Result of FASTA (omim) for pFN21AB6604
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6604, 431 aa
  1>>>pF1KB6604 431 - 431 aa - 431 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4575+/-0.000342; mu= 16.7795+/- 0.021
 mean_var=66.4990+/-13.266, 0's: 0 Z-trim(114.3): 87  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.157278
 statistics sampled from 24020 (24107) to 24020 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.283), width:  16
 Scan time:  8.600

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001710 (OMIM: 112267) bone morphogenetic protei ( 431) 2943 676.6 3.3e-194
NP_066551 (OMIM: 112265) bone morphogenetic protei ( 454) 1632 379.2 1.2e-104
NP_001709 (OMIM: 112266) bone morphogenetic protei ( 513) 1591 369.9 8.5e-102
NP_001711 (OMIM: 602284) bone morphogenetic protei ( 402) 1198 280.7 4.8e-75
XP_016866687 (OMIM: 112265) PREDICTED: bone morpho ( 239) 1195 279.9   5e-75
NP_001316683 (OMIM: 112265) bone morphogenetic pro ( 417) 1092 256.6 8.7e-68
XP_011513119 (OMIM: 112265) PREDICTED: bone morpho ( 357)  937 221.4 2.9e-57
XP_011540324 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morpho ( 357)  935 221.0   4e-57
NP_001316685 (OMIM: 112265) bone morphogenetic pro ( 348)  934 220.7 4.6e-57
XP_011540326 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morpho ( 427)  746 178.1 3.8e-44
XP_016877094 (OMIM: 112262,600625,607932) PREDICTE ( 345)  519 126.6   1e-28
XP_016877093 (OMIM: 112262,600625,607932) PREDICTE ( 345)  519 126.6   1e-28
XP_005268072 (OMIM: 112262,600625,607932) PREDICTE ( 408)  519 126.6 1.2e-28
NP_570911 (OMIM: 112262,600625,607932) bone morpho ( 408)  519 126.6 1.2e-28
NP_001193 (OMIM: 112262,600625,607932) bone morpho ( 408)  519 126.6 1.2e-28
XP_016877092 (OMIM: 112262,600625,607932) PREDICTE ( 408)  519 126.6 1.2e-28
NP_001306067 (OMIM: 112600,113100,200700,201250,22 ( 501)  518 126.4 1.6e-28
NP_000548 (OMIM: 112600,113100,200700,201250,22890 ( 501)  518 126.4 1.6e-28
XP_011527377 (OMIM: 112600,113100,200700,201250,22 ( 501)  518 126.4 1.6e-28
XP_011527625 (OMIM: 112261,112600,235200) PREDICTE ( 240)  489 119.7 8.3e-27
NP_001191 (OMIM: 112261,112600,235200) bone morpho ( 396)  489 119.8 1.3e-26
XP_016857644 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morpho ( 382)  483 118.4 3.2e-26
XP_016857645 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morpho ( 236)  457 112.4 1.3e-24
XP_011540327 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morpho ( 230)  447 110.1 5.9e-24
XP_005271206 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morpho ( 231)  447 110.1 5.9e-24
NP_878248 (OMIM: 604651) growth/differentiation fa ( 450)  444 109.6 1.7e-23
NP_001001557 (OMIM: 118100,601147,613094,613703,61 ( 455)  444 109.6 1.7e-23
NP_065685 (OMIM: 606522,613702,613703,613704) grow ( 364)  423 104.8 3.8e-22
NP_001483 (OMIM: 187500,208530,217095,602880,61385 ( 372)  402 100.0 1.1e-20
NP_055297 (OMIM: 608748) bone morphogenetic protei ( 424)  394 98.2 4.2e-20
NP_001192 (OMIM: 112263) bone morphogenetic protei ( 472)  385 96.2 1.9e-19
NP_057288 (OMIM: 605120,615506) growth/differentia ( 429)  378 94.6 5.2e-19
NP_004953 (OMIM: 601361) growth/differentiation fa ( 478)  375 93.9 9.2e-19
NP_001316868 (OMIM: 107970,190230,615582) transfor ( 412)  374 93.7 9.5e-19
NP_003230 (OMIM: 107970,190230,615582) transformin ( 412)  374 93.7 9.5e-19
NP_001316835 (OMIM: 270100,601265) nodal homolog i ( 214)  352 88.6 1.7e-17
NP_060525 (OMIM: 270100,601265) nodal homolog isof ( 347)  352 88.7 2.6e-17
NP_005439 (OMIM: 300247,300510) bone morphogenetic ( 392)  342 86.4 1.4e-16
XP_016867665 (OMIM: 147290) PREDICTED: inhibin bet ( 426)  340 86.0   2e-16
NP_002183 (OMIM: 147290) inhibin beta A chain prep ( 426)  340 86.0   2e-16
XP_016867664 (OMIM: 147290) PREDICTED: inhibin bet ( 483)  340 86.0 2.3e-16
XP_016867663 (OMIM: 147290) PREDICTED: inhibin bet ( 548)  340 86.0 2.5e-16
NP_002184 (OMIM: 147390) inhibin beta B chain prep ( 407)  316 80.5 8.6e-15
NP_113667 (OMIM: 612031) inhibin beta E chain prep ( 350)  306 78.2 3.6e-14
NP_005529 (OMIM: 601233) inhibin beta C chain prep ( 352)  293 75.3 2.8e-13
NP_005250 (OMIM: 601788,614160) growth/differentia ( 375)  289 74.4 5.6e-13
NP_005802 (OMIM: 603936) growth/differentiation fa ( 407)  287 73.9 8.2e-13
XP_006719257 (OMIM: 603936) PREDICTED: growth/diff ( 407)  287 73.9 8.2e-13
XP_011541613 (OMIM: 601918) PREDICTED: growth/diff ( 276)  275 71.1 3.9e-12
NP_001275753 (OMIM: 601918) growth/differentiation ( 366)  275 71.2 4.9e-12


>>NP_001710 (OMIM: 112267) bone morphogenetic protein 7   (431 aa)
 initn: 2943 init1: 2943 opt: 2943  Z-score: 3607.6  bits: 676.6 E(85289): 3.3e-194
Smith-Waterman score: 2943; 100.0% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 IRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 HNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 QNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 GECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKY
              370       380       390       400       410       420

              430 
pF1KB6 RNMVVRACGCH
       :::::::::::
NP_001 RNMVVRACGCH
              430 

>>NP_066551 (OMIM: 112265) bone morphogenetic protein 5   (454 aa)
 initn: 1098 init1: 874 opt: 1632  Z-score: 1999.6  bits: 379.2 E(85289): 1.2e-104
Smith-Waterman score: 1898; 64.7% identity (84.2% similar) in 442 aa overlap (17-431:15-454)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
                       ::.   :.  : . .. ::.::::::.::::..::::.::::::
NP_066   MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLG-DNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILS
                 10        20        30         40        50       

               70         80        90                        100  
pF1KB6 ILGLPHRPRPHLQGKH-NSAPMFMLDLYNAMAVEEG-----------------GGPGGQG
       ::::::::::   ::. .:::.:::::::::. ::.                 :.  :  
NP_066 ILGLPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYP
        60        70        80        90       100       110       

               110             120       130       140       150   
pF1KB6 FS---YPYKAVFS------TQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHH
        :   :: .  .:      ::.::::::.:..::.:::::::::::::.::.: : : :.
NP_066 ASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHY
       120       130       140       150       160       170       

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 REFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDS
       .::::::..::.::::::::::::::   .::.:::..::.::...:. .:..::::::.
NP_066 KEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDT
       180       190       200       210       220       230       

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB6 RTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNK
       :   : . ::::::::.::::::.::..:::::: .:: ::.::: : :::.::.:::.:
NP_066 RKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSK
       240       250       260       270       280       290       

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB6 QPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKH
       ::::::::::.:: .::.:.. .:...:::.:. ..:.. ::..:.. ..:.:.::::::
NP_066 QPFMVAFFKASEVLLRSVRAA-NKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKH
       300       310        320       330       340       350      

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB6 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPK
       :::::::::::::::::::::::.::.:::.::::..::::::::::::::.. :. :::
NP_066 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPK
        360       370       380       390       400       410      

           400       410       420       430 
pF1KB6 PCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_066 PCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
        420       430       440       450    

>>NP_001709 (OMIM: 112266) bone morphogenetic protein 6   (513 aa)
 initn: 1829 init1: 1591 opt: 1591  Z-score: 1948.5  bits: 369.9 E(85289): 8.5e-102
Smith-Waterman score: 1772; 60.2% identity (78.9% similar) in 450 aa overlap (39-431:64-513)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB6 AAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRP
                                     :.:..:::..::.::::.::::.:::::::
NP_001 AAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRP
            40        50        60        70        80        90   

       70                                    80        90          
pF1KB6 RP-H-LQ--------------------------GKHNSAPMFMLDLYNAMAV---EEGGG
       :: : ::                          :. .:::.::::::::...   :.:..
NP_001 RPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGAS
           100       110       120       130       140       150   

       100       110                                 120       130 
pF1KB6 PGGQGFSYPYKAVFSTQ------------------GP--------PLASLQDSHFLTDAD
        : .  :.:..:. :.:                  .:        ::.: ::: ::.:::
NP_001 EGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDAD
           160       170       180       190       200       210   

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB6 MVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFR
       ::::::::::.::::   . ::.::.:.::.:::::.::::::::::: .   : :.:: 
NP_001 MVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFL
           220       230       240       250       260       270   

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB6 ISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVET
       ::.:::::::  :.:::::::.:..:::::::: :::::::: :::.:.::.:::::: :
NP_001 ISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVT
           280       290       300       310       320       330   

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB6 LDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQE
        ::  ..:. :::.:: :: .::::::::::..::: :. ::..:..:.:.:... ..:.
NP_001 RDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQD
           340       350       360       370       380       390   

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB6 ALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYM
       . :...... .::. . ::.::::::::.:::::::::::.:::: ::.:::.::::..:
NP_001 VARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHM
           400       410       420       430       440       450   

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB6 NATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
       :::::::::::::..::: :::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_001 NATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
           460       470       480       490       500       510   

>>NP_001711 (OMIM: 602284) bone morphogenetic protein 8B  (402 aa)
 initn: 1341 init1: 980 opt: 1198  Z-score: 1468.2  bits: 280.7 E(85289): 4.8e-75
Smith-Waterman score: 1340; 50.2% identity (76.2% similar) in 424 aa overlap (16-431:3-402)

               10        20        30           40        50       
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDN---EVHSSFIHRRLRSQERREMQRE
                      :: .::.::  ::  ..  .   .   .  .::: ..:::..:::
NP_001              MTALPGPLWLLGLALCALGGGGPGLRPPPGCPQRRLGARERRDVQRE
                            10        20        30        40       

        60        70            80        90       100       110   
pF1KB6 ILSILGLPHRPRPHLQGKHN----SAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFST
       ::..:::: ::::.     .    :::.::::::.::: ..                 . 
NP_001 ILAVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDD-----------------DE
        50        60        70        80                         90

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 QGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAE
       .: :       . :  ::.::::::.::.:. . : . : .::::::..:: ::::::::
NP_001 DGAPAE-----RRLGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAE
                   100       110       120       130       140     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 FRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSN
       :::::     .. :.:...:..::.::. .::::::.:: .:: :..:::::.:.::.:.
NP_001 FRIYK-VPSIHLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASD
         150        160       170       180       190       200    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 HWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRS
        :... ...:::.: ::: ::.:..: ::::.:...:...:::.:.::.:.   .:. :.
NP_001 CWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRA
          210       220       230       240       250       260    

           300       310       320        330       340       350  
pF1KB6 TGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAEN-SSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPE
       .   .: : . :. .  .: :. .. ..  .:  ::.:..:::::::.:::: ::.:::.
NP_001 VRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQ
          270        280       290       300       310       320   

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB6 GYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDS
       ::.::::::::.:::.: ::::::::.:.:::.. :..::: :::::.:.: ::::.:.:
NP_001 GYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSS
           330       340       350       360       370       380   

            420       430 
pF1KB6 SNVILKKYRNMVVRACGCH
       .::::.:.:::::.:::::
NP_001 NNVILRKHRNMVVKACGCH
           390       400  

>>XP_016866687 (OMIM: 112265) PREDICTED: bone morphogene  (239 aa)
 initn: 772 init1: 772 opt: 1195  Z-score: 1468.0  bits: 279.9 E(85289): 5e-75
Smith-Waterman score: 1195; 72.8% identity (93.0% similar) in 228 aa overlap (204-431:13-239)

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 FRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSN
                                     :..::::::.:   : . ::::::::.:::
XP_016                   MEAERAQVLPTVRDADLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSN
                                 10        20        30        40  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 HWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRS
       :::.::..:::::: .:: ::.::: : :::.::.:::.:::::::::::.:: .::.:.
XP_016 HWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPFMVAFFKASEVLLRSVRA
             50        60        70        80        90       100  

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB6 TGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEG
       . .:...:::.:. ..:.. ::..:.. ..:.:.::::::::::::::::::::::::::
XP_016 A-NKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEG
             110       120       130       140       150       160 

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB6 YAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSS
       :::.::.:::.::::..::::::::::::::.. :. :::::::::.:::::::::::::
XP_016 YAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSS
             170       180       190       200       210       220 

           420       430 
pF1KB6 NVILKKYRNMVVRACGCH
       :::::::::::::.::::
XP_016 NVILKKYRNMVVRSCGCH
             230         

>>NP_001316683 (OMIM: 112265) bone morphogenetic protein  (417 aa)
 initn: 1391 init1: 874 opt: 1092  Z-score: 1338.0  bits: 256.6 E(85289): 8.7e-68
Smith-Waterman score: 1573; 57.5% identity (75.8% similar) in 442 aa overlap (17-431:15-417)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
                       ::.   :.  : . .. ::.::::::.::::..::::.::::::
NP_001   MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLG-DNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILS
                 10        20        30         40        50       

               70         80        90                        100  
pF1KB6 ILGLPHRPRPHLQGKH-NSAPMFMLDLYNAMAVEEG-----------------GGPGGQG
       ::::::::::   ::. .:::.:::::::::. ::.                 :.  :  
NP_001 ILGLPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYP
        60        70        80        90       100       110       

               110             120       130       140       150   
pF1KB6 FS---YPYKAVFS------TQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHH
        :   :: .  .:      ::.::::::.:..::.:::::::::::::.::.: : : :.
NP_001 ASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHY
       120       130       140       150       160       170       

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 REFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDS
       .::::::..::.::::::::::::::   .::.:::..::.::...:. .:..::::::.
NP_001 KEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDT
       180       190       200       210       220       230       

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB6 RTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNK
       :   : . ::::::::.::::::.::..:::::: .:: ::.::: : :::.::.:::.:
NP_001 RKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSK
       240       250       260       270       280       290       

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB6 QPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKH
       ::::::::::.:: .::.:.. .:...:::.:. ..:.. ::..:.. ..:.:.::::::
NP_001 QPFMVAFFKASEVLLRSVRAA-NKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKH
       300       310        320       330       340       350      

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB6 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPK
       ::::::::::::                                     ::.. :. :::
NP_001 ELYVSFRDLGWQ-------------------------------------VHLMFPDHVPK
        360                                            370         

           400       410       420       430 
pF1KB6 PCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_001 PCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
     380       390       400       410       

>>XP_011513119 (OMIM: 112265) PREDICTED: bone morphogene  (357 aa)
 initn: 1169 init1: 874 opt: 937  Z-score: 1149.0  bits: 221.4 E(85289): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 1203; 56.9% identity (79.4% similar) in 339 aa overlap (17-327:15-350)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
                       ::.   :.  : . .. ::.::::::.::::..::::.::::::
XP_011   MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLG-DNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILS
                 10        20        30         40        50       

               70         80        90                             
pF1KB6 ILGLPHRPRPHLQGKH-NSAPMFMLDLYNAMAVEEG---------------------GGP
       ::::::::::   ::. .:::.:::::::::. ::.                     : :
XP_011 ILGLPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYP
        60        70        80        90       100       110       

      100       110             120       130       140       150  
pF1KB6 GGQGFSYPYKAVFS------TQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYH
       .. . .:: .  .:      ::.::::::.:..::.:::::::::::::.::.: : : :
XP_011 ASPN-GYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRH
       120        130       140       150       160       170      

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 HREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLD
       ..::::::..::.::::::::::::::   .::.:::..::.::...:. .:..::::::
XP_011 YKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLD
        180       190       200       210       220       230      

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB6 SRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQN
       .:   : . ::::::::.::::::.::..:::::: .:: ::.::: : :::.::.:::.
XP_011 TRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQS
        240       250       260       270       280       290      

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB6 KQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKK
       :::::::::::.:: .::.:.. .:...:::.:. ..:.. ::..:.:.  .  :     
XP_011 KQPFMVAFFKASEVLLRSVRAA-NKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGETLHKTTRWNSLD
        300       310        320       330       340       350     

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB6 HELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVP
                                                                   
XP_011 FS                                                          
                                                                   

>>XP_011540324 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morphogene  (357 aa)
 initn: 1051 init1: 690 opt: 935  Z-score: 1146.5  bits: 221.0 E(85289): 4e-57
Smith-Waterman score: 1077; 47.7% identity (73.9% similar) in 375 aa overlap (16-382:3-353)

               10        20        30           40        50       
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDN---EVHSSFIHRRLRSQERREMQRE
                      :: .::.::  ::  ..  .   .   .  .::: ..:::..:::
XP_011              MTALPGPLWLLGLALCALGGGGPGLRPPPGCPQRRLGARERRDVQRE
                            10        20        30        40       

        60        70            80        90       100       110   
pF1KB6 ILSILGLPHRPRPHLQGKHN----SAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFST
       ::..:::: ::::.     .    :::.::::::.::: ..                 . 
XP_011 ILAVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDD-----------------DE
        50        60        70        80                         90

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 QGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAE
       .: :       . :  ::.::::::.::.:. . : . : .::::::..:: ::::::::
XP_011 DGAPA-----ERRLGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAE
                   100       110       120       130       140     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 FRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSN
       :::::     .. :.:...:..::.::. .::::::.:: .:: :..:::::.:.::.:.
XP_011 FRIYK-VPSIHLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASD
         150        160       170       180       190       200    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 HWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRS
        :... ...:::.: ::: ::.:..: ::::.:...:...:::.:.::.:.   .:. :.
XP_011 CWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRA
          210       220       230       240       250       260    

           300       310       320        330       340       350  
pF1KB6 TGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAEN-SSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPE
       .   .: : . :. .  .: :. .. ..  .:  ::.:..:::::::.:::: ::.:::.
XP_011 VRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQ
          270        280       290       300       310       320   

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB6 GYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDS
       ::.::::::::.:::.: ::::::::.:.:                              
XP_011 GYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLEVQR                          
           330       340       350                                 

>>NP_001316685 (OMIM: 112265) bone morphogenetic protein  (348 aa)
 initn: 1166 init1: 874 opt: 934  Z-score: 1145.5  bits: 220.7 E(85289): 4.6e-57
Smith-Waterman score: 1200; 57.6% identity (79.8% similar) in 337 aa overlap (17-325:15-346)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
                       ::.   :.  : . .. ::.::::::.::::..::::.::::::
NP_001   MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLG-DNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILS
                 10        20        30         40        50       

               70         80        90                             
pF1KB6 ILGLPHRPRPHLQGKH-NSAPMFMLDLYNAMAVEEG---------------------GGP
       ::::::::::   ::. .:::.:::::::::. ::.                     : :
NP_001 ILGLPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYP
        60        70        80        90       100       110       

      100       110             120       130       140       150  
pF1KB6 GGQGFSYPYKAVFS------TQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYH
       .. . .:: .  .:      ::.::::::.:..::.:::::::::::::.::.: : : :
NP_001 ASPN-GYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRH
       120        130       140       150       160       170      

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 HREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLD
       ..::::::..::.::::::::::::::   .::.:::..::.::...:. .:..::::::
NP_001 YKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLD
        180       190       200       210       220       230      

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB6 SRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQN
       .:   : . ::::::::.::::::.::..:::::: .:: ::.::: : :::.::.:::.
NP_001 TRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQS
        240       250       260       270       280       290      

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB6 KQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKK
       :::::::::::.:: .::.:.. .:...:::.:. ..:.. ::..:  ..:::       
NP_001 KQPFMVAFFKASEVLLRSVRAA-NKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSV--GGSSDVS     
        300       310        320       330       340               

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB6 HELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVP

>>XP_011540326 (OMIM: 602284) PREDICTED: bone morphogene  (427 aa)
 initn: 1180 init1: 607 opt: 746  Z-score: 913.6  bits: 178.1 E(85289): 3.8e-44
Smith-Waterman score: 1171; 45.2% identity (69.3% similar) in 449 aa overlap (16-431:3-427)

               10        20        30           40        50       
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDN---EVHSSFIHRRLRSQERREMQRE
                      :: .::.::  ::  ..  .   .   .  .::: ..:::..:::
XP_011              MTALPGPLWLLGLALCALGGGGPGLRPPPGCPQRRLGARERRDVQRE
                            10        20        30        40       

        60        70            80        90       100       110   
pF1KB6 ILSILGLPHRPRPHLQGKHN----SAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFST
       ::..:::: ::::.     .    :::.::::::.::: ..                 . 
XP_011 ILAVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDD-----------------DE
        50        60        70        80                         90

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 QGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAE
       .: :       . :  ::.::::::.::.:. . : . : .::::::..:: ::::::::
XP_011 DGAPAE-----RRLGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAE
                   100       110       120       130       140     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 FRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSN
       :::::     .. :.:...:..::.::. .::::::.:: .:: :..:::::.:.::.:.
XP_011 FRIYK-VPSIHLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASD
         150        160       170       180       190       200    

           240       250                        260       270      
pF1KB6 HWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSIN-----------------PKLAGLIGRHGPQNKQ--
        :... ...:::.: ::: ::.. .                  .   ... :.:   :  
XP_011 CWLLKRHKDLGLRLYVETEDGETWTGWGWTKDSRLQMWKLRLSRTPWVLSLHAPGPAQAP
          210       220       230       240       250       260    

             280          290       300       310       320        
pF1KB6 ---PFMVAF---FKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAEN-SSSDQR
          :..  .     :.   .:. :..   .: : . :. .  .: :. .. ..  .:  :
XP_011 AERPLLCLLQGHCPASPSPIRTPRAVRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGR
          270       280       290        300       310       320   

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB6 QACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFIN
       :.:..:::::::.:::: ::.:::.::.::::::::.:::.: ::::::::.:.:::.. 
XP_011 QVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMM
           330       340       350       360       370       380   

       390       400       410       420       430 
pF1KB6 PETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
       :..::: :::::.:.: ::::.:.:.::::.:.:::::.:::::
XP_011 PDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILRKHRNMVVKACGCH
           390       400       410       420       




431 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 11:31:47 2016 done: Sat Nov  5 11:31:49 2016
 Total Scan time:  8.600 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com