Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9950
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9950, 675 aa
1>>>pF1KB9950 675 - 675 aa - 675 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0771+/-0.00135; mu= -10.2479+/- 0.079
mean_var=303.5286+/-67.687, 0's: 0 Z-trim(106.4): 651 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.073616
statistics sampled from 8222 (8959) to 8222 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX ( 675) 4562 499.4 6.7e-141
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 1722 197.8 4.2e-50
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 1722 197.8 4.3e-50
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 1575 182.2 2e-45
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 1568 181.4 2.9e-45
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 ( 620) 1493 173.5 8.3e-43
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 1019 123.3 1.9e-27
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 1019 123.3 2e-27
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 991 120.1 8.3e-27
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 991 120.3 1.4e-26
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 983 119.2 1.4e-26
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 991 120.3 1.4e-26
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 991 120.3 1.4e-26
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 991 120.3 1.5e-26
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 991 120.3 1.5e-26
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 991 120.3 1.6e-26
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 991 120.3 1.6e-26
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 972 118.1 3.2e-26
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 966 117.4 5.2e-26
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 957 116.5 1e-25
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 947 115.4 1.8e-25
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 947 115.4 2e-25
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 947 115.4 2e-25
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 947 115.4 2e-25
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 935 114.1 4.8e-25
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 935 114.1 4.8e-25
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 935 114.2 5e-25
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 935 114.2 5e-25
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 932 113.8 6.4e-25
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 923 112.9 1.2e-24
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 919 112.5 1.6e-24
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 874 107.6 3.9e-23
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 ( 450) 808 100.6 5.1e-21
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 789 98.6 2.2e-20
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 786 98.3 2.6e-20
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 786 98.4 3.9e-20
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 786 98.4 4.2e-20
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 786 98.4 4.2e-20
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 778 97.6 6.6e-20
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 778 97.6 7e-20
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 466) 727 92.0 2e-18
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 507) 727 92.1 2.2e-18
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 508) 727 92.1 2.2e-18
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 713 90.6 5.8e-18
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 680 87.2 1.2e-16
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 678 87.0 1.4e-16
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 668 86.0 2.9e-16
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 668 86.0 2.9e-16
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 668 86.0 2.9e-16
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 668 86.0 3e-16
>>CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX (675 aa)
initn: 4562 init1: 4562 opt: 4562 Z-score: 2643.0 bits: 499.4 E(32554): 6.7e-141
Smith-Waterman score: 4562; 100.0% identity (100.0% similar) in 675 aa overlap (1-675:1-675)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDTKSILEELLLKRSQQKKKMSPNNYKERLFVLTKTNLSYYEYDKMKRGSRKGSIEIKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MDTKSILEELLLKRSQQKKKMSPNNYKERLFVLTKTNLSYYEYDKMKRGSRKGSIEIKKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RCVEKVNLEEQTPVERQYPFQIVYKDGLLYVYASNEESRSQWLKALQKEIRGNPHLLVKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RCVEKVNLEEQTPVERQYPFQIVYKDGLLYVYASNEESRSQWLKALQKEIRGNPHLLVKY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HSGFFVDGKFLCCQQSCKAAPGCTLWEAYANLHTAVNEEKHRVPTFPDRVLKIPRAVPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HSGFFVDGKFLCCQQSCKAAPGCTLWEAYANLHTAVNEEKHRVPTFPDRVLKIPRAVPVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KMDAPSSSTTLAQYDNESKKNYGSQPPSSSTSLAQYDSNSKKIYGSQPNFNMQYIPREDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KMDAPSSSTTLAQYDNESKKNYGSQPPSSSTSLAQYDSNSKKIYGSQPNFNMQYIPREDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PDWWQVRKLKSSSSSEDVASSNQKERNVNHTTSKISWEFPESSSSEEEENLDDYDWFAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDWWQVRKLKSSSSSEDVASSNQKERNVNHTTSKISWEFPESSSSEEEENLDDYDWFAGN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 ISRSQSEQLLRQKGKEGAFMVRNSSQVGMYTVSLFSKAVNDKKGTVKHYHVHTNAENKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISRSQSEQLLRQKGKEGAFMVRNSSQVGMYTVSLFSKAVNDKKGTVKHYHVHTNAENKLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LAENYCFDSIPKLIHYHQHNSAGMITRLRHPVSTKANKVPDSVSLGNGIWELKREEITLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LAENYCFDSIPKLIHYHQHNSAGMITRLRHPVSTKANKVPDSVSLGNGIWELKREEITLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KELGSGQFGVVQLGKWKGQYDVAVKMIKEGSMSEDEFFQEAQTMMKLSHPKLVKFYGVCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KELGSGQFGVVQLGKWKGQYDVAVKMIKEGSMSEDEFFQEAQTMMKLSHPKLVKFYGVCS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KEYPIYIVTEYISNGCLLNYLRSHGKGLEPSQLLEMCYDVCEGMAFLESHQFIHRDLAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KEYPIYIVTEYISNGCLLNYLRSHGKGLEPSQLLEMCYDVCEGMAFLESHQFIHRDLAAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 NCLVDRDLCVKVSDFGMTRYVLDDQYVSSVGTKFPVKWSAPEVFHYFKYSSKSDVWAFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NCLVDRDLCVKVSDFGMTRYVLDDQYVSSVGTKFPVKWSAPEVFHYFKYSSKSDVWAFGI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LMWEVFSLGKQPYDLYDNSQVVLKVSQGHRLYRPHLASDTIYQIMYSCWHELPEKRPTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LMWEVFSLGKQPYDLYDNSQVVLKVSQGHRLYRPHLASDTIYQIMYSCWHELPEKRPTFQ
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB9 QLLSSIEPLREKDKH
:::::::::::::::
CCDS14 QLLSSIEPLREKDKH
670
>>CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX (659 aa)
initn: 2185 init1: 1667 opt: 1722 Z-score: 1013.1 bits: 197.8 E(32554): 4.2e-50
Smith-Waterman score: 2189; 48.6% identity (74.5% similar) in 689 aa overlap (6-666:5-651)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDTKSILEELLLKRSQQKKKMSPNNYKERLFVLTKTNLSYYEYD--KMKRGSRKGSIEIK
::: ..::::::::: :: :.:.:::.:: .::::::: . .:::.::::...
CCDS14 MAAVILESIFLKRSQQKKKTSPLNFKKRLFLLTVHKLSYYEYDFERGRRGSKKGSIDVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB9 KIRCVEKVNLEEQTPVERQ---------------------YPFQIVYKDGLLYVYASNEE
:: ::: : :.. : ::: ::::.:: .: :::.. .::
CCDS14 KITCVETVVPEKNPPPERQIPRRGEESSEMEQISIIERFPYPFQVVYDEGPLYVFSPTEE
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SRSQWLKALQKEIRGNPHLLVKYHSGFFVDGKFLCCQQSCKAAPGCTLWEAY-ANLHTAV
:..:.. :.. :: : :. ::: :..::..:::.:. : : :: . : ..:. .
CCDS14 LRKRWIHQLKNVIRYNSDLVQKYHPCFWIDGQYLCCSQTAKNAMGCQILENRNGSLKPGS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 NEEKHRVPTFP----DRVLKIPRAVPVLKMDAPSSSTTLAQYDNESKKNYGSQPPSSSTS
...: . : : :..:: : .: :: :.. : . : .:
CCDS14 SHRKTKKPLPPTPEEDQILKKP--LPPEPAAAPVSTSELKKV----VALYDYMP------
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 LAQYDSNSKKIYGSQPNFNMQYIPREDFPDWWQVRKLKSSSSSEDVASSNQKERNVNHTT
...:. .. .. : .. . ..: ::..: ..: .: .
CCDS14 ---MNANDLQLRKGDEYFILE---ESNLP-WWRAR------------DKNGQEGYI----
230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SKISWEFPESSSSEEEENLDDYDWFAGNISRSQSEQLLRQKGKEGAFMVRNSSQVGMYTV
: . .: :.... :.:.. ...:::.::::.:.::::.:.::.::..: :::
CCDS14 -------PSNYVTEAEDSIEMYEWYSKHMTRSQAEQLLKQEGKEGGFIVRDSSKAGKYTV
270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 SLFSKAVNDKKGTVKHYHVHTNAENKLYLAENYCFDSIPKLIHYHQHNSAGMITRLRHPV
:.:.:...: .:...:: : .. ... ::::.. :..::.::.::::::::.:.::..::
CCDS14 SVFAKSTGDPQGVIRHYVVCSTPQSQYYLAEKHLFSTIPELINYHQHNSAGLISRLKYPV
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 STKANKVPDSVSLGNGIWELKREEITLLKELGSGQFGVVQLGKWKGQYDVAVKMIKEGSM
: . ...:....:: : ::. ...:.:::::.::::::. :::.::::::.::::::::
CCDS14 SQQNKNAPSTAGLGYGSWEIDPKDLTFLKELGTGQFGVVKYGKWRGQYDVAIKMIKEGSM
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SEDEFFQEAQTMMKLSHPKLVKFYGVCSKEYPIYIVTEYISNGCLLNYLRSHGKGLEPSQ
:::::..::..::.::: :::..::::.:. ::.:.:::..::::::::: . .. .:
CCDS14 SEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGCLLNYLREMRHRFQTQQ
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 LLEMCYDVCEGMAFLESHQFIHRDLAARNCLVDRDLCVKVSDFGMTRYVLDDQYVSSVGT
::::: ::::.: .:::.::.:::::::::::. . :::::::..::::::.:.::::.
CCDS14 LLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVNDQGVVKVSDFGLSRYVLDDEYTSSVGS
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 KFPVKWSAPEVFHYFKYSSKSDVWAFGILMWEVFSLGKQPYDLYDNSQVVLKVSQGHRLY
::::.:: :::. : :.:::::.::::.::::..::::.::. . ::... ...:: :::
CCDS14 KFPVRWSPPEVLMYSKFSSKSDIWAFGVLMWEIYSLGKMPYERFTNSETAEHIAQGLRLY
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670
pF1KB9 RPHLASDTIYQIMYSCWHELPEKRPTFQQLLSSIEPLREKDKH
::::::. .: :::::::: ..::::. :::.:
CCDS14 RPHLASEKVYTIMYSCWHEKADERPTFKILLSNILDVMDEES
620 630 640 650
>>CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX (693 aa)
initn: 2185 init1: 1667 opt: 1722 Z-score: 1012.8 bits: 197.8 E(32554): 4.3e-50
Smith-Waterman score: 2189; 48.6% identity (74.5% similar) in 689 aa overlap (6-666:39-685)
10 20 30
pF1KB9 MDTKSILEELLLKRSQQKKKMSPNNYKERLFVLTK
::: ..::::::::: :: :.:.:::.::
CCDS76 MVIGCPLCGRHCSGGEHTGELQKEEAMAAVILESIFLKRSQQKKKTSPLNFKKRLFLLTV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70
pF1KB9 TNLSYYEYD--KMKRGSRKGSIEIKKIRCVEKVNLEEQTPVERQ----------------
.::::::: . .:::.::::...:: ::: : :.. : :::
CCDS76 HKLSYYEYDFERGRRGSKKGSIDVEKITCVETVVPEKNPPPERQIPRRGEESSEMEQISI
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 -----YPFQIVYKDGLLYVYASNEESRSQWLKALQKEIRGNPHLLVKYHSGFFVDGKFLC
::::.:: .: :::.. .:: :..:.. :.. :: : :. ::: :..::..::
CCDS76 IERFPYPFQVVYDEGPLYVFSPTEELRKRWIHQLKNVIRYNSDLVQKYHPCFWIDGQYLC
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180
pF1KB9 CQQSCKAAPGCTLWEAY-ANLHTAVNEEKHRVPTFP----DRVLKIPRAVPVLKMDAPSS
:.:. : : :: . : ..:. . ...: . : : :..:: : .: :: :
CCDS76 CSQTAKNAMGCQILENRNGSLKPGSSHRKTKKPLPPTPEEDQILKKP--LPPEPAAAPVS
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 STTLAQYDNESKKNYGSQPPSSSTSLAQYDSNSKKIYGSQPNFNMQYIPREDFPDWWQVR
.. : . : .: ...:. .. .. : .. . ..: ::..:
CCDS76 TSELKKV----VALYDYMP---------MNANDLQLRKGDEYFILE---ESNLP-WWRAR
250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KLKSSSSSEDVASSNQKERNVNHTTSKISWEFPESSSSEEEENLDDYDWFAGNISRSQSE
..: .: . : . .: :.... :.:.. ...:::.:
CCDS76 ------------DKNGQEGYI-----------PSNYVTEAEDSIEMYEWYSKHMTRSQAE
290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QLLRQKGKEGAFMVRNSSQVGMYTVSLFSKAVNDKKGTVKHYHVHTNAENKLYLAENYCF
:::.:.::::.:.::.::..: ::::.:.:...: .:...:: : .. ... ::::.. :
CCDS76 QLLKQEGKEGGFIVRDSSKAGKYTVSVFAKSTGDPQGVIRHYVVCSTPQSQYYLAEKHLF
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 DSIPKLIHYHQHNSAGMITRLRHPVSTKANKVPDSVSLGNGIWELKREEITLLKELGSGQ
..::.::.::::::::.:.::..::: . ...:....:: : ::. ...:.:::::.::
CCDS76 STIPELINYHQHNSAGLISRLKYPVSQQNKNAPSTAGLGYGSWEIDPKDLTFLKELGTGQ
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 FGVVQLGKWKGQYDVAVKMIKEGSMSEDEFFQEAQTMMKLSHPKLVKFYGVCSKEYPIYI
::::. :::.::::::.:::::::::::::..::..::.::: :::..::::.:. ::.:
CCDS76 FGVVKYGKWRGQYDVAIKMIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFI
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VTEYISNGCLLNYLRSHGKGLEPSQLLEMCYDVCEGMAFLESHQFIHRDLAARNCLVDRD
.:::..::::::::: . .. .:::::: ::::.: .:::.::.:::::::::::. .
CCDS76 ITEYMANGCLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVNDQ
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 LCVKVSDFGMTRYVLDDQYVSSVGTKFPVKWSAPEVFHYFKYSSKSDVWAFGILMWEVFS
:::::::..::::::.:.::::.::::.:: :::. : :.:::::.::::.::::..:
CCDS76 GVVKVSDFGLSRYVLDDEYTSSVGSKFPVRWSPPEVLMYSKFSSKSDIWAFGVLMWEIYS
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670
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690
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. . : : ..:.:: .. ... . .. .: . .. ..
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CCDS35 SDEVEKELGKQGVRGAVSTLLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMPHSKGQGESDPL
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CCDS35 LVRESESSPGQRSISL------RYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHS
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CCDS35 TVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWK-
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