FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0443, 372 aa 1>>>pF1KB0443 372 - 372 aa - 372 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5125+/-0.00149; mu= 0.0701+/- 0.084 mean_var=290.3789+/-68.044, 0's: 0 Z-trim(106.2): 577 B-trim: 88 in 1/46 Lambda= 0.075265 statistics sampled from 8158 (8874) to 8158 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16 Scan time: 2.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 ( 372) 2490 284.7 9e-77 CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481) 979 121.3 5.4e-27 CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490) 979 121.3 5.4e-27 CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 976 121.0 6.7e-27 CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 976 121.0 6.8e-27 CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 790 100.1 3.3e-21 CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 652 84.9 8.9e-17 CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 614 81.5 3.5e-15 CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 614 81.5 3.6e-15 CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 600 79.4 5e-15 CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 600 79.9 9e-15 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 578 77.1 3.1e-14 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 578 77.2 3.2e-14 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 578 77.2 3.3e-14 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 576 76.9 3.4e-14 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 576 76.9 3.5e-14 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 576 76.9 3.6e-14 CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 572 76.3 3.9e-14 CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 571 76.3 4.5e-14 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 568 75.9 5.8e-14 CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 574 77.0 6.1e-14 CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 574 77.0 6.2e-14 CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 574 77.0 6.2e-14 CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 574 77.0 6.2e-14 CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 570 76.6 8.1e-14 CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 570 76.6 8.4e-14 CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 570 76.6 8.4e-14 CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 556 74.7 1.4e-13 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 558 75.0 1.5e-13 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 558 75.1 1.6e-13 CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 555 74.6 1.6e-13 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 558 75.1 1.7e-13 CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 550 74.0 2.3e-13 CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 549 73.9 2.4e-13 CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 535 72.3 6.3e-13 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 535 72.6 9e-13 CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 535 72.6 9.2e-13 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 533 72.4 1e-12 CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 521 70.8 1.8e-12 CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 528 72.0 1.9e-12 CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 524 71.3 1.9e-12 CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 524 71.4 2e-12 CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 587) 522 71.2 2.6e-12 CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 507 69.2 4.6e-12 CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 495 68.2 1.8e-11 >>CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 (372 aa) initn: 2490 init1: 2490 opt: 2490 Z-score: 1491.7 bits: 284.7 E(32554): 9e-77 Smith-Waterman score: 2490; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS68 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS68 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS68 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS68 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS68 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 AQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS68 AQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNP 310 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 ATTNQTEFERVF :::::::::::: CCDS68 ATTNQTEFERVF 370 >>CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481 aa) initn: 695 init1: 345 opt: 979 Z-score: 598.1 bits: 121.3 E(32554): 5.4e-27 Smith-Waterman score: 979; 43.7% identity (72.1% similar) in 366 aa overlap (16-371:724-1079) 10 20 30 40 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV :.:.. .. ::.::.:.:.::. . ::. : CCDS45 PQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELV 700 710 720 730 740 750 50 60 70 80 90 100 pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF ::::: ..::::::::::.::::::. : :..:::. :: : : ... ::..:::: CCDS45 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVF 760 770 780 790 800 810 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL .. .::: ::: . ::.:. ..:: :..:..:: : :....::::.: .:.:.. .: . CCDS45 EYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQI 820 830 840 850 860 870 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW ::::::::: .. ...:.: :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:.. CCDS45 KLADFGLARLYN-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF 880 890 900 910 920 930 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV :..::.:.: : :: :::.:::: : :::.: . .. .. : .:...... ... CCDS45 TKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEF-SFI 940 950 960 970 980 290 300 310 320 330 pF1KB0 RDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFF----WSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYL ::::.:..:.:::..: ....:. ::. : : :: . : : CCDS45 -PSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCH-----ELW 990 1000 1010 1020 1030 1040 340 350 360 370 pF1KB0 APPRRKGSQ----ITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF . ::. : . . ... ::. : : : CCDS45 SKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIG 1050 1060 1070 1080 1090 1100 CCDS45 LADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEA 1110 1120 1130 1140 1150 1160 >>CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490 aa) initn: 695 init1: 345 opt: 979 Z-score: 598.1 bits: 121.3 E(32554): 5.4e-27 Smith-Waterman score: 979; 43.7% identity (72.1% similar) in 366 aa overlap (16-371:724-1079) 10 20 30 40 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV :.:.. .. ::.::.:.:.::. . ::. : CCDS11 PQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELV 700 710 720 730 740 750 50 60 70 80 90 100 pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF ::::: ..::::::::::.::::::. : :..:::. :: : : ... ::..:::: CCDS11 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVF 760 770 780 790 800 810 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL .. .::: ::: . ::.:. ..:: :..:..:: : :....::::.: .:.:.. .: . CCDS11 EYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQI 820 830 840 850 860 870 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW ::::::::: .. ...:.: :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:.. CCDS11 KLADFGLARLYN-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF 880 890 900 910 920 930 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV :..::.:.: : :: :::.:::: : :::.: . .. .. : .:...... ... CCDS11 TKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEF-SFI 940 950 960 970 980 290 300 310 320 330 pF1KB0 RDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFF----WSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYL ::::.:..:.:::..: ....:. ::. : : :: . : : CCDS11 -PSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCH-----ELW 990 1000 1010 1020 1030 1040 340 350 360 370 pF1KB0 APPRRKGSQ----ITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF . ::. : . . ... ::. : : : CCDS11 SKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIG 1050 1060 1070 1080 1090 1100 CCDS11 LADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEA 1110 1120 1130 1140 1150 1160 >>CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452 aa) initn: 961 init1: 361 opt: 976 Z-score: 596.5 bits: 121.0 E(32554): 6.7e-27 Smith-Waterman score: 976; 46.0% identity (74.5% similar) in 337 aa overlap (16-349:702-1031) 10 20 30 40 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV :.:.. .. ::.::.:.:.::: . ::. : CCDS54 TQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMV 680 690 700 710 720 730 50 60 70 80 90 100 pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF ::::: ..::::::::::.::::::. : :....:. :: : : ... ::..:::: CCDS54 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVF 740 750 760 770 780 790 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL .. .::: ::: . ::.:. ..:: :..:..:: : :....::::.: .:.:.. : . CCDS54 EYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQI 800 810 820 830 840 850 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW ::::::::: .: ...:.: :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:.. CCDS54 KLADFGLARLYS-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF 860 870 880 890 900 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV :..::.:.: : :: :::..::: : :::.: . .. .. : .::.... .: CCDS54 TKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FV 910 920 930 940 950 960 290 300 310 320 330 340 pF1KB0 RDPYA-LDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPP : : :::.: .:.:::..: ...::. .:. : :: . . : . CCDS54 FIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKK 970 980 990 1000 1010 1020 350 360 370 pF1KB0 RRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF ::. .:. CCDS54 RRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTD 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >>CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512 aa) initn: 961 init1: 361 opt: 976 Z-score: 596.3 bits: 121.0 E(32554): 6.8e-27 Smith-Waterman score: 976; 46.0% identity (74.5% similar) in 337 aa overlap (16-349:702-1031) 10 20 30 40 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV :.:.. .. ::.::.:.:.::: . ::. : CCDS54 TQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGEMV 680 690 700 710 720 730 50 60 70 80 90 100 pF1KB0 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF ::::: ..::::::::::.::::::. : :....:. :: : : ... ::..:::: CCDS54 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYLVF 740 750 760 770 780 790 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL .. .::: ::: . ::.:. ..:: :..:..:: : :....::::.: .:.:.. : . CCDS54 EYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQI 800 810 820 830 840 850 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW ::::::::: .: ...:.: :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:.. CCDS54 KLADFGLARLYS-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF 860 870 880 890 900 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV :..::.:.: : :: :::..::: : :::.: . .. .. : .::.... .: CCDS54 TKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREE---FV 910 920 930 940 950 960 290 300 310 320 330 340 pF1KB0 RDPYA-LDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPP : : :::.: .:.:::..: ...::. .:. : :: . . : . CCDS54 FIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFL-RDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKK 970 980 990 1000 1010 1020 350 360 370 pF1KB0 RRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF ::. .:. CCDS54 RRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVKTGPG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >>CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 (360 aa) initn: 748 init1: 271 opt: 790 Z-score: 494.3 bits: 100.1 E(32554): 3.3e-21 Smith-Waterman score: 790; 40.8% identity (69.1% similar) in 311 aa overlap (13-323:33-331) 10 20 30 40 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTG : :...::: .::.::.: :..:: .: CCDS10 EPDLECEQIRLKCIRKEGFFTVPPEHRLGRCRSVKEFEKLNRIGEGTYGIVYRARDTQTD 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB0 QKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLV . :::::: :..::.:.::..:::: .: :.: :.:.: :. :. . ::.:: CCDS10 EIVALKKVRMDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVG-----NHLE-SIFLV 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 FDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGV . .::.:::.:: :. . :. ...: .. ..: :: :.::: :.:::.:..:.:.: : CCDS10 MGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIHRDLKVSNLLMTDKGC 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 LKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEM .: ::::::::... .: .: .::::::: :::::: ::.:..:::.::. CCDS10 VKTADFGLARAYGVP--VKP--MTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSIDMWAVGCILAEL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 WTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAY .. :.. :..: ::. :: :: :. . ..::. .. : . : : ..: .. CCDS10 LAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQPYNNLKHKFPWL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB0 VRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPP . .: :. :.. :: .: . : :. ..: :.: . CCDS10 --SEAGLRLLHFLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFPHHRNKRAAPAT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 pF1KB0 RRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF CCDS10 SEGQSKRCKP 360 >>CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 (272 aa) initn: 617 init1: 271 opt: 652 Z-score: 414.7 bits: 84.9 E(32554): 8.9e-17 Smith-Waterman score: 652; 38.8% identity (68.5% similar) in 276 aa overlap (52-327:1-264) 30 40 50 60 70 80 pF1KB0 LAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNL :..::.:.::..:::: .: :.: :.:.: CCDS32 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 IEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIH :. :. . ::.::. .::.:::.:: :. . :. ...: .. ..: :: :.: CCDS32 KEVVVG-----NHLE-SIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLH 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KB0 RNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLL :: :.:::.:..:.:.: : .: ::::::::... .: .: .::::::: ::::: CCDS32 RNFIIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVP--VKP--MTPKVVTLWYRAPELLL 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KB0 GERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYEL : ::.:..:::.::. .. :.. :..: ::. :: :: :. . ..::. .. : CCDS32 GTTTQTTSIDMWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPL 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KB0 YEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMP . : : ..: .. .. . .: :. :.. :: .: . : :. ..: :. CCDS32 VGQYSLRKQPYNNLKHKFP-WLSEA-GLRLLHFLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLR 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 pF1KB0 SDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF ..:. CCDS32 LPISGVCEGCREPG 260 270 >>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (960 aa) initn: 434 init1: 217 opt: 614 Z-score: 386.1 bits: 81.5 E(32554): 3.5e-15 Smith-Waterman score: 614; 33.4% identity (61.8% similar) in 353 aa overlap (16-364:10-348) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP ..:.: :. .:.:..: :.: ::..: . ::.:: .:.: CCDS83 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK :.:::.:.:. ::.::.:.: : : . :..::::.. :... :: .. CCDS83 ETTLRELKMLRTLKQENIVELKEAFRRR--------GKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNG 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS ..: . .:...... :.: :.:::.: :.::... :::: :::.:: .: ..:. CCDS83 VPPEKVKSYIYQLIKAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNA 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL . ::. :.: ::: :::::: :: .:.:..:::..:. .:.. :..: :: CCDS83 N---YTEYVATRWYRSPELLLGA-PYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFT 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP :... : . : . .. :.. .. . .: . . :::. .:: ::: CCDS83 IQKVLGPLPSEQMKLFYSNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDP 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KB0 AQRIDSDDALNHDFFWS----DPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQ :.: ... ::: : . : :: :. : :. . :.. . :: .. CCDS83 ADRYLTEQCLNHPTFQTQRLLDRSPSRSAKRKPYHVES--STLSNRNQAGKSTALQSHHR 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KB0 SRNPATTNQTEFERVF : . : CCDS83 SNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNN 350 360 370 380 390 400 >>CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030 aa) initn: 434 init1: 217 opt: 614 Z-score: 385.8 bits: 81.5 E(32554): 3.6e-15 Smith-Waterman score: 614; 33.4% identity (61.8% similar) in 353 aa overlap (16-364:10-348) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFP ..:.: :. .:.:..: :.: ::..: . ::.:: .:.: CCDS14 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 ITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVK :.:::.:.:. ::.::.:.: : : . :..::::.. :... :: .. CCDS14 ETTLRELKMLRTLKQENIVELKEAFRRR--------GKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNG 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 FTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNS ..: . .:...... :.: :.:::.: :.::... :::: :::.:: .: ..:. CCDS14 VPPEKVKSYIYQLIKAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNA 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 QPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLAL . ::. :.: ::: :::::: :: .:.:..:::..:. .:.. :..: :: CCDS14 N---YTEYVATRWYRSPELLLGA-PYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFT 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 ISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP :... : . : . .. :.. .. . .: . . :::. .:: ::: CCDS14 IQKVLGPLPSEQMKLFYSNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDP 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KB0 AQRIDSDDALNHDFFWS----DPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQSTNQ :.: ... ::: : . : :: :. : :. . :.. . :: .. CCDS14 ADRYLTEQCLNHPTFQTQRLLDRSPSRSAKRKPYHVES--STLSNRNQAGKSTALQSHHR 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KB0 SRNPATTNQTEFERVF : . : CCDS14 SNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNN 350 360 370 380 390 400 >>CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 (326 aa) initn: 497 init1: 185 opt: 600 Z-score: 383.3 bits: 79.4 E(32554): 5e-15 Smith-Waterman score: 648; 38.3% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (12-315:6-300) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQK-VALKKVLMENEKEGF .: ..:: .:.::.:..:.::::: :.: . ::::.: ... .::. CCDS56 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 PITALREIKILQLLK---HENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIYLVFDFCEHDLAGLLSN :....::. .:. :. : ::: :...: . : .: . .. :::. ..::. :.. CCDS56 PLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTV--SRTDR-ETKLTLVFEHVDQDLTTYLDK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 VLVKFTLSE-IKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFS : . .: :: .: .:: :: ..: ....:::.: :.:.: .: .::::::::: .: CCDS56 VPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 LAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQ . :. ::::::: ::.:: . .:. :.:::..:::.:::. :.:...:... CCDS56 FQMA-----LTSVVVTLWYRAPEVLL-QSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDV 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 HQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYAL--DLID ::. : .. : : :: . : .. . . : . .. .: : : ::. CCDS56 DQLGKILDVIGLPGEEDWPR--DVALPRQ-----AFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLL 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 KLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQITQQS : :...::.::.. .::.: .: CCDS56 KCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA 280 290 300 310 320 372 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 02:45:47 2016 done: Mon Nov 7 02:45:47 2016 Total Scan time: 2.290 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]