Result of FASTA (ccds) for pFN21AB0443
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0443, 372 aa
  1>>>pF1KB0443 372 - 372 aa - 372 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5125+/-0.00149; mu= 0.0701+/- 0.084
 mean_var=290.3789+/-68.044, 0's: 0 Z-trim(106.2): 577  B-trim: 88 in 1/46
 Lambda= 0.075265
 statistics sampled from 8158 (8874) to 8158 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.273), width:  16
 Scan time:  2.290

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9            ( 372) 2490 284.7   9e-77
CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17        (1481)  979 121.3 5.4e-27
CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17        (1490)  979 121.3 5.4e-27
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7           (1452)  976 121.0 6.7e-27
CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7           (1512)  976 121.0 6.8e-27
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 360)  790 100.1 3.3e-21
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 272)  652 84.9 8.9e-17
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          ( 960)  614 81.5 3.5e-15
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          (1030)  614 81.5 3.6e-15
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7            ( 326)  600 79.4   5e-15
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17         ( 816)  600 79.9   9e-15
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 423)  578 77.1 3.1e-14
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7           ( 451)  578 77.2 3.2e-14
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 469)  578 77.2 3.3e-14
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2          ( 384)  576 76.9 3.4e-14
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 400)  576 76.9 3.5e-14
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 429)  576 76.9 3.6e-14
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12           ( 303)  572 76.3 3.9e-14
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 340)  571 76.3 4.5e-14
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9         ( 346)  568 75.9 5.8e-14
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 770)  574 77.0 6.1e-14
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 779)  574 77.0 6.2e-14
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 780)  574 77.0 6.2e-14
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 783)  574 77.0 6.2e-14
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 748)  570 76.6 8.1e-14
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 782)  570 76.6 8.4e-14
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 795)  570 76.6 8.4e-14
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 357)  556 74.7 1.4e-13
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 496)  558 75.0 1.5e-13
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 502)  558 75.1 1.6e-13
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 379)  555 74.6 1.6e-13
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 570)  558 75.1 1.7e-13
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22         ( 360)  550 74.0 2.3e-13
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  549 73.9 2.4e-13
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10           ( 297)  535 72.3 6.3e-13
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12          ( 523)  535 72.6   9e-13
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8        ( 544)  535 72.6 9.2e-13
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12         ( 523)  533 72.4   1e-12
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305)  521 70.8 1.8e-12
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15         ( 721)  528 72.0 1.9e-12
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1          ( 474)  524 71.3 1.9e-12
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1           ( 504)  524 71.4   2e-12
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18         ( 587)  522 71.2 2.6e-12
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5           ( 253)  507 69.2 4.6e-12
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17          ( 527)  495 68.2 1.8e-11


>>CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9                 (372 aa)
 initn: 2490 init1: 2490 opt: 2490  Z-score: 1491.7  bits: 284.7 E(32554): 9e-77
Smith-Waterman score: 2490; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 AQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 AQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNP
              310       320       330       340       350       360

              370  
pF1KB0 ATTNQTEFERVF
       ::::::::::::
CCDS68 ATTNQTEFERVF
              370  

>>CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17             (1481 aa)
 initn: 695 init1: 345 opt: 979  Z-score: 598.1  bits: 121.3 E(32554): 5.4e-27
Smith-Waterman score: 979; 43.7% identity (72.1% similar) in 366 aa overlap (16-371:724-1079)

                              10        20        30        40     
pF1KB0                MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV
                                     :.:.. .. ::.::.:.:.::. . ::. :
CCDS45 PQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELV
           700       710       720       730       740       750   

          50        60        70        80          90       100   
pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF
       ::::: ..::::::::::.::::::. : :..:::. ::   :  :  ... ::..::::
CCDS45 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVF
           760       770       780       790       800       810   

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL
       .. .::: ::: . ::.:. ..::  :..:..:: : :....::::.: .:.:.. .: .
CCDS45 EYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQI
           820       830       840       850       860       870   

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW
       ::::::::: .. ...:.:  :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:..
CCDS45 KLADFGLARLYN-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF
           880        890         900       910       920       930

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV
       :..::.:.: :  :: :::.::::  : :::.: .   .. ..  :  .:...... ...
CCDS45 TKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEF-SFI
              940       950       960       970       980          

           290       300       310           320       330         
pF1KB0 RDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFF----WSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYL
           ::::.:..:.:::..:  ....:. ::.     :   : ::    . :     :  
CCDS45 -PSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCH-----ELW
      990      1000      1010      1020      1030      1040        

     340           350       360       370                         
pF1KB0 APPRRKGSQ----ITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF                       
       .  ::.  :    . .   ...    ::. :  : :                        
CCDS45 SKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIG
          1050      1060      1070      1080      1090      1100   

CCDS45 LADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEA
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

>>CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17             (1490 aa)
 initn: 695 init1: 345 opt: 979  Z-score: 598.1  bits: 121.3 E(32554): 5.4e-27
Smith-Waterman score: 979; 43.7% identity (72.1% similar) in 366 aa overlap (16-371:724-1079)

                              10        20        30        40     
pF1KB0                MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV
                                     :.:.. .. ::.::.:.:.::. . ::. :
CCDS11 PQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELV
           700       710       720       730       740       750   

          50        60        70        80          90       100   
pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF
       ::::: ..::::::::::.::::::. : :..:::. ::   :  :  ... ::..::::
CCDS11 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVF
           760       770       780       790       800       810   

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL
       .. .::: ::: . ::.:. ..::  :..:..:: : :....::::.: .:.:.. .: .
CCDS11 EYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQI
           820       830       840       850       860       870   

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW
       ::::::::: .. ...:.:  :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:..
CCDS11 KLADFGLARLYN-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF
           880        890         900       910       920       930

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pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV
       :..::.:.: :  :: :::.::::  : :::.: .   .. ..  :  .:...... ...
CCDS11 TKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEF-SFI
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pF1KB0 RDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFF----WSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYL
           ::::.:..:.:::..:  ....:. ::.     :   : ::    . :     :  
CCDS11 -PSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCH-----ELW
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pF1KB0 APPRRKGSQ----ITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF                       
       .  ::.  :    . .   ...    ::. :  : :                        
CCDS11 SKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIG
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CCDS11 LADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEA
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

>>CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7                (1452 aa)
 initn: 961 init1: 361 opt: 976  Z-score: 596.5  bits: 121.0 E(32554): 6.7e-27
Smith-Waterman score: 976; 46.0% identity (74.5% similar) in 337 aa overlap (16-349:702-1031)

                              10        20        30        40     
pF1KB0                MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV
                                     :.:.. .. ::.::.:.:.::: . ::. :
CCDS54 TQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMV
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pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF
       ::::: ..::::::::::.::::::. : :....:. ::   :  :  ... ::..::::
CCDS54 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVF
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pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL
       .. .::: ::: . ::.:. ..::  :..:..:: : :....::::.: .:.:..  : .
CCDS54 EYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQI
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pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW
       ::::::::: .: ...:.:  :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:..
CCDS54 KLADFGLARLYS-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF
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pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV
       :..::.:.: :  :: :::..:::  : :::.: .   .. ..  :  .::....   .:
CCDS54 TKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FV
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pF1KB0 RDPYA-LDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPP
         : : :::.: .:.:::..:  ...::. .:.  :  :: .         .  :  .  
CCDS54 FIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKK
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pF1KB0 RRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF                              
       ::. .:.                                                     
CCDS54 RRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTD
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>>CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7                (1512 aa)
 initn: 961 init1: 361 opt: 976  Z-score: 596.3  bits: 121.0 E(32554): 6.8e-27
Smith-Waterman score: 976; 46.0% identity (74.5% similar) in 337 aa overlap (16-349:702-1031)

                              10        20        30        40     
pF1KB0                MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV
                                     :.:.. .. ::.::.:.:.::: . ::. :
CCDS54 TQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMV
             680       690       700       710       720       730 

          50        60        70        80          90       100   
pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF
       ::::: ..::::::::::.::::::. : :....:. ::   :  :  ... ::..::::
CCDS54 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVF
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pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL
       .. .::: ::: . ::.:. ..::  :..:..:: : :....::::.: .:.:..  : .
CCDS54 EYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQI
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pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW
       ::::::::: .: ...:.:  :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:..
CCDS54 KLADFGLARLYS-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF
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           230       240       250       260       270       280   
pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV
       :..::.:.: :  :: :::..:::  : :::.: .   .. ..  :  .::....   .:
CCDS54 TKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FV
      910       920       930       940       950       960        

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB0 RDPYA-LDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPP
         : : :::.: .:.:::..:  ...::. .:.  :  :: .         .  :  .  
CCDS54 FIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKK
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pF1KB0 RRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF                              
       ::. .:.                                                     
CCDS54 RRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVKTGPG
         1030      1040      1050      1060      1070      1080    

>>CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16              (360 aa)
 initn: 748 init1: 271 opt: 790  Z-score: 494.3  bits: 100.1 E(32554): 3.3e-21
Smith-Waterman score: 790; 40.8% identity (69.1% similar) in 311 aa overlap (13-323:33-331)

                                 10        20        30        40  
pF1KB0                   MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTG
                                     :  :...::: .::.::.: :..::  .: 
CCDS10 EPDLECEQIRLKCIRKEGFFTVPPEHRLGRCRSVKEFEKLNRIGEGTYGIVYRARDTQTD
             10        20        30        40        50        60  

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB0 QKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLV
       . :::::: :..::.:.::..:::: .:  :.: :.:.: :.        :. . ::.::
CCDS10 EIVALKKVRMDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVG-----NHLE-SIFLV
             70        80        90       100            110       

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB0 FDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGV
       . .::.:::.:: :. . :. ...: .. ..: :: :.::: :.:::.:..:.:.:  : 
CCDS10 MGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIHRDLKVSNLLMTDKGC
        120       130       140       150       160       170      

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB0 LKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEM
       .: ::::::::...    .:  .: .::::::: ::::::       ::.:..:::.::.
CCDS10 VKTADFGLARAYGVP--VKP--MTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSIDMWAVGCILAEL
        180       190           200       210       220       230  

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB0 WTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAY
        .. :.. :..: ::. :: :: :. . ..::. ..  :  .  : :    ..: ..   
CCDS10 LAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQPYNNLKHKFPWL
            240       250       260       270       280       290  

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB0 VRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPP
         .  .: :.  :.. :: .:  . : :. ..:   :.: .                   
CCDS10 --SEAGLRLLHFLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFPHHRNKRAAPAT
              300       310       320       330       340       350

            350       360       370  
pF1KB0 RRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF
                                     
CCDS10 SEGQSKRCKP                    
              360                    

>>CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16              (272 aa)
 initn: 617 init1: 271 opt: 652  Z-score: 414.7  bits: 84.9 E(32554): 8.9e-17
Smith-Waterman score: 652; 38.8% identity (68.5% similar) in 276 aa overlap (52-327:1-264)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB0 LAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNL
                                     :..::.:.::..:::: .:  :.: :.:.:
CCDS32                               MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL
                                             10        20        30

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB0 IEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIH
        :.        :. . ::.::. .::.:::.:: :. . :. ...: .. ..: :: :.:
CCDS32 KEVVVG-----NHLE-SIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLH
                    40         50        60        70        80    

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB0 RNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLL
       :: :.:::.:..:.:.:  : .: ::::::::...    .:  .: .::::::: :::::
CCDS32 RNFIIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVP--VKP--MTPKVVTLWYRAPELLL
           90       100       110       120           130       140

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB0 GERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYEL
       :       ::.:..:::.::. .. :.. :..: ::. :: :: :. . ..::. ..  :
CCDS32 GTTTQTTSIDMWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPL
              150       160       170       180       190       200

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB0 YEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMP
         .  : :    ..: ..  .. .  .: :.  :.. :: .:  . : :. ..:   :. 
CCDS32 VGQYSLRKQPYNNLKHKFP-WLSEA-GLRLLHFLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLR
              210        220        230       240       250        

             330       340       350       360       370  
pF1KB0 SDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF
         ..:.                                             
CCDS32 LPISGVCEGCREPG                                     
      260       270                                       

>>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX               (960 aa)
 initn: 434 init1: 217 opt: 614  Z-score: 386.1  bits: 81.5 E(32554): 3.5e-15
Smith-Waterman score: 614; 33.4% identity (61.8% similar) in 353 aa overlap (16-364:10-348)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP
                      ..:.: :. .:.:..: :.: ::..: . ::.::    .:.:   
CCDS83       MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVK
                     10        20        30        40        50    

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pF1KB0 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK
        :.:::.:.:. ::.::.:.: :  : .        :..::::.. :...  :: ..   
CCDS83 ETTLRELKMLRTLKQENIVELKEAFRRR--------GKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNG
           60        70        80                90       100      

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pF1KB0 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS
           ..:  . .:...... :.: :.:::.:  :.::... :::: :::.:: .: ..:.
CCDS83 VPPEKVKSYIYQLIKAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNA
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KB0 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL
       .   ::. :.: ::: ::::::   ::  .:.:..:::..:.   .:.. :..:  ::  
CCDS83 N---YTEYVATRWYRSPELLLGA-PYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFT
           170       180        190       200       210       220  

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pF1KB0 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP
       :... : .  :      .   .. :..   .. .  .:    . .   :::. .:: :::
CCDS83 IQKVLGPLPSEQMKLFYSNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDP
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pF1KB0 AQRIDSDDALNHDFFWS----DPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQ
       :.:  ... :::  : .    :  ::        :. :    :.   . :.. . :: ..
CCDS83 ADRYLTEQCLNHPTFQTQRLLDRSPSRSAKRKPYHVES--STLSNRNQAGKSTALQSHHR
            290       300       310       320         330       340

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pF1KB0 SRNPATTNQTEFERVF                                            
       : .    :                                                    
CCDS83 SNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNN
              350       360       370       380       390       400

>>CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX               (1030 aa)
 initn: 434 init1: 217 opt: 614  Z-score: 385.8  bits: 81.5 E(32554): 3.6e-15
Smith-Waterman score: 614; 33.4% identity (61.8% similar) in 353 aa overlap (16-364:10-348)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP
                      ..:.: :. .:.:..: :.: ::..: . ::.::    .:.:   
CCDS14       MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVK
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK
        :.:::.:.:. ::.::.:.: :  : .        :..::::.. :...  :: ..   
CCDS14 ETTLRELKMLRTLKQENIVELKEAFRRR--------GKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNG
           60        70        80                90       100      

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pF1KB0 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS
           ..:  . .:...... :.: :.:::.:  :.::... :::: :::.:: .: ..:.
CCDS14 VPPEKVKSYIYQLIKAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNA
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KB0 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL
       .   ::. :.: ::: ::::::   ::  .:.:..:::..:.   .:.. :..:  ::  
CCDS14 N---YTEYVATRWYRSPELLLGA-PYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFT
           170       180        190       200       210       220  

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pF1KB0 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP
       :... : .  :      .   .. :..   .. .  .:    . .   :::. .:: :::
CCDS14 IQKVLGPLPSEQMKLFYSNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDP
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pF1KB0 AQRIDSDDALNHDFFWS----DPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQ
       :.:  ... :::  : .    :  ::        :. :    :.   . :.. . :: ..
CCDS14 ADRYLTEQCLNHPTFQTQRLLDRSPSRSAKRKPYHVES--STLSNRNQAGKSTALQSHHR
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pF1KB0 SRNPATTNQTEFERVF                                            
       : .    :                                                    
CCDS14 SNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNN
              350       360       370       380       390       400

>>CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7                 (326 aa)
 initn: 497 init1: 185 opt: 600  Z-score: 383.3  bits: 79.4 E(32554): 5e-15
Smith-Waterman score: 648; 38.3% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (12-315:6-300)

               10        20        30        40         50         
pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQK-VALKKVLMENEKEGF
                  .:   ..:: .:.::.:..:.:::::  :.: . ::::.: ... .::.
CCDS56       MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGM
                     10        20        30        40        50    

      60        70           80        90       100       110      
pF1KB0 PITALREIKILQLLK---HENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSN
       :....::. .:. :.   : ::: :...: .  :  .: . .. :::.  ..::.  :..
CCDS56 PLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTV--SRTDR-ETKLTLVFEHVDQDLTTYLDK
           60        70        80          90        100       110 

        120        130       140       150       160       170     
pF1KB0 VLVKFTLSE-IKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFS
       :    . .: :: .: .:: :: ..: ....:::.:  :.:.: .: .::::::::: .:
CCDS56 VPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYS
             120       130       140       150       160       170 

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB0 LAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQ
       .         :. ::::::: ::.:: . .:. :.:::..:::.:::. :.:...:... 
CCDS56 FQMA-----LTSVVVTLWYRAPEVLL-QSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDV
                  180       190        200       210       220     

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pF1KB0 HQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYAL--DLID
        ::. : .. :    : ::   .  : ..     . . :  . .. .: :   :  ::. 
CCDS56 DQLGKILDVIGLPGEEDWPR--DVALPRQ-----AFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLL
         230       240         250            260       270        

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB0 KLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQS
       : :...::.::.. .::.: .:                                      
CCDS56 KCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA            
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372 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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