FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6321, 337 aa 1>>>pF1KE6321 337 - 337 aa - 337 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5966+/-0.000832; mu= 15.6127+/- 0.050 mean_var=80.1435+/-15.929, 0's: 0 Z-trim(108.3): 26 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.143265 statistics sampled from 10092 (10115) to 10092 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16 Scan time: 1.770 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43014.1 APOL2 gene_id:23780|Hs108|chr22 ( 337) 2163 456.4 1.5e-128 CCDS46702.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22 ( 380) 1262 270.2 1.9e-72 CCDS13926.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22 ( 398) 1262 270.2 1.9e-72 CCDS13925.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22 ( 414) 1262 270.3 2e-72 CCDS13922.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22 ( 402) 1033 222.9 3.5e-58 CCDS74851.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22 ( 348) 653 144.3 1.4e-34 CCDS74852.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22 ( 351) 653 144.3 1.4e-34 CCDS13924.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22 ( 202) 583 129.7 2e-30 CCDS13919.1 APOL6 gene_id:80830|Hs108|chr22 ( 343) 502 113.1 3.3e-25 CCDS13920.1 APOL5 gene_id:80831|Hs108|chr22 ( 433) 460 104.5 1.7e-22 >>CCDS43014.1 APOL2 gene_id:23780|Hs108|chr22 (337 aa) initn: 2163 init1: 2163 opt: 2163 Z-score: 2421.4 bits: 456.4 E(32554): 1.5e-128 Smith-Waterman score: 2163; 100.0% identity (100.0% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 SHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 SHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 NSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGMGLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 NSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGMGLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNWYQVTQGIGRNIRAIRRARANPQLGAYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 ARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNWYQVTQGIGRNIRAIRRARANPQLGAYA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 PPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 GAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQPGQDQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 GAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQPGQDQ 310 320 330 >>CCDS46702.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22 (380 aa) initn: 1267 init1: 973 opt: 1262 Z-score: 1414.2 bits: 270.2 E(32554): 1.9e-72 Smith-Waterman score: 1262; 61.8% identity (82.8% similar) in 338 aa overlap (1-336:42-379) 10 20 30 pF1KE6 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLT :.::::::::: .:::...:: .::: ::: CCDS46 LCIWVQQNVPSGTDTGDPQSKPLGDWAAGTMDPESSIFIEDAIKYFKEKVSTQNLLLLLT 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 DDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLASHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKR :.::::::::::::::.:::::::::..:: .:.::::: ::: ::.:.:::::::::: CCDS46 DNEAWNGFVAAAELPRNEADELRKALDNLARQMIMKDKNWHDKGQQYRNWFLKEFPRLKS 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 ELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVSNSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLD ::::.::.:::::. :..::.:::::::::.:.. .::::::.:.:::::::: :.:::. 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CCDS13 KILQADQEL 390 >>CCDS13925.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22 (414 aa) initn: 1267 init1: 973 opt: 1262 Z-score: 1413.7 bits: 270.3 E(32554): 2e-72 Smith-Waterman score: 1262; 61.8% identity (82.8% similar) in 338 aa overlap (1-336:76-413) 10 20 30 pF1KE6 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLT :.::::::::: .:::...:: .::: ::: CCDS13 AGARVQQNVPSGTDTGDPQSKPLGDWAAGTMDPESSIFIEDAIKYFKEKVSTQNLLLLLT 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 DDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLASHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKR :.::::::::::::::.:::::::::..:: .:.::::: ::: ::.:.:::::::::: CCDS13 DNEAWNGFVAAAELPRNEADELRKALDNLARQMIMKDKNWHDKGQQYRNWFLKEFPRLKS 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 ELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVSNSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLD ::::.::.:::::. :..::.:::::::::.:.. .::::::.:.:::::::: :.:::. CCDS13 ELEDNIRRLRALADGVQKVHKGTTIANVVSGSLSISSGILTLVGMGLAPFTEGGSLVLLE 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 TGMGLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLV :: :: .::..::: :... .: ..:::..: .. . : ..::.: : : :.:. CCDS13 PGMELGITAALTGITSSTMDYGKKWWTQAQAHDLVIKSLDKLKEVREFLGENISNFLSLA 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 pF1KE6 DNWYQVTQGIGRNIRAIRRARANPQL--GAYAPPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAM : ::.:.:::..:::.:::::: : : : :.: ::::.::::::: : : CCDS13 GNTYQLTRGIGKDIRALRRARANLQSVPHASASRPRVTEPISAESGEQVERVNEPSILEM 290 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 SRGTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLEGAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIH :::. .. .: ...:.:::: :.:::::: ::::::.:::::: ::::: :::.:.. . CCDS13 SRGVKLTDVAPVSFFLVLDVVYLVYESKHLHEGAKSETAEELKKVAQELEEKLNILNNNY 350 360 370 380 390 400 330 pF1KE6 EMLQPGQDQ ..:: :. CCDS13 KILQADQEL 410 >>CCDS13922.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22 (402 aa) initn: 1051 init1: 752 opt: 1033 Z-score: 1158.1 bits: 222.9 E(32554): 3.5e-58 Smith-Waterman score: 1033; 52.7% identity (79.4% similar) in 330 aa overlap (4-333:75-398) 10 20 30 pF1KE6 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDE :.. : :. :::...:: .: :::..: CCDS13 GYYADARLEVGSTQLRTAGSCSHSFKRSFLEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNE 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 AWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLASHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELE ::. ::.:::::::::: : .::.:: .. ...:. ..::.: :.:::::::..::... CCDS13 AWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKRKIQ 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 DHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVSNSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGM . :.::::::. .:.:::: ::.::::.:.:..:::..: :: ::::: : :..: .:. CCDS13 ESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGV 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 GLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNW :::::.::.::: :.:: :.:.: : .. . ::.:: . :::.:.:..:. CCDS13 GLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNY 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 YQVTQGIGRNIRAIRRARANPQLGAYAPPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTM :..:: :: .:::::.::: .: : . :::: .: :.::.. : ..:.:::. CCDS13 YEATQTIGSEIRAIRQARARARL------PVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGAR 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 IVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLEGAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQP :..:.:.::.: ::::.:.:::::: ::::: :::::...::::: .: ::.:.. :.: CCDS13 ILSATTSGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNP 340 350 360 370 380 390 pF1KE6 GQDQ CCDS13 CHTH 400 >>CCDS74851.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22 (348 aa) initn: 819 init1: 431 opt: 653 Z-score: 734.5 bits: 144.3 E(32554): 1.4e-34 Smith-Waterman score: 798; 41.3% identity (74.3% similar) in 334 aa overlap (4-334:28-348) 10 20 30 pF1KE6 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDEAWN :.. : :. ..::: .:: .: :::.::::. CCDS74 MGSWVQLITSVGVQQNHPGWTVAGQFQEKKRFTEEVIEYFQKKVSPVHLKILLTSDEAWK 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 GFVAAAELPRDEADELRKALNKLASHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELEDHI :: .:::::.::: : .::..:. .....::. ..:.:: :.:::::::... .... : CCDS74 RFVRVAELPREEADALYEALKNLTPYVAIEDKDMQQKEQQFREWFLKEFPQIRWKIQESI 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVSNSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGMGLG ..::..:.:.:.:::: .::::::.: .:::...:. ::::: :.:. . .:.::: CCDS74 ERLRVIANEIEKVHRGCVIANVVSGS----TGILSVIGVMLAPFTAGLSLSITAAGVGLG 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 AAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNWYQV :.:.:::. :.:: . :. : : ..:. ....... :::::... .. .. CCDS74 IASATAGIASSIVENTYTRSAELTASRLTATSTDQLEALRDILRDITPNVLSFALDFDEA 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 TQGIGRNIRAIRRARAN---PQLGAYAPPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTM :. :. .....::..:. : .. : .:. . ..:. :.:. :. . CCDS74 TKMIANDVHTLRRSKATVGRPLIAWRYVPINVVETLRTRGAP--TRIVRKVARNL----- 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 IVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLEGAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQP : ::.:.:..::::.:. .: : .:::::::: :.. ::::: .:: ::.::. :. CCDS74 --GKATSGVLVVLDVVNLVQDSLDLHKGAKSESAESLRQWAQELEENLNELTHIHQSLKA 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 GQDQ : CCDS74 G >>CCDS74852.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22 (351 aa) initn: 819 init1: 431 opt: 653 Z-score: 734.5 bits: 144.3 E(32554): 1.4e-34 Smith-Waterman score: 798; 41.3% identity (74.3% similar) in 334 aa overlap (4-334:31-351) 10 20 30 pF1KE6 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDE :.. : :. ..::: .:: .: :::.:: CCDS74 MEGAALLKIFVVCIWVQQNHPGWTVAGQFQEKKRFTEEVIEYFQKKVSPVHLKILLTSDE 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 AWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLASHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELE ::. :: .:::::.::: : .::..:. .....::. ..:.:: :.:::::::... ... CCDS74 AWKRFVRVAELPREEADALYEALKNLTPYVAIEDKDMQQKEQQFREWFLKEFPQIRWKIQ 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 DHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVSNSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGM . :..::..:.:.:.:::: .::::::.: .:::...:. ::::: :.:. . .:. CCDS74 ESIERLRVIANEIEKVHRGCVIANVVSGS----TGILSVIGVMLAPFTAGLSLSITAAGV 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 GLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNW ::: :.:.:::. :.:: . :. : : ..:. ....... :::::... .. CCDS74 GLGIASATAGIASSIVENTYTRSAELTASRLTATSTDQLEALRDILRDITPNVLSFALDF 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 YQVTQGIGRNIRAIRRARAN---PQLGAYAPPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSR ..:. :. .....::..:. : .. : .:. . ..:. :.:. :. . CCDS74 DEATKMIANDVHTLRRSKATVGRPLIAWRYVPINVVETLRTRGAP--TRIVRKVARNL-- 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 GTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLEGAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEM : ::.:.:..::::.:. .: : .:::::::: :.. ::::: .:: ::.::. CCDS74 -----GKATSGVLVVLDVVNLVQDSLDLHKGAKSESAESLRQWAQELEENLNELTHIHQS 300 310 320 330 340 pF1KE6 LQPGQDQ :. : CCDS74 LKAG 350 >>CCDS13924.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22 (202 aa) initn: 601 init1: 313 opt: 583 Z-score: 659.7 bits: 129.7 E(32554): 2e-30 Smith-Waterman score: 583; 51.5% identity (76.0% similar) in 204 aa overlap (130-333:1-198) 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RALAEEVEQVHRGTTIANVVSNSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGMGLGAAA ..: :: ::::: : :..: .:.:::::. CCDS13 MSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGVGLGAAS 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 AVAGITCSVVELVNKLRARAQARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNWYQVTQG ::.::: :.:: :.:.: : .. . ::.:: . :::.:.:..:.:..:: CCDS13 AVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNYYEATQT 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 IGRNIRAIRRARANPQLGAYAPPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTMIVGAAT :: .:::::.::: .: : . :::: .: :.::.. : ..:.:::. :..:.: CCDS13 IGSEIRAIRQARARARL------PVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATT 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 pF1KE6 GGILLLLDVVSLAYESKHLLEGAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQPGQDQ .::.: ::::.:.:::::: ::::: :::::...::::: .: ::.:.. :.: CCDS13 SGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH 150 160 170 180 190 200 >>CCDS13919.1 APOL6 gene_id:80830|Hs108|chr22 (343 aa) initn: 498 init1: 498 opt: 502 Z-score: 565.9 bits: 113.1 E(32554): 3.3e-25 Smith-Waterman score: 503; 32.5% identity (68.2% similar) in 302 aa overlap (31-332:2-293) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLA :..: :.. : ::: : : CCDS13 MDNQAERESEAGVGLQRDEDDA------PLC 10 20 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 SHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVS . ..: . ... ::.::::::..:. .: ::::::......:. : ::.:. CCDS13 EDVELQDGDLSPEEKI----FLREFPRLKEDLKGNIDKLRALADDIDKTHKKFTKANMVA 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 NSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGMGLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQ .:... ::...::::.::: : : :..: .:.::..::.:..:. ...: .. .:.:. CCDS13 TSTAVISGVMSLLGLALAPATGGGSLLLSTAGQGLATAAGVTSIVSGTLERSKNKEAQAR 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 ARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNWYQVTQGIGRNIRAIRRARANPQLGAYA :... . . . .: . . . .. : .. . .:.::. . ::::.:. . CCDS13 AEDILPTYDQEDREDEEEKADYVTAAGKIIYNLRNTLKYAKKNVRAFWKLRANPRLANAT 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 PPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLE . :..:... ::... : . ::.... ..:.. ... : :...:. : ::: : CCDS13 KRLLTTGQVSSRSRVQVQKAFAGTTLAMTKNARVLGGVMSAFSLGYDLATLSKEWKHLKE 210 220 230 240 250 260 310 320 330 pF1KE6 GAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQPGQDQ ::... ::::. .: ::: ::. ::.... :: CCDS13 GARTKFAEELRAKALELERKLTELTQLYKSLQQKVRSRARGVGKDLTGTCETEAYWKELR 270 280 290 300 310 320 CCDS13 EHVWMWLWLCVCLCVCVYVQFT 330 340 >>CCDS13920.1 APOL5 gene_id:80831|Hs108|chr22 (433 aa) initn: 438 init1: 266 opt: 460 Z-score: 517.6 bits: 104.5 E(32554): 1.7e-22 Smith-Waterman score: 460; 33.9% identity (66.1% similar) in 289 aa overlap (59-337:73-356) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 LTDDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLASHMVMKDKNRHDKDQ-------QHRQWF . :...... : :::. .... : CCDS13 PEPEFPSLVNLCQSWKINNLMSTVHSDEAGMLSYFLFEELMRCDKDSMPDGNLSEEEKLF 50 60 70 80 90 100 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 LKEFPRLKRELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVSNSVGTTSGILTLLGLGLAPFT :. :: : :::..:..: .::..:. .:. : ...:..: :..::....:::.::: : CCDS13 LSYFPLHKFELEQNIKELNTLADQVDTTHELLTKTSLVASSSGAVSGVMNILGLALAPVT 110 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 EGISFVLLDTGMGLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQARNLDQSGTNVAKVMKEFVGG : :..: :: :::::::...:. .:.: .. :: .: : :. . : : CCDS13 AGGSLMLSATGTGLGAAAAITNIVTNVLENRSNSAARDKASRLGPLTTS----HEAFGGI 170 180 190 200 210 210 220 230 240 250 pF1KE6 NTPNVLTL---VDNWYQVTQGIGRNIRAIRRARANPQLGAYAPPPHVIGRISAEGGEQVE : .. . :.. .. ::: ....: . :..: . :.. . .: .. :. CCDS13 NWSEIEAAGFCVNKCVKAIQGI-KDLHAYQMAKSNSGFMAMVKNFVAKRHIPFWTARGVQ 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 RVVEGPAQAMSRGTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLEGAKSESAEELKKRAQELE :. :: . ::. :. ..::: .:.::. :. :. ::: .::..:.::::. :..:: CCDS13 RAFEGTTLAMTNGAWVMGAAGAGFLLMKDMSSFLQSWKHLEDGARTETAEELRALAKKLE 280 290 300 310 320 330 320 330 pF1KE6 GKLNFLTKIHEMLQPGQDQ .:. ::. :. : .: CCDS13 QELDRLTQHHRHLPQKASQTCSSSRGRAVRGSRVVKPEGSRSPLPWPVVEHQPRLGPGVA 340 350 360 370 380 390 337 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:04:52 2016 done: Tue Nov 8 12:04:52 2016 Total Scan time: 1.770 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]