FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6526, 359 aa 1>>>pF1KB6526 359 - 359 aa - 359 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3686+/-0.000332; mu= 16.3720+/- 0.021 mean_var=70.1624+/-13.955, 0's: 0 Z-trim(115.6): 27 B-trim: 5 in 1/50 Lambda= 0.153117 statistics sampled from 26212 (26239) to 26212 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16 Scan time: 8.610 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004303 (OMIM: 301770) arrestin-C [Homo sapiens] ( 388) 2341 526.1 5.2e-149 XP_016885007 (OMIM: 301770) PREDICTED: arrestin-C ( 403) 2130 479.5 5.7e-135 XP_011543336 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 449) 1545 350.3 5e-96 XP_016873239 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 473) 1545 350.3 5.2e-96 NP_004032 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform A ( 418) 1539 348.9 1.2e-95 XP_016873241 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 442) 1539 348.9 1.2e-95 XP_016873242 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 437) 1534 347.8 2.6e-95 XP_011543337 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 441) 1485 337.0 4.8e-92 XP_016873240 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 465) 1485 337.0 5e-92 NP_064647 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform B ( 410) 1479 335.7 1.1e-91 XP_016873243 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 434) 1479 335.7 1.2e-91 NP_004304 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 1 ( 409) 1396 317.3 3.7e-86 NP_001244259 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 421) 1396 317.3 3.8e-86 XP_011522160 (OMIM: 107941) PREDICTED: beta-arrest ( 440) 1394 316.9 5.4e-86 XP_016860130 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 373) 1258 286.8 5.2e-77 NP_000532 (OMIM: 181031,258100,613758) S-arrestin ( 405) 1257 286.6 6.5e-77 XP_016860131 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 369) 1255 286.2 8.2e-77 NP_945355 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 2 ( 394) 1159 265.0 2.1e-70 NP_001244260 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 406) 1159 265.0 2.1e-70 NP_001244258 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 330) 1044 239.5 8e-63 XP_016860132 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 273) 900 207.7 2.6e-53 NP_001244257 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 430) 902 208.2 2.8e-53 XP_011509895 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 305) 847 196.0 9.5e-50 XP_011509896 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 281) 836 193.5 4.8e-49 XP_011509898 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 271) 799 185.3 1.3e-46 NP_001316993 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 217) 550 130.3 4e-30 XP_016880134 (OMIM: 107941) PREDICTED: beta-arrest ( 229) 550 130.3 4.2e-30 >>NP_004303 (OMIM: 301770) arrestin-C [Homo sapiens] (388 aa) initn: 2341 init1: 2341 opt: 2341 Z-score: 2796.2 bits: 526.1 E(85289): 5.2e-149 Smith-Waterman score: 2341; 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XP_016 FRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPP-APEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 VTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAG ::::::::::::::.:: ::.:.:::.::::: :: . ::. ::::.::::.:: . : XP_016 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 PGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQIT : :.:.: :.::.: .::.:.: .:.:..:::::::::: ..: :::..::::::: : . 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XP_016 ISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYT 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 VTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGG .::.:: . .:::::::::::::::::::::..: : ..:.:::.:::::.:.:.:: :: XP_016 LTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGG 310 320 330 340 350 360 340 350 pF1KB6 ILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR ::.::::..:.::::..: XP_016 --------DVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPENETPVDTNLIELDTNQRPSSHRTVAR 370 380 390 400 410 >>NP_064647 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform B [Ho (410 aa) initn: 1492 init1: 1004 opt: 1479 Z-score: 1766.8 bits: 335.7 E(85289): 1.1e-91 Smith-Waterman score: 1479; 60.8% identity (84.2% similar) in 355 aa overlap (2-356:6-351) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCA ..::::.: ::::..::::::::::.: :.:.::::::::::.: :...: :::: NP_064 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 FRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQM :::::.::.:.::::::::.: ..: : . . ::: :::::..:::..:::::... 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