FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6339, 429 aa 1>>>pF1KE6339 429 - 429 aa - 429 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7797+/- 0.001; mu= 14.7027+/- 0.060 mean_var=68.3461+/-13.608, 0's: 0 Z-trim(103.8): 27 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.155138 statistics sampled from 7583 (7601) to 7583 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16 Scan time: 2.410 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 ( 429) 2779 631.3 5.6e-181 CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 ( 388) 797 187.7 1.8e-47 CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 372) 505 122.3 8e-28 CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 323) 439 107.5 2e-23 CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 320) 432 105.9 5.8e-23 CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 369) 432 106.0 6.6e-23 CCDS3996.1 SLC30A5 gene_id:64924|Hs108|chr5 ( 765) 264 68.5 2.6e-11 >>CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 (429 aa) initn: 2779 init1: 2779 opt: 2779 Z-score: 3362.7 bits: 631.3 E(32554): 5.6e-181 Smith-Waterman score: 2779; 100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-429) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAGSGAWKRLKSMLRKDDAPLFLNDTSAFDFSDEAGDEGLSRFNKLRVVVADDGSEAPER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MAGSGAWKRLKSMLRKDDAPLFLNDTSAFDFSDEAGDEGLSRFNKLRVVVADDGSEAPER 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 PVNGAHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQREILKQRKVKARLTIAAVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 PVNGAHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQREILKQRKVKARLTIAAVL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 YLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 VLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 HRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 HRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 YKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 NIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRT 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 CANCQSSSP ::::::::: CCDS10 CANCQSSSP >>CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 (388 aa) initn: 772 init1: 423 opt: 797 Z-score: 965.9 bits: 187.7 E(32554): 1.8e-47 Smith-Waterman score: 797; 37.2% identity (69.6% similar) in 349 aa overlap (79-425:39-383) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 VVADDGSEAPERPVNGAHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQREILKQR . :: .. . . : : . CCDS17 GLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPLPPPGLTPE 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 KVKAR--LTIAAVLYLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSK ...:: : : .. ..:: ::.::::.:.:::::::: :.:.:..... .:..::::.. CCDS17 RLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSLWLSTR 70 80 90 100 110 120 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 SPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGV :. .:::.:: :.:.:. ::. .... :.::: : : .: .:.:.: ::.::...: CCDS17 PATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLTASIAV 130 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 AVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSV .:..:.:.:.:.: :::. .: . : :. . .:::::::.::::.:: CCDS17 CANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLE-EGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDLLQSF 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 GVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKE ::: :. .: :::.:: :::: :..::. . .: . :.. :..::.: ... . ... CCDS17 GVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFEPVRD 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 ALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRC .:... : ....:..:.:: .: .:. . :.. : : ..:. : . ::. : CCDS17 TLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAI--DSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFSSC 310 320 330 340 350 360 410 420 pF1KE6 TIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP :.:...:. :. . : :: CCDS17 TLQVEQYQPEMAQ-CLRCQEPPQA 370 380 >>CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (372 aa) initn: 867 init1: 505 opt: 505 Z-score: 613.0 bits: 122.3 E(32554): 8e-28 Smith-Waterman score: 913; 39.0% identity (71.6% similar) in 387 aa overlap (56-428:2-371) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 TSAFDFSDEAGDEGLSRFNKLRVVVADDGSEAPERP-VNGAHPTLQADDDSLLDQD---L :: :. . :.:.... :: .. . 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CCDS30 WVVTGVLVYLAVERLISGDYEIDGGTMLITSGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTT--- 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 NSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYV :. ... .:::::.:..::..::.:::.::::. :::::: .:::::.: CCDS30 -----------NQQEENPSVRAAFIHVIGDFMQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFV 210 220 230 240 250 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 FSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKST ::.:: ::. :. :......::.:. .. ... :...: : ....:.::.:: .. . CCDS30 FSILVLGTTLTILRDVILVLMEGTPKGVDFTAVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPV 260 270 280 290 300 310 380 390 400 410 420 pF1KE6 AIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP ::: . .... . : . :. : . : .. :::...: ... . : ::. : CCDS30 LSVHIAIAQNTDA--QAVLKTASSRLQGKFHFHTVTIQIEDYSEDM-KDCQACQGPSD 320 330 340 350 360 370 >>CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (323 aa) initn: 640 init1: 376 opt: 439 Z-score: 534.2 bits: 107.5 E(32554): 2e-23 Smith-Waterman score: 643; 40.0% identity (73.2% similar) in 250 aa overlap (179-428:90-322) 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 TDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIH .:.:.:..::: .... : :.: ::.: : CCDS27 DSHCDPKKGKAQRQLYVASAICLLFMIGEVVEILGALVSVLSIWVVTGVLVYLAVERLIS 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 MNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDS .:::.: ::::.. .::::.:::. :.:::: :::. . :. ... CCDS27 GDYEIDGGTMLITSGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTT--------------NQQEEN 120 130 140 150 160 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTV .:::::.:..::..::.:::.::::. :::::: .:::::.:::.:: ::. :. :.. CCDS27 PSVRAAFIHVIGDFMQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFVFSILVLGTTLTILRDVI 170 180 190 200 210 220 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 VIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEE ....::.:. .. ... :...: : ....:.::.:: .. . ::: . .... . CCDS27 LVLMEGTPKGVDFTAVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPVLSVHIAIAQNTDA--QA 230 240 250 260 270 280 390 400 410 420 pF1KE6 VQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP : . :. : . : .. :::...: ... . : ::. : CCDS27 VLKTASSRLQGKFHFHTVTIQIEDYSEDM-KDCQACQGPSD 290 300 310 320 >>CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (320 aa) initn: 799 init1: 426 opt: 432 Z-score: 525.8 bits: 105.9 E(32554): 5.8e-23 Smith-Waterman score: 815; 40.2% identity (70.6% similar) in 333 aa overlap (95-425:4-316) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 AHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQRE--ILKQRKVKARLTIAAVLYL : . :: : . .: .: :... . 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CCDS55 FCEDPCD 320 >>CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (369 aa) initn: 799 init1: 426 opt: 432 Z-score: 524.8 bits: 106.0 E(32554): 6.6e-23 Smith-Waterman score: 815; 40.2% identity (70.6% similar) in 333 aa overlap (95-425:53-365) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 AHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQRE--ILKQRKVKARLTIAAVLYL : . :: : . .: .: :... . CCDS63 ESVELQQKPVNKDQCPRERPEELESGGMYHCHSGSKPTEKGANEYAYAKWKLCSASAICF 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 LFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVL .:::.:.:::.::.:::..::: :.: ::....:.:..:::::: :.::.:::.:: :.: CCDS63 IFMIAEVVGGHIAGSLAVVTDAAHLLIDLTSFLLSLFSLWLSSKPPSKRLTFGWHRAEIL 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 SAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHR .:..:.: .... : :.: : .: .. .:.:.. .:.:... .::.:... .:.: CCDS63 GALLSILCIWVVTGVLVYLACERLLYPDYQIQATVMIIVSSCAVAANIVLTVVLHQRCLG 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 HSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYK :.:.. : . .:::::::::::: ::..:::.: :: :::::: CCDS63 HNHKEV-----------------QANASVRAAFVHALGDLFQSISVLISALIIYFKPEYK 210 220 230 240 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 IADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDLNI :::::::..::.:: .:. :. : ....::::. :: . .:: .. .. : ::..:.: CCDS63 IADPICTFIFSILVLASTITILKDFSILLMEGVPKSLNYSGVKELILAVDGVLSVHSLHI 250 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 WSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCA :::: .. .:. . .:. :. . . : ..: :. :::..: .. : : CCDS63 WSLTMNQVILSAHVATAASRDSQV--VRREIAKALSKSFTMHSLTIQMESPVDQ-DPDCL 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 NCQSSSP :. CCDS63 FCEDPCD >>CCDS3996.1 SLC30A5 gene_id:64924|Hs108|chr5 (765 aa) initn: 253 init1: 185 opt: 264 Z-score: 316.5 bits: 68.5 E(32554): 2.6e-11 Smith-Waterman score: 400; 27.5% identity (62.5% similar) in 309 aa overlap (120-411:425-727) 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 LKVDSCDNCSKQREILKQRKVKARLTIAAVLYLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLT : ::: . :: : ..:::....:..::: CCDS39 SSQSIPRFIKESLKQILEESDSRQIFYFLCLNLLFTFVELFYGVLTNSLGLISDGFHMLF 400 410 420 430 440 450 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 DLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHM : ::... :.: .: . :. :..:. :.:.::..:. :.. .. :...:.: : : CCDS39 DCSALVMGLFAALMSRWKATRIFSYGYGRIEILSGFINGLFLIVIAFFVFMESVARLIDP 460 470 480 490 500 510 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 NYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQD-- :.. .. ... :. ::.: :. . .: :.:. : : . : .. ::.. CCDS39 P-ELDTHMLTPVSVGGLIVNLI-GICAFSHAHSHAHGASQGSCHSSDHSHSHHMHGHSDH 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 pF1KE6 -------------SLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSL . .:..:.:.:.: . :.::.... .:. . . ::::.:. ... CCDS39 GHGHSHGSAGGGMNANMRGVFLHVLADTLGSIGVIVSTVLIE-QFGWFIADPLCSLFIAI 580 590 600 610 620 630 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 LVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVD-YIK-EALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTA :. ... .: :. ..: .: . . . .: : ..::: . : .: ..: ... .. CCDS39 LIFLSVVPLIKDACQVLLLRLPPEYEKELHIALEKIQKIEGLISYRDPHFWRHSASIVAG 640 650 660 670 680 690 380 390 400 410 420 pF1KE6 IVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP .:::. .:. :. . .:. :. :::.. CCDS39 TIHIQV---TSDVLEQRIVQQVTGILKDAGVNNLTIQVEKEAYFQHMSGLSTGFHDVLAM 700 710 720 730 740 CCDS39 TKQMESMKYCKDGTYIM 750 760 429 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:15:33 2016 done: Tue Nov 8 12:15:33 2016 Total Scan time: 2.410 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]