FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3931, 545 aa 1>>>pF1KE3931 545 - 545 aa - 545 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8627+/-0.000743; mu= 8.7949+/- 0.045 mean_var=169.7243+/-33.690, 0's: 0 Z-trim(115.5): 116 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.098447 statistics sampled from 15924 (16046) to 15924 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.798), E-opt: 0.2 (0.493), width: 16 Scan time: 3.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 3738 542.7 4.8e-154 CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 2772 405.4 8.2e-113 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 869 135.1 1.8e-31 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 799 125.2 1.8e-28 CCDS4467.1 TRIM52 gene_id:84851|Hs108|chr5 ( 297) 778 122.0 9.6e-28 CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 780 122.5 1.2e-27 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 666 106.3 9.1e-23 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 656 104.9 2.3e-22 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 653 104.5 3.1e-22 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 652 104.3 3.3e-22 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 619 99.6 8.7e-21 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 613 98.7 1.4e-20 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 582 94.4 3.4e-19 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 571 92.8 1e-18 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 571 92.8 1e-18 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 544 89.0 1.5e-17 CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6 ( 465) 540 88.4 2e-17 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 531 87.1 5e-17 CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 532 87.3 5e-17 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 521 85.6 1e-16 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 510 84.1 3.9e-16 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 502 83.0 8.9e-16 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 502 83.2 1.4e-15 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 493 81.7 2.1e-15 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 493 81.7 2.2e-15 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 481 80.0 7e-15 CCDS43414.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 329) 475 79.0 9.3e-15 CCDS4463.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 303) 466 77.7 2.1e-14 CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 463 77.5 4e-14 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 454 76.2 9.8e-14 CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 439 74.1 4.5e-13 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 432 73.1 8.8e-13 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 430 72.8 1.1e-12 CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 408 69.7 9.1e-12 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 394 67.5 2.7e-11 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 394 67.6 2.8e-11 CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 391 67.2 4.4e-11 >>CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 (630 aa) initn: 3738 init1: 3738 opt: 3738 Z-score: 2879.1 bits: 542.7 E(32554): 4.8e-154 Smith-Waterman score: 3738; 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CCDS34 QVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEK 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 CEEVQLQPPEVWSPDPCQPHSHDFLTDAIVRKMSRMFCQAARVDLTLDPDTAHPALMLSP ::.:. . : . . :. .::. ... .:.::::.:::: :.:: CCDS34 CEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLI----ADVTLDPETAHPNLVLSE 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 DRRGVRLAERR-QEVADHPKRFSADCCVLGAQGFRSGRHYWEVEVGGRRGWAVGAAREST ::..:...: : ... : :.::. :::...:: ::::::::::: . ::::. :.:. CCDS34 DRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSV 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 HHKEKVGPGGSSVGSGDASSSRHHHRRRRLHLPQQPLLQREVWCVGTNGKRYQAQSSTEQ .: .. : ::. . ..: :: .: : ..: CCDS34 SRKGELTP-----------------------LPETGYWRVRLW----NGDKY-AATTTPF 390 400 410 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 TLLSPSEKPRRFGVYLDYEAGRLGFYNAETLAHVHTFSAAFLGERVFPFFRVLSKGTRIK : : . ::.: :..:::::: :.:::. .:..::. .: :...:.: .. : . CCDS34 TPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFT-EKLWPLFYPGIRAGRKN 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 LCP : CCDS34 AAPLTIRPPTDWE 480 >>CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 (503 aa) initn: 815 init1: 472 opt: 799 Z-score: 624.5 bits: 125.2 E(32554): 1.8e-28 Smith-Waterman score: 799; 39.8% identity (70.7% similar) in 314 aa overlap (94-406:62-368) 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DEEDEEEVLEEVEEEDLDPVTPLPPPPAPRRCFTCPQCRKSFPRRSFRPNLQLANMVQVI : : :: :::. ::.::: ::..::.. CCDS78 CLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIA 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 RQMHPTPGRGSRVTDQGICPKHQEALKLFCEVDEEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVQ .:.. . .. :...::.:.:::.::: :.::.:..: :..:. :.::::....: CCDS78 KQLQAVK---RKIRDESLCPQHHEALSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQ 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 EYKAKLQGHVEPLRKHLEAVQKMKAKEERRVTELKSQMKSELAAVASEFGRLTRFLAEEQ ::: ::: .:::...:. . . :..::.. ::: ..:. . :: .: : : ::: CCDS78 EYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQ 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 AGLERRLREMHEAQLGRAGAAASRLAEQAAQLSRLLAEAQERSQQGGLRLLQDIKETFNR : ::.: .. : : :..:... .:..: ::.. . :.:...:.:.: :... CCDS78 QVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEK 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 CEEVQLQPPEVWSPDPCQPHSHDFLTDAIVRKMSRMFCQAARVDLTLDPDTAHPALMLSP ::.:. . : . . :. .::. ... .:.::::.:::: :.:: CCDS78 CEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLI----ADVTLDPETAHPNLVLSE 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 DRRGVRLAERR-QEVADHPKRFSADCCVLGAQGFRSGRHYWEVEVGGRRGWAVGAAREST ::..:...: : ... : :.::. :::...:: ::::::::: CCDS78 DRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEAAHCVLAQDPENQALA 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 HHKEKVGPGGSSVGSGDASSSRHHHRRRRLHLPQQPLLQREVWCVGTNGKRYQAQSSTEQ CCDS78 RFYCYTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSLLVPGLTCTQRQRRCRGQRWTVQTCLTC 390 400 410 420 430 440 >>CCDS4467.1 TRIM52 gene_id:84851|Hs108|chr5 (297 aa) initn: 907 init1: 615 opt: 778 Z-score: 611.6 bits: 122.0 E(32554): 9.6e-28 Smith-Waterman score: 778; 61.7% identity (79.8% similar) in 193 aa overlap (1-186:82-271) 10 20 pF1KE3 MRDEDYEGDMEEEV-EEEEEGVFWTSGMSR .:. :.:. .::. ..... .: . . CCDS44 DEEDQNEEEDEWEEEEDEEAVGAMDGWDGSIREVLYRGNADEELFQDQDDDELWLGDSGI 60 70 80 90 100 110 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 SSWDNMDYVW--EEEDEEEDLDYYLGDMEEEDLRGEDEEDEEEVLEEVEEEDLDPVTP-- ..:::.::.: :::.:::: ::::: .. ::: : :::.:: .:.. . . : CCDS44 TNWDNVDYMWDEEEEEEEEDQDYYLGGLRP-DLRI-DVYREEEILEAYDEDEDEELYPDI 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 LPPP--PAPRRCFTCPQCRKSFPRRSFRPNLQLANMVQVIRQMHPTPGRGSRVTDQGICP ::: : : . :::::::::: :::::::::::::::.:::: ::: ::.: .:::.: CCDS44 HPPPSLPLPGQ-FTCPQCRKSFTRRSFRPNLQLANMVQIIRQMCPTPYRGNRSNDQGMCF 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 KHQEALKLFCEVDEEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVQEYKAKLQGHVEPLRKHLEAV :::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::. CCDS44 KHQEALKLFCEVDKEAICVVCRESRSHKQHSVLPLEEVVQEYQEIKLETTLVGILQIEQE 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 QKMKAKEERRVTELKSQMKSELAAVASEFGRLTRFLAEEQAGLERRLREMHEAQLGRAGA CCDS44 SIHSKAYNQ 290 >>CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 (511 aa) initn: 954 init1: 399 opt: 780 Z-score: 609.8 bits: 122.5 E(32554): 1.2e-27 Smith-Waterman score: 907; 36.6% identity (61.7% similar) in 475 aa overlap (87-545:72-511) 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 EEDLRGEDEEDEEEVLEEVEEEDLDPVTPLPPPPAPRRCFTCPQCRKSFPRRSFRPNLQL :: : : :::::. ..::: :: CCDS44 VECGHSFCRACIGRCWERPGAGSVGAATRAPPFPLP-----CPQCREPARPSQLRPNRQL 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 pF1KE3 ANMVQVIRQMH-PT--PGR-GSRVTDQGI----CPKHQEALKLFCEVDEEAICVVCRESR : .. ..:.. :. ::. ::... : .: : .::.:. : .:::::: ..: CCDS44 AAVATLLRRFSLPAAAPGEHGSQAAAARAAAARCGQHGEPFKLYCQDDGRAICVVCDRAR 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 SHKQHSVVPLEEVVQEYKAKLQGHVEPLRKHLEAVQKMKAKEERRVTELKSQMKSELAAV :..:.:.::.:.::: : :..... :.:.:: . ... :... :: .:: .: : CCDS44 EHREHAVLPLDEAVQEAKELLESRLRVLKKELEDCEVFRSTEKKESKELLKQMAAEQEKV 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 ASEFGRLTRFLAEEQAGLERRLREMHEAQLGRAGAAASRLAEQAAQLSRLLAEAQERSQQ ..:: : ::.:... : ::.:. . . . ..:. . .:::.: .. :: .:. CCDS44 GAEFQALRAFLVEQEGRLLGRLEELSREVAQKQNENLAQLGVEITQLSKLSSQIQETAQK 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 GGLRLLQDIKETFNRCEEVQLQPPEVWSPDPCQPHSHDFLTDAIVRKMSRMFCQAAR--- : .::..: :..:: .: : . : . . . : ... : . : . : CCDS44 PDLDFLQEFKSTLSRCSNVPGPKPTTVSSEMKNKVWNVSLKTFVLKGMLKKFKEDLRGEL 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 -----VDLTLDPDTAHPALMLSPDRRGVRLAERRQEVADHPKRFSADCCVLGAQGFRSGR :.::::::::.: :.:: : .::::.:: :.. .:: ::... ::.. :: ::: CCDS44 EKEEKVELTLDPDTANPRLILSLDLKGVRLGERAQDLPNHPCRFDTNTRVLASCGFSSGR 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 HYWEVEVGGRRGWAVGAARESTHHKEKVGPGGSSVGSGDASSSRHHHRRRRLHLPQQPLL :.::::::.. ::: :.::::. ::. : : CCDS44 HHWEVEVGSKDGWAFGVARESV--------------------------RRKGLTPFTP-- 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 QREVWCVGTNGKRYQAQSSTEQTLLSPSEKPRRFGVYLDYEAGRLGFYNAETLAHVHTFS .. :: . :: .: : .: :.. :: .. : : :: :.: ..:: .: . :..:: CCDS44 EEGVWALQLNGGQYWAVTSPERSPLSCGHLSR-VRVALDLEVGAVSFYAVEDMRHLYTFR 430 440 450 460 470 480 530 540 pF1KE3 AAFLGERVFPFFRVLSKGTRIKLCP . : :::::.: : : :: ... : CCDS44 VNFQ-ERVFPLFSVCSTGTYLRIWP 490 500 510 >>CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (518 aa) initn: 984 init1: 445 opt: 666 Z-score: 522.3 bits: 106.3 E(32554): 9.1e-23 Smith-Waterman score: 940; 35.2% identity (61.5% similar) in 483 aa overlap (94-545:62-508) 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DEEDEEEVLEEVEEEDLDPVTPLPPPPAPRRCFTCPQCRKSFPRRSFRPNLQLANMVQVI : : :: :::. ::.::: ::..::.. CCDS34 CLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIA 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 RQMHPTPGRGSRVTDQGICPKHQEALKLFCEVDEEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVQ .:.. . .. :...::.:.:::.::: :.::.:..: :..:. :.::::....: CCDS34 KQLQAVK---RKIRDESLCPQHHEALSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQ 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 EYKAKLQGHVEPLRKHLEAVQKMKAKEERRVTELKSQMKSELAAVASEFGRLTRFLAEEQ ::: ::: .:::...:. . . :..::.. ::: ..:. . :: .: : : ::: CCDS34 EYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQ 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 AGLERRLREMHEAQLGRAGAAASRLAEQAAQLSRLLAEAQERSQQGGLRLLQDIKETF-- : ::.: .. : : :..:... .:..: ::.. . :.:...:.:.: :. CCDS34 QVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEK 210 220 230 240 250 260 310 320 330 pF1KE3 ----------------------------NRCEEVQLQPPEVWSPDPCQPHSHDFLTDAIV ::::.:. . : . . :. . CCDS34 NIPRKFGGSLSTICPRDHKALLGLVKEINRCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFAL 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 RKMSRMFCQAARVDLTLDPDTAHPALMLSPDRRGVRLAERR-QEVADHPKRFSADCCVLG ::. ... .:.::::.:::: :.:: ::..:...: : ... : :.::. :::. CCDS34 RKILKQLI----ADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLA 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 AQGFRSGRHYWEVEVGGRRGWAVGAARESTHHKEKVGPGGSSVGSGDASSSRHHHRRRRL ..:: ::::::::::: . ::::. :.:. .: .. : CCDS34 TEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTP---------------------- 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 HLPQQPLLQREVWCVGTNGKRYQAQSSTEQTLLSPSEKPRRFGVYLDYEAGRLGFYNAET ::. . ..: :: .: : ..: : : . ::.: :..:::::: :.:::. CCDS34 -LPETGYWRVRLW----NGDKY-AATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTD 430 440 450 460 470 520 530 540 pF1KE3 LAHVHTFSAAFLGERVFPFFRVLSKGTRIKLCP .:..::. .: :...:.: .. : . : CCDS34 RSHIYTFTDTFT-EKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE 480 490 500 510 >>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 (477 aa) initn: 679 init1: 405 opt: 656 Z-score: 515.1 bits: 104.9 E(32554): 2.3e-22 Smith-Waterman score: 735; 32.9% identity (60.8% similar) in 441 aa overlap (96-532:60-456) 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EDEEEVLEEVEEEDLDPVTPLPPPPAPRRCFTCPQCRKSFPRRSFRPNLQLANMVQVIRQ : ::.::. :.:.. :: :...... .: CCDS15 TCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 MHPTPGRGSRVTDQGICPKHQEALKLFCEVDEEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVQEY :: : . : .: .:.: :::::. :. ::::::::: :. : :.: ::.:: : CCDS15 -HP--G----LQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGY 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KAKLQGHVEPLRKHLEAVQKMKAKEERRVTELKSQMKSELAAVASEFGRLTRFLAEEQAG : ::. .: ::... . ...:.::. ..: ....: . .. :: ... .:.::. CCDS15 KLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQR 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 LERRLREMHEAQLGRAGAAASRLAEQAAQLSRLLAEAQERSQQGGLRLLQDIKETFNRCE : . :. .: .: ... : .:. .: :: . .::: :: :..:::.:: ..: . CCDS15 LLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKN 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 EVQLQPPEVWSPDPCQPHSHDFLTDAIVRKMSRMFCQAARVDLTLDPDTAHPALMLSPDR .:..: ::: .: : .:.. . : .. : : . :.. : .:.: :.: .: CCDS15 NVSVQCPEV-AP-PTRPRTVCRVPGQI--EVLRGFLE----DVVPDATSAYPYLLLYESR 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RGVRLAERRQEVADHPK-RFSADCCVLGAQGFRSGRHYWEV--EVGGRRGWAVGAAREST . :. . . : :: : :..: .: :::::::: .. : ::.:. :... CCDS15 QRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNV 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 HHKEKVGPGGSSVGSGDASSSRHHHRRRRLHLPQQPLLQREVWCVG-TNGKRYQAQSSTE .:..: :. : . : : ..: .: . :. CCDS15 SRKDRV--------------------------PKCP--ENGFWVVQLSKGTKYLSTFSAL 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 QTLLSPSEKPRRFGVYLDYEAGRLGFYNAETLAHVHTFSAAFLGERVFPFFRVLSKGTRI .. : : ..:..::.:::...::.. .:.::.: : . . ::: CCDS15 TPVML-MEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQ 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 KLCP CCDS15 MVISTVTMWVKG 470 >>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 (485 aa) initn: 702 init1: 263 opt: 653 Z-score: 512.7 bits: 104.5 E(32554): 3.1e-22 Smith-Waterman score: 776; 33.8% identity (58.7% similar) in 450 aa overlap (96-532:55-462) 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EDEEEVLEEVEEEDLDPVTPLPPPPAPRRCFTCPQCRKSFPRRSFRPNLQLANMVQVIRQ .::: :: :..::: ::::.:. .: CCDS31 EPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRL 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 MHPTPGRGSRVTDQGICPKHQEALKLFCEVDEEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVQEY .. :: : . .: .: : ::.::. : .: .: .: :. :::::.:.:. :: CCDS31 LRLHPGMGLK---GDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEY 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KAKLQGHVEPLRKHLEAVQKMKAKEERRVTELKSQMKSELAAVASEFGRLTRFLAEEQ-- : .:. .: :.:. : . :... :..:.. : :.... ... :: . :.: ..: CCDS31 KWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPP 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 pF1KE3 ---------AGLERRLREMHEAQLGRAGAAASRLAEQAAQLSRLLAEAQERSQQGGLRLL :.: :: :. . . :.: .:. : :..:: .::::. .: CCDS31 HRQLGAEVAAALASLQREAAET-MQKLELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWML 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 QDIKETFNRCEEVQLQPPEVWSPDPCQPHSHDFLTDAIVRKMSRMFCQAARVDLTLDPDT :::.:..:: . .:: :: : : .. :: : . : . .. .:. ::::: CCDS31 QDIQEVLNRSKSWSLQQPE--------PISLELKTDCRVLGL-REILKTYAADVRLDPDT 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 AHPALMLSPDRRGVRLAERRQEVADHPKRFSADCCVLGAQGFRSGRHYWEVEVGGRRGWA :. :..: ::. :. .. :.. :.:.:: :::.: . ::::::::::: : :. CCDS31 AYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWG 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 VGAARESTHHKEKVGPGGSSVGSGDASSSRHHHRRRRLHLPQQPLLQREVWCVGT-NGKR .:. .... .:: : : :. : . .:.. CCDS31 LGVCKQNVDRKEVV------------YLSPHYG----------------FWVIRLRKGNE 380 390 400 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 YQAQSSTEQTLLSPSEKPRRFGVYLDYEAGRLGFYNA-ETLAHVHTFSAAFLGERVFPFF :.: .. : .:: ::: :...:::: ..:::. . .:. :: . :..:.: CCDS31 YRA-GTDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYF 410 420 430 440 450 460 540 pF1KE3 RVLSKGTRIKLCP CCDS31 SPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED 470 480 >>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 (471 aa) initn: 763 init1: 411 opt: 652 Z-score: 512.1 bits: 104.3 E(32554): 3.3e-22 Smith-Waterman score: 762; 30.3% identity (60.4% similar) in 449 aa overlap (96-544:51-464) 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EDEEEVLEEVEEEDLDPVTPLPPPPAPRRCFTCPQCRKSFPRRSFRPNLQLANMVQVIRQ : :: :: :: .::: : :: :.... .: CCDS38 EYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQ 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 MHPTPGRGSRVTDQGICPKHQEALKLFCEVDEEAICVVCRESRSHKQHSVVPLEEVVQEY .. .. .: ....: ::.. : ::: : : .:. : : .:..: . :...... . CCDS38 LQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYH 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 KAKLQGHVEPLRKHLEAVQKMKAKEERRVTELKSQMKSELAAVASEFGRLTRFLAEEQAG . :.: .::::...: :.:. . . .:::.... . . ::: .. :: .:: CCDS38 REILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEM 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 LERRLREMHEAQLGRAGAAASRLAEQAAQLSRLLAEAQERSQQGGLRLLQDIKETFNRCE . :.... . :.. . .:.. .. :..:: :.. .: :..:.:: . : .. . CCDS38 ILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQ 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 EVQLQPPEVWSPDPCQPHSHDFLTDAIVRKMSRMFCQAARVDLTLDPDTAHPALMLSPDR . :. ::..: . .. : ..:.. . .::. :: .:::: :..: :: CCDS38 N--LKCPELFS---FRLTKYGFSLPPQYSGLDRII-KPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDR 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RGVRLAERRQEVADHPKRFSADCCVLGAQGFRSGRHYWEVEVGGRRGWAVGAARESTHHK ..:: ...... :.:: . :::.: : :::::::::::.. : .:. .. .. CCDS38 KAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRN 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 EKVGPGGSSVGSGDASSSRHHHRRRRLHLPQQPLLQREVWCVGTNGKRYQAQSSTEQTLL . : :: .: : .: : . :. . : : CCDS38 WQDQP---SVLGG-------------------------FWAIGRYMKSGYVASGPKTTQL 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 SPSEKPRRFGVYLDYEAGRLGFYNAETLAHVHTFSAAFLGERVFPFFRVLSKGTRIKLCP : :: ..:..:::: : :.::: . . ..::. : : :.:.: . . . .:.: CCDS38 LPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFT-EAVWPYFYTGTDSEPLKICS 410 420 430 440 450 460 CCDS38 VSDSER 470 545 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:46:24 2016 done: Sun Nov 6 01:46:25 2016 Total Scan time: 3.520 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]