FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9615, 348 aa 1>>>pF1KE9615 348 - 348 aa - 348 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3697+/-0.000791; mu= 15.8866+/- 0.048 mean_var=64.4380+/-12.754, 0's: 0 Z-trim(107.8): 26 B-trim: 120 in 1/48 Lambda= 0.159773 statistics sampled from 9771 (9791) to 9771 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16 Scan time: 2.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1974.1 CAPG gene_id:822|Hs108|chr2 ( 348) 2346 549.3 1.7e-156 CCDS58715.1 CAPG gene_id:822|Hs108|chr2 ( 333) 1419 335.6 3.5e-92 CCDS47545.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 ( 715) 1186 282.1 9.9e-76 CCDS6829.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 731) 1168 277.9 1.8e-74 CCDS65118.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 739) 1168 277.9 1.8e-74 CCDS48011.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 742) 1168 277.9 1.8e-74 CCDS75891.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 748) 1168 277.9 1.8e-74 CCDS75890.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 767) 1168 277.9 1.9e-74 CCDS6828.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 782) 1168 277.9 1.9e-74 CCDS2417.1 VIL1 gene_id:7429|Hs108|chr2 ( 827) 905 217.3 3.5e-56 CCDS8959.1 AVIL gene_id:10677|Hs108|chr12 ( 819) 896 215.3 1.5e-55 CCDS2670.2 VILL gene_id:50853|Hs108|chr3 ( 856) 749 181.4 2.4e-45 CCDS58522.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1214) 436 109.3 1.7e-23 CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258) 436 109.3 1.8e-23 CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1269) 436 109.3 1.8e-23 CCDS47546.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 ( 468) 418 105.0 1.3e-22 >>CCDS1974.1 CAPG gene_id:822|Hs108|chr2 (348 aa) initn: 2346 init1: 2346 opt: 2346 Z-score: 2922.9 bits: 549.3 E(32554): 1.7e-156 Smith-Waterman score: 2346; 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CCDS47 CGSSCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 DLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDDCFVLDNGLCGKIYIWK :. :: .: . : :: ::::.:.: .: ::. .::.. .:.:..::.::.: .:..:: CCDS47 DIIADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFVWK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 GRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGHESPIFKQFFKDWK :. :: .::.::...:: :...:.:. :::...::.: :.::::::::::. CCDS47 GKDANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFG 300 310 320 330 340 350 CCDS47 KVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYG 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 348 init1: 97 opt: 442 Z-score: 546.2 bits: 110.6 E(32554): 4.2e-24 Smith-Waterman score: 442; 29.9% identity (57.0% similar) in 335 aa overlap (21-347:398-710) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGDSYLV ...::::. . : :.. : :..:: :.. CCDS47 IKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFYGGDCYII 370 380 390 400 410 420 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LHNGPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYF :.. :. . .. : : ...::: . : :.:.:. :: . :: : ::.: ..: : CCDS47 LYTYPRG-QIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPVHLLSLF 430 440 450 460 470 480 120 130 140 150 160 pF1KE9 P-RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWD----SFNTGDC . : ..:. : . ::: .:.:: ..:. . : .. : :.:..: CCDS47 KDKPLIIYKNGTS----KKGGQAPAPPTRLFQV--RRNLASITRIVEVDVDANSLNSNDV 490 500 510 520 530 540 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 FILDLGQNI-FAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVL :.: : :: . : : .. :.. :. .: .. : .. . .:::: :. . : CCDS47 FVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVL-------KCKTLRIQEGEEPEEFWNSL 550 560 570 580 590 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 GPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDDCFV : : . .: : .:. . :: :. ::.. . .. . :. . : :: .. CCDS47 GGKKDYQT-SP---LLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIP--GEFTQDDLAEDDVML 600 610 620 630 640 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPN--TQVEILPQGHESPIFKQ :: .:.:: :. ::: :.. .:. :. .. . . : . :. :::: : : CCDS47 LDAW--EQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTG 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 FFKDWK .: : CCDS47 WFLGWDSSKW 710 >>CCDS6829.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (731 aa) initn: 1146 init1: 416 opt: 1168 Z-score: 1450.5 bits: 277.9 E(32554): 1.8e-74 Smith-Waterman score: 1168; 50.7% identity (77.2% similar) in 337 aa overlap (17-348:13-346) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGDSYLVLH-----NGP ..:::..:::::. ::: . : ::.::.:..:. :: CCDS68 MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 EEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLK . . :: :.:.. :.::.:: :...:.:. :. : :::::::: :: :..:: ::: CCDS68 LQYD-LHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 YQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIF :..::: :.: : . .....:.::::.. .:::: ..:.:::.:::::::::.:: CCDS68 YKKGGVASGF-KHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 AWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPALKEGNP :::..:: :: :: ... .:::.::.:.:.:.. .: :: :.::::::::: :. 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CCDS68 WKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDG 300 310 320 330 340 350 CCDS68 LGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPAT 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 326 init1: 122 opt: 467 Z-score: 577.2 bits: 116.3 E(32554): 7.9e-26 Smith-Waterman score: 467; 29.8% identity (56.4% similar) in 349 aa overlap (7-347:385-712) 10 20 30 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQ : : :. : ..::.: . ::: CCDS68 GLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQK---QIWRIEGSNKVPVDP 360 370 380 390 400 410 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 ENQGVFFSGDSYLVLHN---GPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPV . : :..::::..:.: : .. . .. : : ::..:: .: :.:...:. :: :: CCDS68 ATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPV 420 430 440 450 460 470 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 QHREVQGNESDLFMSYFP-RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKN--IRA : : :::.: .:: : . . .::. .: :::. . :.::.... :: CCDS68 QSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQT---APASTR-LFQVRANSAGATRA 480 490 500 510 520 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 TERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEI .: . ..:..: :.: . . : : .. :.. :..: ..: :: CCDS68 VEVLPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLR-------AQPVQ 530 540 550 560 570 580 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VTDGEEPAEMIQVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSS :..: :: . ..:: : : . .:. : : .:. :. :. :.. . .: . CCDS68 VAEGSEPDGFWEALGGKAAYRT-SPR--LKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEV--PG 590 600 610 620 630 280 290 300 310 320 pF1KE9 PFALELLISDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISR--MQYAPNTQV . : : .:: ..::. ....: :. ..:.:. :: :. .: . : . CCDS68 ELMQEDLATDDVMLLDTW--DQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPI 640 650 660 670 680 690 330 340 pF1KE9 EILPQGHESPIFKQFFKDWK .. :: : : : .: : CCDS68 TVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA 700 710 720 730 >>CCDS65118.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (739 aa) initn: 1146 init1: 416 opt: 1168 Z-score: 1450.4 bits: 277.9 E(32554): 1.8e-74 Smith-Waterman score: 1168; 50.7% identity (77.2% similar) in 337 aa overlap (17-348:21-354) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGDSYLVLH---- ..:::..:::::. ::: . : ::.::.:..:. CCDS65 MPLCTPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILKTVQL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 -NGPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFP :: . . :: :.:.. :.::.:: :...:.:. :. : :::::::: :: :..:: CCDS65 RNGNLQYD-LHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWDSFNTGDCFILDLG ::::..::: :.: : . .....:.::::.. .:::: ..:.:::.::::::::: CCDS65 SGLKYKKGGVASGF-KHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGDCFILDLG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 QNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPALK .:: :::..:: :: :: ... .:::.::.:.:.:.. .: :: :.::::::::: CCDS65 NNIHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQVLGPKPALP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 EGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDDCFVLDNGLCG :. :. : :: . : :::::...: :... ::: .::: : :.:::.::.: : CCDS65 AGT-EDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSEDCFILDHGKDG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 KIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGHESPIFKQFFKDWK ::..:::..:: .::.:::..: ::..:.: .::: .::.: :.:.::::::.:. CCDS65 KIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPD 300 310 320 330 340 350 CCDS65 QTDGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPV 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 326 init1: 122 opt: 467 Z-score: 577.2 bits: 116.3 E(32554): 7.9e-26 Smith-Waterman score: 467; 29.8% identity (56.4% similar) in 349 aa overlap (7-347:393-720) 10 20 30 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQ : : :. : ..::.: . ::: CCDS65 GLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQK---QIWRIEGSNKVPVDP 370 380 390 400 410 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 ENQGVFFSGDSYLVLHN---GPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPV . : :..::::..:.: : .. . .. : : ::..:: .: :.:...:. :: :: CCDS65 ATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPV 420 430 440 450 460 470 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 QHREVQGNESDLFMSYFP-RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKN--IRA : : :::.: .:: : . . .::. .: :::. . :.::.... :: CCDS65 QSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQT---APASTR-LFQVRANSAGATRA 480 490 500 510 520 530 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 TERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEI .: . ..:..: :.: . . : : .. :.. :..: ..: :: CCDS65 VEVLPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLR-------AQPVQ 540 550 560 570 580 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VTDGEEPAEMIQVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSS :..: :: . ..:: : : . .:. : : .:. :. :. :.. . .: . CCDS65 VAEGSEPDGFWEALGGKAAYRT-SPR--LKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEV--PG 590 600 610 620 630 640 280 290 300 310 320 pF1KE9 PFALELLISDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISR--MQYAPNTQV . : : .:: ..::. ....: :. ..:.:. :: :. .: . : . CCDS65 ELMQEDLATDDVMLLDTW--DQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPI 650 660 670 680 690 700 330 340 pF1KE9 EILPQGHESPIFKQFFKDWK .. :: : : : .: : CCDS65 TVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA 710 720 730 >>CCDS48011.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (742 aa) initn: 1146 init1: 416 opt: 1168 Z-score: 1450.4 bits: 277.9 E(32554): 1.8e-74 Smith-Waterman score: 1168; 50.7% identity (77.2% similar) in 337 aa overlap (17-348:24-357) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGDSYLVLH- ..:::..:::::. ::: . : ::.::.:..:. CCDS48 MEKLFCCFPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILKT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE9 ----NGPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMS :: . . :: :.:.. :.::.:: :...:.:. :. : :::::::: :: :.. CCDS48 VQLRNGNLQYD-LHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFESATFLG 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 YFPRGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWDSFNTGDCFIL :: ::::..::: :.: : . .....:.::::.. .:::: ..:.:::.:::::: CCDS48 YFKSGLKYKKGGVASGF-KHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGDCFIL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 DLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKP :::.:: :::..:: :: :: ... .:::.::.:.:.:.. .: :: :.::::::: CCDS48 DLGNNIHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQVLGPKP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 ALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDDCFVLDNG :: :. :. : :: . : :::::...: :... ::: .::: : :.:::.::.: CCDS48 ALPAGT-EDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSEDCFILDHG 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGHESPIFKQFFKDWK :::..:::..:: .::.:::..: ::..:.: .::: .::.: :.:.::::::.:. CCDS48 KDGKIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWR 300 310 320 330 340 350 CCDS48 DPDQTDGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNK 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 326 init1: 122 opt: 467 Z-score: 577.1 bits: 116.3 E(32554): 8e-26 Smith-Waterman score: 467; 29.8% identity (56.4% similar) in 349 aa overlap (7-347:396-723) 10 20 30 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQ : : :. : ..::.: . ::: CCDS48 GLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQK---QIWRIEGSNKVPVDP 370 380 390 400 410 420 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 ENQGVFFSGDSYLVLHN---GPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPV . : :..::::..:.: : .. . .. : : ::..:: .: :.:...:. :: :: CCDS48 ATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPV 430 440 450 460 470 480 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 QHREVQGNESDLFMSYFP-RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKN--IRA : : :::.: .:: : . . .::. .: :::. . :.::.... :: CCDS48 QSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQT---APASTR-LFQVRANSAGATRA 490 500 510 520 530 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 TERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEI .: . ..:..: :.: . . : : .. :.. :..: ..: :: CCDS48 VEVLPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLR-------AQPVQ 540 550 560 570 580 590 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VTDGEEPAEMIQVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSS :..: :: . ..:: : : . .:. : : .:. :. :. :.. . .: . CCDS48 VAEGSEPDGFWEALGGKAAYRT-SPR--LKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEV--PG 600 610 620 630 640 280 290 300 310 320 pF1KE9 PFALELLISDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISR--MQYAPNTQV . : : .:: ..::. ....: :. ..:.:. :: :. .: . : . CCDS48 ELMQEDLATDDVMLLDTW--DQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPI 650 660 670 680 690 700 330 340 pF1KE9 EILPQGHESPIFKQFFKDWK .. :: : : : .: : CCDS48 TVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA 710 720 730 740 >>CCDS75891.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (748 aa) initn: 1146 init1: 416 opt: 1168 Z-score: 1450.3 bits: 277.9 E(32554): 1.8e-74 Smith-Waterman score: 1168; 50.7% identity (77.2% similar) in 337 aa overlap (17-348:30-363) 10 20 30 40 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGDS ..:::..:::::. ::: . : ::.::. CCDS75 MAEEEALRGNSDPWPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 YLVLH-----NGPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNE :..:. :: . . :: :.:.. :.::.:: :...:.:. :. : :::::::: : CCDS75 YVILKTVQLRNGNLQYD-LHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFE 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 SDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWDSFNT : :..:: ::::..::: :.: : . .....:.::::.. .:::: ..:.:::. CCDS75 SATFLGYFKSGLKYKKGGVASGF-KHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 GDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQ :::::::::.:: :::..:: :: :: ... .:::.::.:.:.:.. .: :: :.: CCDS75 GDCFILDLGNNIHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 VLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDDC :::::::: :. :. : :: . : :::::...: :... ::: .::: : :.:: CCDS75 VLGPKPALPAGT-EDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSEDC 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 FVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGHESPIFKQ :.::.: :::..:::..:: .::.:::..: ::..:.: .::: .::.: :.:.::: CCDS75 FILDHGKDGKIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQ 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 FFKDWK :::.:. CCDS75 FFKNWRDPDQTDGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWR 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 326 init1: 122 opt: 467 Z-score: 577.1 bits: 116.3 E(32554): 8e-26 Smith-Waterman score: 467; 29.8% identity (56.4% similar) in 349 aa overlap (7-347:402-729) 10 20 30 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQ : : :. : ..::.: . ::: CCDS75 GLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQK---QIWRIEGSNKVPVDP 380 390 400 410 420 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 ENQGVFFSGDSYLVLHN---GPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPV . : :..::::..:.: : .. . .. : : ::..:: .: :.:...:. :: :: CCDS75 ATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPV 430 440 450 460 470 480 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 QHREVQGNESDLFMSYFP-RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKN--IRA : : :::.: .:: : . . .::. .: :::. . :.::.... :: CCDS75 QSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQT---APASTR-LFQVRANSAGATRA 490 500 510 520 530 540 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 TERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEI .: . ..:..: :.: . . : : .. :.. :..: ..: :: CCDS75 VEVLPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLR-------AQPVQ 550 560 570 580 590 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VTDGEEPAEMIQVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSS :..: :: . ..:: : : . .:. : : .:. :. :. :.. . .: . CCDS75 VAEGSEPDGFWEALGGKAAYRT-SPR--LKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEV--PG 600 610 620 630 640 650 280 290 300 310 320 pF1KE9 PFALELLISDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISR--MQYAPNTQV . : : .:: ..::. ....: :. ..:.:. :: :. .: . : . CCDS75 ELMQEDLATDDVMLLDTW--DQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPI 660 670 680 690 700 710 330 340 pF1KE9 EILPQGHESPIFKQFFKDWK .. :: : : : .: : CCDS75 TVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA 720 730 740 >>CCDS75890.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (767 aa) initn: 1146 init1: 416 opt: 1168 Z-score: 1450.2 bits: 277.9 E(32554): 1.9e-74 Smith-Waterman score: 1168; 50.7% identity (77.2% similar) in 337 aa overlap (17-348:49-382) 10 20 30 40 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGD ..:::..:::::. ::: . : ::.:: CCDS75 MSHPQPELFLFPKAQPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGD 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 SYLVLH-----NGPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGN .:..:. :: . . :: :.:.. :.::.:: :...:.:. :. : :::::::: CCDS75 AYVILKTVQLRNGNLQYD-LHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGF 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 ESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWDSFN :: :..:: ::::..::: :.: : . .....:.::::.. .:::: ..:.::: CCDS75 ESATFLGYFKSGLKYKKGGVASGF-KHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFN 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 TGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMI .:::::::::.:: :::..:: :: :: ... .:::.::.:.:.:.. .: :: :. CCDS75 NGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAML 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 QVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDD ::::::::: :. :. : :: . : :::::...: :... ::: .::: : :.: CCDS75 QVLGPKPALPAGT-EDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSED 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 CFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGHESPIFK ::.::.: :::..:::..:: .::.:::..: ::..:.: .::: .::.: :.:.:: CCDS75 CFILDHGKDGKIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFK 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 QFFKDWK ::::.:. CCDS75 QFFKNWRDPDQTDGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIW 380 390 400 410 420 430 >-- initn: 326 init1: 122 opt: 467 Z-score: 576.9 bits: 116.4 E(32554): 8.2e-26 Smith-Waterman score: 467; 29.8% identity (56.4% similar) in 349 aa overlap (7-347:421-748) 10 20 30 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQ : : :. : ..::.: . ::: CCDS75 GLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQK---QIWRIEGSNKVPVDP 400 410 420 430 440 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 ENQGVFFSGDSYLVLHN---GPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPV . : :..::::..:.: : .. . .. : : ::..:: .: :.:...:. :: :: CCDS75 ATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPV 450 460 470 480 490 500 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 QHREVQGNESDLFMSYFP-RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKN--IRA : : :::.: .:: : . . .::. .: :::. . :.::.... :: CCDS75 QSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQT---APASTR-LFQVRANSAGATRA 510 520 530 540 550 560 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 TERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEI .: . ..:..: :.: . . : : .. :.. :..: ..: :: CCDS75 VEVLPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLR-------AQPVQ 570 580 590 600 610 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VTDGEEPAEMIQVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSS :..: :: . ..:: : : . .:. : : .:. :. :. :.. . .: . CCDS75 VAEGSEPDGFWEALGGKAAYRT-SPR--LKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEV--PG 620 630 640 650 660 670 280 290 300 310 320 pF1KE9 PFALELLISDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISR--MQYAPNTQV . : : .:: ..::. ....: :. ..:.:. :: :. .: . : . CCDS75 ELMQEDLATDDVMLLDTW--DQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPI 680 690 700 710 720 330 340 pF1KE9 EILPQGHESPIFKQFFKDWK .. :: : : : .: : CCDS75 TVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA 730 740 750 760 >>CCDS6828.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (782 aa) initn: 1146 init1: 416 opt: 1168 Z-score: 1450.0 bits: 277.9 E(32554): 1.9e-74 Smith-Waterman score: 1168; 50.7% identity (77.2% similar) in 337 aa overlap (17-348:64-397) 10 20 30 40 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGD ..:::..:::::. ::: . : ::.:: CCDS68 ASQAGAPQGRVPEARPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGD 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 SYLVLH-----NGPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGN .:..:. :: . . :: :.:.. :.::.:: :...:.:. :. : :::::::: CCDS68 AYVILKTVQLRNGNLQYD-LHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGF 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 ESDLFMSYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWDSFN :: :..:: ::::..::: :.: : . .....:.::::.. .:::: ..:.::: CCDS68 ESATFLGYFKSGLKYKKGGVASGF-KHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFN 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 TGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMI .:::::::::.:: :::..:: :: :: ... .:::.::.:.:.:.. .: :: :. CCDS68 NGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAML 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 QVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDD ::::::::: :. :. : :: . : :::::...: :... ::: .::: : :.: CCDS68 QVLGPKPALPAGT-EDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSED 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 CFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGHESPIFK ::.::.: :::..:::..:: .::.:::..: ::..:.: .::: .::.: :.:.:: CCDS68 CFILDHGKDGKIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFK 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 QFFKDWK ::::.:. CCDS68 QFFKNWRDPDQTDGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIW 400 410 420 430 440 450 >-- initn: 326 init1: 122 opt: 467 Z-score: 576.8 bits: 116.4 E(32554): 8.3e-26 Smith-Waterman score: 467; 29.8% identity (56.4% similar) in 349 aa overlap (7-347:436-763) 10 20 30 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQ : : :. : ..::.: . ::: CCDS68 GLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQK---QIWRIEGSNKVPVDP 410 420 430 440 450 460 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 ENQGVFFSGDSYLVLHN---GPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPV . : :..::::..:.: : .. . .. : : ::..:: .: :.:...:. :: :: CCDS68 ATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPV 470 480 490 500 510 520 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 QHREVQGNESDLFMSYFP-RGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKN--IRA : : :::.: .:: : . . .::. .: :::. . :.::.... :: CCDS68 QSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQT---APASTR-LFQVRANSAGATRA 530 540 550 560 570 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 TERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEI .: . ..:..: :.: . . : : .. :.. :..: ..: :: CCDS68 VEVLPKAGALNSNDAFVLKTPSAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLR-------AQPVQ 580 590 600 610 620 630 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 VTDGEEPAEMIQVLGPKPALKEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSS :..: :: . ..:: : : . .:. : : .:. :. :. :.. . .: . CCDS68 VAEGSEPDGFWEALGGKAAYRT-SPR--LKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEV--PG 640 650 660 670 680 280 290 300 310 320 pF1KE9 PFALELLISDDCFVLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISR--MQYAPNTQV . : : .:: ..::. ....: :. ..:.:. :: :. .: . : . CCDS68 ELMQEDLATDDVMLLDTW--DQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPI 690 700 710 720 730 740 330 340 pF1KE9 EILPQGHESPIFKQFFKDWK .. :: : : : .: : CCDS68 TVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA 750 760 770 780 >>CCDS2417.1 VIL1 gene_id:7429|Hs108|chr2 (827 aa) initn: 865 init1: 231 opt: 905 Z-score: 1122.0 bits: 217.3 E(32554): 3.5e-56 Smith-Waterman score: 905; 42.9% identity (70.3% similar) in 343 aa overlap (15-347:13-349) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGDSYLVL--HNGPEEV .. :::..::.: .. ::: . . : ::.:: :..: :. . CCDS24 MTKLSAQVKGSLNITTPGLQIWRIEAMQMVPVPSSTFGSFFDGDCYIILAIHKTASSL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SH-LHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFMSYFPRGLKYQ :. .: ::::.:: ::::: :. ..... .: : :::::::::::. : .:: .:: . CCDS24 SYDIHYWIGQDSSLDEQGAAAIYTTQMDDFLKGRAVQHREVQGNESEAFRGYFKQGLVIR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 EGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGKKNIRATERALNWDSFNTGDCFILDLGQNIFAW .::: :..... :.. ...: .::::.:. : : ..: ::: :: :.::::. :. : CCDS24 KGGVASGMKHVETNS-YDVQRLLHVKGKRNVVAGEVEMSWKSFNRGDVFLLDLGKLIIQW 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 CGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAE-------MIQVLGPKPAL : .:. .:: .. :: :::.:: :.. : .: :::. : .::: . : CCDS24 NGPESTRMERLRGMTLAKEIRDQERGGRTYVGVV-DGENELASPKLMEVMNHVLGKRREL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 KEGNPEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDDCFVLDNGLC : . : : ... : : ::.:::. :.. . .:: . :.. .:: .::..::.: CCDS24 KAAVP--DTVVEPALKAALKLYHVSDSEGNLVVREVA-TRPLTQDLLSHEDCYILDQGGL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 GKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYAPNTQVEILPQGHESPIFKQFFKDWK :::.:::.::::.:...:.. : .::. :: :.::::. .: :: .:.:.:. : CCDS24 -KIYVWKGKKANEQEKKGAMSHALNFIKAKQYPPSTQVEVQNDGAESAVFQQLFQKWTAS 300 310 320 330 340 350 CCDS24 NRTSGLGKTHTVGSVAKVEQVKFDATSMHVKPQVAAQQKMVDDGSGEVQVWRIENLELVP 360 370 380 390 400 410 >-- initn: 353 init1: 119 opt: 440 Z-score: 542.8 bits: 110.1 E(32554): 6.5e-24 Smith-Waterman score: 504; 31.8% identity (59.8% similar) in 336 aa overlap (21-347:400-714) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWRVEKLKPVPVAQENQGVFFSGDSYLV ..:::.:.:. ::: .. : :..:: ::. CCDS24 VEQVKFDATSMHVKPQVAAQQKMVDDGSGEVQVWRIENLELVPVDSKWLGHFYGGDCYLL 370 380 390 400 410 420 60 70 80 90 100 pF1KE9 LHN---GPEEVSHLHLWIGQQSSRDEQGACAVLAVHLNTLLGERPVQHREVQGNESDLFM :.. : .. :..: :.:.:.:: : : :: :. . .::: : .:.: .: CCDS24 LYTYLIGEKQHYLLYVWQGSQASQDEITASAYQAVILDQKYNGEPVQIRVPMGKEPPHLM 430 440 450 460 470 480 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 SYFPRGLKYQEGGVESAFHKTSTGAPAAIKKLYQVKGK--KNIRATERALNWDSFNTGDC : : . .::. : .. :: :.. .:.::.: .: .: : . .:..: CCDS24 SIFKGRMVVYQGGT-SRTNNLETG-PST--RLFQVQGTGANNTKAFEVPARANFLNSNDV 490 500 510 520 530 540 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 FILDLGQNIFAWCGGKSNILERNKARDLALAIRDSERQGKAQVEIVTDGEEPAEMIQVLG :.: . . ::: . ::. :. .: .: .:.: .:..:.:::.. ..:: CCDS24 FVLKTQSCCYLWCGKGCSGDEREMAKMVADTISRTEKQ------VVVEGQEPANFWMALG 550 560 570 580 590 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 PKPALKEGN--PEEDLTADKANAQAAALYKVSDATGQMNLTKVADSSPFALELLISDDCF : . . ::.:. . :.. :. ::.. :.. : : . : :: : CCDS24 GKAPYANTKRLQEENLVI------TPRLFECSNKTGRFLATEIPD---FNQDDLEEDDVF 600 610 620 630 640 650 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 VLDNGLCGKIYIWKGRKANEKERQAALQVAEGFISRMQYA--PNTQVEILPQGHESPIFK .:: . ....: :..:::.:..:: .:. ... . :.: . .. :::: : : CCDS24 LLD--VWDQVFFWIGKHANEEEKKAAATTAQEYLKTHPSGRDPETPIIVVKQGHEPPTFT 660 670 680 690 700 pF1KE9 QFFKDWK .: : CCDS24 GWFLAWDPFKWSNTKSYEDLKAELGNSRDWSQITAEVTSPKVDVFNANSNLSSGPLPIFP 710 720 730 740 750 760 348 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 17:44:35 2016 done: Mon Nov 7 17:44:36 2016 Total Scan time: 2.760 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]