FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3919, 707 aa 1>>>pF1KE3919 707 - 707 aa - 707 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9957+/-0.00134; mu= 16.3573+/- 0.080 mean_var=82.3550+/-16.649, 0's: 0 Z-trim(101.1): 63 B-trim: 34 in 1/50 Lambda= 0.141328 statistics sampled from 6319 (6369) to 6319 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16 Scan time: 3.190 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 707) 4710 971.1 0 CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 735) 3808 787.2 0 CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 690) 3676 760.3 0 CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 436) 410 94.3 4.3e-19 CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 404) 353 82.6 1.3e-15 CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 423) 352 82.4 1.5e-15 CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 444) 324 76.7 8.2e-14 CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 491) 324 76.7 8.9e-14 >>CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (707 aa) initn: 4710 init1: 4710 opt: 4710 Z-score: 5191.4 bits: 971.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4710; 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CCDS32 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNV 10 20 30 40 50 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 MTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCL-LRPKTFRSVSH-CR .. .: :. ::. . . : . . . .: . .:..:::: . ...:. .. :: CCDS32 LALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCR 60 70 80 90 100 110 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNL-SNTTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLA :.. ::.. : :: . .:. : . :.: : :.::: ... : . :..:... CCDS32 NIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNIS 120 130 140 150 160 170 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 YCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLT .: . : :.: : :: : : :.::::. ....::. : .. :... .: CCDS32 WCDQVTKDGIQ--ALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQIT 180 190 200 210 220 230 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 DNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSA-C-KLRKIRFEGNKRVTDASFKFID :. . .. . : .. :: .: .:.: . ::. : .:: .. ...::..: . CCDS32 DEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLA 240 250 260 270 280 290 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLS-PLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGP-ASMR .: .: .. . .: ::::.: .:: .: ::.:..: : : :.... .: : . CCDS32 RNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQ 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT .. ..:.:: ..:::. .: . : .:. . : .:...: :: CCDS32 LEVIELDNCPLITDASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFA 360 370 380 390 400 410 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 DISNEAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLS CCDS32 PVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL 420 430 >>CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (404 aa) initn: 750 init1: 226 opt: 353 Z-score: 394.0 bits: 82.6 E(32554): 1.3e-15 Smith-Waterman score: 497; 28.2% identity (59.4% similar) in 372 aa overlap (158-523:28-365) 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 RAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQVNHAWML ::.. .:.:: .:.. . :.::..:: . CCDS54 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNV 10 20 30 40 50 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 MTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCL-LRPKTFRSVSH-CR .. .: :. ::. . . : . . . .: . .:..:::: . ...:. .. :: CCDS54 LALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCR 60 70 80 90 100 110 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLAY :.. ::.. : :: .:::: :..:.... CCDS54 NIEVLNLNGCTKTTD------AEGCPL-------------------------LEQLNISW 120 130 140 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 CRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLTD : . : :.: : :: : : :.::::. ....::. : .. :... .:: CCDS54 CDQVTKDGIQ--ALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITD 150 160 170 180 190 200 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 NCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSA-C-KLRKIRFEGNKRVTDASFKFIDK . . .. . : .. :: .: .:.: . ::. : .:: .. ...::..: . . CCDS54 EGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLAR 210 220 230 240 250 260 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 NYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLS-PLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGP-ASMRI : .: .. . .: ::::.: .:: .: ::.:..: : : :.... .: : .. CCDS54 NCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQL 270 280 290 300 310 320 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 RELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGTD . ..:.:: ..:::. .: . : .:. . : .:...: :: CCDS54 EVIELDNCPLITDASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAP 330 340 350 360 370 380 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 ISNEAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSA CCDS54 VTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL 390 400 >>CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (423 aa) initn: 559 init1: 222 opt: 352 Z-score: 392.6 bits: 82.4 E(32554): 1.5e-15 Smith-Waterman score: 544; 27.7% identity (65.5% similar) in 357 aa overlap (158-507:15-368) 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 RAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQVNHAWML ::.. .:.:: .:.. . :.:...:: . 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CCDS54 CRRWYNLAWDPRLWRTIRLTG-ETINVDR-ALKVLTR----------RLCQDTPNV---- 150 160 170 180 250 260 270 280 290 pF1KE3 SHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVL------CLNLSNTTITNRTMRLLPRHF : :. ..:: : .::... :.. :: . : :.:: .. . .. : : CCDS54 --CLMLETVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFD-VVSLCP--- 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 pF1KE3 HNLQNLSLAYCRRFTDKGLQY---LNLGNGCHKLI---YLDLSGCTQISVQGFRYIANSC ::..:... : . : .: ..:. : : :::.. : . .:.. :: : CCDS54 -NLEHLDVSGCSKVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHC 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 TGIMHLTINDMPTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEG : . :: . :::. .. :: :. : : .::: : CCDS54 TQLTHLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCASIKEL------SVSDCRF--------------- 300 310 320 330 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 NKRVTDASFKFIDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPL-KQLTVLNLANCVRIGDMG :.: ... : : : .. .: : .:: ..: .. ..: :: .: : : : CCDS54 ---VSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHG 340 350 360 370 380 390 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 LKQFLDGPASMRIRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIV- . ..: . ... :....: .::... :. : ::. :::..:: .:.::. .. CCDS54 V-EYL-AKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQGLQIVAA 400 410 420 430 440 450 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 NIFSLVSIDLSGTDISNEAF------CKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLT : :.: ..... ..: ::. :: ..:: . .. CCDS54 NCFDLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRC-VIEHTNPAFF 460 470 480 490 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 SLSIAGCPKITDSAMEMLSAKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCT 707 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 08:57:32 2016 done: Sun Nov 6 08:57:32 2016 Total Scan time: 3.190 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]