Result of FASTA (ccds) for pFN21AE0018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0018, 856 aa
  1>>>pF1KE0018 856 - 856 aa - 856 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5583+/-0.00108; mu= 19.8641+/- 0.065
 mean_var=80.0470+/-15.552, 0's: 0 Z-trim(103.9): 30  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.143351
 statistics sampled from 7639 (7658) to 7639 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.235), width:  16
 Scan time:  3.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS54746.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 856) 5637 1176.3       0
CCDS47029.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 865) 5025 1049.8       0
CCDS54748.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 842) 4826 1008.6       0
CCDS54747.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 834) 4775 998.1       0
CCDS2012.1 PROM2 gene_id:150696|Hs108|chr2         ( 834) 1244 267.8 5.6e-71


>>CCDS54746.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (856 aa)
 initn: 5637 init1: 5637 opt: 5637  Z-score: 6297.6  bits: 1176.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5637; 100.0% identity (100.0% similar) in 856 aa overlap (1-856:1-856)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKIVYYEAGIILCCVLGLLFIILMPLVGYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKIVYYEAGIILCCVLGLLFIILMPLVGYF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVANHQVRTRIKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVANHQVRTRIKR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGGILDRLRPNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGGILDRLRPNI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 IPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRSSLNDPLCLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRSSLNDPLCLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 HPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQGYQSLNDIPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQGYQSLNDIPD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 RVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYIHRNLPTLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYIHRNLPTLEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 YDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGGVFLMVGVGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGGVFLMVGVGL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 SFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEYYLSGKLFNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEYYLSGKLFNK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 SKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELESLKVNLNIFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELESLKVNLNIFL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 LGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANSLPPGNLRNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANSLPPGNLRNS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 LKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASLDFAQNFITN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASLDFAQNFITN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 NTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVDVFLCSYIID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVDVFLCSYIID
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 PLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNMENGNNGYHKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNMENGNNGYHKD
              790       800       810       820       830       840

              850      
pF1KE0 HVYGIHNPVMTSPSQH
       ::::::::::::::::
CCDS54 HVYGIHNPVMTSPSQH
              850      

>>CCDS47029.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (865 aa)
 initn: 5025 init1: 5025 opt: 5025  Z-score: 5613.5  bits: 1049.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5609; 99.0% identity (99.0% similar) in 865 aa overlap (1-856:1-865)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90                100       110 
pF1KE0 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDK---------IVYYEAGIILCCVLGLLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::         :::::::::::::::::::
CCDS47 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE0 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE0 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE0 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
              370       380       390       400       410       420

             420       430       440       450       460       470 
pF1KE0 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
              430       440       450       460       470       480

             480       490       500       510       520       530 
pF1KE0 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
              490       500       510       520       530       540

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE0 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
              550       560       570       580       590       600

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE0 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
              610       620       630       640       650       660

             660       670       680       690       700       710 
pF1KE0 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
              670       680       690       700       710       720

             720       730       740       750       760       770 
pF1KE0 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
              730       740       750       760       770       780

             780       790       800       810       820       830 
pF1KE0 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
              790       800       810       820       830       840

             840       850      
pF1KE0 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
              850       860     

>>CCDS54748.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (842 aa)
 initn: 4826 init1: 4826 opt: 4826  Z-score: 5391.3  bits: 1008.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5410; 98.9% identity (98.9% similar) in 838 aa overlap (1-829:1-838)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90                100       110 
pF1KE0 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDK---------IVYYEAGIILCCVLGLLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::         :::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE0 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE0 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE0 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
              370       380       390       400       410       420

             420       430       440       450       460       470 
pF1KE0 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
              430       440       450       460       470       480

             480       490       500       510       520       530 
pF1KE0 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
              490       500       510       520       530       540

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE0 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
              550       560       570       580       590       600

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE0 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
              610       620       630       640       650       660

             660       670       680       690       700       710 
pF1KE0 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
              670       680       690       700       710       720

             720       730       740       750       760       770 
pF1KE0 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
              730       740       750       760       770       780

             780       790       800       810       820       830 
pF1KE0 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNPS
              790       800       810       820       830       840

             840       850      
pF1KE0 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
                                
CCDS54 QH                       
                                

>>CCDS54747.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (834 aa)
 initn: 4775 init1: 4775 opt: 4775  Z-score: 5334.3  bits: 998.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5359; 98.9% identity (98.9% similar) in 830 aa overlap (1-821:1-830)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90                100       110 
pF1KE0 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDK---------IVYYEAGIILCCVLGLLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::         :::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE0 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE0 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE0 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
              370       380       390       400       410       420

             420       430       440       450       460       470 
pF1KE0 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
              430       440       450       460       470       480

             480       490       500       510       520       530 
pF1KE0 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
              490       500       510       520       530       540

             540       550       560       570       580       590 
pF1KE0 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
              550       560       570       580       590       600

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE0 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
              610       620       630       640       650       660

             660       670       680       690       700       710 
pF1KE0 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
              670       680       690       700       710       720

             720       730       740       750       760       770 
pF1KE0 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
              730       740       750       760       770       780

             780       790       800       810       820       830 
pF1KE0 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDPSQH      
              790       800       810       820       830          

             840       850      
pF1KE0 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH

>>CCDS2012.1 PROM2 gene_id:150696|Hs108|chr2              (834 aa)
 initn: 920 init1: 275 opt: 1244  Z-score: 1387.7  bits: 267.8 E(32554): 5.6e-71
Smith-Waterman score: 1244; 27.2% identity (65.7% similar) in 816 aa overlap (4-811:7-807)

                  10        20            30        40          50 
pF1KE0    MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTD----APKAWNYELPATN--YETQDSHKAGP
             .:. :: ::: : ..:    ..::    .:       ::.   . .   .  : 
CCDS20 MKHTLALLAPLLGLGL-GLALSQLAAGATDCKFLGPAEHLTFTPAARARWLAPRVRAPGL
               10         20        30        40        50         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE0 IGILFELVHIFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
       .  :.  :. :: :::   :: . .. .:..    :..  ..: :::: ..: :.. :..
CCDS20 LDSLYGTVRRFLSVVQLNPFPSELVKALLNELASVKVN--EVVRYEAGYVVCAVIAGLYL
      60        70        80        90         100       110       

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       .:.: .:  :: :::  .:::... ..:  .   :  . . ::.  ... ::.  .::.:
CCDS20 LLVPTAGLCFCCCRCHRRCGGRVKTEHKALA-CERAALMVFLLLTTLLLLIGVVCAFVTN
       120       130       140        150       160       170      

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE0 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       .... ..  : .    .. .:  :....:.... .  :..  ....  .:....  .:..
CCDS20 QRTHEQMGPSIEAMPETLLSLWGLVSDVPQELQAVAQQFSLPQEQVSEELDGVGVSIGSA
        180       190       200       210       220       230      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       :  .:: .. :.:  . :.. ... . . :...:.:.  :.  . .:  ..   .  :  
CCDS20 IHTQLRSSVYPLLAAVGSLGQVLQVSVHHLQTLNATVVELQAGQQDLEPAIREHRDRLLE
        240       250       260       270       280       290      

             300       310        320       330       340       350
pF1KE0 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQ-LNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQ
        :..  :     .  : .  :: .. :. . .. :.: ::  : ....: .......::.
CCDS20 LLQEARC-----QGDCAGA-LSWARTLELGADFSQVPSVDHVLHQLKGVPEANFSSMVQE
        300            310        320       330       340       350

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pF1KE0 GYQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESY
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CCDS20 IPRVTSLKL                  
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