Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2705
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2705, 400 aa
  1>>>pF1KE2705     400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7305+/-0.00121; mu= 1.3797+/- 0.072
 mean_var=200.0291+/-39.774, 0's: 0 Z-trim(108.4): 90  B-trim: 67 in 1/50
 Lambda= 0.090683
 statistics sampled from 10077 (10167) to 10077 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.312), width:  16
 Scan time:  2.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17         ( 400) 2520 342.5 4.2e-94
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17         ( 432) 1638 227.1 2.4e-59
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17         ( 472) 1586 220.3 2.9e-57
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17         ( 473) 1573 218.6 9.5e-57
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17         ( 456) 1562 217.2 2.5e-56
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 458) 1524 212.2 7.9e-55
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 420) 1523 212.0 8.1e-55
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17         ( 584) 1422 198.9   1e-50
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17         ( 494) 1420 198.6   1e-50
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17       ( 525) 1322 185.8 7.9e-47
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17         ( 467) 1309 184.1 2.4e-46
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17         ( 455) 1242 175.3   1e-43
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17          ( 623) 1229 173.7 4.2e-43
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17       ( 450) 1219 172.3   8e-43
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17       ( 459) 1217 172.0 9.7e-43
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17       ( 464) 1208 170.9 2.2e-42
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17         ( 448) 1207 170.7 2.4e-42
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17        ( 404) 1174 166.4 4.3e-41
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17         ( 416) 1174 166.4 4.5e-41
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17        ( 404) 1173 166.2 4.8e-41
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17        ( 424) 1168 165.6 7.8e-41
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17         ( 436) 1157 164.2 2.2e-40
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17       ( 468) 1156 164.1 2.5e-40
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12         ( 430) 1113 158.4 1.2e-38
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 422) 1060 151.5 1.4e-36
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17       ( 431) 1052 150.4 2.9e-36
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17       ( 491) 1027 147.2 3.1e-35
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17         ( 456) 1024 146.8 3.9e-35
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17         ( 449) 1000 143.6 3.4e-34
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 285)  700 104.3 1.5e-22
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2            ( 470)  644 97.1 3.7e-20
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8            ( 916)  648 97.8 4.3e-20
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10            ( 466)  634 95.8   9e-20
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 431)  628 95.0 1.5e-19
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 432)  628 95.0 1.5e-19
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 438)  628 95.0 1.5e-19
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10            ( 499)  624 94.5 2.4e-19
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8           ( 543)  624 94.5 2.5e-19
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12           ( 469)  586 89.5   7e-18
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3          ( 415)  575 88.0 1.7e-17
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12           ( 483)  571 87.5 2.8e-17
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12          ( 511)  571 87.6 2.9e-17
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12         ( 638)  570 87.5 3.8e-17
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12          ( 600)  565 86.8 5.7e-17
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12          ( 551)  563 86.5 6.4e-17
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22          (1020)  558 86.1 1.6e-16
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12         ( 564)  549 84.7 2.3e-16
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12           ( 470)  545 84.1 2.9e-16
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12          ( 493)  545 84.1   3e-16
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12        ( 564)  546 84.3 3.1e-16


>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17              (400 aa)
 initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520  Z-score: 1802.9  bits: 342.5 E(32554): 4.2e-94
Smith-Waterman score: 2520; 99.8% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400
pF1KE2 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
              370       380       390       400

>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17              (432 aa)
 initn: 1691 init1: 1588 opt: 1638  Z-score: 1178.8  bits: 227.1 E(32554): 2.4e-59
Smith-Waterman score: 1638; 66.7% identity (87.6% similar) in 396 aa overlap (1-390:1-394)

               10           20        30          40         50    
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGSVRFGPGVA--FRAPSIHGGS-GGRGVSVSSARFVS
       ::. : :: ...::.   .:::::: : .  ..  . : : . :: :: : ..... . :
CCDS11 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSY-S
                10        20        30        40        50         

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE2 SSSSGGYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRD
       :  : : :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: ::::::::
CCDS11 SCYSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRD
       60        70        80        90       100       110        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE2 WYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
       :::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.::::::::::::::::::::::
CCDS11 WYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE2 LRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVS
       ::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::...
CCDS11 LRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEIN
      180       190       200       210       220       230        

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE2 VEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRS
       ::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..:
CCDS11 VEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKS
      240       250       260       270       280       290        

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE2 EVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRA
       :...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...: 
CCDS11 EISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRC
      300       310       320       330       340       350        

          360       370       380       390       400              
pF1KE2 DSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL              
       . :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :                        
CCDS11 EMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDG
      360       370       380       390       400       410        

CCDS11 KVISSREQVHQTTR
      420       430  

>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17              (472 aa)
 initn: 1773 init1: 1522 opt: 1586  Z-score: 1141.5  bits: 220.3 E(32554): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 1592; 61.6% identity (81.2% similar) in 432 aa overlap (7-398:6-430)

               10               20           30        40        50
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSA
             :: ...::.       ::.:::: :..    : . :::: .::    :.::::.
CCDS11  MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGG----GLSVSSS
                10        20        30        40            50     

                                     60                70        80
pF1KE2 RF---------------VSSSSS-------GGYGGG--------YGGVLTASDGLLAGNE
       ::                :::::       ::::::        .:: ....::::.:.:
CCDS11 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSE
          60        70        80        90       100       110     

               90       100       110       120       130       140
pF1KE2 KLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDK
       :.:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :.  .::: :. ::.:::.:
CCDS11 KVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNK
         120       130       140       150       160       170     

              150       160       170       180       190       200
pF1KE2 ILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDL
       :: ::..:. ..::::::::::::::::.:::  :::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 ILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADL
         180       190       200       210       220       230     

              210       220       230       240       250       260
pF1KE2 EMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMA
       :::::.:::::::::::::::...:::::::.:.::.:.:::.::..::..::.::: ::
CCDS11 EMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMA
         240       250       260       270       280       290     

              270       280       290       300       310       320
pF1KE2 EQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAAL
       :.:::::: :: ..::::::::: ..: .: ..::...::::.:.:::::::::::::.:
CCDS11 EKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASL
         300       310       320       330       340       350     

              330       340       350       360       370       380
pF1KE2 EDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATY
       :..: ::..:.  :::.:: .:...: ::...: . :.:::::. :.:.:.:::::::::
CCDS11 ENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATY
         360       370       380       390       400       410     

              390       400                                        
pF1KE2 RSLLEGQEDHYNNLSASKVL                                        
       : ::::.. :   ::.:.                                          
CCDS11 RRLLEGEDAH---LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
         420          430       440       450       460       470  

>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17              (473 aa)
 initn: 1544 init1: 1544 opt: 1573  Z-score: 1132.3  bits: 218.6 E(32554): 9.5e-57
Smith-Waterman score: 1595; 60.8% identity (82.1% similar) in 429 aa overlap (7-397:6-434)

               10               20           30        40          
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGS----------
             :: ...::.       ::.:::: :..    : . :::: .::.          
CCDS11  MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSG
                10        20        30        40        50         

                     50        60                    70        80  
pF1KE2 ------GGRGVSVSSARFVSSSSSGGYGGG------------YGGVLTASDGLLAGNEKL
             :: : . ::.   .:. .::::::            .:: ....::::.:.::.
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
      60        70        80        90       100       110         

             90       100       110       120       130       140  
pF1KE2 TMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKIL
       :::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :.  .::: :. ::.:::.::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
     120       130       140       150       160       170         

            150       160       170       180       190       200  
pF1KE2 GATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEM
       .:::::.. .::::::::::::::::.: : :::..::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
     180       190       200       210       220       230         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KE2 QIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQ
       ::::::::::::.::::::. .::::.::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.
CCDS11 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
     240       250       260       270       280       290         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE2 NRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALED
       ::.:::.:: :.:::::.:::...: .: ::::::.:::.::::::::::::::::.::.
CCDS11 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
     300       310       320       330       340       350         

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE2 TLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRS
       .: ::..:.  ::..::.::...: ::...: . :.:.:::: :.:.:.:::::::::: 
CCDS11 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
     360       370       380       390       400       410         

            390       400                                    
pF1KE2 LLEGQEDHYNNLSASKVL                                    
       ::::.. : .. .::                                       
CCDS11 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
     420       430       440       450       460       470   

>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17              (456 aa)
 initn: 1500 init1: 1227 opt: 1562  Z-score: 1124.7  bits: 217.2 E(32554): 2.5e-56
Smith-Waterman score: 1622; 63.5% identity (85.4% similar) in 417 aa overlap (1-388:1-414)

               10          20        30        40        50        
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS
       ::. .. :.: .:.::: .  :::.  : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
CCDS11 MTT-TFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG
                 10        20         30        40        50       

       60                                 70         80        90  
pF1KE2 GGYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
       ::::::                         .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
CCDS11 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA
        60        70        80        90       100       110       

            100       110       120        130       140       150 
pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
       :::::::::: ::..:::::.:::::: : .:  :::.:. ::..:::::...::.:::.
CCDS11 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV
       120       130       140       150       160       170       

             160       170       180       190       200       210 
pF1KE2 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
       .:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL
       180       190       200       210       220       230       

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE2 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
       ::::::::::.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.::.:.::::
CCDS11 AYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWF
       240       250       260       270       280       290       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE2 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
        :.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..::::: :.
CCDS11 FSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRY
       300       310       320       330       340       350       

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE2 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
       ..:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::::::.   
CCDS11 ATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM
       360       370       380       390       400       410       

             400                              
pF1KE2 NNLSASKVL                              
                                              
CCDS11 AGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
       420       430       440       450      

>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (458 aa)
 initn: 1495 init1: 1201 opt: 1524  Z-score: 1097.8  bits: 212.2 E(32554): 7.9e-55
Smith-Waterman score: 1540; 61.7% identity (82.3% similar) in 418 aa overlap (8-397:6-422)

               10        20        30           40         50      
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS
              :::..:  ::.:::: ..: : .  . :   . ::: :: : .:: . : ...
CCDS11   MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA
                 10        20        30        40        50        

                60        70                        80        90   
pF1KE2 SSG-------GYGGGYGGVLT---------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLAS
       .::       : :::::: :                : :: ::.::::.:::::::::::
CCDS11 GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLAS
        60        70        80        90       100       110       

           100       110       120        130       140       150  
pF1KE2 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIV
       ::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:..
CCDS11 YLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVI
       120       130       140       150       160       170       

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA
       :.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.::::
CCDS11 LEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELA
       180       190       200       210       220       230       

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT
       :.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: :: 
CCDS11 YMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFH
       240       250       260       270       280       290       

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE2 SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFG
       ... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :..
CCDS11 TKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYA
       300       310       320       330       340       350       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN
        :: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::. .. 
CCDS11 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMI
       360       370       380       390       400       410       

            400                                 
pF1KE2 NLSASKVL                                 
       .. .:                                    
CCDS11 GFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
       420       430       440       450        

>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (420 aa)
 initn: 1495 init1: 1201 opt: 1523  Z-score: 1097.7  bits: 212.0 E(32554): 8.1e-55
Smith-Waterman score: 1539; 62.8% identity (82.6% similar) in 409 aa overlap (8-388:6-413)

               10        20        30           40         50      
pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS
              :::..:  ::.:::: ..: : .  . :   . ::: :: : .:: . : ...
CCDS11   MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA
                 10        20        30        40        50        

                60        70                        80        90   
pF1KE2 SSG-------GYGGGYGGVLT---------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLAS
       .::       : :::::: :                : :: ::.::::.:::::::::::
CCDS11 GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLAS
        60        70        80        90       100       110       

           100       110       120        130       140       150  
pF1KE2 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIV
       ::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:..
CCDS11 YLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVI
       120       130       140       150       160       170       

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA
       :.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.::::
CCDS11 LEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELA
       180       190       200       210       220       230       

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT
       :.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: :: 
CCDS11 YMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFH
       240       250       260       270       280       290       

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE2 SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFG
       ... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :..
CCDS11 TKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYA
       300       310       320       330       340       350       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN
        :: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::.    
CCDS11 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKKR
       360       370       380       390       400       410       

            400
pF1KE2 NLSASKVL
               
CCDS11 QPP     
       420     

>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17              (584 aa)
 initn: 1469 init1: 1088 opt: 1422  Z-score: 1024.2  bits: 198.9 E(32554): 1e-50
Smith-Waterman score: 1432; 60.7% identity (82.9% similar) in 387 aa overlap (5-387:84-456)

                                         10        20        30    
pF1KE2                           MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAP
                                     :.: : ..:::::  ::   :: : .: . 
CCDS11 GGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGI--FGGG-SFGGG
            60        70        80        90       100          110

           40         50        60        70        80        90   
pF1KE2 SIHGGS-GGRGVSVSSARFVSSSSSGGYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLAS
       :. ::: :: : .           .::.:::.:: . .. :::.::::.:::::::::::
CCDS11 SFGGGSFGGGGFG-----------GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLAS
              120                  130       140       150         

           100       110       120          130       140       150
pF1KE2 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG---PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSR
       ::::::::: .: ::: ::..::.:.:    :  ::::.:: ::.::...::. : .:. 
CCDS11 YLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNAN
     160       170       180       190       200       210         

              160       170       180       190       200       210
pF1KE2 IVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEE
       :.:::::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::...:::::::.: ::
CCDS11 ILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEE
     220       230       240       250       260       270         

              220       230       240       250       260       270
pF1KE2 LAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAW
       :::::::::::.. ::.   :.:.::...:::.::...:..:::::: .:::::::::::
CCDS11 LAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAW
     280       290       300       310       320       330         

              280       290       300       310       320       330
pF1KE2 FTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEAR
       :. ...::. :. .. ::..  .::.:.:::..:.:::::::::..: .:: .:::::.:
CCDS11 FNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGR
     340       350       360       370       380       390         

              340       350       360       370       380       390
pF1KE2 FGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDH
       . .::..::: ::..: :: ..::..: :: :::.:.::: :::.:: ::::::::.   
CCDS11 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSS
     400       410       420       430       440       450         

              400                                                  
pF1KE2 YNNLSASKVL                                                  
                                                                   
CCDS11 GGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSS
     460       470       480       490       500       510         

>>CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17              (494 aa)
 initn: 1364 init1: 1119 opt: 1420  Z-score: 1023.8  bits: 198.6 E(32554): 1e-50
Smith-Waterman score: 1437; 58.9% identity (81.5% similar) in 406 aa overlap (7-387:31-436)

                                       10        20          30    
pF1KE2                         MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGP--GVAFRAP
                                     :  ::.:  .: ::..  ::   : .: : 
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAA
               10        20        30        40        50        60

           40            50              60                70      
pF1KE2 SIHGGS----GGRGVSVSSA------RFVSSSSSGGYGGGYGG--------VLTASDG-L
       :. :.:    :: : :....      : ....: :: : :.::        .:...:: :
CCDS11 SMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGILSGNDGGL
               70        80        90       100       110       120

          80        90       100       110       120           130 
pF1KE2 LAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPS----RDYSHYY
       :.:.:: :::::::::::::::::::: :: ::: :::.::. .: : .     :::.::
CCDS11 LSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYY
              130       140       150       160       170       180

             140       150       160       170       180       190 
pF1KE2 TTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLD
         :.:::.::..:.: :....::::::::::.::: :.:.: :::..:::::::::::::
CCDS11 PLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLD
              190       200       210       220       230       240

             200       210       220       230       240       250 
pF1KE2 ELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSD
       ::::.:::::::::.:.:::::.:::::.:....:    :.::::.:.:::.::...:.:
CCDS11 ELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLND
              250       260       270       280       290       300

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE2 MRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQ
       ::.:::..::::::::::::  .. :: .:.. .::::: :.::::::::..:.::::::
CCDS11 MRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQ
              310       320       330       340       350       360

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE2 SQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKS
       :::.:: .:::.:::.:. . :::...: :::..:::: .::::.:::: ..:::...:.
CCDS11 SQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKA
              370       380       390       400       410       420

             380       390       400                               
pF1KE2 RLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL                               
       ::: :: ::: ::.:.                                            
CCDS11 RLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVNG
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17            (525 aa)
 initn: 1239 init1: 1003 opt: 1322  Z-score: 954.2  bits: 185.8 E(32554): 7.9e-47
Smith-Waterman score: 1324; 56.4% identity (83.6% similar) in 383 aa overlap (16-387:75-452)

                              10        20        30         40    
pF1KE2                MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGG-SG-GR
                                     ::.::.:   : :..: . :  :: :: ::
CCDS11 GGASSCSLSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGAS---GSGTGFGGGSSFGGVSGFGR
           50        60        70        80           90       100 

             50        60           70        80        90         
pF1KE2 GVSV-SSARFVSSSSSGG---YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVR
       : .  .:.:: ::...::   ::::.:: . .. ::..:.:: ::::::::::.::::::
CCDS11 GSGFCGSSRF-SSGATGGFYSYGGGMGGGV-GDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVR
             110        120       130        140       150         

     100       110       120            130       140       150    
pF1KE2 ALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPS-----RDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQ
       ::: :: .:: ::..::.: ::: .     ::::.::. :.:::..:..::.::. :.:.
CCDS11 ALEEANTDLENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILH
     160       170       180       190       200       210         

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE2 IDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYL
       :::::::::::: :.:.:  ::.::::::::::.:::.::..:.:::::::.. ::::::
CCDS11 IDNARLAADDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYL
     220       230       240       250       260       270         

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE2 KKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSR
       .::::::.....:. ::.:.::...::::::.:.:.:::.::: .:::::..::  :...
CCDS11 RKNHEEEMKNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQ
     280       290       300       310       320       330         

          280       290       300       310       320       330    
pF1KE2 TEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQ
       .  :. ...  .     ...:.:.:.::::.:::::::::.::..:: :::.::: . ::
CCDS11 SASLQAQISTDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQ
     340       350       360       370       380       390         

          340       350       360       370       380       390    
pF1KE2 LAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNL
       :..::. ::..: .. .. .... :: ::..:.:::.::: :: ::: ::.:.       
CCDS11 LSEIQTQISALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFA
     400       410       420       430       440       450         

          400                                                      
pF1KE2 SASKVL                                                      
                                                                   
CCDS11 EFGGRNSGSVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSI
     460       470       480       490       500       510         




400 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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