FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6341, 424 aa 1>>>pF1KE6341 424 - 424 aa - 424 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6432+/-0.000849; mu= 12.8338+/- 0.051 mean_var=121.9180+/-23.874, 0's: 0 Z-trim(111.3): 12 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.116156 statistics sampled from 12277 (12288) to 12277 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16 Scan time: 2.180 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12433.1 CHST8 gene_id:64377|Hs108|chr19 ( 424) 2898 496.4 2.1e-140 CCDS42422.1 CHST9 gene_id:83539|Hs108|chr18 ( 443) 1304 229.3 5.6e-60 CCDS55878.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 ( 347) 737 134.2 1.9e-31 CCDS9099.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 ( 352) 737 134.3 1.9e-31 CCDS3039.1 CHST13 gene_id:166012|Hs108|chr3 ( 341) 627 115.8 6.5e-26 CCDS10059.1 CHST14 gene_id:113189|Hs108|chr15 ( 376) 571 106.5 4.7e-23 CCDS2047.1 CHST10 gene_id:9486|Hs108|chr2 ( 356) 562 104.9 1.3e-22 CCDS5333.1 CHST12 gene_id:55501|Hs108|chr7 ( 414) 476 90.6 3.1e-18 >>CCDS12433.1 CHST8 gene_id:64377|Hs108|chr19 (424 aa) initn: 2898 init1: 2898 opt: 2898 Z-score: 2634.2 bits: 496.4 E(32554): 2.1e-140 Smith-Waterman score: 2898; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MTLRPGTMRLACMFSSILLFGAAGLLLFISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDLPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MTLRPGTMRLACMFSSILLFGAAGLLLFISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDLPP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 GGSQDGDLKEPTERVTRDLSSGAPRGRNLPAPDQPQPPLQRGTRLRLRQRRRRLLIKKMP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 GGSQDGDLKEPTERVTRDLSSGAPRGRNLPAPDQPQPPLQRGTRLRLRQRRRRLLIKKMP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 AAATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASSSRRAVTPRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AAATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASSSRRAVTPRH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VSRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVHYGSALKRLDTFD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 VSRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVHYGSALKRLDTFD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 RQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSYYHPVFGKAILARYRANASREAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSYYHPVFGKAILARYRANASREAL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 RTGSGVRFPEFVQYLLDVHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RTGSGVRFPEFVQYLLDVHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 LIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPF 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 ADLY :::: CCDS12 ADLY >>CCDS42422.1 CHST9 gene_id:83539|Hs108|chr18 (443 aa) initn: 1368 init1: 1296 opt: 1304 Z-score: 1190.3 bits: 229.3 E(32554): 5.6e-60 Smith-Waterman score: 1331; 48.1% identity (71.3% similar) in 449 aa overlap (3-420:1-442) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MTLRPGTMRLA--CMFSSILLFGAAGLLLFISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDL ..:. : . .: :.:.::.::::::. :: : .: : .. :. .. 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CCDS42 KVSKLCYPCLINYDFVGKFETLEEDANYFLQMIGAPKELKFPNFKDRHSSDERTNAQVVR 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 pF1KE6 QYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPFADLY ::. .:. .:: :::::.:::::::. :: CCDS42 QYLKDLTRTERQLIYDFYYLDYLMFNYTTPFL 420 430 440 >>CCDS55878.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 (347 aa) initn: 682 init1: 181 opt: 737 Z-score: 678.3 bits: 134.2 E(32554): 1.9e-31 Smith-Waterman score: 737; 41.8% identity (70.0% similar) in 273 aa overlap (153-419:73-341) 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASS-SRRAVTPRHV .: :. . ..: :.: .::..:: . CCDS55 VDICCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDL 50 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 pF1KE6 SRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLA--SSTADIQHNTVHYGSALKRLDTF ... :.. :...:: :::..:.::::..:::.: . :. .: : .: .. :: :. . CCDS55 KHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQY 110 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 DRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHP-NSYYHPVFGKAILARYRANASRE . : :::..: :.:::::::::::::.:.:: . : .: .: :. : : ::..: CCDS55 SIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQE 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 ALRTGSGVRFPEFVQYLLDVH--RPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDAN ::: :. :.: ::: ::.: : : .. ::. : :: :: : ::.:::.:..:.:.: CCDS55 ALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSN 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 FFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNY . :.: . : :: . .. .::: ... ..: ..:. .. . :. : .:.::::: CCDS55 YVLQLAGVGSYLKFPTY----AKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNY 290 300 310 320 330 420 pF1KE6 SKPFADLY : : CCDS55 SVPSYLKLE 340 >>CCDS9099.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 (352 aa) initn: 682 init1: 181 opt: 737 Z-score: 678.2 bits: 134.3 E(32554): 1.9e-31 Smith-Waterman score: 737; 41.8% identity (70.0% similar) in 273 aa overlap (153-419:78-346) 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASS-SRRAVTPRHV .: :. . ..: :.: .::..:: . CCDS90 VDICCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDL 50 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 pF1KE6 SRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLA--SSTADIQHNTVHYGSALKRLDTF ... :.. :...:: :::..:.::::..:::.: . :. .: : .: .. :: :. . CCDS90 KHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQY 110 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 DRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHP-NSYYHPVFGKAILARYRANASRE . : :::..: :.:::::::::::::.:.:: . : .: .: :. : : ::..: CCDS90 SIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQE 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 ALRTGSGVRFPEFVQYLLDVH--RPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDAN ::: :. :.: ::: ::.: : : .. ::. : :: :: : ::.:::.:..:.:.: CCDS90 ALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSN 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 FFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNY . :.: . : :: . .. .::: ... ..: ..:. .. . :. : .:.::::: CCDS90 YVLQLAGVGSYLKFPTY----AKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNY 290 300 310 320 330 340 420 pF1KE6 SKPFADLY : : CCDS90 SVPSYLKLE 350 >>CCDS3039.1 CHST13 gene_id:166012|Hs108|chr3 (341 aa) initn: 445 init1: 145 opt: 627 Z-score: 578.7 bits: 115.8 E(32554): 6.5e-26 Smith-Waterman score: 627; 38.4% identity (65.2% similar) in 276 aa overlap (148-419:65-335) 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 KMPAAATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASSSRRAVT .: . ...:. ... ::. : : .: . CCDS30 GNRALGSSWLGGEKRSPLQKLYDLDQDPRSTLAKVHRQRRDLLNSACS--RHSRRQRLLQ 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 PRHVSRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTAD-IQHNTVHYGSALKRL :. . ...:.: : .::: :::..:.::::::..:.: : . :. . .: . : : CCDS30 PEDLRHVLVDDAHGLLYCYVPKVACTNWKRVLLALSGQARGDPRAISAQEAHAPGRLPSL 100 110 120 130 140 150 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 DTFDRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSY-YHPVFGKAILARYRANA :. : .:: .: .::::::::::.::.:.:. .: : .. .: :. : : : CCDS30 ADFSPAEINRRLRAYLAFLFVREPFERLASAYRNKLARPYSAAFQRRYGARIVQRLRPRA 160 170 180 190 200 210 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 SREALRTGSGVRFPEFVQYLLD--VHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMED .: : ::: ::. :::: ..: .. ::... :: :: . :: :::::.. . CCDS30 LPDARARGHDVRFAEFLAYLLDPRTRREEPFNEHWERAHALCHPCRLRYDVVGKFETLAE 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 DANFFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLM :: : :.: : .:.:: . . : .. .: . : ..: . ..: .:.: ::.:. CCDS30 DAAFVLGLAGAS-DLSFP--GPPRPRGAAASRDLAARLFRDISPFYQRRLFDLYKMDFLL 280 290 300 310 320 420 pF1KE6 FNYSKPFADLY :::: : CCDS30 FNYSAPSYLRLL 330 340 >>CCDS10059.1 CHST14 gene_id:113189|Hs108|chr15 (376 aa) initn: 494 init1: 181 opt: 571 Z-score: 527.4 bits: 106.5 E(32554): 4.7e-23 Smith-Waterman score: 578; 34.0% identity (57.0% similar) in 377 aa overlap (58-419:6-367) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 FISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDLPPGGSQDGDLKEPTERVTRDLSSGAPRGR : : .. .: :: :. : : :. CCDS10 MFPRPLTPLAAPNG--AEPLGRALRRAPLGRARA- 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 NLPAPDQPQPPLQR-----GTRLRLRQRRRRLLIKKMPAAATIPANSSDAPFIR-PGPGT .: .: : . .. : . .: .: . : :. . : . : :: CCDS10 GLGGPPLLLPSMLMFAVIVASSGLLLMIERGILAEMKPLPLHPPGREGTAWRGKAPKPGG 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 pF1KE6 LDGRW--VSLHRSQQERKRVMQEACAK-------YRASSSRRAVTPRHVSRIFVEDRHRV :. : ..:. :. :.:... .:.. . ..: . :: :.: ::.: CCDS10 LSLRAGDADLQVRQDVRNRTLRAVCGQPGMPRDPWDLPVGQRRTLLRH---ILVSDRYRF 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 LYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVHYGSALKRLDTFDRQGILHRLSTYT ::: :::..:::::::. ::::. .:. :.. . : : : : . . : .::. : CCDS10 LYCYVPKVACSNWKRVMKVLAGVLDSV-DVRLKMDHR-SDLVFLADLRPEEIRYRLQHYF 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 KMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSYYHPVFGKAILARYRANASREALRTGSGVRFPEFV :.::::::.:::.::.:.:: . : . .: :. ::::.:. .:. : ::::. CCDS10 KFLFVREPLERLLSAYRNKFGEIREYQQR-YGAEIVRRYRAGAGPSP--AGDDVTFPEFL 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 QYLLDVHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLSLIRAPRNLTFPR .::.: . : :. :: : .::.:: . :::::..: .: ::: : .::: .. :: CCDS10 RYLVD-EDPERMNEHWMPVYHLCQPCAVHYDFVGSYERLEADANQVLEWVRAPPHVRFPA 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 pF1KE6 FKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPFADLY :.. .. . : .. . : . : .:. .: : : CCDS10 ---RQAWYRPASPESLHYHLCSAPRALLQDVLPKYILDFSLFAYPLPNVTKEACQQ 330 340 350 360 370 >>CCDS2047.1 CHST10 gene_id:9486|Hs108|chr2 (356 aa) initn: 466 init1: 183 opt: 562 Z-score: 519.6 bits: 104.9 E(32554): 1.3e-22 Smith-Waterman score: 562; 32.8% identity (61.3% similar) in 323 aa overlap (110-419:38-351) 80 90 100 110 120 130 pF1KE6 SSGAPRGRNLPAPDQPQPPLQRGTRLRLRQRRRRLLIKKMPAAATIPANSSDAPFIRPGP ... :.. :: . .: .. ..: CCDS20 LAACFWVIFMFMVASKFITLTFKDPDVYSAKQEFLFLTTMPEVRKLPEEKHIPEELKPTG 10 20 30 40 50 60 140 150 160 170 180 190 pF1KE6 GTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASS-SRRAVTPRHVSRIFVEDRHRVLYCEVP : . .:: ......: .. :. :. ..:::: :.:..:.:..: CCDS20 KELPDSQLVQPLVYMERLELIRNVCRDDALKNLSHTPVSKFVLDRIFVCDKHKILFCQTP 70 80 90 100 110 120 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 KAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVH--YGSALKRLDTFDRQGILHRLSTYTKMLF :.: ..::.::.:: : :: .: .:.:: ..: ::..:. : .::.:: :... 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