Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6604
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6604, 431 aa
1>>>pF1KB6604 431 - 431 aa - 431 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7991+/-0.000785; mu= 14.5921+/- 0.047
mean_var=66.2204+/-13.083, 0's: 0 Z-trim(107.7): 44 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.157608
statistics sampled from 9727 (9771) to 9727 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 2943 677.9 5e-195
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 1632 379.8 2.9e-105
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 1591 370.5 2.1e-102
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 1198 281.1 1.3e-75
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 1198 281.1 1.3e-75
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 519 126.8 4e-29
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 518 126.6 5.6e-29
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 489 119.9 4.4e-27
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 444 109.7 5.9e-24
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 444 109.7 6e-24
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 423 104.9 1.3e-22
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 402 100.1 3.7e-21
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 ( 424) 394 98.3 1.5e-20
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 385 96.3 6.8e-20
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 378 94.7 1.9e-19
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 375 94.0 3.3e-19
CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 ( 412) 374 93.8 3.4e-19
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 352 88.8 9.2e-18
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 342 86.5 5e-17
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 340 86.1 7.4e-17
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 316 80.6 3.1e-15
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 306 78.3 1.3e-14
CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12 ( 352) 293 75.4 1e-13
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 289 74.5 2e-13
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 287 74.0 3e-13
CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 366) 275 71.3 1.8e-12
CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 454) 275 71.3 2.2e-12
CCDS12376.1 GDF15 gene_id:9518|Hs108|chr19 ( 308) 266 69.2 6.4e-12
CCDS1521.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 414) 266 69.2 8.4e-12
CCDS44318.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 442) 266 69.2 8.9e-12
>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa)
initn: 2943 init1: 2943 opt: 2943 Z-score: 3614.8 bits: 677.9 E(32554): 5e-195
Smith-Waterman score: 2943; 100.0% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 IRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 HNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 QNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKY
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB6 RNMVVRACGCH
:::::::::::
CCDS13 RNMVVRACGCH
430
>>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 (454 aa)
initn: 1098 init1: 874 opt: 1632 Z-score: 2003.4 bits: 379.8 E(32554): 2.9e-105
Smith-Waterman score: 1898; 64.7% identity (84.2% similar) in 442 aa overlap (17-431:15-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILS
::. :. : . .. ::.::::::.::::..::::.::::::
CCDS49 MHLTVFLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLG-DNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILS
10 20 30 40 50
70 80 90 100
pF1KB6 ILGLPHRPRPHLQGKH-NSAPMFMLDLYNAMAVEEG-----------------GGPGGQG
:::::::::: ::. .:::.:::::::::. ::. :. :
CCDS49 ILGLPHRPRPFSPGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB6 FS---YPYKAVFS------TQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHH
: :: . .: ::.::::::.:..::.:::::::::::::.::.: : : :.
CCDS49 ASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHY
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 REFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDS
.::::::..::.:::::::::::::: .::.:::..::.::...:. .:..::::::.
CCDS49 KEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETIKISIYQIIKEYTNRDADLFLLDT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 RTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNK
: : . ::::::::.::::::.::..:::::: .:: ::.::: : :::.::.:::.:
CCDS49 RKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 QPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKH
::::::::::.:: .::.:.. .:...:::.:. ..:.. ::..:.. ..:.:.::::::
CCDS49 QPFMVAFFKASEVLLRSVRAA-NKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPK
:::::::::::::::::::::::.::.:::.::::..::::::::::::::.. :. :::
CCDS49 ELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KB6 PCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS49 PCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGCH
420 430 440 450
>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 1829 init1: 1591 opt: 1591 Z-score: 1952.1 bits: 370.5 E(32554): 2.1e-102
Smith-Waterman score: 1772; 60.2% identity (78.9% similar) in 450 aa overlap (39-431:64-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRP
:.:..:::..::.::::.::::.:::::::
CCDS45 AAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRP
40 50 60 70 80 90
70 80 90
pF1KB6 RP-H-LQ--------------------------GKHNSAPMFMLDLYNAMAV---EEGGG
:: : :: :. .:::.::::::::... :.:..
CCDS45 RPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGAS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130
pF1KB6 PGGQGFSYPYKAVFSTQ------------------GP--------PLASLQDSHFLTDAD
: . :.:..:. :.: .: ::.: ::: ::.:::
CCDS45 EGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDAD
160 170 180 190 200 210
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 MVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFR
::::::::::.:::: . ::.::.:.::.:::::.::::::::::: . : :.::
CCDS45 MVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFL
220 230 240 250 260 270
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 ISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVET
::.::::::: :.:::::::.:..:::::::: :::::::: :::.:.::.:::::: :
CCDS45 ISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVT
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 LDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQE
:: ..:. :::.:: :: .::::::::::..::: :. ::..:..:.:.:... ..:.
CCDS45 RDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQD
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 ALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYM
. :...... .::. . ::.::::::::.:::::::::::.:::: ::.:::.::::..:
CCDS45 VARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHM
400 410 420 430 440 450
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 NATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
:::::::::::::..::: :::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS45 NATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
460 470 480 490 500 510
>>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 1341 init1: 980 opt: 1198 Z-score: 1470.9 bits: 281.1 E(32554): 1.3e-75
Smith-Waterman score: 1340; 50.2% identity (76.2% similar) in 424 aa overlap (16-431:3-402)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MHVRSLRAAAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDN---EVHSSFIHRRLRSQERREMQRE
:: .::.:: :: .. . . . .::: ..:::..:::
CCDS44 MTALPGPLWLLGLALCALGGGGPGLRPPPGCPQRRLGARERRDVQRE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ILSILGLPHRPRPHLQGKHN----SAPMFMLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFST
::..:::: ::::. . :::.::::::.::: .. .
CCDS44 ILAVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDD-----------------DE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAE
.: : . : ::.::::::.::.:. . : . : .::::::..:: ::::::::
CCDS44 DGAPAE-----RRLGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAE
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 FRIYKDYIRERFDNETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSN
::::: .. :.:...:..::.::. .::::::.:: .:: :..:::::.:.::.:.
CCDS44 FRIYK-VPSIHLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASD
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 HWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRS
:... ...:::.: ::: ::.:..: ::::.:...:...:::.:.::.:. .:. :.
CCDS44 CWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRA
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 TGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANVAEN-SSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPE
. .: : . :. . .: :. .. .. .: ::.:..:::::::.:::: ::.:::.
CCDS44 VRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQ
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 GYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDS
::.::::::::.:::.: ::::::::.:.:::.. :..::: :::::.:.: ::::.:.:
CCDS44 GYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSS
330 340 350 360 370 380
420 430
pF1KB6 SNVILKKYRNMVVRACGCH
.::::.:.:::::.:::::
CCDS44 NNVILRKHRNMVVKACGCH
390 400
>>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 1319 init1: 980 opt: 1198 Z-score: 1470.9 bits: 281.1 E(32554): 1.3e-75
Smith-Waterman score: 1342; 52.3% identity (78.0% similar) in 396 aa overlap (43-431:33-402)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 SFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRPRPHL
.::: ..:::..:::::..:::: ::::.
CCDS43 ARPGPLWLLGLTLCALGGGGPGLRPPPGCPQRRLGARERRDVQREILAVLGLPGRPRPRA
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KB6 QGKHN----SAPMFMLDLYNAMAVE--EGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLASLQDSHF
. :::.::::::.::: . : :.:. :
CCDS43 PPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDEDGAPAEQR------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFD
: ::.::::::.::.:. . : . : .::::::..:: ::::::::::::: ..
CCDS43 LGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYK-VPSIHLL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NETFRISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQ
:.:...:..::.::. .::::::.:: .:: :..:::::.:.::.:. :... ...:::.
CCDS43 NRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKDLGLR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKT
: ::: ::.:..: ::::.:...:...:::.:.::.:. .:. :.. .: : . :.
CCDS43 LYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRPLRRRQPK-KS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PKNQEALRMANVAEN-SSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAF
. .: :. .. .. .: ::.:..:::::::.:::: ::.:::.::.::::::::.:
CCDS43 NELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSAYYCEGECSF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVV
::.: ::::::::.:.:::...:..::: :::::.:.: ::::.:.:.::::.:.:::::
CCDS43 PLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILRKHRNMVV
340 350 360 370 380 390
430
pF1KB6 RACGCH
.:::::
CCDS43 KACGCH
400
>>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 (408 aa)
initn: 664 init1: 273 opt: 519 Z-score: 636.4 bits: 126.8 E(32554): 4e-29
Smith-Waterman score: 664; 33.1% identity (60.0% similar) in 402 aa overlap (47-430:46-407)
20 30 40 50 60 70
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:: . .:. :. .:...:: .::.:
CCDS97 VLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRPQP--
20 30 40 50 60 70
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.: : .: ::: .. :: . :. :: . . . :.
CCDS97 -SKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPA-----------------SRAN
80 90 100 110
140 150 160 170 180
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: :: . :. : . .. ::: .::.:::.:....::.:.... . . : :
CCDS97 TVRSFHH--EEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEVISSAELRLFREQVDQGPDWER
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 --FRISVYQVLQ---EHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLG
::..:.:.. : . . :::.: . . : .::.. . .:. . . : :
CCDS97 GFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYG
180 190 200 210 220 230
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: . : : . :.: ::.. .:..:.: . . : . ...
CCDS97 LAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGH------ALTRR
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: .:: ..:.: : : . :..: :::.: :.::.:::.:: :: :.:
CCDS97 RRAKRSPKHHSQRA-RKKN----------KNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFY
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:.:.: ::: ...:.::::::::::. .: ..:: ::.::.:.:::.::.:. ..:.::
CCDS97 CHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNS-SIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLK
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CCDS97 NYQEMVVEGCGCR
400
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. . :: :::: : . : ... : : .:. . :.... : :: . : . :
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.. . : : .. : :.. : : ... . .:. : : .: . :.
CCDS13 VHEKALFLVFGRTKKRDLFFNEIKAR-SGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLATRQGKRPSK
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330 340 350 360 370 380
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CCDS13 NLKARCSRKALHVNFKDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMN
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390 400 410 420 430
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CCDS13 SMDPESTPPTCCVPTRLSPISILFIDSANNVVYKQYEDMVVESCGCR
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CCDS13 AGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTP---SRDAVVPPY
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CCDS13 MLDLYR----RHSGQPGSPA--------------PDHRLERAA--SRANTVRSF-----H
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CCDS13 HEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINI
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pF1KB6 YQVLQEHLG--RESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETL
:.... . . :::.: . . : ::.: . .:... . : :. . : :
CCDS13 YEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHL
180 190 200 210 220 230
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. .. : :.: :... :..:.: :. .: : :.. :::.. .
CCDS13 EEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLK
240 250 260 270 280 290
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: .::.: :::.: :.::.:::.:: :: :.::.:::
CCDS13 S------------------------SCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGEC
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CCDS13 PFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSK-IPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDM
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CCDS13 VVEGCGCR
390
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:..: : :: . .:.. . .:. . . : ::.:.. ... :..
CCDS17 SASG---------H--GRADTITGFTDQATQDESAAET---GQSFLFDVSSLNDADEVVG
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CCDS17 AELRVLRRGSPESGPG-SWTSPPLLLLSTCPGAARAPRLLYSR---AAEPLVGQRWEAFD
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.. . . .:: .. : .... : .: .:. : : : .. ... .
CCDS17 VADAMRRHRREPRPPRAFCLLLRAVAGPVPSPLALRRLGFGWPGGGGSAAEERAVLVVSS
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CCDS17 RTQRKESLFREIRAQARALGAALASEPLPDPGTGTASPRAVIGGRRRRRTALAGTRTAQG
280 290 300 310 320 330
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CCDS17 SGGGAGRGHGRRGRSRCSRKPLHVDFKELGWDDWIIAPLDYEAYHCEGLCDFPLRSHLEP
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CCDS17 TNHAIIQTLLNSMAPDAAPASCCVPARLSPISILYIDAANNVVYKQYEDMVVEACGCR
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40 50
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.: ... : : .. :. . :::. : . : ..... ::.: . . : ...:
CCDS34 IAEKLGINASFFQSSKSANTITSFVDRGLDD--LSHTPLRRQKYLFDVSMLSDKEELVGA
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.. ..:.: .. . . : .: ..:.. : .: . : :
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CCDS34 HLEPTNHAIIQTLMNSMDPGSTPPSCCVPTKLTPISILYIDAGNNVVYKQYEDMVVESCG
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pF1KB6 CH
:
CCDS34 CR
431 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sat Nov 5 11:31:46 2016 done: Sat Nov 5 11:31:47 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]