FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4474, 493 aa 1>>>pF1KE4474 493 - 493 aa - 493 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5461+/-0.000456; mu= 16.2489+/- 0.028 mean_var=65.9438+/-13.547, 0's: 0 Z-trim(109.7): 11 B-trim: 627 in 3/50 Lambda= 0.157938 statistics sampled from 17919 (17927) to 17919 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16 Scan time: 9.230 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003079 (OMIM: 602689) fascin [Homo sapiens] ( 493) 3306 762.7 0 NP_036550 (OMIM: 607643,607921) fascin-2 isoform 1 ( 492) 1914 445.6 1.6e-124 XP_011522892 (OMIM: 607643,607921) PREDICTED: fasc ( 516) 1539 360.1 8.5e-99 NP_001070650 (OMIM: 607643,607921) fascin-2 isofor ( 516) 1539 360.1 8.5e-99 XP_011522889 (OMIM: 607643,607921) PREDICTED: fasc ( 516) 1539 360.1 8.5e-99 NP_065102 (OMIM: 615800) fascin-3 [Homo sapiens] ( 498) 656 158.9 3e-38 >>NP_003079 (OMIM: 602689) fascin [Homo sapiens] (493 aa) initn: 3306 init1: 3306 opt: 3306 Z-score: 4070.9 bits: 762.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3306; 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