Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1563
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1563, 458 aa
  1>>>pF1KE1563 458 - 458 aa - 458 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4526+/-0.000785; mu= 17.0612+/- 0.047
 mean_var=67.1130+/-13.274, 0's: 0 Z-trim(107.3): 32  B-trim: 3 in 1/53
 Lambda= 0.156556
 statistics sampled from 9456 (9484) to 9456 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.291), width:  16
 Scan time:  3.060

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10           ( 458) 3154 721.3 5.2e-208
CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4             ( 476) 1411 327.6 1.7e-89
CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4            ( 515) 1315 305.9 6.2e-83
CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4             ( 641) 1315 306.0 7.5e-83
CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4            ( 652) 1315 306.0 7.6e-83
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20        ( 734)  834 197.4 4.2e-50
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10        ( 756)  774 183.8 5.2e-46
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7            (1158)  685 163.8 8.5e-40
CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12            ( 443)  678 162.0 1.1e-39
CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17           (1133)  572 138.3   4e-32
CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17           (1380)  572 138.3 4.7e-32


>>CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10                (458 aa)
 initn: 3154 init1: 3154 opt: 3154  Z-score: 3848.0  bits: 721.3 E(32554): 5.2e-208
Smith-Waterman score: 3154; 100.0% identity (100.0% similar) in 458 aa overlap (1-458:1-458)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYSIGRSVEGRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYSIGRSVEGRHL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 YVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRNQRIVQLIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRNQRIVQLIQD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 TRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIYYNEKYGGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIYYNEKYGGPN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 HHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDKSFEHRVRGVRRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDKSFEHRVRGVRRT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 ASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNCGDYFPDGITNGASWYSLSKGMQDFNYLHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNCGDYFPDGITNGASWYSLSKGMQDFNYLHT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 NCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAVIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAVIS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 VSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVGPAEPTLVNFHLKRSIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVGPAEPTLVNFHLKRSIP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450        
pF1KE1 QVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
              430       440       450        

>>CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4                  (476 aa)
 initn: 1441 init1: 694 opt: 1411  Z-score: 1720.1  bits: 327.6 E(32554): 1.7e-89
Smith-Waterman score: 1411; 53.1% identity (77.5% similar) in 409 aa overlap (21-416:49-450)

                         10        20        30        40        50
pF1KE1           MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
                                     ..:..::: .: ..: .:  .: .:.:.:.
CCDS38 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
       20        30        40        50        60        70        

               60        70        80        90       100       110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
       .::: :::.: :.:.::.::.::: ::: ::.::::::::.::::.. :...::.:... 
CCDS38 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
       80        90       100       110       120       130        

              120       130       140       150       160       170
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYI
       :. ::.::..:::::.::.::::.: ::.:  .   ..:::.::.:.:::::::::.  .
CCDS38 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
      140       150       160       170       180       190        

              180       190            200       210       220     
pF1KE1 YYNEKYGGPNHHLPLPDNWK-----SQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYP
       : ::: ::::.:: : .  :     ... :::.:::.:. .. :::::::::: .:::::
CCDS38 YVNEKEGGPNNHL-LKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYP
      200       210        220       230       240       250       

         230       240       250       260             270         
pF1KE1 YDKSFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQG------WNCGDY-FPDG
       ::   : :  .... .:.  ::: .::.::..::  .  : .        :  :  : ::
CCDS38 YD---ETRSGSAHEYSSS--PDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDG
          260       270         280       290       300       310  

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE1 ITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQV
        :::..:::.  :::::::: .::::::.::::.:::::: :.  :  :...::..:::.
CCDS38 TTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQI
            320       330       340       350       360       370  

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE1 HQGIKGMVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPET
       :.:.::.: : . : .:::.::: ::.:::::.  :::.:::.:: : ..:.::::   :
CCDS38 HRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAIT
            380       390       400       410       420       430  

      400       410        420       430       440       450       
pF1KE1 VTVTVGPAEPTL-VNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGP
         :.: :  :.  :.:.:.                                         
CCDS38 KKVAV-PYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF               
             440       450       460       470                     

>>CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4                 (515 aa)
 initn: 1179 init1: 605 opt: 1315  Z-score: 1602.4  bits: 305.9 E(32554): 6.2e-83
Smith-Waterman score: 1315; 50.3% identity (77.0% similar) in 392 aa overlap (21-406:46-432)

                         10        20        30        40        50
pF1KE1           MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
                                     . : :: : ..::.: .. ..:  ..:.::
CCDS43 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
          20        30        40        50        60        70     

               60        70        80        90       100       110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
       :::: .::.: :.:::..:: :: .::::: .::.::::. :::... :...:: :.   
CCDS43 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
          80        90       100       110       120       130     

              120       130       140       150       160          
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNT-Y
       : :: .:.. ::::.::::::::::::::.: .  :.  ::.::...:::::::::.. :
CCDS43 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
         140       150       160       170       180       190     

     170       180        190       200       210       220        
pF1KE1 IYYNEKYGGPNHHLPLPDN-WKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDK
           :  :. . :.:.:.. : ..: :::.:...::... :::::.:::: .:..::.: 
CCDS43 YRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDF
         200       210       220       230       240       250     

      230       240       250       260        270          280    
pF1KE1 SFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMF-QGWN-CG-DYFPDG-ITNGAS
       : .:     ..   .::::.:.:. :...:. .:  :. .. : :: ...  : : :::.
CCDS43 S-KH---PQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGAD
             260       270       280       290       300       310 

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE1 WYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKG
       :::.. ::.:::::::::::::.::.: :::::: :   :  :.:.:..:.: ::.::::
CCDS43 WYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKG
             320       330       340       350       360       370 

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 MVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVG
       .: :.  . . :: :::.:: ::.:..  :::.::: :::. : : ::::  ...  .. 
CCDS43 VVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGY-AKVIKKVII
             380       390       400       410       420        430

          410       420       430       440       450              
pF1KE1 PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA      
       ::                                                          
CCDS43 PARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSA
              440       450       460       470       480       490

>>CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4                  (641 aa)
 initn: 1179 init1: 605 opt: 1315  Z-score: 1600.9  bits: 306.0 E(32554): 7.5e-83
Smith-Waterman score: 1315; 50.3% identity (77.0% similar) in 392 aa overlap (21-406:172-558)

                         10        20        30        40        50
pF1KE1           MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
                                     . : :: : ..::.: .. ..:  ..:.::
CCDS34 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
             150       160       170       180       190       200 

               60        70        80        90       100       110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
       :::: .::.: :.:::..:: :: .::::: .::.::::. :::... :...:: :.   
CCDS34 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
             210       220       230       240       250       260 

              120       130       140       150       160          
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNT-Y
       : :: .:.. ::::.::::::::::::::.: .  :.  ::.::...:::::::::.. :
CCDS34 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
             270       280       290       300       310       320 

     170       180        190       200       210       220        
pF1KE1 IYYNEKYGGPNHHLPLPDN-WKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDK
           :  :. . :.:.:.. : ..: :::.:...::... :::::.:::: .:..::.: 
CCDS34 YRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDF
             330       340       350       360       370       380 

      230       240       250       260        270          280    
pF1KE1 SFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMF-QGWN-CG-DYFPDG-ITNGAS
       : .:     ..   .::::.:.:. :...:. .:  :. .. : :: ...  : : :::.
CCDS34 S-KH---PQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGAD
                 390       400       410       420       430       

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE1 WYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKG
       :::.. ::.:::::::::::::.::.: :::::: :   :  :.:.:..:.: ::.::::
CCDS34 WYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKG
       440       450       460       470       480       490       

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 MVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVG
       .: :.  . . :: :::.:: ::.:..  :::.::: :::. : : ::::  ...  .. 
CCDS34 VVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGY-AKVIKKVII
       500       510       520       530       540        550      

          410       420       430       440       450              
pF1KE1 PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA      
       ::                                                          
CCDS34 PARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSA
        560       570       580       590       600       610      

>>CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4                 (652 aa)
 initn: 1179 init1: 605 opt: 1315  Z-score: 1600.8  bits: 306.0 E(32554): 7.6e-83
Smith-Waterman score: 1315; 50.3% identity (77.0% similar) in 392 aa overlap (21-406:183-569)

                         10        20        30        40        50
pF1KE1           MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
                                     . : :: : ..::.: .. ..:  ..:.::
CCDS33 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
            160       170       180       190       200       210  

               60        70        80        90       100       110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
       :::: .::.: :.:::..:: :: .::::: .::.::::. :::... :...:: :.   
CCDS33 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
            220       230       240       250       260       270  

              120       130       140       150       160          
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNT-Y
       : :: .:.. ::::.::::::::::::::.: .  :.  ::.::...:::::::::.. :
CCDS33 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
            280       290       300       310       320       330  

     170       180        190       200       210       220        
pF1KE1 IYYNEKYGGPNHHLPLPDN-WKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDK
           :  :. . :.:.:.. : ..: :::.:...::... :::::.:::: .:..::.: 
CCDS33 YRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDF
            340       350       360       370       380       390  

      230       240       250       260        270          280    
pF1KE1 SFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMF-QGWN-CG-DYFPDG-ITNGAS
       : .:     ..   .::::.:.:. :...:. .:  :. .. : :: ...  : : :::.
CCDS33 S-KH---PQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGAD
                400       410       420       430       440        

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE1 WYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKG
       :::.. ::.:::::::::::::.::.: :::::: :   :  :.:.:..:.: ::.::::
CCDS33 WYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKG
      450       460       470       480       490       500        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 MVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVG
       .: :.  . . :: :::.:: ::.:..  :::.::: :::. : : ::::  ...  .. 
CCDS33 VVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGY-AKVIKKVII
      510       520       530       540       550        560       

          410       420       430       440       450              
pF1KE1 PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA      
       ::                                                          
CCDS33 PARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSA
       570       580       590       600       610       620       

>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20             (734 aa)
 initn: 1269 init1: 599 opt: 834  Z-score: 1012.9  bits: 197.4 E(32554): 4.2e-50
Smith-Waterman score: 1299; 48.2% identity (71.7% similar) in 448 aa overlap (20-451:294-730)

                          10        20        30        40         
pF1KE1            MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVY
                                     :. :.:: :  . . . .::..::.:::.:
CCDS13 APCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDPLDFQHHNYKAMRKLMKQVQEQCPNITRIY
           270       280       290       300       310       320   

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE1 SIGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRN
       :::.: .: .:::.:.::.:: ::  ::::.::..:::::::::::.: : .:::.::  
CCDS13 SIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGNEALGRELLLLLMQFLCHEFLR
           330       340       350       360       370       380   

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE1 RNQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTY
        : :...:... :::.::::::::::.:  .: .  :.  :: : ...:::.:: :::: 
CCDS13 GNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWAEGRWNNQSIDLNHNFADLNTP
           390       400       410       420       430       440   

     170            180          190       200       210       220 
pF1KE1 IYYNEKYGG-----PNHHLPLPDNW---KSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVV
       ..  .  :      ::::::::  .   .. : :::::::.::. . :::::::::: .:
CCDS13 LWEAQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTLPNATVAPETRAVIKWMKRIPFVLSANLHGGELV
           450       460       470       480       490       500   

             230       240       250       260       270           
pF1KE1 ANYPYDKSFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWN---CG--DYFP
       ..::.: .   :.  . :   :::::: .:. :. ::. ..  : :  .   :   :.  
CCDS13 VSYPFDMT---RTPWAAREL-TPTPDDAVFRWLSTVYAGSNLAM-QDTSRRPCHSQDFSV
           510          520        530       540        550        

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE1 DG-ITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFL
        : : :::.:...  .:.::.::::::::.:.:::::::: :.:: .:: .:..::. .:
CCDS13 HGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFPHENELPQEWENNKDALLTYL
      560       570       580       590       600       610        

         340       350        360       370       380       390    
pF1KE1 EQVHQGIKGMVLDENYN-NLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGY
       :::..:: :.: :.. . ..:.:::.:.:::::::..  :::.::: :: : :.:.: ::
CCDS13 EQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGGDYWRLLTPGDYMVTASAEGY
      620       630       640       650       660       670        

          400        410       420       430       440       450   
pF1KE1 DPETVTVTVGPAE-PTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQL
          : .  :   : :   :: : ..     : .:   .  .. ::: :. :..  ..:  
CCDS13 HSVTRNCRVTFEEGPFPCNFVLTKT-----PKQRL-RELLAAGAKVPPDLRRRLERLRGQ
      680       690       700             710       720       730  

            
pF1KE1 QRGPA
            
CCDS13 KD   
            

>>CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10             (756 aa)
 initn: 1225 init1: 567 opt: 774  Z-score: 939.5  bits: 183.8 E(32554): 5.2e-46
Smith-Waterman score: 1245; 45.1% identity (70.7% similar) in 450 aa overlap (23-456:316-756)

                       10        20        30        40         50 
pF1KE1         MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNE-CPGITRVYSI
                                     :.:: : .. : :.:: :: ::.:::.:.:
CCDS76 MRMEILGCPLPDPNNYYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEM-RQLMKVVNEMCPNITRIYNI
         290       300       310       320        330       340    

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE1 GRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRN
       :.: .: .::..:.::::: ::  ::: .:... ::::.:::::.: : .:.:.:.  ::
CCDS76 GKSHQGLKLYAVEISDHPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRELLLLLVQFVCQEYLARN
          350       360       370       380       390       400    

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE1 QRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIY
        :::.:...::::.:::.:::::: :   : .  :. .:: . .:.:.: ::::::: ..
CCDS76 ARIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTHDGIDINNNFPDLNTLLW
          410       420       430       440       450       460    

                  180       190          200       210       220   
pF1KE1 YNEKYGG-----PNHHLPLPDNWKSQ---VEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVAN
         :   .     :::.. .:. . :.   :  :::::: ::... :::..::.:: .:. 
CCDS76 EAEDRQNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEKIPFVLGGNLQGGELVVA
          470       480       490       500       510       520    

           230       240        250       260       270            
pF1KE1 YPYDKSFEHRVRGVRRTAS-TPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWN--CG--DYFPD-
       ::::      ::.  .:   ::::::..:. ::  :. .:  : ..    :   :.  . 
CCDS76 YPYD-----LVRSPWKTQEHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARRRVCHTEDFQKEE
               530       540       550       560       570         

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE1 GITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQ
       : .:::::.... ...::.::::::::... ..:::.: : .: .:: .:::.:: :.::
CCDS76 GTVNGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEEWENNRESLIVFMEQ
     580       590       600       610       620       630         

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE1 VHQGIKGMVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPE
       ::.::::.: : . ... ::.::: :::::. ... :::.::: :: :.:.: : :.   
CCDS76 VHRGIKGLVRDSHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPGEYVVTAKAEGFTAS
     640       650       660       670       680       690         

       400        410       420       430       440       450      
pF1KE1 TVTVTVG-PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRG
       : .  ::     :  .: :...  ... .:.   .. : .    :  : :   ... :::
CCDS76 TKNCMVGYDMGATRCDFTLSKT--NMARIREI-MEKFGKQPVSLPARRLKLRGQKRRQRG
     700       710       720          730       740       750      

         
pF1KE1 PA

>>CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7                 (1158 aa)
 initn: 1160 init1: 540 opt: 685  Z-score: 828.0  bits: 163.8 E(32554): 8.5e-40
Smith-Waterman score: 1168; 43.4% identity (66.7% similar) in 468 aa overlap (23-444:562-1028)

                       10        20        30        40         50 
pF1KE1         MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNE-CPGITRVYSI
                                     :::: : :. : :.:: :: :: :::.::.
CCDS54 CMRLEVLGCSVAPVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDM-RQLMKVVNEECPTITRTYSL
             540       550       560       570        580       590

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE1 GRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRN
       :.: .: ..:..:.::.:: ::  ::: .:....::::.:::::.: : ..::.:.:. :
CCDS54 GKSSRGLKIYAMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDGN
              600       610       620       630       640       650

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE1 QRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIY
        :. .:.::::::..::.::::::::: .: .  .. .:  . .: :. ..:::::. ..
CCDS54 PRVRSLVQDTRIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVLW
              660       670       680       690       700       710

                  180       190          200       210       220   
pF1KE1 YNEK-----YGGPNHHLPLPDNWKSQ---VEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVAN
         :.     :  ::..::.:. . :    :  :.::.: ::..  :::.:::.::  ...
CCDS54 GAEERKWVPYRVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGANLNGGERLVS
              720       730       740       750       760       770

           230                     240       250       260         
pF1KE1 YPYDKSFEHR-----------VRGVRR---TASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGW
       :::: .               .::  .   . .  :::  .:. ::  .. ::  . . .
CCDS54 YPYDMARTPTQEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFASAHLTLTEPY
              780       790       800       810       820       830

     270            280       290       300       310       320    
pF1KE1 NCG----DYFPD-GITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREW
         :    ::    ::.:::.:   .  ..::.::::::.:... :.::::: : :: :::
CCDS54 RGGCQAQDYTGGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFPHESELPREW
              840       850       860       870       880       890

          330       340       350       360       370       380    
pF1KE1 LGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGI
        .:.:::. :.::::.::::.: ::.   .:::.:::::::: : ... :::.:.: :: 
CCDS54 ENNKEALLTFMEQVHRGIKGVVTDEQGIPIANATISVSGINHGVKTASGGDYWRILNPGE
              900       910       920       930       940       950

          390       400        410                       420       
pF1KE1 YTVSATAPGYDPETVTVTVG-PAEPTLVNFHLKRS----------------IPQVSPVR-
       : :.: : :: : . : .:      :  :: : ::                ::...: : 
CCDS54 YRVTAHAEGYTPSAKTCNVDYDIGATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNRPIPHIDPSRP
              960       970       980       990      1000      1010

        430       440       450                                    
pF1KE1 RAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA                            
        .:..:.  . ..: . :                                          
CCDS54 MTPQQRRLQQRRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATTLSTTIEPWGL
             1020      1030      1040      1050      1060      1070

>>CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12                 (443 aa)
 initn: 1047 init1: 364 opt: 678  Z-score: 825.8  bits: 162.0 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1049; 43.5% identity (69.5% similar) in 416 aa overlap (9-419:6-392)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYSIGRSVEGRHL
               : : ::. ::: . : .:: . .   :  : ..  ..:...:::.::.::.:
CCDS89    MDFPCLWLGLLLPLVAALDFNYHRQEGMEAFLKTVAQNYSSVTHLHSIGKSVKGRNL
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 YVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRNQRIVQLIQD
       .::  .  :  :.   :: :::.::::.:..::::.:.: ..:     ... .:..::..
CCDS89 WVLVVGRFPKEHRIGIPEFKYVANMHGDETVGRELLLHLIDYLVTS-DGKDPEITNLINS
        60        70        80        90       100        110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 TRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIYYNEKYGGPN
       :::::.:::::::.:  :.. :.   : .::.: :  ::::::::   :           
CCDS89 TRIHIMPSMNPDGFE--AVKKPDCY-YSIGRENYNQYDLNRNFPDAFEY-----------
        120       130          140       150       160             

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 HHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDKSFEHRVRGVRRT
             .: . :  ::: ::..:... .:::::::::::.::.::.:.. .  . :.  .
CCDS89 ------NNVSRQ--PETVAVMKWLKTETFVLSANLHGGALVASYPFDNGVQ--ATGALYS
                    170       180       190       200         210  

              250       260       270         280       290        
pF1KE1 ASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNCGDY--FPDGITNGASWYSLSKGMQDFNYL
        :  :::: .:: ::..:.  .  : .: .: .   ::.:.::: ::: :. ::::.::.
CCDS89 RSL-TPDDDVFQYLAHTYASRNPNMKKGDECKNKMNFPNGVTNGYSWYPLQGGMQDYNYI
             220       230       240       250       260       270 

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE1 HTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAV
        ..:::::::::: :.: ::.:   : .:. .::....::: :.::.:.:.: : : :..
CCDS89 WAQCFEITLELSCCKYPREEKLPSFWNNNKASLIEYIKQVHLGVKGQVFDQNGNPLPNVI
             280       290       300       310       320       330 

      360         370       380       390       400       410      
pF1KE1 ISVSGINH--DVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVGPAEPTLVNFH-L
       . :.  .:     .. .:.:. ::::: : ...:.::.::. .: .. : .    ::  :
CCDS89 VEVQDRKHICPYRTNKYGEYYLLLLPGSYIINVTVPGHDPH-ITKVIIPEKSQ--NFSAL
             340       350       360       370        380          

         420       430       440       450                    
pF1KE1 KRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA            
       :..:                                                   
CCDS89 KKDILLPFQGQLDSIPVSNPSCPMIPLYRNLPDHSAATKPSLFLFLVSLLHIFFK
      390       400       410       420       430       440   

>>CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17                (1133 aa)
 initn: 1169 init1: 368 opt: 572  Z-score: 690.2  bits: 138.3 E(32554): 4e-32
Smith-Waterman score: 709; 51.1% identity (74.2% similar) in 225 aa overlap (209-424:3-221)

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE1 PNHHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDKSFEHRVRGVR
                                     ::::.:::::.:::.::.: : ::.. :. 
CCDS56                             MRFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGIY
                                           10        20        30  

      240       250       260        270           280       290   
pF1KE1 RTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGW-NC-GDY---FPDGITNGASWYSLSKGMQ
           . : ::..:. :::.:.  :  :  :  .: ::    : ::::::: ::..  :::
CCDS56 ----SKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIMKTGEPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQ
                 40        50        60        70        80        

           300       310       320       330       340        350  
pF1KE1 DFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDE-NYN
       :.::. .::::::::::: :.::  .:..:: .:::.:: ..:.:: :.::.: :  . .
CCDS56 DYNYVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGS
       90       100       110       120       130       140        

            360       370       380       390       400            
pF1KE1 NLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTV---GPAEPT
       .: ::.:::.::::..:.:  ::..:::.:: :.....  :: : ::: .:   :::  :
CCDS56 GLENATISVAGINHNITTGRFGDFYRLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPA--T
      150       160       170       180       190       200        

     410       420       430       440       450                   
pF1KE1 LVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA           
        :.: :. .. .: :                                             
CCDS56 EVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFL
        210       220       230       240       250       260      

>--
 initn: 1169 init1: 368 opt: 572  Z-score: 690.2  bits: 138.3 E(32554): 4e-32
Smith-Waterman score: 1289; 49.0% identity (73.2% similar) in 410 aa overlap (15-418:246-626)

                               10        20        30        40    
pF1KE1                 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPG
                                     .. . :  :.::.. :.   : .  :: :.
CCDS56 VTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPN
         220       230       240       250       260       270     

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE1 ITRVYSIGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLC
       :::.::.:.:::.:.:::.:.::.::.::: ::: ::.:::::::..::::.:.: :.::
CCDS56 ITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLC
         280       290       300       310       320       330     

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE1 EEFRNRNQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFP
       ..: . . ....:...::::..:::::::::  . .: .    ..::::.:. :::::::
CCDS56 KNF-GTDPEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFP
          340       350       360        370         380       390 

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE1 DLNTYIYYNEKYGGPNHHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANY
       :               . . . :     ..::: ::. ::.:. ::::::::::..:.::
CCDS56 D---------------QFVQITD----PTQPETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNY
                                400       410       420       430  

          230       240       250       260       270              
pF1KE1 PYDKSFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNC-----GDYFPDGI
       :.: . .    :.  .. . .::: .::..:  ::  .. ::::  :     ..::: ::
CCDS56 PFDDDEQ----GL--ATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGI
                440         450       460       470       480      

     280       290       300       310       320       330         
pF1KE1 TNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVH
       :::::::..  ::::.:::.:::::.:.::.: :.: :.::   :  ::..::::..:::
CCDS56 TNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVH
        490       500       510       520       530       540      

     340        350       360       370       380       390        
pF1KE1 QGIKGMVLDE-NYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPET
       ::..:.:::  .  .. ::.:::. ::: ::.   :::.:::.:: : ..:.: ::.: :
CCDS56 QGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVT
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        .:::       ::: : ::                                        
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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