FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4424, 439 aa 1>>>pF1KE4424 439 - 439 aa - 439 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2309+/-0.00101; mu= 13.2743+/- 0.060 mean_var=86.5254+/-16.918, 0's: 0 Z-trim(104.9): 56 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.137880 statistics sampled from 8062 (8117) to 8062 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16 Scan time: 2.570 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 2826 572.4 3.2e-163 CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 1120 233.0 3.9e-61 CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 1120 233.0 4.6e-61 CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 1055 220.1 3.3e-57 CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 1055 220.1 3.3e-57 CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 1018 212.7 5.2e-55 CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 1018 212.7 5.6e-55 CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 982 205.5 8.2e-53 CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 944 198.0 1.5e-50 CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 640 137.6 4.2e-32 CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 631 135.9 1.5e-31 CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 584 126.6 1.5e-28 CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 581 125.9 1.6e-28 CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 578 125.3 1.9e-28 CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 577 125.1 2.4e-28 CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 577 125.1 2.4e-28 CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 577 125.1 2.6e-28 CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 573 124.4 5.1e-28 CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 571 123.9 5.7e-28 CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 562 122.2 3.3e-27 CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 549 119.6 1.7e-26 CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 549 119.6 1.8e-26 CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 543 118.2 1.8e-26 CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 543 118.3 2.4e-26 CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 543 118.3 2.5e-26 CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 543 118.3 2.6e-26 CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 531 115.9 9.3e-26 CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 503 110.2 3.4e-24 CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 492 108.1 1.8e-23 CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 490 107.7 2.5e-23 CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 490 107.7 3.1e-23 CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 490 107.8 3.2e-23 CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 487 107.2 5.3e-23 CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 475 104.7 1.9e-22 CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 426 95.1 2.6e-19 CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 389 87.7 4.3e-17 CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 350 79.9 6.4e-15 CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 344 78.6 9.9e-15 CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 338 77.5 4.1e-14 CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 338 77.6 4.8e-14 >>CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 (439 aa) initn: 2826 init1: 2826 opt: 2826 Z-score: 3043.9 bits: 572.4 E(32554): 3.2e-163 Smith-Waterman score: 2826; 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CCDS81 MEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLR 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 TLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEK :. :... :..: :.. :...::. . ... ....:: . CCDS81 GTPMSVGTLEEIID---------------DNH-----AIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDL 40 50 60 70 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 LKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVL :.:: : .:. . .. .: . : : .:.:.. : : :.::::::.::::. :.. : CCDS81 LEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVEL 80 90 100 110 120 130 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 PMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDG :..: : .:..::.:::::..::::::::::::.: : ::.::::...: .:.: ..::: CCDS81 PLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDG 140 150 160 170 180 190 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 AKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNT ::::. : .:.:.::::.::::.:::::::.::...:.::.::::::::::::::. CCDS81 PKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRG 200 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 QVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEEL .:::: ::::.. :::::.: ::.:::::::.:.:... ::.:::. .:... ::. ..: CCDS81 DVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDL 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 pF1KE4 ARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA ::..::. ::.:.:::..:::. ..:.::. .. .: ::. CCDS81 IMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL 320 330 340 350 360 >>CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 (440 aa) initn: 1107 init1: 1107 opt: 1120 Z-score: 1209.8 bits: 233.0 E(32554): 4.6e-61 Smith-Waterman score: 1146; 42.8% identity (72.2% similar) in 432 aa overlap (5-432:27-431) 10 20 30 pF1KE4 MNLLPNIESPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMST : . . : ...: . : : . : . : CCDS32 MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASK-------LPLVT 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 EEIIQRTRLLDSE-IK---IMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVI . : .:: : :: .:. : .: .... ...: .:. :. . :. :... CCDS32 PHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLE 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 ELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVN :..: :.. :...::. . ... ....:: . :.:: : .: CCDS32 EIID---------------DNH-----AIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 KDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFEN . . .. .: . : : .:.:.. : : :.::::::.::::. :.. ::..: : .:. CCDS32 HKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEE 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFAL .::.:::::..::::::::::::.: : ::.::::...: .:.: ..::: ::::. : . CCDS32 MGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRV 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 AKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNR :.:.::::.::::.:::::::.::...:.::.::::::::::::::. .:::: :::: CCDS32 AEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNR 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 VDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGA .. :::::.: ::.:::::::.:.:... ::.:::. .:... ::. ..: ::..:: CCDS32 IETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGA 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 QCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA . ::.:.:::..:::. ..:.::. .. .: ::. CCDS32 DIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL 400 410 420 430 440 >>CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 (398 aa) initn: 1041 init1: 1019 opt: 1055 Z-score: 1140.6 bits: 220.1 E(32554): 3.3e-57 Smith-Waterman score: 1055; 45.1% identity (73.7% similar) in 377 aa overlap (55-430:12-385) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 EQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNK ... : .::: . . ..: ....... CCDS56 MELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQR 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 TLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANI-DLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAE . .. ..:: . . .:.:. . .. : ...:. . . . : .: . CCDS56 NE---LNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDIN 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 KLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIV . :. :.. .::: . . ::.. : :. : :.. : : ::::::::.:. :.: CCDS56 DVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIE 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 LPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGD ::..: : :: ::: :::::.:::::::::::::: : .: ::....: .::: :::. CCDS56 LPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGE 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPN ::..::. :..:.:.::::::.::.:.::..:... ..:: ::::::::::::::::. . CCDS56 GARMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEAT 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 TQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEE ..::: ::::.:::: :::: ::.::::::: :::::: :..:::::::.. .: .. CCDS56 KNIKVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRK 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 pF1KE4 LARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA .:. .::. :.::.:::: :::. ...:.::. .. .:. : CCDS56 IAELMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK 340 350 360 370 380 390 >>CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 (406 aa) initn: 1041 init1: 1019 opt: 1055 Z-score: 1140.5 bits: 220.1 E(32554): 3.3e-57 Smith-Waterman score: 1055; 45.1% identity (73.7% similar) in 377 aa overlap (55-430:20-393) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 EQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNK ... : .::: . . ..: ....... CCDS11 MALDGPEQMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQR 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 TLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANI-DLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAE . .. ..:: . . .:.:. . .. : ...:. . . . : .: . CCDS11 NE---LNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDIN 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 KLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIV . :. :.. .::: . . ::.. : :. : :.. : : ::::::::.:. :.: CCDS11 DVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIE 110 120 130 140 150 160 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 LPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGD ::..: : :: ::: :::::.:::::::::::::: : .: ::....: .::: :::. CCDS11 LPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGE 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPN ::..::. :..:.:.::::::.::.:.::..:... ..:: ::::::::::::::::. . CCDS11 GARMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEAT 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 TQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEE ..::: ::::.:::: :::: ::.::::::: :::::: :..:::::::.. .: .. CCDS11 KNIKVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRK 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 430 pF1KE4 LARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA .:. .::. :.::.:::: :::. ...:.::. .. .:. : CCDS11 IAELMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK 350 360 370 380 390 400 >>CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 (387 aa) initn: 997 init1: 959 opt: 1018 Z-score: 1101.0 bits: 212.7 E(32554): 5.2e-55 Smith-Waterman score: 1020; 42.0% identity (73.0% similar) in 374 aa overlap (65-438:33-386) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 KMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVI : . ..: .. .:..: ...: .... . CCDS46 EIGILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKEEVKRIQSIPLVIGQFL 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 ELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVN : :: : :.. ..: ..:.. ... .: : :::. :... CCDS46 E--AVDQNT------------------AIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALH 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 KDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFEN : : ....:: : :: . . :..: .:.::::.: : ::. ::. ::..: : ... CCDS46 KHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQ 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFAL .::.::.::::::::: :::.::.: : .: :.:....: ..:: ..:.: ..:::.: : CCDS46 IGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRL 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 AKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNR :::.::.::::::.:::.:::::.. ..:::::: .::::::.:::. :..:::: :::: CCDS46 AKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNR 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 VDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGA .: ::::::: ::::::::::.:... . :.. . :::.: .:. :. . : ..:: CCDS46 ADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGA 290 300 310 320 330 340 400 410 420 430 pF1KE4 QCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA . ...: :.::.:.:.. . .:. .. : : . . ..: CCDS46 DINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK 350 360 370 380 >>CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 (418 aa) initn: 959 init1: 959 opt: 1018 Z-score: 1100.5 bits: 212.7 E(32554): 5.6e-55 Smith-Waterman score: 1049; 40.2% identity (72.5% similar) in 400 aa overlap (39-438:38-417) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 SPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMSTEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQA :.. .: . :..:..... . . : . CCDS12 VEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQKN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 MKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTST .: .. . .:..: ...: .... .: :: : :.. ..: CCDS12 LKKEFLHAQEEVKRIQSIPLVIGQFLE--AVDQNT------------------AIVGSTT 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 RQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDI ..:.. ... .: : :::. :...: : ....:: : :: . . :..: .:.:: CCDS12 GSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADI 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATF ::.: : ::. ::. ::..: : ....::.::.::::::::: :::.::.: : .: :.: CCDS12 GGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAF 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQR ....: ..:: ..:.: ..:::.: ::::.::.::::::.:::.:::::.. ..:::::: CCDS12 IRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQR 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 TMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQI .::::::.:::. :..:::: ::::.: ::::::: ::::::::::.:... . :.. CCDS12 ILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFST 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 HSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQ . :::.: .:. :. . : ..::. ...: :.::.:.:.. . .:. .. : CCDS12 ITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVI 350 360 370 380 390 400 430 pF1KE4 AKKKANLQYYA : . . ..: CCDS12 KKDEQEHEFYK 410 >>CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 (433 aa) initn: 981 init1: 958 opt: 982 Z-score: 1061.6 bits: 205.5 E(32554): 8.2e-53 Smith-Waterman score: 984; 40.4% identity (66.8% similar) in 416 aa overlap (27-427:3-416) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MNLLPNIESPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMSTEEIIQRT-RLLD-SEIKIMKS- : .: . : . .: .. : :: ..: ..:. CCDS57 MPDYLGADQRKTKEDEKDDKPIRALDEGDIALLKTY 10 20 30 60 70 80 90 100 pF1KE4 -------EVLRVTHELQAMKDKIKE-----NSEKIKVNKTLPYLVSNVIELLDVDPNDQE .. .: ..: . ::.: .:. . .: :... : . .: . CCDS57 GQSTYSRQIKQVEDDIQQLLKKINELTGIKESDTGLAPPALWDLAADKQTLQSEQPLQVA 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 EDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLP . :. ::. .:... . . . : .. : :::....: : :: CCDS57 RCTKIINADSEDPKY--IINVKQFAKFVVDLSDQVAPTDIEEGMRVGVDRNKYQIHIPLP 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 TEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFENLGIQPPKGVLM . : : :.:.:.: :::.:: .::..: :.. :. : :.: ::::.::::::. CCDS57 PKIDPTVTMMQVEEKPDVTYSDVGGCKEQIEKLREVVETPLLHPERFVNLGIEPPKGVLL 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 YGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPSIIFI .::::::::: ::: : .: : :... : .::: ..:.::..::. : .:. : .::. CCDS57 FGPPGTGKTLCARAVANRTDACFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACLIFF 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 DELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNRVDILDPALLRS ::.:::: :::. .:: :::::::::.::::::.: ..::. :::: : :::::.: CCDS57 DEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRP 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 GRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGM ::::::::: .:. :.:..:..::.:.:.: :. .: ::: . .::. ..::.:::: CCDS57 GRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVERDIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTEAGM 340 350 360 370 380 390 410 420 430 pF1KE4 IALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA .:.: :..:..:.. .: CCDS57 FAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSATPRYMTYN 400 410 420 430 >>CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 (403 aa) initn: 937 init1: 937 opt: 944 Z-score: 1021.2 bits: 198.0 E(32554): 1.5e-50 Smith-Waterman score: 946; 42.7% identity (70.2% similar) in 379 aa overlap (67-432:21-393) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 STEEIIQRTRLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVIEL .:..: :. :. ... : : .. :: CCDS97 MAIPGIPYERRLLIMADPRDKALQDYRKKLLEHKEIDGRLKELREQLKEL 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 pF1KE4 LDVDPNDQEEDGANIDLDS-QRKGKCA--VIKTSTRQTYFL-----P--VIGL---VDAE . : : . : :: . : :. . :.: :.. ... : :.: .: CCDS97 -----TKQYEKSEN-DLKALQSVGQIVGEVLKQLTEEKFIVKATNGPRYVVGCRRQLDKS 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 KLKPGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIV ::::: :... . :.. :: : : : : .. . .::.::::..::.:: :.: CCDS97 KLKPGTRVALDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIE 110 120 130 140 150 160 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 LPMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGD ::... : :. .:: :::: :.:::::::::::::: :.: .:::... ..:. .::. CCDS97 LPLTNPELFQRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGE 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GAKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPN .:.:.:. : :... : :::.::.:::: .::. ..:::.:::..:::::.:::. CCDS97 SARLIREMFNYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTL 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 TQVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEE .::.: :::: : ::::::: :::::::.. .:::.:: :..::. .. ...:: CCDS97 HRVKMIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEA 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 430 pF1KE4 LARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA ... .: ::::. . ::.::::.:.: ...::.:... .: .:: CCDS97 IVKLSDGFNGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKVADSKKLESKLDYKPV 350 360 370 380 390 400 >>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 (806 aa) initn: 993 init1: 617 opt: 640 Z-score: 689.8 bits: 137.6 E(32554): 4.2e-32 Smith-Waterman score: 675; 34.2% identity (64.1% similar) in 365 aa overlap (76-419:78-434) 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 RLLDSEIKIMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTL-PYLVSNVIELLDVDPNDQ ..:::..:... : . ......: . CCDS65 ELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPD 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 EEDGANID---LDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLV----GVNKDS . : : .:. .: : . ..:. : . : . .. ::. :. CCDS65 VKYGKRIHVLPIDDTVEG----ITGNLFEVYLKPYF-LEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVE 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 pF1KE4 YLILETLPTEY-----DSRVKAM-EVDERPTEQ-------YSDIGGLDKQIQELVEAIVL . ..:: :. : :. .. : .: :. :.:::: ::. .. : . : CCDS65 FKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVEL 170 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 PMNHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDG :. : :. .:..::.:.:.::::::::::.::: : .: : :. . ::.... . :.. CCDS65 PLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGES 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 AKLVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNT . .: :: :...::.::::::::::. :: ::. . .: . .::. .::.. . CCDS65 ESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKR---EKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRA 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 QVKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEEL .: :.::::: . .:::: : ::.::.... .:. .: .:.:::...:... ::. :.. CCDS65 HVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQV 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 pF1KE4 ARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA : : ::. :.: ::.. :.:. . :: CCDS65 ANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQS 400 410 420 430 440 450 CCDS65 NPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGP 460 470 480 490 500 510 >-- initn: 1028 init1: 617 opt: 640 Z-score: 689.8 bits: 137.6 E(32554): 4.2e-32 Smith-Waterman score: 640; 41.2% identity (72.0% similar) in 243 aa overlap (177-418:468-710) 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 PGDLVGVNKDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPM : : : . :::::. .:: : . :. CCDS65 DAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPV 440 450 460 470 480 490 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 NHKEKFENLGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAK .: .:: ..:. : ::::.::::: ::::::.: : . .:.:... ::.:. :..:.. CCDS65 EHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEA 500 510 520 530 540 550 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 LVRDAFALAKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQV ::. : :.. :: ..:.::::.:. : . : ..:.. ..:...::.. . .: CCDS65 NVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNV 560 570 580 590 600 610 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 KVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELAR .:.:::: ::.:::.:: ::::. : .:.:.:..:. :.. . :: :. ::. : ::. CCDS65 FIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAK 620 630 640 650 660 670 390 400 410 420 430 pF1KE4 CTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGA-TELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA :. :.::. .: .: .:.:.. .:. .: CCDS65 MTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFE 680 690 700 710 720 730 CCDS65 EAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYT 740 750 760 770 780 790 439 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:12:27 2016 done: Sun Nov 6 01:12:28 2016 Total Scan time: 2.570 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]