FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6554, 391 aa 1>>>pF1KB6554 391 - 391 aa - 391 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5560+/-0.00113; mu= -3.8655+/- 0.066 mean_var=249.9695+/-56.149, 0's: 0 Z-trim(109.0): 480 B-trim: 158 in 1/50 Lambda= 0.081121 statistics sampled from 10040 (10616) to 10040 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16 Scan time: 2.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13003.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 ( 391) 2661 324.9 8e-89 CCDS59224.1 CSNK2A3 gene_id:283106|Hs108|chr11 ( 391) 2619 320.0 2.4e-87 CCDS10794.1 CSNK2A2 gene_id:1459|Hs108|chr16 ( 350) 1980 245.1 7.2e-65 CCDS13004.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 ( 255) 1760 219.3 3.2e-57 CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 495 71.4 1.5e-12 CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 492 71.0 2e-12 CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 465 67.8 1.6e-11 CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 464 67.7 1.6e-11 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 465 67.9 1.8e-11 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 465 67.9 1.9e-11 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 465 67.9 2e-11 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 464 67.8 2.1e-11 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 464 67.8 2.2e-11 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 464 67.8 2.3e-11 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 458 67.0 3e-11 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 458 67.1 3.9e-11 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 458 67.1 4e-11 CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 454 66.6 4.2e-11 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 458 67.2 4.4e-11 CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 452 66.3 5e-11 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 451 66.3 7.2e-11 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 451 66.3 7.2e-11 >>CCDS13003.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 (391 aa) initn: 2661 init1: 2661 opt: 2661 Z-score: 1708.2 bits: 324.9 E(32554): 8e-89 Smith-Waterman score: 2661; 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CCDS10 LLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQSQPCADNAVLSSGLTAAR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 TPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ >>CCDS13004.1 CSNK2A1 gene_id:1457|Hs108|chr20 (255 aa) initn: 1760 init1: 1760 opt: 1760 Z-score: 1140.9 bits: 219.3 E(32554): 3.2e-57 Smith-Waterman score: 1760; 100.0% identity (100.0% similar) in 255 aa overlap (137-391:1-255) 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 RTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDH :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 MYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDH 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 EHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 EHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMI 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 FRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 FRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVH 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 SENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPV 160 170 180 190 200 210 350 360 370 380 390 pF1KB6 SSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SSANMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ 220 230 240 250 >>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 (364 aa) initn: 206 init1: 131 opt: 495 Z-score: 338.6 bits: 71.4 E(32554): 1.5e-12 Smith-Waterman score: 495; 30.1% identity (62.0% similar) in 316 aa overlap (20-324:4-308) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPRE-YWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINI :: .. : . . : . : .: .: : :. : : . CCDS14 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 TNNEKVVVKIL-KP----VKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVS---RTPAL .::.:: : .: .. .. ::...:..:. :.: : :. .: . . CCDS14 RLRQKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKH-ENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVY 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KB6 VFEHVNNTDFKQLY--QTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHR . . ..:.... :.:.: ..: .:..:..: : :: ::.:::.:: :: .. : CCDS14 LVTTLMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVN-EDC 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 KLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRK .::..:.:::. . .:.. ::.:....::...... :. ..:.::.::..: .. . CCDS14 ELRILDFGLAR--QADEEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELL-QG 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 EPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSEN . .: : : ::: :: .:.:: . . . : . : . . : .: . .. : CCDS14 KALFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPS-PEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGAN 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 QHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSA : :.:.: ..: : ..:..: ::. : :: CCDS14 -----PLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERT 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 pF1KB6 NMMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ CCDS14 LEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ 340 350 360 >>CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 (367 aa) initn: 364 init1: 127 opt: 492 Z-score: 336.7 bits: 71.0 E(32554): 2e-12 Smith-Waterman score: 492; 30.3% identity (61.7% similar) in 337 aa overlap (1-327:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MSGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINIT ::.: :.:. : . : . : : ..: :. .. .: : :. : :.. CCDS14 MSSPPPARSGFYRQEVT---KTAW--EVRAV-------YRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB6 NNEKVVVKIL-KPVKK----KKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEH .. ::..: : .: .. :. ::...:...: :.: : :. . : CCDS14 TGAKVAIKKLYRPFQSELFAKRAYRELRLLKHMRH-ENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYL 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 VN---NTDFKQL--YQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRK : .::. .: .. : . :.: .:..::.: : :. ::.:::.:: :. .. : . CCDS14 VMPFMGTDLGKLMKHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVN-EDCE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 LRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKE :...:.:::. . .:.. :..:....::...... : ..:.::.::..: :: : CCDS14 LKILDFGLAR--QADSEMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKT 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 PFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQ .:.: :. ::: .: :: :: ..... . . . : . .: . .. . CCDS14 -LFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPA-EFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTN--- 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 HLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSAN .:: :...:.:.: : ..:.:: ::. :::: .. CCDS14 --ASPLAVNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTL 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 pF1KB6 MMSGISSVPTPSPLGPLAGSPVIAAANPLGMPVPAAAGAQQ CCDS14 DEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL 340 350 360 >>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 (315 aa) initn: 373 init1: 145 opt: 465 Z-score: 320.5 bits: 67.8 E(32554): 1.6e-11 Smith-Waterman score: 466; 29.5% identity (62.8% similar) in 312 aa overlap (37-333:2-295) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 SRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVV . :. . : :.:.:. ::. : :... :. CCDS33 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 VKIL-----KPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDF :: . :: :: :::..:..:. ::...: .. . .: ::::. ..: . CCDS33 VKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH-PNLVNLIEVFRR--KRKMHLVFEYCDHTLL 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KB6 KQLYQT---LTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGL ..: .. ..: :. ... :.::..:: . .:::.::.:..: .. ... :.:. CCDS33 NELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIHNCIHRDIKPENILITKQG-IIKICDFGF 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 AEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDN :.. ::. :. ::.:....::::: .: :.:.:..::..: .. .:.. :... CCDS33 AQILIPGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYGSSVDIWAIGCVFAELL-TGQPLWPGKSD 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 YDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHL------ ::: : ..:: .: :: ..:. .. . . . :... CCDS33 VDQLYLIIRTLG-------------KLIPRHQSIFKSNGFFHGISIPEPEDMETLEEKFS 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 -VSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMGSSSMPGGSTPVSSANM : : ::.:. :... ..::: . .: :: . . : . 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