FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4578, 774 aa 1>>>pF1KE4578 774 - 774 aa - 774 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3716+/-0.000411; mu= 20.5027+/- 0.026 mean_var=84.0534+/-17.651, 0's: 0 Z-trim(112.1): 86 B-trim: 291 in 1/51 Lambda= 0.139893 statistics sampled from 20877 (20963) to 20877 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16 Scan time: 7.560 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002309 (OMIM: 606663) lysyl oxidase homolog 2 p ( 774) 5505 1121.7 0 XP_011531436 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxida ( 753) 3125 641.4 4.2e-183 NP_115992 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 i ( 753) 3125 641.4 4.2e-183 NP_115587 (OMIM: 607318) lysyl oxidase homolog 4 p ( 756) 2299 474.7 6.4e-133 XP_005270273 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxida ( 757) 2292 473.3 1.7e-132 XP_006718083 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxida ( 757) 2292 473.3 1.7e-132 NP_001276093 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog ( 608) 2177 450.0 1.4e-125 XP_016860601 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxida ( 392) 1882 390.3 8.4e-108 NP_001276094 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog ( 392) 1882 390.3 8.4e-108 NP_002308 (OMIM: 153455,617168) protein-lysine 6-o ( 417) 759 163.7 1.5e-39 XP_016877668 (OMIM: 153456,177650) PREDICTED: lysy ( 225) 735 158.6 2.7e-38 NP_005567 (OMIM: 153456,177650) lysyl oxidase homo ( 574) 737 159.3 4.1e-38 NP_001171573 (OMIM: 153455,617168) protein-lysine ( 187) 704 152.3 1.8e-36 XP_011537709 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 554 122.9 1.6e-26 XP_011537711 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 552 122.5 2.1e-26 XP_011537715 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2282) 549 121.9 3.1e-26 XP_016871287 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (1990) 546 121.2 4.2e-26 XP_011537710 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 546 121.3 4.9e-26 XP_011537712 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2411) 546 121.3 4.9e-26 NP_001307573 (OMIM: 601969) deleted in malignant b (2412) 546 121.3 4.9e-26 XP_011537705 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26 XP_011537707 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26 XP_011537704 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26 XP_011537703 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2413) 546 121.3 4.9e-26 NP_015568 (OMIM: 601969) deleted in malignant brai (2413) 546 121.3 4.9e-26 XP_011537702 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2434) 546 121.3 4.9e-26 XP_006717728 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2510) 546 121.3 5e-26 XP_011537701 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2510) 546 121.3 5e-26 XP_011537700 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2521) 546 121.3 5e-26 XP_006717723 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2526) 546 121.3 5e-26 XP_011537698 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2526) 546 121.3 5e-26 XP_011537691 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2541) 546 121.3 5e-26 XP_011537690 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2542) 546 121.3 5e-26 XP_011537692 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 514 114.9 4.4e-24 XP_011537697 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 511 114.3 6.7e-24 XP_011537713 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2403) 510 114.0 7.4e-24 XP_011537694 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 481 108.2 4.5e-22 XP_011537695 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 480 108.0 5.1e-22 XP_011537696 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2532) 480 108.0 5.1e-22 NP_001304002 (OMIM: 153455,617168) protein-lysine ( 120) 462 103.3 6.5e-22 NP_005885 (OMIM: 602592) CD5 antigen-like precurso ( 347) 430 97.2 1.3e-19 XP_005245659 (OMIM: 602592) PREDICTED: CD5 antigen ( 347) 430 97.2 1.3e-19 XP_016858295 (OMIM: 602592) PREDICTED: CD5 antigen ( 353) 430 97.2 1.3e-19 NP_981961 (OMIM: 605545) scavenger receptor cystei (1121) 419 95.4 1.4e-18 XP_005253586 (OMIM: 605545) PREDICTED: scavenger r (1124) 419 95.4 1.4e-18 NP_004235 (OMIM: 605545) scavenger receptor cystei (1156) 419 95.4 1.5e-18 XP_016875720 (OMIM: 605545) PREDICTED: scavenger r (1161) 419 95.4 1.5e-18 XP_011518923 (OMIM: 606079) PREDICTED: scavenger r ( 766) 406 92.6 6.6e-18 XP_011518922 (OMIM: 606079) PREDICTED: scavenger r (1182) 406 92.8 9.1e-18 XP_011518921 (OMIM: 606079) PREDICTED: scavenger r (1182) 406 92.8 9.1e-18 >>NP_002309 (OMIM: 606663) lysyl oxidase homolog 2 precu (774 aa) initn: 5505 init1: 5505 opt: 5505 Z-score: 6004.1 bits: 1121.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5505; 99.9% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 AGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 AGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 IWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 IWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 IQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 IQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGER 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 TYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGLPAVVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 TYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGLPAVVS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQGCNHEEDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQGCNHEEDA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 GVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 GLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 GLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 VACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRFS :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 VACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFMLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRFS 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 SQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 SQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLED 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 TECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 TECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEV 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 AESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_002 AESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ 730 740 750 760 770 >>XP_011531436 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxidase h (753 aa) initn: 2887 init1: 1665 opt: 3125 Z-score: 3408.3 bits: 641.4 E(85289): 4.2e-183 Smith-Waterman score: 3125; 55.1% identity (79.6% similar) in 760 aa overlap (19-771:1-752) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK . :.:. :.. : . .:.: :. :. XP_011 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG ...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..:: XP_011 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ : : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...: . XP_011 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI-E 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG .:. ..:::..::: .. :. :: :: :::. :.:.::: :.:.::.:::::.: XP_011 VEH-HLQVEEVRIRPAVGWGRRPLPVTEGLVEVRLPDGWSQVCDKGWSAHNSHVVCGMLG 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL ::.:. :. :...:.:... . .. :.:::::.: :.: . : . : .: XP_011 FPSEKRVNAAFYRLLAQRQQHSFGLHGVACVGTEAHLSLCSLEFYRANDTAR---CPGGG 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPE-QPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDK ::::::::: :.. .. .. .. ::. . :::.:::. ::::::::: . :::::: : XP_011 PAVVSCVPGPVYAASSGQKKQQQSKPQGEARVRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRK 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 WDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQG ::: .:::::::::::::.::..:.:.:::.: :::.:..:.:.: :. : : .. XP_011 WDLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAED 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 CNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEA :.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: .:: XP_011 CSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEA 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 MVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQG ::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: . XP_011 MVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRT 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGY :... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :. XP_011 GTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGH 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 RRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHK :::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. :::::::::: XP_011 RRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHK 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 ASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVV ::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:..::: XP_011 ASFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVV 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 INPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSP :::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::. XP_011 INPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII 700 710 720 730 740 750 pF1KE4 Q >>NP_115992 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 isofo (753 aa) initn: 2887 init1: 1665 opt: 3125 Z-score: 3408.3 bits: 641.4 E(85289): 4.2e-183 Smith-Waterman score: 3125; 55.1% identity (79.6% similar) in 760 aa overlap (19-771:1-752) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK . :.:. :.. : . .:.: :. :. NP_115 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG ...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..:: NP_115 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ : : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...: . NP_115 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI-E 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG .:. ..:::..::: .. :. :: :: :::. :.:.::: :.:.::.:::::.: NP_115 VEH-HLQVEEVRIRPAVGWGRRPLPVTEGLVEVRLPDGWSQVCDKGWSAHNSHVVCGMLG 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL ::.:. :. :...:.:... . .. :.:::::.: :.: . : . : .: NP_115 FPSEKRVNAAFYRLLAQRQQHSFGLHGVACVGTEAHLSLCSLEFYRANDTAR---CPGGG 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPE-QPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDK ::::::::: :.. .. .. .. ::. . :::.:::. ::::::::: . :::::: : NP_115 PAVVSCVPGPVYAASSGQKKQQQSKPQGEARVRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRK 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 WDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQG ::: .:::::::::::::.::..:.:.:::.: :::.:..:.:.: :. : : .. NP_115 WDLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAED 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 CNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEA :.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: .:: NP_115 CSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEA 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 MVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQG ::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: . NP_115 MVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRT 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGY :... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :. NP_115 GTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGH 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 RRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHK :::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. :::::::::: NP_115 RRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHK 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 ASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVV ::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:..::: NP_115 ASFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVV 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 INPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSP :::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::. NP_115 INPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII 700 710 720 730 740 750 pF1KE4 Q >>NP_115587 (OMIM: 607318) lysyl oxidase homolog 4 precu (756 aa) initn: 2334 init1: 1594 opt: 2299 Z-score: 2507.4 bits: 474.7 E(85289): 6.4e-133 Smith-Waterman score: 3014; 55.3% identity (78.8% similar) in 740 aa overlap (47-769:21-754) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 ALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHSEGRVEVYY :. : ... .:::.: . : :::.:: . NP_115 MAWSPPATLFLFLLLLGQPPPSRPQSLGTTKLRLVGPESKPEEGRLEVLH 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 DGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLA .:::::::::.:.:. : :.::.::. : .:. :..::.:::::::::..:.:.:..: NP_115 QGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLGFEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLD 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 ACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYR : ::::::.::.:.:::::.: .: :. ..... : . . ..:..:.. ::.. . NP_115 QCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGY-LSETVSNALGPQGRRLEEVRLKPILASAK 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 KRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMF------ ...:: :: :::: :.:.::. :: .::::::::.:::.: ... :. NP_115 QHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWDLKMR 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 pF1KE4 --ASR-----RKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNV---TCENGLPAVVS :: :. .: .. : ::: :...: ::.. : .. .: .:. :::: NP_115 DPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANC----QVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVS 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA :: : : : . ::. :.: ::::.:: .:::::::: : .:::::: .:.:.:: NP_115 CVAGPHFRPPKTKPQRKGSWAEEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLISA 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 pF1KE4 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQ-GCNHEED :::::.::::::.::. :.:::::.:::::.:..: : :... :: :: ::.::.: NP_115 SVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHLSEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHEND 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 AGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQ :.::::.: ::.:...:: ::: : :: .:: :: :: :: ::..:::..::::.::: NP_115 AAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVCSENWGLTEAMVACRQ 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 LGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGA :::::: .:..:::.: : ...::::::.::::::.: .:.. : : : .:: .. : NP_115 LGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGP-VHCSHGGGRFLA 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRF ::.: ..:::::.::..::.:.::::::. : :: :::::: :: . : :::::::: NP_115 GVSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLRF 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 SSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLE :.::.: :..:::::.:: .:.::.:::::::.:::::::::.:::.::::::::::::: NP_115 STQIYNLGRTDFRPKTGRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCLE 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 DTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFE ::.: .:. : :::::.::.:.:::: ::::::::::::::: ::.:.:::..::..: NP_115 DTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYRHDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHYE 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 VAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ :::::.:::...:: .:::::.:..::: :.:. ..: ..:. . : :: NP_115 VAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQRLRNNLI 710 720 730 740 750 >>XP_005270273 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxidase h (757 aa) initn: 2258 init1: 1518 opt: 2292 Z-score: 2499.7 bits: 473.3 E(85289): 1.7e-132 Smith-Waterman score: 3007; 55.3% identity (78.7% similar) in 741 aa overlap (47-769:21-755) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 ALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHSEGRVEVYY :. : ... .:::.: . : :::.:: . XP_005 MAWSPPATLFLFLLLLGQPPPSRPQSLGTTKLRLVGPESKPEEGRLEVLH 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 DGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLA .:::::::::.:.:. : :.::.::. : .:. :..::.:::::::::..:.:.:..: XP_005 QGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLGFEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLD 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 ACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYR : ::::::.::.:.:::::.: .: :. ..... : . . ..:..:.. ::.. . XP_005 QCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGY-LSETVSNALGPQGRRLEEVRLKPILASAK 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 KRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMF------ ...:: :: :::: :.:.::. :: .::::::::.:::.: ... :. XP_005 QHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWDLKMR 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 pF1KE4 --ASR-----RKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNV---TCENGLPAVVS :: :. .: .. : ::: :...: ::.. : .. .: .:. :::: XP_005 DPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANC----QVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVS 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQ-PLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVS :: : : : . ::. :: : ::::.:: .:::::::: : .:::::: .:.:.: XP_005 CVAGPHFRPPKTKPQRKGSWAEQEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLIS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 ASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQ-GCNHEE ::::::.::::::.::. :.:::::.:::::.:..: : :... :: :: ::.::. XP_005 ASVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHLSEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHEN 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 DAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCR ::.::::.: ::.:...:: ::: : :: .:: :: :: :: ::..:::..::::.:: XP_005 DAAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVCSENWGLTEAMVACR 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 QLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYG ::::::: .:..:::.: : ...::::::.::::::.: .:.. : : : .:: .. XP_005 QLGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGP-VHCSHGGGRFL 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 AGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLR :::.: ..:::::.::..::.:.::::::. : :: :::::: :: . : ::::::: XP_005 AGVSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLR 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 FSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCL ::.::.: :..:::::.:: .:.::.:::::::.:::::::::.:::.:::::::::::: XP_005 FSTQIYNLGRTDFRPKTGRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCL 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 EDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNF :::.: .:. : :::::.::.:.:::: ::::::::::::::: ::.:.:::..::.. XP_005 EDTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYRHDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHY 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 EVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ ::::::.:::...:: .:::::.:..::: :.:. ..: ..:. . : :: XP_005 EVAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQRLRNNLI 710 720 730 740 750 >>XP_006718083 (OMIM: 607318) PREDICTED: lysyl oxidase h (757 aa) initn: 2258 init1: 1518 opt: 2292 Z-score: 2499.7 bits: 473.3 E(85289): 1.7e-132 Smith-Waterman score: 3007; 55.3% identity (78.7% similar) in 741 aa overlap (47-769:21-755) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 ALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHSEGRVEVYY :. : ... .:::.: . : :::.:: . XP_006 MAWSPPATLFLFLLLLGQPPPSRPQSLGTTKLRLVGPESKPEEGRLEVLH 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 DGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLA .:::::::::.:.:. : :.::.::. : .:. :..::.:::::::::..:.:.:..: XP_006 QGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLGFEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLD 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 ACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYR : ::::::.::.:.:::::.: .: :. ..... : . . ..:..:.. ::.. . XP_006 QCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGY-LSETVSNALGPQGRRLEEVRLKPILASAK 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 KRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMF------ ...:: :: :::: :.:.::. :: .::::::::.:::.: ... :. XP_006 QHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWDLKMR 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 pF1KE4 --ASR-----RKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNV---TCENGLPAVVS :: :. .: .. : ::: :...: ::.. : .. .: .:. :::: XP_006 DPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANC----QVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVS 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQ-PLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVS :: : : : . ::. :: : ::::.:: .:::::::: : .:::::: .:.:.: XP_006 CVAGPHFRPPKTKPQRKGSWAEQEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLIS 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 ASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQ-GCNHEE ::::::.::::::.::. :.:::::.:::::.:..: : :... :: :: ::.::. XP_006 ASVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHLSEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHEN 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 DAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCR ::.::::.: ::.:...:: ::: : :: .:: :: :: :: ::..:::..::::.:: XP_006 DAAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVCSENWGLTEAMVACR 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 QLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYG ::::::: .:..:::.: : ...::::::.::::::.: .:.. : : : .:: .. XP_006 QLGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGP-VHCSHGGGRFL 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 AGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLR :::.: ..:::::.::..::.:.::::::. : :: :::::: :: . : ::::::: XP_006 AGVSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLR 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 FSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCL ::.::.: :..:::::.:: .:.::.:::::::.:::::::::.:::.:::::::::::: XP_006 FSTQIYNLGRTDFRPKTGRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCL 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 EDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNF :::.: .:. : :::::.::.:.:::: ::::::::::::::: ::.:.:::..::.. XP_006 EDTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYRHDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHY 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 EVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ ::::::.:::...:: .:::::.:..::: :.:. ..: ..:. . : :: XP_006 EVAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQRLRNNLI 710 720 730 740 750 >>NP_001276093 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 is (608 aa) initn: 2673 init1: 1665 opt: 2177 Z-score: 2375.6 bits: 450.0 E(85289): 1.4e-125 Smith-Waterman score: 2420; 47.4% identity (66.0% similar) in 759 aa overlap (19-771:1-607) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK . :.:. :.. : . .:.: :. :. NP_001 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG ...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..:: NP_001 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ : : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...: NP_001 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI-- 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG NP_001 ------------------------------------------------------------ 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL ::. NP_001 ---------------------------------EAR------------------------ 160 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKW :::.:::. ::::::::: . :::::: :: NP_001 ------------------------------VRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRKW 170 180 190 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 DLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQGC :: .:::::::::::::.::..:.:.:::.: :::.:..:.:.: :. : : .. : NP_001 DLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAEDC 200 210 220 230 240 250 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 NHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAM .: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: .::: NP_001 SHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEAM 260 270 280 290 300 310 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 VVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGG :.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: . : NP_001 VACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRTG 320 330 340 350 360 370 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYR ... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :.: NP_001 TRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGHR 380 390 400 410 420 430 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 RLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKA ::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. ::::::::::: NP_001 RLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHKA 440 450 460 470 480 490 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 SFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVI :::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:..:::: NP_001 SFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVVI 500 510 520 530 540 550 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 NPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ ::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::. NP_001 NPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII 560 570 580 590 600 >>XP_016860601 (OMIM: 607163) PREDICTED: lysyl oxidase h (392 aa) initn: 1874 init1: 1395 opt: 1882 Z-score: 2056.4 bits: 390.3 E(85289): 8.4e-108 Smith-Waterman score: 1882; 61.7% identity (84.7% similar) in 392 aa overlap (381-771:1-391) 360 370 380 390 400 pF1KE4 CDDKWDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NA .:::.: :::.:..:.:.: :. : : XP_016 MGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNI 10 20 30 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 ESQGCNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWG .. :.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: XP_016 TAEDCSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWG 40 50 60 70 80 90 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 IVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVA .::::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : .. 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XP_016 QII 390 >>NP_001276094 (OMIM: 607163) lysyl oxidase homolog 3 is (392 aa) initn: 1874 init1: 1395 opt: 1882 Z-score: 2056.4 bits: 390.3 E(85289): 8.4e-108 Smith-Waterman score: 1882; 61.7% identity (84.7% similar) in 392 aa overlap (381-771:1-391) 360 370 380 390 400 pF1KE4 CDDKWDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NA .:::.: :::.:..:.:.: :. : : NP_001 MGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNI 10 20 30 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 ESQGCNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWG .. :.: .::::::: : : . ..::.:::. .:::::: . : : ::..::..:: NP_001 TAEDCSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWG 40 50 60 70 80 90 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 IVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVA .::::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : .. NP_001 TLEAMVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHIT 100 110 120 130 140 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 CPQGGVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDP : . :... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... NP_001 CKRTGTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANW 150 160 170 180 190 200 590 600 610 620 630 640 pF1KE4 TTGYRRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVA :.:::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. :::::: NP_001 PYGHRRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVA 210 220 230 240 250 260 650 660 670 680 690 700 pF1KE4 EGHKASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYL ::::::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:. 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NP_002 STYVQKMSMYNLRCAAEENCLASTAYRADVRDYDHRVLLRFPQRVKNQGTSDFLPSRPRY 230 240 250 260 270 280 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 AWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTK-VAEGHKASFCLEDTECEGDIQKNYECANFG .: ::.::.:::::. :.:::::. : . :::::::::::::: :. .. . :. NP_002 SWEWHSCHQHYHSMDEFSHYDLLDANTQRRVAEGHKASFCLEDTSCDYGYHRRFACTAH- 290 300 310 320 330 340 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 DQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYD ::.. ::.: : ::::::.::::: ::.:...: .::.. : ::::.::...: :: NP_002 TQGLSPGCYDTYGADIDCQWIDITDVKPGNYILKVSVNPSYLVPESDYTNNVVRCDIRYT 350 360 370 380 390 400 740 750 760 770 pF1KE4 GHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ ::. . .: : NP_002 GHHAYASGCTISPY 410 774 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 18:37:48 2016 done: Mon Nov 7 18:37:49 2016 Total Scan time: 7.560 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]