FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1545, 407 aa 1>>>pF1KE1545 407 - 407 aa - 407 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6287+/-0.00114; mu= 15.1089+/- 0.068 mean_var=66.9504+/-13.431, 0's: 0 Z-trim(101.8): 78 B-trim: 54 in 1/49 Lambda= 0.156746 statistics sampled from 6601 (6681) to 6601 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16 Scan time: 2.420 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 2655 609.8 1.5e-174 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 2426 558.0 5.7e-159 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 1971 455.1 4.7e-128 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 1801 416.7 2e-116 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 930 219.7 4.6e-57 CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 923 218.1 1.4e-56 CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 913 215.9 6.5e-56 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 891 210.9 1.9e-54 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 888 210.2 3e-54 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 873 206.8 3.5e-53 CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 856 202.9 4e-52 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 834 198.1 2.5e-50 CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 825 196.0 6e-50 CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 825 196.0 6.1e-50 CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 815 193.7 2.9e-49 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 800 190.3 2.6e-48 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 728 174.1 4e-43 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 721 172.5 7.4e-43 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 706 169.1 1.1e-41 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 695 166.7 8.9e-41 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 695 166.7 8.9e-41 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 690 165.5 1.2e-40 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 676 162.3 1.1e-39 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 676 162.3 1.1e-39 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 666 160.1 6.2e-39 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 666 160.1 6.2e-39 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 660 158.8 1.9e-38 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 660 158.8 1.9e-38 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 612 147.9 2.5e-35 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 609 147.2 5.9e-35 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 605 146.2 6.1e-35 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 604 146.1 9e-35 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 573 139.0 1.2e-32 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 573 139.0 1.2e-32 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 570 138.4 1.9e-32 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 566 137.5 3.4e-32 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 566 137.5 3.7e-32 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 548 133.4 7.8e-31 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 536 130.7 4.3e-30 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 536 130.7 4.7e-30 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 527 128.7 1.8e-29 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 510 124.8 2.1e-28 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 510 124.8 2.5e-28 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 510 124.8 2.5e-28 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 510 124.8 2.6e-28 CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 455 112.3 8.5e-25 CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 404 100.9 4.7e-21 CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 377 94.7 2.1e-19 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 357 90.2 5.6e-18 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 287 74.4 3.2e-13 >>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 (407 aa) initn: 2655 init1: 2655 opt: 2655 Z-score: 3247.3 bits: 609.8 E(32554): 1.5e-174 Smith-Waterman score: 2655; 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CCDS58 SAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLGKLYPQNRSRWTVWP 300 310 320 330 340 370 380 390 400 pF1KE1 IGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI >>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 (411 aa) initn: 1802 init1: 1258 opt: 1801 Z-score: 2203.6 bits: 416.7 E(32554): 2e-116 Smith-Waterman score: 1801; 71.4% identity (89.7% similar) in 378 aa overlap (30-407:35-411) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAI ... .:: :.:.:.:::::::::::::::: CCDS11 ATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 QQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQK ::::: ::: :::::.::::::::::.::.:: :.:. .:::::.:::::::: :::: CCDS11 QQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 VILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKM .:::::::.. :::::::::: ....::. . :.:.:::::::::. :: : . ::: CCDS11 GLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDY-GQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKM 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 FVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKK .:::::::::..:::.:::.... : . ::::.:::.: ..::.:.::: ::::::::. CCDS11 LVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKR 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFT .::::::::::.. :::::::.:::::::.:::::::::: ::.::::::::::. .:: CCDS11 DELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIH ::..:::: ::::. ::.:::::.:::::.::. :::.:: ::::.::::::.::: ::: CCDS11 VSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIH 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 pF1KE1 RIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI ::::.::.:::::::::: ..: ::::::: .:.: ..:::::::::: CCDS11 RIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI 370 380 390 400 410 >>CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 (483 aa) initn: 778 init1: 439 opt: 930 Z-score: 1138.0 bits: 219.7 E(32554): 4.6e-57 Smith-Waterman score: 930; 38.4% identity (74.2% similar) in 372 aa overlap (33-403:96-464) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 GGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQR ..:.:. ::. :: ::. .:.:::: ::.. CCDS44 IKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEE 70 80 90 100 110 120 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 AIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVIL .: ..: :..:.:..::::.... : .:..:... . ::.:..:::::: :.... . CCDS44 SIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICI 130 140 150 160 170 180 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 ALGDYMG-ATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFV .. .:: : : ::::.:.....:. .. :.:..::::..:.... . ..:.: CCDS44 QVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLD-DTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIV 190 200 210 220 230 240 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEE :::::..::. : . . .:. : . :..: :::.: .: . .. .. : .: . :: CCDS44 LDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLM-EE 250 260 270 280 290 300 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS :::.:. :.: : :. :. : :. : :.:..:: :. ..:. :..:. .. CCDS44 LTLKGVTQYYAYVT-ERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCF 310 320 330 340 350 360 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI .:. : :..:. ....::.: : :. :::..::::.: :..:::.:.: :.:.::: CCDS44 YIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRI 370 380 390 400 410 420 370 380 390 400 pF1KE1 GRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI ::.::::. :.:::..: .:. :..:: .: .. .: :. CCDS44 GRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEK 430 440 450 460 470 480 CCDS44 P >>CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 (479 aa) initn: 744 init1: 422 opt: 923 Z-score: 1129.5 bits: 218.1 E(32554): 1.4e-56 Smith-Waterman score: 923; 40.3% identity (70.6% similar) in 402 aa overlap (19-407:83-474) 10 20 30 40 pF1KE1 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGI ::.. . : : .:... :: .::.:. CCDS10 KEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYS-----VKSFEELRLKPQLLQGV 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 YAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKG---YDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQAL ::.::..:: ::. :. : . . ..:::.::::::::.:....:.:.: : : : CCDS10 YAMGFNRPSKIQENAL-PLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCL 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 VLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVR-NEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVF :.:: ::: : ::: .: .. : :: :.... : . .::.:::: :. CCDS10 CLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLA----YAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVL 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 DMLNR-RYLSPKWIKMFVLDEADEML-SRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVL : .. ....:: ::.::::::: :. ..: .:: .: . : . :..:.:::. .: CCDS10 DWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVW 230 240 250 260 270 280 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 EVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNT . ..: . :: : .:.:: ::. :::.:. .. :...::.:: ..::.::.:: .: CCDS10 KFAQKVVPDPNVIKLKREEETLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHT 290 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 RRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQV :. ..::. .. . :. : :.: ..: .....:: :. .::.::.. ::::::.:: CCDS10 RKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQV 350 360 370 380 390 400 350 360 370 380 390 pF1KE1 SLVINYDLPTNR------ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFV-TEEDKRILRDIETFYNTT :.:::.:::... :.:.::::: ::::..:.:.:.: .... :: :. .: CCDS10 SVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKK 410 420 430 440 450 460 400 pF1KE1 VEEMPMNVADLI .:.. . : : CCDS10 IERLDTDDLDEIEKIAN 470 >>CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 (478 aa) initn: 734 init1: 422 opt: 913 Z-score: 1117.3 bits: 215.9 E(32554): 6.5e-56 Smith-Waterman score: 913; 39.8% identity (70.6% similar) in 402 aa overlap (19-407:82-473) 10 20 30 40 pF1KE1 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGI ::.. . : : .:... :: .::.:. CCDS10 KEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYS-----VKSFEELRLKPQLLQGV 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 YAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKG---YDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQAL ::.::..:: ::. :. : . . ..:::.::::::::.:....:...: . : : CCDS10 YAMGFNRPSKIQENAL-PMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCL 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 VLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVR-NEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVF :.:: ::: : ::: .: .. : :: :.... : . .::.:::: :. CCDS10 CLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLA----YAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVL 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 DMLNR-RYLSPKWIKMFVLDEADEML-SRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVL : .. ....:: ::.::::::: :. ..: .:: .: . : . :..:.:::. .: CCDS10 DWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVW 230 240 250 260 270 280 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 EVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNT . ..: . :: : .:.:: ::. :::.:. .. :...::.:: ..::.::.:: .: CCDS10 KFAQKVVPDPNVIKLKREEETLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHT 290 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 RRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQV :. ..::. .. . :. : :.: ..: .....:: :. .::.::.. ::::::.:: CCDS10 RKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQV 350 360 370 380 390 400 350 360 370 380 390 pF1KE1 SLVINYDLPTNR------ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFV-TEEDKRILRDIETFYNTT :.:::.:::... :.:.::::: ::::..:.:.:.: .... :: :. .: CCDS10 SVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKK 410 420 430 440 450 460 400 pF1KE1 VEEMPMNVADLI .:.. . : : CCDS10 IERLDTDDLDEIEKIAN 470 >>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 (427 aa) initn: 797 init1: 411 opt: 891 Z-score: 1091.2 bits: 210.9 E(32554): 1.9e-54 Smith-Waterman score: 891; 38.3% identity (72.4% similar) in 373 aa overlap (35-403:46-417) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI : :. :: :::.: :::.:: .:.. : CCDS12 EEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL : :.::. ::.:: ::::.:... :::.: .. .::. ::::: ::.: . CCDS12 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERF 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 GDYMGAT-CHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD . :: .. . .:: ..... . :. . ::.:::::::.. .. : .: : .: :::: CCDS12 SKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLD 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E : :.:: . .. .. :::. : ...:::. :. : .:::.::....: : . CCDS12 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETK 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS :::.:..:.:.... : : : :: ..: ..:..::... .. :.. . ..: . CCDS12 LTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAI 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI :.: : :.:: ...:.. . :.:..:.:..::.:...:..:.:::.: . ..:.::. CCDS12 AIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRV 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 pF1KE1 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI .:.:::: ::.::.::..: : .:: :.. ....: :.: .. CCDS12 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR 380 390 400 410 420 >>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 (428 aa) initn: 798 init1: 411 opt: 888 Z-score: 1087.5 bits: 210.2 E(32554): 3e-54 Smith-Waterman score: 888; 39.2% identity (72.7% similar) in 370 aa overlap (35-400:47-415) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI : :. :: :::.: :::.:: .:.. : CCDS46 EVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL : :.::. ::.:: ::::.:... ::::: ....::. ::::: ::.: . CCDS46 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERF 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 GDYMGATCHACI-GGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD . :: . : . :: ..... . :. . ::::::::::.. . . :. : :: :.:: CCDS46 SKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILD 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E : :.:: . .. .. :::. ::...:::. .. : .:::.::..:.: : . CCDS46 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETK 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS :::.:..:.:.... .: : : :: ..: ..:.:::... .. :.. . ..: . CCDS46 LTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAI 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI :.: : :.:: ...:.. . :.:..:.:..::.:...:....:::.: . ..:.::. CCDS46 AIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRV 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 pF1KE1 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI .:.:::: ::.::.::..: : .:: :.. ..... :.: CCDS46 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR 380 390 400 410 420 >>CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 (483 aa) initn: 686 init1: 434 opt: 873 Z-score: 1068.3 bits: 206.8 E(32554): 3.5e-53 Smith-Waterman score: 873; 39.3% identity (71.1% similar) in 387 aa overlap (32-406:96-475) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 SGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQ : .:... ::: ::.::::.::..:: ::. CCDS44 LLNKLIHQSLVESSHRVEVLQKDPSSPLYSVKTFEELRLKEELLKGIYAMGFNRPSKIQE 70 80 90 100 110 120 70 80 90 100 110 pF1KE1 RAIIPCIKGY---DVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQ :. : . .. ..:::.::::::::.:....:.... : : :::: ::: : CCDS44 MAL-PMMLAHPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVNALELFPQCLCLAPTYELALQTG 130 140 150 160 170 180 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 KVILALGDYMGATCHACIGGTNVR-NEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDM-LNRRYLSPKW .:. . :: : .: :.. . . .:..:::: :.: .. . .. CCDS44 RVV----EQMGKFCVDVQVMYAIRGNRIPRGTDITKQIIIGTPGTVLDWCFKLKLIDLTK 190 200 210 220 230 240 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 IKMFVLDEADEML-SRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRI :..::::::: :. ..::.:. .: . : . :..:.:::. .: . ..... :: : CCDS44 IRVFVLDEADVMIDTQGFSDHSIRIQRALPSECQMLLFSATFEDSVWHFAERIIPDPNVI 250 260 270 280 290 300 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHA ..::::::..:.:.:. :... : ..::..: ..:: ::.:: .:::.. ::: .: CCDS44 KLRKEELTLNNIRQYYVLCEHRKDKYQALCNIYGSITIGQAIIFCQTRRNAKWLTVEMIQ 310 320 330 340 350 360 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 RDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNR- :: : :.. ..: :...::.:. .:::::.. ::::::.::..:.:.:::... CCDS44 DGHQVSLLSGELTVEQRASIIQRFRDGKEKVLITTNVCARGIDVKQVTIVVNFDLPVKQG 370 380 390 400 410 420 360 370 380 390 400 pF1KE1 -----ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI :.:.::::: ::::.::.:.:.. .. : :. .:..... .:. :. CCDS44 EEPDYETYLHRIGRTGRFGKKGLAFNMIEVDELPSLMKIQDHFNSSIKQ--LNAEDMDEI 430 440 450 460 470 CCDS44 EKIDY 480 407 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 01:30:54 2016 done: Mon Nov 7 01:30:55 2016 Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]