- : . . :.. :. .:: : :.. . .: ::.. :.. .. . ..::::.: CCDS34 ALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIM-MLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNV 310 320 330 340 350 360 600 610 620 630 640 pF1KE5 -----------LKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYL : :. :... : ... . . .... .::. ::: : .. CCDS34 FTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEI----LDVSWNSLESGRH 370 380 390 400 410 420 650 660 670 680 690 700 pF1KE5 QLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLET . .: .: . . . : ..: ..:: .:: .: :.: .: .:: :.. :. :. CCDS34 K--ENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVP-KQVVKLEALQE 430 440 450 460 470 710 720 730 740 750 760 pF1KE5 LDLSHNQLTTVPERLSNCSR--SLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQM :... :.:: .: .:. ::. ::. .:.. . :.:. ..: . ..: .: CCDS34 LNVAFNSLTDLP----GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQ- 480 490 500 510 520 530 770 780 790 800 810 820 pF1KE5 IQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATD-VTCVGPGAH :::. :: .... . : : : .. CCDS34 -------------------------CTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESY 540 550 560 830 840 850 860 870 pF1KE5 KGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDV-WYIYHFCK-AKI .:. . :.. ::. :. :. ..:......... ..: . :. ::. :. .. CCDS34 RGSPLK--DFHMSELS-CNITLLIVTIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQT 570 580 590 600 610 620 880 890 900 910 920 930 pF1KE5 KGYQRLI-----SPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDW . : : . . . ::: :. .: : :: .::: :: .. ...::.::.. CCDS34 RRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSA---WVKSELVPYLE---KEDIQICLHERNF 630 640 650 660 670 940 950 960 970 980 990 pF1KE5 LPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEK .::. ..::. . :. : :..::.. .....: . .:..:. :. : . .:::.:: CCDS34 VPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEP 680 690 700 710 720 730 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE5 PFQKS---KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV :.: :. .:. . . :.:: . . . :: .. :. CCDS34 IPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS 740 750 760 770 780 790 >>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 (811 aa) initn: 494 init1: 180 opt: 438 Z-score: 410.5 bits: 87.2 E(32554): 1.5e-16 Smith-Waterman score: 554; 24.5% identity (55.8% similar) in 779 aa overlap (279-1036:61-778) 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 NQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQHVPPR .:. . : ....:.:: : : .:.. . CCDS34 MTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDLSYNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLK 40 50 60 70 80 90 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 WFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFN-FELQVYRASMNLSQAFS :. ..:. ::::.: : : . ..: .: :::::: :. .: . . . CCDS34 TFEFNKELRYLDLSNNRL-KSVT----WYLLAGLRYLDLSFNDFD------TMPICEEAG 100 110 120 130 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 SLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQFKRLKVID ... :.:: . : : :: ..:.. : :.: :. . .: ... : ... CCDS34 NMSHLEILGLSGA--KIQKS-------DFQKIAHLHLNTVFLGFRTLPHYEE-GSLPILN 140 150 160 170 180 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 LS-VNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNKEASFMS . .. . : . : . .. .:: . : .. : .. :. ..: ..: . CCDS34 TTKLHIVLPMDTNFWVLLRDGIKTS-KILEMTNIDGKSQFVSYEMQRNLSLENAKTSVLL 190 200 210 220 230 240 490 500 510 520 530 pF1KE5 VNESCYKYGQTLDLSKNSIF----FVKSSDFQHLSFLKCLNLSGN--LISQTLNGSE-FQ .:. .:: ...: :: .. .:.. .. ....:. : .... :. . CCDS34 LNK--------VDLLWDDLFLILQFVWHTSVEHFQ-IRNVTFGGKAYLDHNSFDYSNTVM 250 260 270 280 290 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 PLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDIS-SNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVL .:... : . . .. . : :... ... ::.. . ::: : . . CCDS34 RTIKLEHVHFRV--FYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQ------MPHML-FPNYPTKF 300 310 320 330 340 350 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 QKLMMNDNDISSST-SRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEELDI : : . .: ... .::.. :.:: . ::.:..: .. : : ::.::. CCDS34 QYLNFANNILTDELFKRTIQLPHLKTLILNGNKLETL------SLVSCFANNTPLEHLDL 360 370 380 390 400 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 SKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL-KNLETLDLSHNQLTTVPE :.: :. . . : .. :..:. : :.. . ..:: :... :::..::. :::. CCDS34 SQNLLQH-KNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSD---SVFRCLPKSIQILDLNNNQIQTVPK 410 420 430 440 450 460 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 RLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLK . . .:..: . : . .: . .: :.. : : . . .: .. ...: CCDS34 ETIHLM-ALRELNIAFNFLTDLPG--CSHFSRLSVLNIEMNFI-LSPSLDFVQSC-QEVK 470 480 490 500 510 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 MLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELD : .: : :::. :. ...:: . . . :: : .: . :.. ::. CCDS34 TLNAGRNPFRCTCELKNFIQLETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLK--DVHLHELS 520 530 540 550 560 570 840 850 860 870 880 890 pF1KE5 LTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHF--CKA---KI-KGYQRLISPDCC .. .:. . . : : . .. :.: ::. . : .. : :. .. . CCDS34 CNTALLIVTIVVIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVR 580 590 600 610 620 630 900 910 920 930 940 950 pF1KE5 YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLS . ::: :. .: . :: ::. .:: .. . .:: : . ::. . ::. . :. : CCDS34 FHAFISYSEHD---SLWVKNELIPNLEK-EDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKS 640 650 660 670 680 960 970 980 990 1000 pF1KE5 KKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEK-PFQ--KSKFLQLRKRL :..::.. .....: . ::..:. :. :. : ::::.:: :: ... .:. : CCDS34 YKSIFVLSPNFVQNEWCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALL 690 700 710 720 730 740 1010 1020 1030 1040 pF1KE5 CGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV .. :::: . . :: :. :. .. CCDS34 EKKAYLEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTD 750 760 770 780 790 800 >>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 (786 aa) initn: 352 init1: 171 opt: 406 Z-score: 381.3 bits: 81.8 E(32554): 6.5e-15 Smith-Waterman score: 522; 24.8% identity (55.0% similar) in 803 aa overlap (288-1033:67-776) 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 GNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQHVPPRWFKNINKLQ .:..:..: . : .:.. :: ..:. CCDS33 IHVPKDLSQKTTILNISQNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELE 40 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 ELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFN-FE-LQVYRASMNLSQ-AFSSLKSL-- ::::.: :.: :. : .: .:::::: :. : . . :.:: : .:.. CCDS33 YLDLSHNKLVK-IS----CHPTVNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHL 100 110 120 130 140 150 380 390 400 pF1KE5 --------------KILRIRGYVFKE------LKSFNLSPLHNL--QNLE---VLDLGTN :.: . : .. : :..:: :: . : : .::.... CCDS33 EKSSVLPIAHLNISKVLLVLGETYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVK 160 170 180 190 200 210 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 FIKIANLSMFKQFKRLKVID--LSV-NKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQL- . .:: .: . . . ::. :.. . :.. . .: .:. .:. ..:. . CCDS33 TVANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTL-NNIETTWNSF-IRILQLVW 220 230 240 250 260 470 480 490 500 510 pF1KE5 H----YFRYDKYARSCRFKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIF-FVKSSDFQHLSF : :: .. . .. .. .. ... . . :.. ...: : .: .. .: CCDS33 HTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFDYSGTSLKALSIHQVV----SDVFGFPQSYIYEIFSN 270 280 290 300 310 320 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 L--KCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEE---LHKLEVLDI . : ...::. . . : :...:. .:::::: :: .:.::. : .::.: . CCDS33 MNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFL---HLDFSNN---LLTDTVFENCGHLTELETLIL 330 340 350 360 370 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 SSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDV . : : . .... ..: ..: ::.: ...:..: . : .: : CCDS33 QMN----QLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD-------------EKKG---DC 380 390 400 410 640 650 660 670 680 690 pF1KE5 LWREGDNRYLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWK : :.::. :..:.: .: . .: .:: .: :.: .: .::. : CCDS33 SWT----------KSLLS---LNMSSN---ILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIP-K 420 430 440 450 460 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 KLQCLKNLETLDLSHNQLTTVPERLSNCSR--SLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRY .. :. :. :... :.:: .: .:. ::. ::. .:.. . :.:. ..: CCDS33 QVVKLEALQELNVAFNSLTDLP----GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRS 470 480 490 500 510 760 770 780 790 800 810 pF1KE5 LDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATD . ..: .: :::. :: .... . : CCDS33 IKAGDNPFQ--------------------------CTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPD 520 530 540 550 820 830 840 850 860 pF1KE5 -VTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDV-WY : : ...: .. :.. ::. :. :. ..: ........ ..: . :. :: CCDS33 SYKCDYPESYRG--TLLKDFHMSELS-CNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWY 560 570 580 590 600 870 880 890 900 910 920 pF1KE5 IYHFCK-AKIKGYQRLI-----SPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKH . :. .. . : : . . . ::: :. .: . :: ::. .:: .. CCDS33 LRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHD---SFWVKNELLPNLE---KEG 610 620 630 640 650 660 930 940 950 960 970 980 pF1KE5 FNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKV ...::.::...::. ..::. :. : :..::.. .....: . .:..:. :. : CCDS33 MQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGS 670 680 690 700 710 720 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE5 DVIILIFLEKPFQ---KSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVA . .:::.:: : :.. .:.. . . :::: . . . :: :. :. CCDS33 NSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQ 730 740 750 760 770 780 pF1KE5 YSQVFKETV CCDS33 AKK 1049 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:02:05 2016 done: Tue Nov 8 04:02:06 2016 Total Scan time: 4.050 Total Display time: 0.330 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]