Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1575
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1575, 365 aa
  1>>>pF1KE1575 365 - 365 aa - 365 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2621+/-0.000846; mu= 17.5240+/- 0.051
 mean_var=79.8738+/-15.791, 0's: 0 Z-trim(108.0): 65  B-trim: 3 in 1/51
 Lambda= 0.143507
 statistics sampled from 9838 (9905) to 9838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.304), width:  16
 Scan time:  2.420

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34373.1 A gene_id:3105|Hs108|chr6              ( 365) 2276 480.7 8.4e-136
CCDS34394.1 B gene_id:3106|Hs108|chr6              ( 362) 2095 443.3 1.6e-124
CCDS34393.1 C gene_id:3107|Hs108|chr6              ( 366) 1997 423.0 2.1e-118
CCDS43437.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6              ( 442) 1904 403.8 1.5e-112
CCDS43438.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6              ( 346) 1895 401.8 4.5e-112
CCDS34379.1 E gene_id:3133|Hs108|chr6              ( 358) 1870 396.7 1.7e-110
CCDS4668.1 G gene_id:3135|Hs108|chr6               ( 338) 1866 395.8 2.8e-110
CCDS43439.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6              ( 254) 1045 225.7 3.3e-59
CCDS1342.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1             ( 341)  816 178.4 7.8e-45
CCDS4578.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6             ( 348)  737 162.1 6.7e-40
CCDS75412.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6            ( 337)  730 160.6 1.8e-39
CCDS47387.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6            ( 325)  688 151.9 7.2e-37
CCDS5680.1 AZGP1 gene_id:563|Hs108|chr7            ( 298)  675 149.2 4.3e-36
CCDS4580.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6             ( 260)  571 127.6 1.2e-29
CCDS53440.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1            ( 249)  543 121.8 6.4e-28
CCDS53441.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1            ( 214)  530 119.1 3.7e-27
CCDS56412.1 MICA gene_id:100507436|Hs108|chr6      ( 332)  514 115.9 5.1e-26
CCDS43449.1 MICB gene_id:4277|Hs108|chr6           ( 383)  482 109.3 5.6e-24
CCDS75423.1 MICB gene_id:4277|Hs108|chr6           ( 351)  454 103.5 2.9e-22
CCDS53442.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1            ( 296)  452 103.0 3.4e-22
CCDS12770.1 FCGRT gene_id:2217|Hs108|chr19         ( 365)  423 97.1 2.6e-20
CCDS4581.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6             ( 168)  380 87.9 6.8e-18
CCDS4579.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6             ( 256)  380 88.1 9.4e-18
CCDS75421.1 MICA gene_id:100507436|Hs108|chr6      ( 235)  374 86.8 2.1e-17
CCDS54975.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6            ( 246)  369 85.8 4.4e-17
CCDS54974.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6            ( 334)  369 85.9 5.6e-17
CCDS47386.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6            ( 242)  359 83.7 1.8e-16
CCDS1174.1 CD1A gene_id:909|Hs108|chr1             ( 327)  313 74.3 1.7e-13
CCDS75422.1 MICB gene_id:4277|Hs108|chr6           ( 340)  296 70.8   2e-12


>>CCDS34373.1 A gene_id:3105|Hs108|chr6                   (365 aa)
 initn: 2276 init1: 2276 opt: 2276  Z-score: 2551.6  bits: 480.7 E(32554): 8.4e-136
Smith-Waterman score: 2276; 91.2% identity (96.2% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
       :::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAVMAPRTLLLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :::::::::::::::::::::::::..::::::.::::: .:     :::::: ::::::
CCDS34 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDQETRNVKAQSQTDRVDLGTLRGYYNQSEAGSHTIQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
        ::::::: ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::: 
CCDS34 IMYGCDVGSDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITKRKWEAAHEAEQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       ::::.: :::::::::::::::::::: :::::::: .::::::::::::.:::::::::
CCDS34 RAYLDGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDPPKTHMTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::: 
CCDS34 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSL
       :::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.::
CCDS34 SSQPTIPIVGIIAGLVLLGAVITGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYTQAASSDSAQGSDVSL
              310       320       330       340       350       360

            
pF1KE1 TACKV
       :::::
CCDS34 TACKV
            

>>CCDS34394.1 B gene_id:3106|Hs108|chr6                   (362 aa)
 initn: 2095 init1: 2095 opt: 2095  Z-score: 2349.1  bits: 443.3 E(32554): 1.6e-124
Smith-Waterman score: 2095; 84.5% identity (93.4% similar) in 362 aa overlap (1-362:1-362)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
       : ::::::..::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS34 MLVMAPRTVLLLLSAALALTETWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :::::: : :::::::::::::::::::.  ::..::::::::    :::::: ::::.:
CCDS34 DSDAASPREEPRAPWIEQEGPEYWDRNTQIYKAQAQTDRESLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
        :::::::::::.:::..: ::::::::::::::::::::: ::::::::::.:.:::: 
CCDS34 SMYGCDVGPDGRLLRGHDQYAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAAREAEQR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       ::::::.:::::::::::::. :.:.: ::::.::: .::::::::::::.:::::::::
CCDS34 RAYLEGECVEWLRRYLENGKDKLERADPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
       :::::::::::::::::::::: ::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS34 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDRTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSL
       ::: :.:::::.:::.....:. :::::::: :::::  ::::::::: ::::::::.::
CCDS34 SSQSTVPIVGIVAGLAVLAVVVIGAVVAAVMCRRKSSGGKGGSYSQAACSDSAQGSDVSL
              310       320       330       340       350       360

            
pF1KE1 TACKV
       ::   
CCDS34 TA   
            

>>CCDS34393.1 C gene_id:3107|Hs108|chr6                   (366 aa)
 initn: 1909 init1: 1828 opt: 1997  Z-score: 2239.4  bits: 423.0 E(32554): 2.1e-118
Smith-Waterman score: 1997; 80.8% identity (90.7% similar) in 365 aa overlap (1-364:1-365)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
       : :::::.:.:::::.::::.::: ::::::: :.::::::::::::.::::::::::::
CCDS34 MRVMAPRALLLLLSGGLALTETWACSHSMRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :::::: : ::::::.::::::::::.:.. : ..:.:: :::    :::::::::::.:
CCDS34 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQADRVSLRNLRGYYNQSEDGSHTLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
       :: :::.:::::.::::.:.::::::::::::::::::::: :::::::: :.:. ::: 
CCDS34 RMSGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKLEAARAAEQL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       :::::: ::::::::::::::::::.. ::::.::: .::::::::::::.:::::::::
CCDS34 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEPPKTHVTHHPLSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::: .:::: :::
CCDS34 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGQEQRYTCHMQHEGLQEPLTLSWEP
              250       260       270       280       290       300

              310        320       330       340       350         
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGL-VLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMS
       ::::::::.::.::: ::   .. ::::.:.: :::::  :::: :::: :.:::::: :
CCDS34 SSQPTIPIMGIVAGLAVLVVLAVLGAVVTAMMCRRKSSGGKGGSCSQAACSNSAQGSDES
              310       320       330       340       350       360

     360     
pF1KE1 LTACKV
       : .:: 
CCDS34 LITCKA
             

>>CCDS43437.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6                   (442 aa)
 initn: 1932 init1: 1904 opt: 1904  Z-score: 2134.2  bits: 403.8 E(32554): 1.5e-112
Smith-Waterman score: 1904; 76.9% identity (91.3% similar) in 355 aa overlap (4-358:1-355)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
          ::::.:.::::::::::.:::::::.::: :.::::::::::.::: :::::::.::
CCDS43    MAPRSLLLLLSGALALTDTWAGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRYIAVEYVDDTQFLRF
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :::::  ::::: ::.:::::.::. .:  .::..:::: .::  :: ::::: ::::.:
CCDS43 DSDAAIPRMEPREPWVEQEGPQYWEWTTGYAKANAQTDRVALRNLLRRYNQSEAGSHTLQ
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
        : :::.:::::.::::.: ::::::::.:::::::::::: .:::::: .:. . ::..
CCDS43 GMNGCDMGPDGRLLRGYHQHAYDGKDYISLNEDLRSWTAADTVAQITQRFYEAEEYAEEF
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       :.::::.:.: ::::::::::::::.: ::.:..:: .::::::::::::.:::::::::
CCDS43 RTYLEGECLELLRRYLENGKETLQRADPPKAHVAHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
       ::::::.::::::::::::::::::::::.:::: :.::::::::::::::.:: :::: 
CCDS43 WQRDGEEQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPPGEEQRYTCHVQHEGLPQPLILRWEQ
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSL
       : :::::::::.::::..:::..::::::::::.:::::. :::::::. . ..:. :  
CCDS43 SPQPTIPIVGIVAGLVVLGAVVTGAVVAAVMWRKKSSDRNRGSYSQAAAYSVVSGNLMIT
       300       310       320       330       340       350       

                                                                   
pF1KE1 TACKV                                                       
                                                                   
CCDS43 WWSSLFLLGVLFQGYLGCLRSHSVLGRRKVGDMWILFFLWLWTSFNTAFLALQSLRFGFG
       360       370       380       390       400       410       

>>CCDS43438.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6                   (346 aa)
 initn: 1895 init1: 1895 opt: 1895  Z-score: 2125.6  bits: 401.8 E(32554): 4.5e-112
Smith-Waterman score: 1895; 78.6% identity (91.9% similar) in 345 aa overlap (4-348:1-345)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
          ::::.:.::::::::::.:::::::.::: :.::::::::::.::: :::::::.::
CCDS43    MAPRSLLLLLSGALALTDTWAGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRYIAVEYVDDTQFLRF
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :::::  ::::: ::.:::::.::. .:  .::..:::: .::  :: ::::: ::::.:
CCDS43 DSDAAIPRMEPREPWVEQEGPQYWEWTTGYAKANAQTDRVALRNLLRRYNQSEAGSHTLQ
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
        : :::.:::::.::::.: ::::::::.:::::::::::: .:::::: .:. . ::..
CCDS43 GMNGCDMGPDGRLLRGYHQHAYDGKDYISLNEDLRSWTAADTVAQITQRFYEAEEYAEEF
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       :.::::.:.: ::::::::::::::.: ::.:..:: .::::::::::::.:::::::::
CCDS43 RTYLEGECLELLRRYLENGKETLQRADPPKAHVAHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
       ::::::.::::::::::::::::::::::.:::: :.::::::::::::::.:: :::: 
CCDS43 WQRDGEEQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPPGEEQRYTCHVQHEGLPQPLILRWEQ
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSL
       : :::::::::.::::..:::..::::::::::.:::::. :::::::            
CCDS43 SPQPTIPIVGIVAGLVVLGAVVTGAVVAAVMWRKKSSDRNRGSYSQAAV           
       300       310       320       330       340                 

            
pF1KE1 TACKV

>>CCDS34379.1 E gene_id:3133|Hs108|chr6                   (358 aa)
 initn: 1891 init1: 1867 opt: 1870  Z-score: 2097.4  bits: 396.7 E(32554): 1.7e-110
Smith-Waterman score: 1870; 76.0% identity (90.4% similar) in 354 aa overlap (4-357:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
          :.  ::.:::: :::::::::::::..::.::::::::::::::.::::::::::::
CCDS34    MVDGTLLLLLSEALALTQTWAGSHSLKYFHTSVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRF
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :.:::: :: :::::.:::: :::::.::...  .:  : .::    :::::: ::::.:
CCDS34 DNDAASPRMVPRAPWMEQEGSEYWDRETRSARDTAQIFRVNLRTLRGYYNQSEAGSHTLQ
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
        :.::..::::::::::.: :::::::..::::::::::.: ::::...: . : :::. 
CCDS34 WMHGCELGPDGRFLRGYEQFAYDGKDYLTLNEDLRSWTAVDTAAQISEQKSNDASEAEHQ
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       :::::  :::::..:::.::::: . . ::::.::: .::::::::::::.:::::::::
CCDS34 RAYLEDTCVEWLHKYLEKGKETLLHLEPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
       ::.::: .:::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::.:.::::.:
CCDS34 WQQDGEGHTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPVTLRWKP
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSL
       .::::::::::::::::.:.:..:::::::.::.:::  ::::::.:  :::::::.   
CCDS34 ASQPTIPIVGIIAGLVLLGSVVSGAVVAAVIWRKKSSGGKGGSYSKAEWSDSAQGSESHS
       300       310       320       330       340       350       

            
pF1KE1 TACKV
            
CCDS34 L    
            

>>CCDS4668.1 G gene_id:3135|Hs108|chr6                    (338 aa)
 initn: 1866 init1: 1866 opt: 1866  Z-score: 2093.3  bits: 395.8 E(32554): 2.8e-110
Smith-Waterman score: 1866; 78.7% identity (92.0% similar) in 338 aa overlap (1-338:1-338)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
       :.::::::: :::::::.::.::::::::::: ..:::::::::::::.:::::::::::
CCDS46 MVVMAPRTLFLLLSGALTLTETWAGSHSMRYFSAAVSRPGRGEPRFIAMGYVDDTQFVRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :::.:  ::::::::.::::::::...:::.:::.:::: .:.    :::::: .:::.:
CCDS46 DSDSACPRMEPRAPWVEQEGPEYWEEETRNTKAHAQTDRMNLQTLRGYYNQSEASSHTLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
        : :::.: :::.::::.: :::::::.::::::::::::: ::::..:: :.:. ::: 
CCDS46 WMIGCDLGSDGRLLRGYEQYAYDGKDYLALNEDLRSWTAADTAAQISKRKCEAANVAEQR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       :::::: :::::.:::::::: :::.: ::::.::: : :.:::::::::.:::::: ::
CCDS46 RAYLEGTCVEWLHRYLENGKEMLQRADPPKTHVTHHPVFDYEATLRCWALGFYPAEIILT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
       :::::::::::.:::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::.:: :::. 
CCDS46 WQRDGEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLMLRWKQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSL
       :: :::::.::.::::...::..::.::::.::.::::                      
CCDS46 SSLPTIPIMGIVAGLVVLAAVVTGAAVAAVLWRKKSSD                      
              310       320       330                              

            
pF1KE1 TACKV

>>CCDS43439.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6                   (254 aa)
 initn: 1072 init1: 1044 opt: 1045  Z-score: 1176.3  bits: 225.7 E(32554): 3.3e-59
Smith-Waterman score: 1109; 55.7% identity (66.4% similar) in 345 aa overlap (4-348:1-253)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
          ::::.:.::::::::::.:::::::.::: :.::::::::::.::: :::::::.::
CCDS43    MAPRSLLLLLSGALALTDTWAGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRYIAVEYVDDTQFLRF
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRNVKAHSQTDRESLRIALRYYNQSEDGSHTIQ
       :::::  ::::: ::.:::::.::. .:  .::..:::: .::  :: ::::: ::::.:
CCDS43 DSDAAIPRMEPREPWVEQEGPQYWEWTTGYAKANAQTDRVALRNLLRRYNQSEAGSHTLQ
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQW
        : :::.:::::.::::.: ::::::::.:::::::::::: .:::::: .:. . ::..
CCDS43 GMNGCDMGPDGRLLRGYHQHAYDGKDYISLNEDLRSWTAADTVAQITQRFYEAEEYAEEF
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLT
       :.::::.:.: ::::::::::::::.                                  
CCDS43 RTYLEGECLELLRRYLENGKETLQRA----------------------------------
       180       190       200                                     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
                                                                 : 
CCDS43 ----------------------------------------------------------EQ
                                                                   

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIIAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSL
       : :::::::::.::::..:::..::::::::::.:::::. :::::::            
CCDS43 SPQPTIPIVGIVAGLVVLGAVVTGAVVAAVMWRKKSSDRNRGSYSQAAV           
         210       220       230       240       250               

            
pF1KE1 TACKV

>>CCDS1342.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1                  (341 aa)
 initn: 720 init1: 401 opt: 816  Z-score: 918.4  bits: 178.4 E(32554): 7.8e-45
Smith-Waterman score: 823; 37.5% identity (68.0% similar) in 347 aa overlap (1-344:5-335)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE1     MAVMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQ
           :: . :  .::...      .. . .::.:::  .:: : .: :.::.:::::.  
CCDS13 MGELMAFLLPLIIVLMVK------HSDSRTHSLRYFRLGVSDPIHGVPEFISVGYVDSHP
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       .. .::  .... ::::::. :. .:..:.: :. ... .:  .  :.   :.::.:  :
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       ::: ::: ::..  ::    :. : ::::.:.. .:.:  :: :.: .:.  .. ::.  
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       ::    . .:: .:. ::.:.:: ::.:::::. : ...... .    ..: : : .:::
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CCDS45 RQNRAYLERDCPAQLQQLLELGRGVLDQQVPPLVKVTHH-VTSSVTTLRCRALNYYPQNI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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