FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4480, 497 aa 1>>>pF1KE4480 497 - 497 aa - 497 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1681+/-0.000839; mu= 18.9314+/- 0.051 mean_var=65.5030+/-12.923, 0's: 0 Z-trim(106.4): 71 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.158469 statistics sampled from 8908 (8980) to 8908 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16 Scan time: 3.150 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 3313 766.4 0 CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 2030 472.9 2.1e-133 CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 1221 288.1 1.4e-77 CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 1220 287.8 1.6e-77 CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 1218 287.4 2.3e-77 CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 1216 286.9 3.1e-77 CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 1170 276.4 4.5e-74 CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 1163 274.8 1.4e-73 CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 1147 271.1 1.6e-72 CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 1040 246.6 3.4e-65 CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 957 227.7 2.2e-59 CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 916 218.3 1.4e-56 CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 914 217.9 2e-56 CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 894 213.3 4.7e-55 CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 822 196.9 4.5e-50 CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 820 196.4 5.8e-50 CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 816 195.5 1.1e-49 CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 809 193.9 3.3e-49 CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 808 193.6 3.4e-49 CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 794 190.4 3.1e-48 CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 792 190.0 4.8e-48 CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 788 189.0 7.8e-48 CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 776 186.4 7.8e-47 CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 737 177.4 2.8e-44 CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 728 175.4 1.2e-43 CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 728 175.4 1.2e-43 CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 728 175.4 1.2e-43 CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 728 175.4 1.3e-43 CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 725 174.7 1.9e-43 CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 724 174.4 2.3e-43 CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 716 172.7 9.5e-43 CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 709 171.0 2.5e-42 CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 701 169.2 8.8e-42 CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 682 164.8 1.8e-40 CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 681 164.6 2.2e-40 CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 678 164.0 3.6e-40 CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 656 158.9 1.1e-38 CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 632 153.3 3.4e-37 CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 419 104.6 1.4e-22 CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 341 86.9 5.7e-17 CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 489) 334 85.3 1.7e-16 CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 505) 334 85.3 1.7e-16 CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 494) 333 85.1 2e-16 CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 319 81.9 1.8e-15 CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 316 81.2 2.8e-15 CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 310 79.8 7.3e-15 CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs108|chr20 ( 627) 310 79.9 9.2e-15 CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 516) 297 76.9 6.1e-14 CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8 ( 529) 295 76.4 8.6e-14 CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3 ( 447) 287 74.5 2.7e-13 >>CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 (497 aa) initn: 3313 init1: 3313 opt: 3313 Z-score: 4090.5 bits: 766.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3313; 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CCDS48 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDSRSGKQ-------PSQTLS------PSDF 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 TSNILNRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPR .....: .:: :::::::: ::.:. :::::::::: ::::::::::::::.::: : CCDS48 LDKLMGRT-SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDSR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LKLPSDFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSM : :.. .:.: .::.: .:::::::::::.::::::: .: :: : ..: :: :. 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CCDS14 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDSRSGKQ-------PSQTLS------PSDF 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 TSNILNRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPR .....: .:: :::::::: ::.:. :::::::::. ::::::::::::::.::: : CCDS14 LDKLMGRT-SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSVTETTMDYRVNIFLRQQWNDSR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LKLPSDFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSM : :.. .:.: .::.: .:::::::::::.::::::: .: :: : ..: :: :. CCDS14 LAY-SEY-PDDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 RLSITLSCPLDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIK ::..:::::.:: ::::.: : ::::::::: .:: : : : :::. : ..:::: : CCDS14 RLTLTLSCPMDLKNFPMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQF-IL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 KEDIEYGNCTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDA ::. : : :::.:. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: :: CCDS14 KEEKELGYCTKHYN-TGKFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDA 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 SAARVPLGIFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVML . ::: ::: .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: ::.:.:::.: CCDS14 APARVALGITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAV---- 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 NNPKRVEAEKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSD : .: . : :. . .. ..: .:.... : .: : .: .: CCDS14 NFVSRQHKEFLRLRRRQKRQNKEEDVTRESRFNFSG---------YGMGHCLQV------ 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LRSNDFSIVGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRID .: . : . : . :. . : : . ::::: CCDS14 ---KDGTAVKATPAN-----------PLP----------QPPKDGDAIKKKFVDRAKRID 390 400 410 480 490 pF1KE4 LYARALFPFCFLFFNVIYWSIYL .:: ::. ::.::..:: : CCDS14 TISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK 420 430 440 450 >>CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 (464 aa) initn: 1264 init1: 468 opt: 1218 Z-score: 1502.4 bits: 287.4 E(32554): 2.3e-77 Smith-Waterman score: 1278; 47.0% identity (68.5% similar) in 464 aa overlap (38-496:25-451) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNILNRLL--- : .... .: : :..:..:. CCDS38 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRG .:: :::::::: ::.:. :::::::::: ::::::::::::::::::::: :.. CCDS38 SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAY-SEY-P 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCP .:.: .::.: .:::::::::::.::::.:: .: :: ::..:.:: :.::..::::: CCDS38 DDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGN .:: ::::.: : ::::::::: .:: : ::. :::. : ..:::: .:.: :..: CCDS38 MDLKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRY-- 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 CTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLG :::.:. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: :: CCDS38 CTKHYN-TGKFTCIEVRFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALG 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 IFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEA : .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . .: . CCDS38 ITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFV----SRQHK 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 EKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSI : :. . .. .. . : . :. : .. . : . .: CCDS38 ELLRFRRKRKNKTEAFALEKFYRFSDMDDEVRESRFSF-TAYGMGPCLQAKD-------- 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 VGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFP : :. :. :..: . :: : . :. ::.:: .:: :: CCDS38 -GMTPKG---PNH-----PVQV---MPKS-------PDEMRKVFIDRAKKIDTISRACFP 400 410 420 430 490 pF1KE4 FCFLFFNVIYWSIYL . ::.::..:: :: CCDS38 LAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD 440 450 460 >>CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 (449 aa) initn: 1264 init1: 468 opt: 1216 Z-score: 1500.1 bits: 286.9 E(32554): 3.1e-77 Smith-Waterman score: 1267; 47.4% identity (68.3% similar) in 464 aa overlap (38-496:25-436) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNILNRLL--- : .... .: : :..:..:. CCDS43 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRG .:: :::::::: ::.:. :::::::::: ::::::::::::::::::::: :.. CCDS43 SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAY-SEY-P 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCP .:.: .::.: .:::::::::::.::::.:: .: :: ::..:.:: :.::..::::: CCDS43 DDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGN .:: ::::.: : ::::::::: .:: : ::. :::. : ..:::: .:.: :..: CCDS43 MDLKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRY-- 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 CTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLG :::.:. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: :: CCDS43 CTKHYN-TGKFTCIEVRFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALG 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 IFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEA : .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . .: . CCDS43 ITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFV----SRQHK 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 EKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSI : :. . .. : . : . ..: : : :...: CCDS43 ELLRFRRKRKN--------KDDEVRES----RFSFTAYGMGPC---------LQAKD--- 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 VGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFP : :. :. :..: . :: : . :. ::.:: .:: :: CCDS43 -GMTPKG---PNH-----PVQV---MPKS-------PDEMRKVFIDRAKKIDTISRACFP 390 400 410 420 490 pF1KE4 FCFLFFNVIYWSIYL . ::.::..:: :: CCDS43 LAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD 430 440 >>CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 (449 aa) initn: 1235 init1: 438 opt: 1170 Z-score: 1443.3 bits: 276.4 E(32554): 4.5e-74 Smith-Waterman score: 1206; 45.0% identity (67.7% similar) in 462 aa overlap (41-496:22-438) 20 30 40 50 60 pF1KE4 ILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPAN-STSNILNRLL---VS ... :: .: : :..:..:. . CCDS43 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 YDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSD :: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .: CCDS43 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD .: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.: CCDS43 SLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMD 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGNCT : ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: :: CCDS43 LKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRY--CT 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIF :.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::: CCDS43 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEK .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . .: . : CCDS43 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFV----SRQHKEL 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 ARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVG :. . .. .:. : : ..:. .: . : . .: .:. : CCDS43 LRFRRKRRH--------HKEDEAGEGR-FNFSAYGMGPA-----CLQAKD----GISVKG 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 SLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFC . .: . . : .:.: . .. ::.:: .: ::. CCDS43 A-------NNSNTTNPP-----------PAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMA 390 400 410 420 490 pF1KE4 FLFFNVIYWSIYL ::.::..:: :: CCDS43 FLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ 430 440 >>CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 (457 aa) initn: 1235 init1: 438 opt: 1163 Z-score: 1434.5 bits: 274.8 E(32554): 1.4e-73 Smith-Waterman score: 1210; 45.2% identity (68.4% similar) in 462 aa overlap (41-496:22-446) 20 30 40 50 60 pF1KE4 ILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPAN-STSNILNRLL---VS ... :: .: : :..:..:. . CCDS54 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 YDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSD :: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .: CCDS54 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD .: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.: CCDS54 SLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMD 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGNCT : ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: :: CCDS54 LKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRY--CT 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIF :.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::: CCDS54 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEK .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . . : : . CCDS54 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHK--ELLR 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 ARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVG : : .. . :. ... . : : ..:. .: . : . .: .:. : CCDS54 FR-RKRRHHKSPMLNLFQEDEA-GEGR-FNFSAYGMGPA-----CLQAKD----GISVKG 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 SLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFC . .: . . : .:.: . .. ::.:: .: ::. CCDS54 A-------NNSNTTNPP-----------PAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMA 400 410 420 430 490 pF1KE4 FLFFNVIYWSIYL ::.::..:: :: CCDS54 FLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ 440 450 >>CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX (417 aa) initn: 1096 init1: 799 opt: 1147 Z-score: 1415.3 bits: 271.1 E(32554): 1.6e-72 Smith-Waterman score: 1147; 57.5% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (55-350:43-339) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 KSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNILNRLL---VSYDPRIRPNFKGIPVD : :..:..:. .:: :::::::: ::. CCDS43 LLWTLPGQVLLRVALAKEEVKSGTKGSQPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNFKGPPVN 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 VVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSDALTVDPTMYKCLWKP :. :::::::.:: .::::::::.::::.::::::. .:.: .::.: .::: CCDS43 VTCNIFINSFSSITKTTMDYRVNVFLRQQWNDPRLSYRE--YPDDSLDLDPSMLDSIWKP 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 DLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLDLTLFPMDTQRCKMQL ::::::::.::::.:: .: :: ::..:.:: :.::.. ::: .:: :::: : : ::: CCDS43 DLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLILSCLMDLKNFPMDIQTCTMQL 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 pF1KE4 ESFGYTTDDLRFIWQSGDP-VQL-EKIALPQFDIKKEDIEYGNCTKYYKGTGYYTCVEVI :::::: :: : : : ::. : ..:::: : ... . : :::.:. :: .::.:: CCDS43 ESFGYTMKDLVFEWLEDAPAVQVAEGLTLPQF-ILRDEKDLGCCTKHYN-TGKFTCIEVK 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 FTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIFSVLSLASECTTLAAE : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::: .::..... . : CCDS43 FHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRAS 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 LPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEKARIAKAEQADGKGGN :::::::::.:.:. .:::: ::.:.:::.. CCDS43 LPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAINFVSRQHKEFIRLRRRQRRQRLEEDIIQE 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 VAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVGSLPRDFELSNYDCYG CCDS43 SRFYFRGYGLGHCLQARDGGPMEGSGIYSPQPPAPLLREGETTRKLYVD 370 380 390 400 410 >>CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (363 aa) initn: 1093 init1: 479 opt: 1040 Z-score: 1284.0 bits: 246.6 E(32554): 3.4e-65 Smith-Waterman score: 1082; 46.4% identity (66.4% similar) in 399 aa overlap (99-496:1-352) 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 PRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSDAL :::::::::::.::: :: :.. .:.: CCDS55 MDYRVNIFLRQQWNDSRLAY-SEY-PDDSL 10 20 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 TVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLDLT .::.: .:::::::::::.::::::: .: :: : ..: :: :.::..:::::.:: CCDS55 DLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLK 30 40 50 60 70 80 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKEDIEYGNCTKYY ::::.: : ::::::::: .:: : : : :::. : ..:::: : ::. : : :::.: CCDS55 NFPMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQF-ILKEEKELGYCTKHY 90 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 KGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIFSVL . :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::: .:: CCDS55 N-TGKFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVL 150 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 SLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEKARI ..... . : :::::::::.:.:. .:::: ::.:.:::.:. . .: . : :. CCDS55 TMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFV----SRQHKEFLRL 210 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 AKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVGSLP . .. ..: .:.... : .: : .: .: .: . : . : CCDS55 RRRQKRQNKEEDVTRESRFNFSG---------YGMGHCLQV---------KDGTAVKATP 270 280 290 300 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 RDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFCFLF . :. . : : . ::::: .:: ::. ::. CCDS55 AN-----------PLP----------QPPKDGDAIKKKFVDRAKRIDTISRAAFPLAFLI 310 320 330 340 490 pF1KE4 FNVIYWSIYL ::..:: : CCDS55 FNIFYWITYKIIRHEDVHKK 350 360 497 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 00:52:15 2016 done: Sun Nov 6 00:52:16 2016 Total Scan time: 3.150 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]