Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5703
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5703, 647 aa
1>>>pF1KE5703 647 - 647 aa - 647 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6555+/-0.000305; mu= 14.3215+/- 0.019
mean_var=122.3268+/-24.978, 0's: 0 Z-trim(119.9): 58 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.115961
statistics sampled from 34328 (34387) to 34328 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16
Scan time: 9.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_878267 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel ( 647) 4435 753.2 6.7e-217
NP_061144 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel ( 666) 3200 546.6 1.1e-154
XP_016859928 (OMIM: 606715) PREDICTED: acid-sensin ( 320) 1240 218.4 3.1e-56
NP_064423 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel ( 574) 839 151.5 7.6e-36
NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 512) 787 142.8 2.9e-33
NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 563) 786 142.7 3.5e-33
NP_064718 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 543) 659 121.4 8.5e-27
NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel ( 528) 587 109.4 3.5e-23
XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 529) 587 109.4 3.5e-23
XP_011536653 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 559) 587 109.4 3.7e-23
XP_011536652 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 560) 587 109.4 3.7e-23
NP_001243759 (OMIM: 602866) acid-sensing ion chann ( 562) 587 109.4 3.7e-23
NP_004760 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 531) 514 97.1 1.7e-19
NP_064717 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 549) 514 97.2 1.7e-19
NP_001029 (OMIM: 264350,600228,613021) amiloride-s ( 669) 309 62.9 4.2e-09
NP_001153047 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 692) 309 62.9 4.3e-09
NP_001153048 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 728) 309 62.9 4.5e-09
XP_016879015 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 623) 298 61.1 1.4e-08
XP_016863780 (OMIM: 616693) PREDICTED: acid-sensin ( 463) 269 56.1 3.3e-07
NP_059115 (OMIM: 616693) acid-sensing ion channel ( 505) 269 56.1 3.5e-07
XP_011540231 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 696) 270 56.4 4e-07
XP_011540227 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 704) 270 56.4 4e-07
XP_016857533 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 732) 270 56.4 4.2e-07
XP_011540222 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 736) 270 56.4 4.2e-07
XP_016857532 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 749) 270 56.4 4.2e-07
XP_016857531 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 757) 270 56.4 4.3e-07
XP_016857530 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 760) 270 56.4 4.3e-07
XP_011540210 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 795) 270 56.5 4.4e-07
NP_001123885 (OMIM: 601328) amiloride-sensitive so ( 802) 270 56.5 4.5e-07
XP_016857528 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 810) 270 56.5 4.5e-07
XP_011540207 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 827) 270 56.5 4.6e-07
XP_016857527 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 846) 270 56.5 4.7e-07
XP_011540204 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 851) 270 56.5 4.7e-07
XP_011540203 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 859) 270 56.5 4.7e-07
XP_011540201 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 270 56.5 4.9e-07
XP_016857526 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 270 56.5 4.9e-07
XP_011540235 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 249 52.9 4.3e-06
XP_011540234 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 249 52.9 4.3e-06
XP_016857529 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 764) 249 52.9 4.9e-06
XP_011540208 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 816) 249 52.9 5.2e-06
NP_000327 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) amil ( 640) 208 46.0 0.0005
XP_011544216 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 646) 208 46.0 0.0005
XP_011544215 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 651) 208 46.0 0.0005
XP_016879014 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 659) 208 46.0 0.00051
>>NP_878267 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel 4 is (647 aa)
initn: 4435 init1: 4435 opt: 4435 Z-score: 4015.1 bits: 753.2 E(85289): 6.7e-217
Smith-Waterman score: 4435; 99.7% identity (99.8% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSGAAGAARRGGAALAPSLTRSLAGTHAGADSCAGADKGSHKETIEERDKRQQRQQRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 MLSGAAGAARRGGAALAPSLTRSLAGTHAGADSCAGADKGSHKETIEERDKRQQRQQRQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 QHQGCGAAGSGSDSPTSGPHPVPVLFPLALSLEEQPLPPLPLGRAPGLLAREGQGREALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 QHQGCGAAGSGSDSPTSGPHPVPVLFPLALSLEEQPLPPLPLGRAPGLLAREGQGREALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SPSSRGQMPIEIVCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 SPSSRGQMPIEIVCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LGRACGPGPHGLRRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 LGRACGPGPHGLRRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AVTLCNINRFRHSALSDADIFHLANLTGLPPKDRDGHRAAGLRYPEPDMVDILNRTGHQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 AVTLCNINRFRHSALSDADIFHLANLTGLPPKDRDGHRAAGLRYPEPDMVDILNRTGHQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNADPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 ADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNADPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 EYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 EYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMPDSLGGGPEGPCFCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 GNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMPDSLGGGPEGPCFCP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 TPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 TPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 AYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 AYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGIS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE5 TLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::
NP_878 TLGLQELKEQSPCPSRGRVEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
610 620 630 640
>>NP_061144 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel 4 is (666 aa)
initn: 4421 init1: 3200 opt: 3200 Z-score: 2898.3 bits: 546.6 E(85289): 1.1e-154
Smith-Waterman score: 4387; 96.8% identity (97.0% similar) in 666 aa overlap (1-647:1-666)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSGAAGAARRGGAALAPSLTRSLAGTHAGADSCAGADKGSHKETIEERDKRQQRQQRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MLSGAAGAARRGGAALAPSLTRSLAGTHAGADSCAGADKGSHKETIEERDKRQQRQQRQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 QHQGCGAAGSGSDSPTSGPHPVPVLFPLALSLEEQPLPPLPLGRAPGLLAREGQGREALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 QHQGCGAAGSGSDSPTSGPHPVPVLFPLALSLEEQPLPPLPLGRAPGLLAREGQGREALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SPSSRGQMPIEIVCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SPSSRGQMPIEIVCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LGRACGPGPHGLRRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LGRACGPGPHGLRRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AVTLCNINRFRHSALSDADIFHLANLTGLPPKDRDGHRAAGLRYPEPDMVDILNRTGHQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AVTLCNINRFRHSALSDADIFHLANLTGLPPKDRDGHRAAGLRYPEPDMVDILNRTGHQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNADPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNADPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 EYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 EYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE5 GNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 GNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMPGNETICPPNIYIEC
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 -----DSLGGGPEGPCFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ADHTLDSLGGGPEGPCFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 LVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRL
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 KRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::
NP_061 KRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSRGRVEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGL
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 FEDFAC
::::::
NP_061 FEDFAC
>>XP_016859928 (OMIM: 606715) PREDICTED: acid-sensing io (320 aa)
initn: 2071 init1: 1235 opt: 1240 Z-score: 1130.6 bits: 218.4 E(85289): 3.1e-56
Smith-Waterman score: 2037; 93.4% identity (93.8% similar) in 320 aa overlap (347-647:1-320)
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 SNFSVVYTRYGKCYTFNADPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQEEYLPIWRETNETSFEA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGSGLEIMLDIQQEEYLPIWRETNETSFEA
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 GIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNCRAESELREPELQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNCRAESELREPELQG
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470
pF1KE5 YSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-------------------DSLGGGPEGPC
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
XP_016 YSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMPGNETICPPNIYIECADHTLDSLGGGPEGPC
100 110 120 130 140 150
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 FCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAME
160 170 180 190 200 210
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 QRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTG
220 230 240 250 260 270
600 610 620 630 640
pF1KE5 GISTLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
:::::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GISTLGLQELKEQSPCPSRGRVEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
280 290 300 310 320
>>NP_064423 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 is (574 aa)
initn: 1063 init1: 501 opt: 839 Z-score: 764.5 bits: 151.5 E(85289): 7.6e-36
Smith-Waterman score: 1414; 45.0% identity (66.5% similar) in 538 aa overlap (163-616:12-546)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 VCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGL
:. : .. .:::.::::::.. . .:
NP_064 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSL
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 RRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRH
.:.:::: .: :::..: . .. :. :.. .: .: . .. ::::::::.:.::
NP_064 KRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLT-FPAVTLCNLNEFRF
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290
pF1KE5 SALSDADIFHLANLTGL-------PPKDRDGHRA-------AGLRY--PEP-DMVDILNR
: .: :..: ..: .: : . .. :..: :.: .: .. .:
NP_064 SQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDR
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 TGHQLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEI
.::.. ::: ::.: :. ::: .:.::.::::::::::. : : : . :: :.::::
NP_064 AGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEI
170 180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 MLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRL
::::::.::::.: ::.::::::::.::::::.:::.: ::::::.:::::::.::::::
NP_064 MLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRL
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 TYLPQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGGG
::: :::.:.: . . .:. ...::..:::. :: . ... :.::::::: :.
NP_064 IYLPPPWGTCKAVT--MDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCT
290 300 310 320 330
480 490 500 510
pF1KE5 PE------GP------------CFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNE
:: : : : ::::::::::.:::.::...::.:::.:.:..:
NP_064 PEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSE
340 350 360 370 380 390
520 530 540
pF1KE5 TYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLG-------------------------
:: ::.::::.:::.:. :..::. :: ...:::
NP_064 QYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKAGC
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580
pF1KE5 ---------------------DLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRP
:.::::::::::::::.::..:: ::: .: : .
NP_064 SLLSHEGPPPQRPFPKPCCLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQ
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 KTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
: :.:. .:.:...:...:: ::
NP_064 KEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
520 530 540 550 560 570
>>NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel 2 is (512 aa)
initn: 1402 init1: 475 opt: 787 Z-score: 718.2 bits: 142.8 E(85289): 2.9e-33
Smith-Waterman score: 1421; 49.1% identity (74.2% similar) in 454 aa overlap (166-581:14-462)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 IKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGLRRT
: .. ::.::::::. . :: .::.
NP_001 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRV
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 LWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRHSAL
:::.:.. ::. .: ... . :.. :.. .: .. .. ::::::::.: :: : :
NP_001 LWAVAFVGSLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLV-FPAVTLCNLNGFRFSRL
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290
pF1KE5 SDADIFHLANLTGL-------P-PKDRDG------HRAAGLRYPEP---DMVDILNRTGH
. :..: ..: .: : :. : .. :.... .: .:...:.:.::
NP_001 TTNDLYHAGELLALLDVNLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGH
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 QLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLD
.: ::. :.:.:..:. ..:..:.:.::::: ::. : . : . :: :.:::::::
NP_001 DLKDMMLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLD
170 180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 IQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYL
:::.:::::: ::.::.::::..:::::: :::.:..:::::.:::::::. ::::::::
NP_001 IQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYL
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 PQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGGGPEG
: :::.::. ::. :. . .::..:::. :: . ... :.::::::: :. ::
NP_001 PPPWGECRS-SEMG---LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQ
290 300 310 320 330
480 490 500 510
pF1KE5 ------P------------CFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYI
: :.: ::::::::.::.:::.::.. ::.:: .:.:..: ::
NP_001 HKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYI
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 RENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVS
::.::::.:::::. :..::. :: ..:::::.::::::::::::::.::..:::::.
NP_001 SENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELI
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 WDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHPHGP
..:
NP_001 KEKLLDLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSETISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
460 470 480 490 500 510
>>NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel 2 is (563 aa)
initn: 1342 init1: 475 opt: 786 Z-score: 716.7 bits: 142.7 E(85289): 3.5e-33
Smith-Waterman score: 1333; 47.5% identity (68.3% similar) in 482 aa overlap (151-581:43-513)
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SPSSRGQMPIEIVCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHG
: :..: : ::.: : .. : . :::
NP_899 ALTGPGRFRMAREEPAPAALAAAGQPGGGRGGERALQG---PGVARRGRPSL-SRAKLHG
20 30 40 50 60
190 200 210 220 230
pF1KE5 LGRACG----PGPHGLRRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRP-HL-VAMDPAAPA
: . :. : ::.::.::. ::.. .: ... .:. : : : . .
NP_899 LRHMCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCTSFGLLLSWSSNRLLYWLSFPSHTRVHREWSRQL
70 80 90 100 110 120
240 250 260 270 280
pF1KE5 PVAGFPAVTLCNINRFRHSALSDADIFHLANLTGLPPKDRDGHRAAG--LRYPEP-----
: :::::.:: : .: :: .:... .. :: .: .. .. :: ::
NP_899 P---FPAVTVCNNNPLRFPRLSKGDLYYAGHWLGLLLPNRTARPLVSELLRGDEPRRQWF
130 140 150 160 170 180
290 300 310 320 330
pF1KE5 -DMVDI----------------LNRTGHQLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCY
..:. ..: :::: ::: ::.. :. :. ::: :.:.:::::
NP_899 RKLADFRLFLPPRHFEGISAAFMDRLGHQLEDMLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCY
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380
pF1KE5 TFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEP
::. : . : . :: :.::::::::::.:::::: ::.::.::::..:::::: ::
NP_899 MFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 PYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLR
:.:..:::::.:::::::. ::::::::: :::.::. ::. :. . .::..:::.
NP_899 PFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRS-SEM---GLDFFPVYSITACRID
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480
pF1KE5 CEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGGGPEG------P------------CFCPTPCNLTRYG
:: . ... :.::::::: :. :: : :.: ::::::::.
NP_899 CETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYN
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 KEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLG
::.:::.::.. ::.:: .:.:..: :: ::.::::.:::::. :..::. :: ..::::
NP_899 KELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLG
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 DLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKE
:.::::::::::::::.::..:::::. ..:
NP_899 DIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDENVSTCDTMPNHSE
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640
pF1KE5 QSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
NP_899 TISHTVNVPLQTTLGTLEEIAC
550 560
>>NP_064718 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel 3 is (543 aa)
initn: 1473 init1: 477 opt: 659 Z-score: 602.1 bits: 121.4 E(85289): 8.5e-27
Smith-Waterman score: 1443; 50.6% identity (70.3% similar) in 472 aa overlap (168-596:16-484)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 FAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGLRRTLW
:. .:::. ..::::.. ::: .::: .:
NP_064 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMW
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 ALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRHSALSD
: :.. :.:.::::.: .: : : .:.: . :::::::::: .:.: :.
NP_064 AAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLI-FPAVTLCNINPLRRSRLTP
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300
pF1KE5 ADIFHLAN--LTGLPPKDRDGH-RAAGLRYPEP---------DMVDILNRTGHQLADMLK
:. : :. : :: : .. . :: : : : : ::... :.::.: :::
NP_064 NDL-HWAGSALLGLDPAEHAAFLRALG-RPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLL
110 120 130 140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFN--ADPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQEEYL
.: : :. :. ::....::.::::::: :: : . ::::.::.::::.::::::
NP_064 DCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYL
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 PIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNC
:.::...:: ::.::::::::::::: : :::.:::::.:::::::.:.:..:: :::.:
NP_064 PVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDC
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470
pF1KE5 RAES--ELREPE----LQGYSA-----YSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMPDSLG-G
. : ::: : . : :.. .::: :: . : ..: ::::.:: ..
NP_064 SSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVC
290 300 310 320 330 340
480 490 500 510
pF1KE5 GPEG------P----------CFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNET
.:. : : ::.:: :::.::.::::::.:..::.:::: ::.:.
NP_064 SPQQYKNCAHPAIDAMLRKDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEA
350 360 370 380 390 400
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 YIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYE
:: :: :.::.:::::. :..::. :: .: ::::.:::::::::::.::.::::::. :
NP_064 YIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCE
410 420 430 440 450 460
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 VSWDR-LKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHP
: :. : : : .. ..::
NP_064 VFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPR
470 480 490 500 510 520
>>NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 is (528 aa)
initn: 1293 init1: 542 opt: 587 Z-score: 537.1 bits: 109.4 E(85289): 3.5e-23
Smith-Waterman score: 1571; 48.4% identity (71.9% similar) in 523 aa overlap (163-647:12-528)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 VCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGL
:. : .. .:::.::::::.. . .:
NP_001 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSL
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 RRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRH
.:.:::: .: :::..: . .. :. :.. .: .: . .. ::::::::.:.::
NP_001 KRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLT-FPAVTLCNLNEFRF
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290
pF1KE5 SALSDADIFHLANLTGL-------PPKDRDGHRA-------AGLRY--PEP-DMVDILNR
: .: :..: ..: .: : . .. :..: :.: .: .. .:
NP_001 SQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDR
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 TGHQLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEI
.::.. ::: ::.: :. ::: .:.::.::::::::::. : : : . :: :.::::
NP_001 AGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEI
170 180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 MLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRL
::::::.::::.: ::.::::::::.::::::.:::.: ::::::.:::::::.::::::
NP_001 MLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRL
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 TYLPQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGGG
::: :::.:.: . . .:. ...::..:::. :: . ... :.::::::: :.
NP_001 IYLPPPWGTCKAVTM--DSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCT
290 300 310 320 330
480 490 500 510
pF1KE5 PE------GP------------CFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNE
:: : : : ::::::::::.:::.::...::.:::.:.:..:
NP_001 PEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSE
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 TYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIY
:: ::.::::.:::.:. :..::. :: ...::::.::::::::::::::.::..:: :
NP_001 QYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAY
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 EVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHP
:: .: : . : :.:. .:.:...:...:: :: :.. .:.. . :
NP_001 EVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESL-RGHPAGMT--YAANILP
460 470 480 490 500 510
640
pF1KE5 HGPPGGLFEDFAC
: : : ::::.:
NP_001 HHPARGTFEDFTC
520
>>XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensing io (529 aa)
initn: 1595 init1: 542 opt: 587 Z-score: 537.1 bits: 109.4 E(85289): 3.5e-23
Smith-Waterman score: 1559; 48.3% identity (71.8% similar) in 524 aa overlap (163-647:12-529)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 VCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGL
:. : .. .:::.::::::.. . .:
XP_011 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSL
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 RRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRH
.:.:::: .: :::..: . .. :. :.. .: .: . .. ::::::::.:.::
XP_011 KRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLT-FPAVTLCNLNEFRF
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290
pF1KE5 SALSDADIFHLANLTGL-------PPKDRDGHRA-------AGLRY--PEP-DMVDILNR
: .: :..: ..: .: : . .. :..: :.: .: .. .:
XP_011 SQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDR
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 TGHQLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEI
.::.. ::: ::.: :. ::: .:.::.::::::::::. : : : . :: :.::::
XP_011 AGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEI
170 180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 MLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQR-
::::::.::::.: ::.::::::::.::::::.:::.: ::::::.:::::::.:::::
XP_011 MLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRQ
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 LTYLPQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGG
: ::: :::.:.: . . .:. ...::..:::. :: . ... :.::::::: :.
XP_011 LIYLPPPWGTCKAVTM--DSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYC
290 300 310 320 330
480 490 500 510
pF1KE5 GPE------GP------------CFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRN
:: : : : ::::::::::.:::.::...::.:::.:.:..
XP_011 TPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKS
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 ETYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYI
: :: ::.::::.:::.:. :..::. :: ...::::.::::::::::::::.::..::
XP_011 EQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYA
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 YEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHH
::: .: : . : :.:. .:.:...:...:: :: :.. .:.. .
XP_011 YEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESL-RGHPAGMT--YAANIL
460 470 480 490 500 510
640
pF1KE5 PHGPPGGLFEDFAC
:: : : ::::.:
XP_011 PHHPARGTFEDFTC
520
>>XP_011536653 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensing io (559 aa)
initn: 1512 init1: 542 opt: 587 Z-score: 536.8 bits: 109.4 E(85289): 3.7e-23
Smith-Waterman score: 1499; 45.7% identity (67.9% similar) in 554 aa overlap (163-647:12-559)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 VCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGL
:. : .. .:::.::::::.. . .:
XP_011 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSL
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 RRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRH
.:.:::: .: :::..: . .. :. :.. .: .: . .. ::::::::.:.::
XP_011 KRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLT-FPAVTLCNLNEFRF
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290
pF1KE5 SALSDADIFHLANLTGL-------PPKDRDGHRA-------AGLRY--PEP-DMVDILNR
: .: :..: ..: .: : . .. :..: :.: .: .. .:
XP_011 SQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDR
110 120 130 140 150 160
300 310 320
pF1KE5 TGHQLADMLKSCNFSGHHCSASNFSV-------------------------------VYT
.::.. ::: ::.: :. ::: .:.: :.:
XP_011 AGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVKPMQVAKELRRCTLPGTVFQGTQRARKGEKQVFT
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 RYGKCYTFNA--DPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQI
:::::::::. : : : . :: :.::::::::::.::::.: ::.::::::::.:::
XP_011 RYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQI
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 HSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSV
:::.:::.: ::::::.:::::::.:::::: ::: :::.:.: . . .:. ...::.
XP_011 HSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTM--DSDLDFFDSYSI
290 300 310 320 330
450 460 470 480
pF1KE5 SACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGGGPE------GP------------CFCPTPC
.:::. :: . ... :.::::::: :. :: : : : ::
XP_011 TACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPC
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 NLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYG
::::::::.:::.::...::.:::.:.:..: :: ::.::::.:::.:. :..::. ::
XP_011 NLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYE
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLG
...::::.::::::::::::::.::..:: ::: .: : . : :.:. .:.
XP_011 IAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALS
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640
pF1KE5 LQELKEQSPCPSLGRAEGGGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
:...:...:: :: :.. .:.. . :: : : ::::.:
XP_011 LDDVKRHNPCESL-RGHPAGMT--YAANILPHHPARGTFEDFTC
520 530 540 550
647 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:55:35 2016 done: Tue Nov 8 05:55:36 2016
Total Scan time: 9.770 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]