FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4561, 685 aa 1>>>pF1KE4561 685 - 685 aa - 685 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6906+/-0.000417; mu= -5.5655+/- 0.026 mean_var=258.8387+/-53.799, 0's: 0 Z-trim(119.6): 9 B-trim: 910 in 1/57 Lambda= 0.079719 statistics sampled from 33778 (33787) to 33778 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16 Scan time: 13.870 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003147 (OMIM: 160565,605921,612783) stromal int ( 685) 4540 535.8 2.1e-151 NP_001264891 (OMIM: 160565,605921,612783) stromal ( 540) 3414 406.2 1.6e-112 NP_001264890 (OMIM: 160565,605921,612783) stromal ( 791) 3406 405.4 4.3e-112 NP_001162588 (OMIM: 610841) stromal interaction mo ( 599) 1911 233.4 2e-60 NP_065911 (OMIM: 610841) stromal interaction molec ( 746) 1911 233.4 2.4e-60 NP_001162589 (OMIM: 610841) stromal interaction mo ( 754) 1886 230.5 1.7e-59 >>NP_003147 (OMIM: 160565,605921,612783) stromal interac (685 aa) initn: 4540 init1: 4540 opt: 4540 Z-score: 2839.2 bits: 535.8 E(85289): 2.1e-151 Smith-Waterman score: 4540; 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