FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6526, 359 aa 1>>>pF1KB6526 359 - 359 aa - 359 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5459+/-0.00076; mu= 15.1364+/- 0.046 mean_var=68.1289+/-13.619, 0's: 0 Z-trim(108.6): 13 B-trim: 79 in 2/50 Lambda= 0.155385 statistics sampled from 10298 (10309) to 10298 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16 Scan time: 2.930 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14399.1 ARR3 gene_id:407|Hs108|chrX ( 388) 2341 533.6 1.1e-151 CCDS44684.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 ( 418) 1539 353.8 1.5e-97 CCDS31640.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 ( 410) 1479 340.3 1.7e-93 CCDS11050.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 409) 1396 321.7 6.7e-88 CCDS46545.1 SAG gene_id:6295|Hs108|chr2 ( 405) 1257 290.6 1.6e-78 CCDS11051.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 394) 1159 268.6 6.4e-72 CCDS58505.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 406) 1159 268.6 6.6e-72 CCDS59276.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 330) 1044 242.8 3.2e-64 CCDS58504.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 430) 902 211.0 1.5e-54 CCDS82039.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 217) 550 132.0 4.8e-31 >>CCDS14399.1 ARR3 gene_id:407|Hs108|chrX (388 aa) initn: 2341 init1: 2341 opt: 2341 Z-score: 2836.8 bits: 533.6 E(32554): 1.1e-151 Smith-Waterman score: 2341; 99.7% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCAFRYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS14 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYLKCRKLFVMLTCAFRYG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 RDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 RDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQMVTNL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 PCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 PCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 AQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 AQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQITDVVL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 YSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 YSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 TIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAASS 310 320 330 340 350 360 CCDS14 EDIVIEEFTRKGEEESQKAVEAEGDEGS 370 380 >>CCDS44684.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 (418 aa) initn: 1540 init1: 1127 opt: 1539 Z-score: 1864.6 bits: 353.8 E(32554): 1.5e-97 Smith-Waterman score: 1539; 62.3% identity (86.5% similar) in 355 aa overlap (2-356:6-359) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTCA ..::::.: ::::..::::::::::.: :.:.::::::::::.: :...: :::: CCDS44 MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 FRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQM :::::.::.:.::::::::.: ..: : . . ::: :::::..:::..:::::... 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CCDS11 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPP-TRLQDRLLRKLGQHAHPFFFT 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 MVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEA . ::::::::::::::.:: ::.:::...:::.. :: ::. ::::.::::::: . CCDS11 IPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKP 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 GPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQI :: :::.: :.::.: . :.:.: .:.:..:::::..::: ..: ..:..::::.:: : CCDS11 GPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQY 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 TDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDT .:. :.: .: : : . :. .:.: . ...::.:. . .::::::::::::::: CCDS11 ADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDT 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 NLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSH :::::::.. : .::.:::::::.:.:.:.:: :: ::.::::.::.:::: CCDS11 NLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------DVSVELPFVLMHPKPHD 290 300 310 320 330 pF1KB6 EAAR CCDS11 HIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC 340 350 360 370 380 390 >>CCDS58505.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (406 aa) initn: 1141 init1: 927 opt: 1159 Z-score: 1404.4 bits: 268.6 E(32554): 6.6e-72 Smith-Waterman score: 1276; 54.8% identity (77.8% similar) in 352 aa overlap (2-353:7-334) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYFKCRKLFVMLTC ..::::.: : ::..::::::::::.: :.:. .:: ::: CCDS58 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPV---------------VFVTLTC 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 AFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQ ::::::.::.:.::.:::::.. : :. : . :. : : ::.:::.:::..:.:: . CCDS58 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPP-TRLQDRLLRKLGQHAHPFFFT 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 MVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEA . ::::::::::::::.:: ::.:::...:::.. :: ::. ::::.::::::: . 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CCDS58 VHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPL 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 LAASCQKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGD :. . .::::::::::::::::::::::.. : .::.:::::::.:.:.:.:: :: CCDS58 LSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG---- 300 310 320 330 340 350 340 350 pF1KB6 LTASDVGVELPLVLIHPKPSHEAAR ::.::::.::.:::: CCDS58 ----DVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFED 360 370 380 390 400 410 >>CCDS82039.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (217 aa) initn: 562 init1: 488 opt: 550 Z-score: 670.8 bits: 132.0 E(32554): 4.8e-31 Smith-Waterman score: 550; 52.1% identity (78.8% similar) in 165 aa overlap (189-353:1-157) 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 DYVRLVVRKVQFAPPEAGPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSIN .: . :.:.: .:.:..:::::..::: .. CCDS82 MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVT 10 20 30 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 NCTNKVIKKIKISVDQITDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAAS : ..:..::::.:: : .:. :.: .: : : . :. .:.: . ...::.:. . CCDS82 NNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDN 40 50 60 70 80 90 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 CQKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTAS .::::::::::::::::::::::.. : .::.:::::::.:.:.:.:: :: CCDS82 REKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG-------- 100 110 120 130 140 340 350 pF1KB6 DVGVELPLVLIHPKPSHEAAR ::.::::.::.:::: CCDS82 DVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARL 150 160 170 180 190 200 359 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 01:44:35 2016 done: Mon Nov 7 01:44:36 2016 Total Scan time: 2.930 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]