Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1435
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1435, 277 aa
1>>>pF1KE1435 277 - 277 aa - 277 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7299+/-0.00103; mu= 12.3153+/- 0.061
mean_var=62.7292+/-12.423, 0's: 0 Z-trim(103.1): 40 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.161934
statistics sampled from 7197 (7235) to 7197 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3836.1 CASP3 gene_id:836|Hs108|chr4 ( 277) 1855 442.2 1.9e-124
CCDS58096.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 278) 942 228.9 3.1e-60
CCDS7581.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 303) 942 228.9 3.4e-60
CCDS7580.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 336) 942 228.9 3.7e-60
CCDS73200.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 388) 942 228.9 4.3e-60
CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 479) 461 116.6 3.5e-26
CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 522) 461 116.6 3.8e-26
CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 478) 428 108.9 7.3e-24
CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 521) 428 108.9 7.9e-24
CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 464) 403 103.0 4e-22
CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 479) 403 103.0 4.2e-22
CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 496) 403 103.0 4.3e-22
CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 538) 403 103.0 4.6e-22
CCDS159.2 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 333) 392 100.4 1.8e-21
CCDS158.1 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 416) 392 100.4 2.2e-21
CCDS3684.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 293) 386 99.0 4.1e-21
CCDS56159.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 455) 368 94.8 1.2e-19
CCDS12323.1 CASP14 gene_id:23581|Hs108|chr19 ( 242) 356 92.0 4.5e-19
CCDS3685.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 204) 322 84.0 9.4e-17
CCDS7582.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 253) 295 77.7 9.1e-15
>>CCDS3836.1 CASP3 gene_id:836|Hs108|chr4 (277 aa)
initn: 1855 init1: 1855 opt: 1855 Z-score: 2347.6 bits: 442.2 E(32554): 1.9e-124
Smith-Waterman score: 1855; 100.0% identity (100.0% similar) in 277 aa overlap (1-277:1-277)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MENTENSVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTG
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CCDS38 MENTENSVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 MTSRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEIVELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLS
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CCDS38 MTSRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEIVELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HGEEGIIFGTNGPVDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIETDSGVDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 HGEEGIIFGTNGPVDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIETDSGVDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVN
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CCDS38 DMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE1 RKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
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CCDS38 RKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
250 260 270
>>CCDS58096.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (278 aa)
initn: 942 init1: 524 opt: 942 Z-score: 1194.8 bits: 228.9 E(32554): 3.1e-60
Smith-Waterman score: 942; 57.4% identity (79.8% similar) in 242 aa overlap (37-275:35-276)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
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CCDS58 LFSDGDTSKKKKNVTMRSIKTTRDRVPTYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEIVELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLSHGEEGI
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CCDS58 TDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSCAKMQDLLKKASEEDHTNAACFACILLSHGEENV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IFGTNGPVDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIETDSG-VDDDMAC-
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CCDS58 IYGKDGVTPIKDLTAHFRGDRCKTLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 -HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKV
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CCDS58 RYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE1 ATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
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CCDS58 ARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
250 260 270
>>CCDS7581.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (303 aa)
initn: 942 init1: 524 opt: 942 Z-score: 1194.2 bits: 228.9 E(32554): 3.4e-60
Smith-Waterman score: 942; 57.4% identity (79.8% similar) in 242 aa overlap (37-275:60-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
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CCDS75 SFVPSLFSKKKKNVTMRSIKTTRDRVPTYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNG
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEIVELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLSHGEEGI
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CCDS75 TDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSCAKMQDLLKKASEEDHTNAACFACILLSHGEENV
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IFGTNGPVDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIETDSG-VDDDMAC-
:.: .: . .: .: ::::::..: :::::.:::::::::: ::..::: ..: :
CCDS75 IYGKDGVTPIKDLTAHFRGDRCKTLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANP
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 -HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKV
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CCDS75 RYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRV
210 220 230 240 250 260
250 260 270
pF1KE1 ATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
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CCDS75 ARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
270 280 290 300
>>CCDS7580.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (336 aa)
initn: 942 init1: 524 opt: 942 Z-score: 1193.5 bits: 228.9 E(32554): 3.7e-60
Smith-Waterman score: 942; 57.4% identity (79.8% similar) in 242 aa overlap (37-275:93-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
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CCDS75 SFVPSLFSKKKKNVTMRSIKTTRDRVPTYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNG
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEIVELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLSHGEEGI
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CCDS75 TDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSCAKMQDLLKKASEEDHTNAACFACILLSHGEENV
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IFGTNGPVDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIETDSG-VDDDMAC-
:.: .: . .: .: ::::::..: :::::.:::::::::: ::..::: ..: :
CCDS75 IYGKDGVTPIKDLTAHFRGDRCKTLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANP
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 -HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKV
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CCDS75 RYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRV
250 260 270 280 290 300
250 260 270
pF1KE1 ATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
: .::: : : :: ::::::.::::::::::
CCDS75 ARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
310 320 330
>>CCDS73200.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (388 aa)
initn: 963 init1: 524 opt: 942 Z-score: 1192.4 bits: 228.9 E(32554): 4.3e-60
Smith-Waterman score: 942; 57.4% identity (79.8% similar) in 242 aa overlap (37-275:145-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
:.:.. ..: ::::::::: : ::: :.:
CCDS73 SGTLYFTSKKKKNVTMRSIKTTRDRVPTYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNG
120 130 140 150 160 170
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEIVELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLSHGEEGI
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CCDS73 TDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSCAKMQDLLKKASEEDHTNAACFACILLSHGEENV
180 190 200 210 220 230
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IFGTNGPVDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIETDSG-VDDDMAC-
:.: .: . .: .: ::::::..: :::::.:::::::::: ::..::: ..: :
CCDS73 IYGKDGVTPIKDLTAHFRGDRCKTLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANP
240 250 260 270 280 290
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 -HKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKV
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CCDS73 RYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRV
300 310 320 330 340 350
250 260 270
pF1KE1 ATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
: .::: : : :: ::::::.::::::::::
CCDS73 ARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
360 370 380
>>CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (479 aa)
initn: 340 init1: 173 opt: 461 Z-score: 583.6 bits: 116.6 E(32554): 3.5e-26
Smith-Waterman score: 461; 35.1% identity (66.9% similar) in 248 aa overlap (37-275:233-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
:.:. . :::.:.::..: :.. .:.:
CCDS23 KEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSF---TSLKDRQG
210 220 230 240 250
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEI-VELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLSHGEEG
: :: : ..:. : . :. .:..:. :. . :... . :. . :: .:.::. :
CCDS23 THKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGRFG
260 270 280 290 300 310
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IIFGTNGP-VDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELD--CGIETDSGVDDDM
..... . ...: . : . .: :. :::::.::::.: :.. .::.:. .. ..
CCDS23 AVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADA-LNPEQ
320 330 340 350 360 370
190 200 210 220 230
pF1KE1 A----CHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLE-FMHILT
: .::.::::: . .:.::: :.:. ..:::.::::: ::. . . : .. :::
CCDS23 APTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSILT
380 390 400 410 420 430
240 250 260 270
pF1KE1 RVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
:: :. . .. . .:::.: . : :.: :
CCDS23 AVNDDVSRRVDKQG------TKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
440 450 460 470
>>CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (522 aa)
initn: 340 init1: 173 opt: 461 Z-score: 583.0 bits: 116.6 E(32554): 3.8e-26
Smith-Waterman score: 461; 35.1% identity (66.9% similar) in 248 aa overlap (37-275:276-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
:.:. . :::.:.::..: :.. .:.:
CCDS23 NGAPSLVSRGMQGASANTLNSETSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSF---TSLKDRQG
250 260 270 280 290 300
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEI-VELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLSHGEEG
: :: : ..:. : . :. .:..:. :. . :... . :. . :: .:.::. :
CCDS23 THKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGRFG
310 320 330 340 350 360
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IIFGTNGP-VDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELD--CGIETDSGVDDDM
..... . ...: . : . .: :. :::::.::::.: :.. .::.:. .. ..
CCDS23 AVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADA-LNPEQ
370 380 390 400 410 420
190 200 210 220 230
pF1KE1 A----CHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLE-FMHILT
: .::.::::: . .:.::: :.:. ..:::.::::: ::. . . : .. :::
CCDS23 APTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSILT
430 440 450 460 470 480
240 250 260 270
pF1KE1 RVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
:: :. . .. . .:::.: . : :.: :
CCDS23 AVNDDVSRRVDKQG------TKKQMPQPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
490 500 510 520
>>CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (478 aa)
initn: 328 init1: 173 opt: 428 Z-score: 541.9 bits: 108.9 E(32554): 7.3e-24
Smith-Waterman score: 428; 32.9% identity (66.7% similar) in 243 aa overlap (37-270:233-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
:.:. . :::.:.::..: :.. .:.:
CCDS56 KEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSF---TSLKDRQG
210 220 230 240 250
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEI-VELMRDVSKEDHSKRSSFVCVLLSHGEEG
: :: : ..:. : . :. .:..:. :. . :... . :. . :: .:.::. :
CCDS56 THKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQKCNPAHADGDCFVFCILTHGRFG
260 270 280 290 300 310
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IIFGTNGP-VDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELD--CGIETDSGVDDDM
..... . ...: . : . .: :. :::::.::::.: :.. .::.:. .. ..
CCDS56 AVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEADA-LNPEQ
320 330 340 350 360 370
190 200 210 220 230
pF1KE1 A----CHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADK-LEFMHILT
: .::.::::: . .:.::: :.:. ..:::.::::: ::. . . :.:..
CCDS56 APTSLQDSIPAEADFLLGLATVPGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRMLKFLEKTM
380 390 400 410 420 430
240 250 260 270
pF1KE1 RVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQIPCIVSMLTKELYFYH
.. . : . . ...:: ..: .: :
CCDS56 EIRGRKRTVWGAKQISAT-----SLPTAISAQTPRPPMRRWSSVS
440 450 460 470
>>CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (521 aa)
initn: 328 init1: 173 opt: 428 Z-score: 541.3 bits: 108.9 E(32554): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 428; 32.9% identity (66.7% similar) in 243 aa overlap (37-270:276-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SVDSKSIKNLEPKIIHGSESMDSGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSG
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