Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1545
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1545, 407 aa
  1>>>pF1KE1545 407 - 407 aa - 407 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6287+/-0.00114; mu= 15.1089+/- 0.068
 mean_var=66.9504+/-13.431, 0's: 0 Z-trim(101.8): 78  B-trim: 54 in 1/49
 Lambda= 0.156746
 statistics sampled from 6601 (6681) to 6601 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.205), width:  16
 Scan time:  2.420

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407) 2655 609.8 1.5e-174
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406) 2426 558.0 5.7e-159
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 347) 1971 455.1 4.7e-128
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411) 1801 416.7  2e-116
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11          ( 483)  930 219.7 4.6e-57
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 479)  923 218.1 1.4e-56
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 478)  913 215.9 6.5e-56
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19       ( 427)  891 210.9 1.9e-54
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6          ( 428)  888 210.2   3e-54
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 483)  873 206.8 3.5e-53
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 370)  856 202.9   4e-52
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  834 198.1 2.5e-50
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 448)  825 196.0   6e-50
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 453)  825 196.0 6.1e-50
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 447)  815 193.7 2.9e-49
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 369)  800 190.3 2.6e-48
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  728 174.1   4e-43
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 455)  721 172.5 7.4e-43
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648)  706 169.1 1.1e-41
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031)  695 166.7 8.9e-41
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032)  695 166.7 8.9e-41
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619)  690 165.5 1.2e-40
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  676 162.3 1.1e-39
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  676 162.3 1.1e-39
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729)  666 160.1 6.2e-39
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731)  666 160.1 6.2e-39
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  660 158.8 1.9e-38
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  660 158.8 1.9e-38
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  612 147.9 2.5e-35
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938)  609 147.2 5.9e-35
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483)  605 146.2 6.1e-35
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631)  604 146.1   9e-35
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646)  573 139.0 1.2e-32
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662)  573 139.0 1.2e-32
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660)  570 138.4 1.9e-32
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  566 137.5 3.4e-32
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  566 137.5 3.7e-32
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  548 133.4 7.8e-31
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715)  536 130.7 4.3e-30
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783)  536 130.7 4.7e-30
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737)  527 128.7 1.8e-29
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575)  510 124.8 2.1e-28
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690)  510 124.8 2.5e-28
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704)  510 124.8 2.5e-28
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724)  510 124.8 2.6e-28
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 406)  455 112.3 8.5e-25
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12          ( 820)  404 100.9 4.7e-21
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7         ( 507)  377 94.7 2.1e-19
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12         ( 600)  357 90.2 5.6e-18
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9          ( 585)  287 74.4 3.2e-13


>>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3               (407 aa)
 initn: 2655 init1: 2655 opt: 2655  Z-score: 3247.3  bits: 609.8 E(32554): 1.5e-174
Smith-Waterman score: 2655; 100.0% identity (100.0% similar) in 407 aa overlap (1-407:1-407)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 VLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 ELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       
pF1KE1 IGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
              370       380       390       400       

>>CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17             (406 aa)
 initn: 2418 init1: 2418 opt: 2426  Z-score: 2967.5  bits: 558.0 E(32554): 5.7e-159
Smith-Waterman score: 2426; 89.7% identity (98.0% similar) in 407 aa overlap (1-407:1-406)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQ
       ::... . .:..: :.::.:.::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 MSASQDSRSRDNG-PDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQ
               10         20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKV
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:...: :::::::::::::::::::
CCDS11 QRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMF
       ..::::::::.::::::::::: :.:::: :::::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS11 VMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMF
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 VLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE
       ::::::::::::::::::.::::::.. ::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS11 VLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 ELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTV
       :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS11 ELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTV
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       
pF1KE1 IGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
       :::::::::::::::.::::::: ::::::::::..::::.::::::
CCDS11 IGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI
     360       370       380       390       400      

>>CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17             (347 aa)
 initn: 1963 init1: 1963 opt: 1971  Z-score: 2412.5  bits: 455.1 E(32554): 4.7e-128
Smith-Waterman score: 1971; 88.4% identity (97.9% similar) in 335 aa overlap (1-335:1-334)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQ
       ::... . .:..: :.::.:.::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::
CCDS58 MSASQDSRSRDNG-PDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQ
               10         20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 QRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKV
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:...: :::::::::::::::::::
CCDS58 QRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 ILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMF
       ..::::::::.::::::::::: :.:::: :::::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS58 VMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMF
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 VLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE
       ::::::::::::::::::.::::::.. ::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS58 VLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 ELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTV
       :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS58 ELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTV
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHR
       ::.::::::::::::::::::::::::::::::..                         
CCDS58 SAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLGKLYPQNRSRWTVWP            
     300       310       320       330       340                   

              370       380       390       400       
pF1KE1 IGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI

>>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17             (411 aa)
 initn: 1802 init1: 1258 opt: 1801  Z-score: 2203.6  bits: 416.7 E(32554): 2e-116
Smith-Waterman score: 1801; 71.4% identity (89.7% similar) in 378 aa overlap (30-407:35-411)

                10        20        30        40        50         
pF1KE1  MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAI
                                     ... .:: :.:.:.::::::::::::::::
CCDS11 ATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAI
           10        20        30        40        50        60    

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE1 QQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQK
       :::::   ::: :::::.::::::::::.::.:: :.:. .:::::.:::::::: ::::
CCDS11 QQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQK
           70        80        90       100       110       120    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE1 VILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKM
        .:::::::.. :::::::::: ....::.  . :.:.:::::::::. :: :  . :::
CCDS11 GLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDY-GQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKM
          130       140       150        160       170       180   

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE1 FVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKK
       .:::::::::..:::.:::.... :  . ::::.:::.: ..::.:.::: ::::::::.
CCDS11 LVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKR
           190       200       210       220       230       240   

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE1 EELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFT
       .::::::::::.. :::::::.:::::::.:::::::::: ::.::::::::::.  .::
CCDS11 DELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFT
           250       260       270       280       290       300   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE1 VSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIH
       ::..:::: ::::. ::.:::::.:::::.::. :::.:: ::::.::::::.::: :::
CCDS11 VSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIH
           310       320       330       340       350       360   

     360       370       380       390       400       
pF1KE1 RIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
       ::::.::.:::::::::: ..: ::::::: .:.: ..::::::::::
CCDS11 RIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
           370       380       390       400       410 

>>CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11               (483 aa)
 initn: 778 init1: 439 opt: 930  Z-score: 1138.0  bits: 219.7 E(32554): 4.6e-57
Smith-Waterman score: 930; 38.4% identity (74.2% similar) in 372 aa overlap (33-403:96-464)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KE1 GGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQR
                                     ..:.:. ::. :: ::. .:.:::: ::..
CCDS44 IKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEE
          70        80        90       100       110       120     

             70        80        90       100       110       120  
pF1KE1 AIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVIL
       .:   ..: :..:.:..::::.... : .:..:...  . ::.:..:::::: :.... .
CCDS44 SIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICI
         130       140       150       160       170       180     

             130       140       150       160       170       180 
pF1KE1 ALGDYMG-ATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFV
        .. .:: :   :  ::::.:.....:. .. :.:..::::..:....   .   ..:.:
CCDS44 QVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLD-DTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIV
         190       200       210        220       230       240    

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE1 LDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEE
       :::::..::. : . . .:.  :  . :..: :::.: .: .  .. .. : .: .  ::
CCDS44 LDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLM-EE
          250       260       270       280       290       300    

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE1 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS
       :::.:. :.:  :  :. :.  :  :.  : :.:..:: :. ..:. :..:.    ..  
CCDS44 LTLKGVTQYYAYVT-ERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCF
           310        320       330       340       350       360  

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE1 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI
        .:. : :..:. ....::.:  : :. :::..::::.: :..:::.:.:   :.:.:::
CCDS44 YIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRI
            370       380       390       400       410       420  

             370       380       390       400                     
pF1KE1 GRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI              
       ::.::::. :.:::..: .:.  :..::   .: .. .: :.                  
CCDS44 GRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEK
            430       440       450       460       470       480  

CCDS44 P
        

>>CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16            (479 aa)
 initn: 744 init1: 422 opt: 923  Z-score: 1129.5  bits: 218.1 E(32554): 1.4e-56
Smith-Waterman score: 923; 40.3% identity (70.6% similar) in 402 aa overlap (19-407:83-474)

                           10        20        30        40        
pF1KE1             MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGI
                                     ::.. . :     : .:... :: .::.:.
CCDS10 KEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYS-----VKSFEELRLKPQLLQGV
             60        70        80        90            100       

       50        60        70           80        90       100     
pF1KE1 YAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKG---YDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQAL
       ::.::..:: ::. :. : . .    ..:::.::::::::.:....:.:.:   :  : :
CCDS10 YAMGFNRPSKIQENAL-PLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCL
       110       120        130       140       150       160      

         110       120       130       140        150       160    
pF1KE1 VLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVR-NEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVF
        :.:: ::: :  :::  .: ..     :      :: :.... :  . .::.:::: :.
CCDS10 CLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLA----YAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVL
        170       180       190           200       210       220  

           170       180        190       200       210       220  
pF1KE1 DMLNR-RYLSPKWIKMFVLDEADEML-SRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVL
       :  .. ....:: ::.::::::: :. ..: .::  .: . :  . :..:.:::.  .: 
CCDS10 DWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVW
            230       240       250       260       270       280  

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE1 EVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNT
       . ..: . ::  : .:.:: ::. :::.:.    .. :...::.:: ..::.::.:: .:
CCDS10 KFAQKVVPDPNVIKLKREEETLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHT
            290       300       310       320       330       340  

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE1 RRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQV
       :. ..::. ..  .   :. : :.:  ..: .....:: :. .::.::.. ::::::.::
CCDS10 RKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQV
            350       360       370       380       390       400  

            350             360       370        380       390     
pF1KE1 SLVINYDLPTNR------ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFV-TEEDKRILRDIETFYNTT
       :.:::.:::...      :.:.::::: ::::..:.:.:.: ....  ::  :.  .:  
CCDS10 SVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKK
            410       420       430       440       450       460  

         400            
pF1KE1 VEEMPMNVADLI     
       .:..  .  : :     
CCDS10 IERLDTDDLDEIEKIAN
            470         

>>CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16            (478 aa)
 initn: 734 init1: 422 opt: 913  Z-score: 1117.3  bits: 215.9 E(32554): 6.5e-56
Smith-Waterman score: 913; 39.8% identity (70.6% similar) in 402 aa overlap (19-407:82-473)

                           10        20        30        40        
pF1KE1             MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGI
                                     ::.. . :     : .:... :: .::.:.
CCDS10 KEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYS-----VKSFEELRLKPQLLQGV
              60        70        80             90       100      

       50        60        70           80        90       100     
pF1KE1 YAYGFEKPSAIQQRAIIPCIKG---YDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQAL
       ::.::..:: ::. :. : . .    ..:::.::::::::.:....:...:   .  : :
CCDS10 YAMGFNRPSKIQENAL-PMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCL
        110       120        130       140       150       160     

         110       120       130       140        150       160    
pF1KE1 VLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVR-NEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVF
        :.:: ::: :  :::  .: ..     :      :: :.... :  . .::.:::: :.
CCDS10 CLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLA----YAVRGNKLERGQKISEQIVIGTPGTVL
         170       180       190           200       210       220 

           170       180        190       200       210       220  
pF1KE1 DMLNR-RYLSPKWIKMFVLDEADEML-SRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVL
       :  .. ....:: ::.::::::: :. ..: .::  .: . :  . :..:.:::.  .: 
CCDS10 DWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVW
             230       240       250       260       270       280 

            230       240       250       260       270       280  
pF1KE1 EVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNT
       . ..: . ::  : .:.:: ::. :::.:.    .. :...::.:: ..::.::.:: .:
CCDS10 KFAQKVVPDPNVIKLKREEETLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHT
             290       300       310       320       330       340 

            290       300       310       320       330       340  
pF1KE1 RRKVDWLTEKMHARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQV
       :. ..::. ..  .   :. : :.:  ..: .....:: :. .::.::.. ::::::.::
CCDS10 RKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQV
             350       360       370       380       390       400 

            350             360       370        380       390     
pF1KE1 SLVINYDLPTNR------ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFV-TEEDKRILRDIETFYNTT
       :.:::.:::...      :.:.::::: ::::..:.:.:.: ....  ::  :.  .:  
CCDS10 SVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKK
             410       420       430       440       450       460 

         400            
pF1KE1 VEEMPMNVADLI     
       .:..  .  : :     
CCDS10 IERLDTDDLDEIEKIAN
             470        

>>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19            (427 aa)
 initn: 797 init1: 411 opt: 891  Z-score: 1091.2  bits: 210.9 E(32554): 1.9e-54
Smith-Waterman score: 891; 38.3% identity (72.4% similar) in 373 aa overlap (35-403:46-417)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE1 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
                                     : :. ::  :::.:   :::.:: .:.. :
CCDS12 EEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
          20        30        40        50        60        70     

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE1 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL
          : :.::. ::.:: ::::.:... :::.:    .. .::.  ::::: ::.:    .
CCDS12 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERF
          80        90       100       110       120       130     

          130        140       150       160       170       180   
pF1KE1 GDYMGAT-CHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD
       . :: ..   . .:: ..... . :. . ::.:::::::.. ..  : .: : .: ::::
CCDS12 SKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLD
         140       150       160       170       180       190     

           190        200       210       220       230       240  
pF1KE1 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E
       : :.:: .  .. .. :::.      : ...:::.  :.  : .:::.::....:  : .
CCDS12 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETK
         200       210       220       230       240       250     

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pF1KE1 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS
       :::.:..:.:....  : :   : :: ..: ..:..::... ..   :.. .  ..: . 
CCDS12 LTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAI
         260       270        280       290       300       310    

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE1 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI
       :.:  : :.::   ...:.. . :.:..:.:..::.:...:..:.:::.: . ..:.::.
CCDS12 AIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRV
          320       330       340       350       360       370    

             370       380        390       400             
pF1KE1 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI      
       .:.:::: ::.::.::..: : .:: :..  ....: :.: ..          
CCDS12 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR
          380       390       400       410       420       

>>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6               (428 aa)
 initn: 798 init1: 411 opt: 888  Z-score: 1087.5  bits: 210.2 E(32554): 3e-54
Smith-Waterman score: 888; 39.2% identity (72.7% similar) in 370 aa overlap (35-400:47-415)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE1 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
                                     : :. ::  :::.:   :::.:: .:.. :
CCDS46 EVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
         20        30        40        50        60        70      

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pF1KE1 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL
          : :.::. ::.:: ::::.:... :::::    ....::.  ::::: ::.:    .
CCDS46 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERF
         80        90       100       110       120       130      

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pF1KE1 GDYMGATCHACI-GGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD
       . ::  .  : . :: ..... . :. . ::::::::::.. .   . :. : :: :.::
CCDS46 SKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILD
        140       150       160       170       180       190      

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pF1KE1 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E
       : :.:: .  .. .. :::.      ::...:::.  ..  : .:::.::..:.:  : .
CCDS46 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETK
        200       210       220       230       240       250      

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pF1KE1 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS
       :::.:..:.:.... .: :   : :: ..: ..:.:::... ..   :.. .  ..: . 
CCDS46 LTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAI
        260       270        280       290       300       310     

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pF1KE1 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI
       :.:  : :.::   ...:.. . :.:..:.:..::.:...:....:::.: . ..:.::.
CCDS46 AIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRV
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pF1KE1 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI      
       .:.:::: ::.::.::..: : .:: :..  ..... :.:             
CCDS46 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR
         380       390       400       410       420        

>>CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11             (483 aa)
 initn: 686 init1: 434 opt: 873  Z-score: 1068.3  bits: 206.8 E(32554): 3.5e-53
Smith-Waterman score: 873; 39.3% identity (71.1% similar) in 387 aa overlap (32-406:96-475)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE1 SGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQ
                                     : .:... ::: ::.::::.::..:: ::.
CCDS44 LLNKLIHQSLVESSHRVEVLQKDPSSPLYSVKTFEELRLKEELLKGIYAMGFNRPSKIQE
          70        80        90       100       110       120     

              70           80        90       100       110        
pF1KE1 RAIIPCIKGY---DVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQ
        :. : . ..   ..:::.::::::::.:....:....      : : :::: ::: :  
CCDS44 MAL-PMMLAHPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVNALELFPQCLCLAPTYELALQTG
          130       140       150       160       170       180    

      120       130       140        150       160        170      
pF1KE1 KVILALGDYMGATCHACIGGTNVR-NEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDM-LNRRYLSPKW
       .:.    . ::  :        .: :.. .    . .:..:::: :.:  .. . ..   
CCDS44 RVV----EQMGKFCVDVQVMYAIRGNRIPRGTDITKQIIIGTPGTVLDWCFKLKLIDLTK
              190       200       210       220       230       240

        180        190       200       210       220       230     
pF1KE1 IKMFVLDEADEML-SRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRI
       :..::::::: :. ..::.:.  .: . : .  :..:.:::.  .: . ..... ::  :
CCDS44 IRVFVLDEADVMIDTQGFSDHSIRIQRALPSECQMLLFSATFEDSVWHFAERIIPDPNVI
              250       260       270       280       290       300

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE1 LVKKEELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHA
        ..::::::..:.:.:.  :... : ..::..: ..:: ::.:: .:::.. ::: .:  
CCDS44 KLRKEELTLNNIRQYYVLCEHRKDKYQALCNIYGSITIGQAIIFCQTRRNAKWLTVEMIQ
              310       320       330       340       350       360

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE1 RDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNR-
           :: : :..  ..:  :...::.:. .:::::.. ::::::.::..:.:.:::... 
CCDS44 DGHQVSLLSGELTVEQRASIIQRFRDGKEKVLITTNVCARGIDVKQVTIVVNFDLPVKQG
              370       380       390       400       410       420

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pF1KE1 -----ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI  
            :.:.::::: ::::.::.:.:..  ..   :  :.  .:.....  .:. :.   
CCDS44 EEPDYETYLHRIGRTGRFGKKGLAFNMIEVDELPSLMKIQDHFNSSIKQ--LNAEDMDEI
              430       440       450       460         470        

CCDS44 EKIDY
      480   




407 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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