Result of FASTA (omim) for pFN21AE6718
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6718, 682 aa
  1>>>pF1KE6718 682 - 682 aa - 682 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1503+/-0.000509; mu= 20.4947+/- 0.032
 mean_var=66.4052+/-13.545, 0's: 0 Z-trim(107.1): 23  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.157389
 statistics sampled from 15169 (15179) to 15169 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.178), width:  16
 Scan time:  8.850

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005101 (OMIM: 603865) glutamine--fructose-6-pho ( 682) 4416 1012.6       0
XP_006715005 (OMIM: 603865) PREDICTED: glutamine-- ( 628) 3972 911.7       0
NP_002047 (OMIM: 138292,608931,610542) glutamine-- ( 681) 3637 835.7       0
XP_016859291 (OMIM: 138292,608931,610542) PREDICTE ( 706) 3617 831.2       0
XP_016865589 (OMIM: 603865) PREDICTED: glutamine-- ( 507) 3124 719.1 9.8e-207
NP_001231639 (OMIM: 138292,608931,610542) glutamin ( 699) 2442 564.4 5.2e-160
XP_016859290 (OMIM: 138292,608931,610542) PREDICTE ( 724) 2442 564.4 5.4e-160
NP_002694 (OMIM: 172450) amidophosphoribosyltransf ( 517)  200 55.2 7.3e-07


>>NP_005101 (OMIM: 603865) glutamine--fructose-6-phospha  (682 aa)
 initn: 4416 init1: 4416 opt: 4416  Z-score: 5416.2  bits: 1012.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4416; 99.9% identity (100.0% similar) in 682 aa overlap (1-682:1-682)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNHEVKERHIQLVKKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNHEVKERHIQLVKKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 GKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 AFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKTRMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKTRMK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 RLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSAS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 DDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 LKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 ISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEVGVASTKAYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
NP_005 ISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEIGVASTKAYT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 SQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 LLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE6 AKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLLSFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLLSFH
              610       620       630       640       650       660

              670       680  
pF1KE6 LAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
       ::::::::::::::::::::::
NP_005 LAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
              670       680  

>>XP_006715005 (OMIM: 603865) PREDICTED: glutamine--fruc  (628 aa)
 initn: 4045 init1: 3972 opt: 3972  Z-score: 4871.8  bits: 911.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3972; 99.8% identity (100.0% similar) in 614 aa overlap (1-614:1-614)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNHEVKERHIQLVKKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNHEVKERHIQLVKKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 GKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 GIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 AFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKTRMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKTRMK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 RLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSAS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 DDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 LKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 ISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEVGVASTKAYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
XP_006 ISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEIGVASTKAYT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 SQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE6 LLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE6 AKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLLSFH
       ::::::::::::::                                              
XP_006 AKCQNALQQVTARQVDFPRNLAKSVTVE                                
              610       620                                        

>>NP_002047 (OMIM: 138292,608931,610542) glutamine--fruc  (681 aa)
 initn: 3640 init1: 2440 opt: 3637  Z-score: 4460.2  bits: 835.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3637; 79.0% identity (94.6% similar) in 685 aa overlap (1-682:1-681)

               10        20        30        40           50       
pF1KE6 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNH---EVKERHIQLV
       :::::::.::.:::::.::.::::::::::::::::::::..::.:    :..  .:::.
NP_002 MCGIFAYLNYHVPRTRREILETLIKGLQRLEYRGYDSAGVGFDGGNDKDWEANACKIQLI
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE6 KKRGKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVV
       ::.:::::::::..::..::: .::..:.::::::::::: :: ::::::::::.:::.:
NP_002 KKKGKVKALDEEVHKQQDMDLDIEFDVHLGIAHTRWATHGEPSPVNSHPQRSDKNNEFIV
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE6 IHNGIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQ
       ::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::..::::..: .:.:::::::::
NP_002 IHNGIITNYKDLKKFLESKGYDFESETDTETIAKLVKYMYDNRESQDTSFTTLVERVIQQ
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE6 LEGAFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKT
       :::::::::::::.::.::.:::::::::::::..::::..:::::::   .. :. :. 
NP_002 LEGAFALVFKSVHFPGQAVGTRRGSPLLIGVRSEHKLSTDHIPILYRTG--KDKKGSCN-
              190       200       210       220         230        

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE6 RMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKR
        ..:.::..::  : .::::..:::::::.::::::::::::::.:::.::.:::::.::
NP_002 -LSRVDSTTCLFPVEEKAVEYYFASDASAVIEHTNRVIFLEDDDVAAVVDGRLSIHRIKR
        240       250       260       270       280       290      

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE6 SASDDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGL
       .:.: :.::.::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::.  :: ::::
NP_002 TAGDHPGRAVQTLQMELQQIMKGNFSSFMQKEIFEQPESVVNTMRGRVNFDDYTVNLGGL
        300       310       320       330       340       350      

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE6 KDHLKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDV
       :::.:::.::::::.:.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDHIKEIQRCRRLILIACGTSYHAGVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDV
        360       370       380       390       400       410      

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE6 CFFISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEVGVASTK
       :::.::::::::::..:::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
NP_002 CFFLSQSGETADTLMGLRYCKERGALTVGITNTVGSSISRETDCGVHINAGPEIGVASTK
        420       430       440       450       460       470      

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE6 AYTSQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYT
       ::::::.:::::.::: .::::.:.::.::. ::. ::.:::::::....:. :: ::: 
NP_002 AYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEVLSMDDEIQKLATELYH
        480       490       500       510       520       530      

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE6 QRSLLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKD
       :.:.:.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::.::.:
NP_002 QKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALVDKLMPVIMIIMRD
        540       550       560       570       580       590      

       600       610       620       630       640       650       
pF1KE6 PCFAKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLL
         .::::::::::.::::::...:.:.:::. : . .::..::.::::::::::::::::
NP_002 HTYAKCQNALQQVVARQGRPVVICDKEDTETIKNTKRTIKVPHSVDCLQGILSVIPLQLL
        600       610       620       630       640       650      

       660       670       680  
pF1KE6 SFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
       .::::::::::::::::::::::::
NP_002 AFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
        660       670       680 

>>XP_016859291 (OMIM: 138292,608931,610542) PREDICTED: g  (706 aa)
 initn: 3620 init1: 2440 opt: 3617  Z-score: 4435.5  bits: 831.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3617; 78.9% identity (94.6% similar) in 683 aa overlap (3-682:28-706)

                                        10        20        30     
pF1KE6                          MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGY
                                  :::::.::.:::::.::.:::::::::::::::
XP_016 MTKIRELPSRNCCLIRGKKMNAHATASGIFAYLNYHVPRTRREILETLIKGLQRLEYRGY
               10        20        30        40        50        60

          40           50        60        70        80        90  
pF1KE6 DSAGVAIDGNNH---EVKERHIQLVKKRGKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTR
       :::::..::.:    :..  .:::.::.:::::::::..::..::: .::..:.::::::
XP_016 DSAGVGFDGGNDKDWEANACKIQLIKKKGKVKALDEEVHKQQDMDLDIEFDVHLGIAHTR
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KE6 WATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHNGIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKL
       ::::: :: ::::::::::.:::.:::::::::::::.::::::::.:::::::::::::
XP_016 WATHGEPSPVNSHPQRSDKNNEFIVIHNGIITNYKDLKKFLESKGYDFESETDTETIAKL
              130       140       150       160       170       180

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE6 IKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEGAFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKY
       .::..::::..: .:.::::::::::::::::::::::.::.::.:::::::::::::..
XP_016 VKYMYDNRESQDTSFTTLVERVIQQLEGAFALVFKSVHFPGQAVGTRRGSPLLIGVRSEH
              190       200       210       220       230       240

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE6 KLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKTRMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTN
       ::::..:::::::   .. :. :.  ..:.::..::  : .::::..:::::::.:::::
XP_016 KLSTDHIPILYRTG--KDKKGSCN--LSRVDSTTCLFPVEEKAVEYYFASDASAVIEHTN
              250         260         270       280       290      

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE6 RVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSASDDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFE
       :::::::::.:::.::.:::::.::.:.: :.::.::::::::::::::::.::::::::
XP_016 RVIFLEDDDVAAVVDGRLSIHRIKRTAGDHPGRAVQTLQMELQQIMKGNFSSFMQKEIFE
        300       310       320       330       340       350      

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE6 QPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDHLKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEEL
       ::::: :::::::::.  :: :::::::.:::.::::::.:.:::::::.::::::::::
XP_016 QPESVVNTMRGRVNFDDYTVNLGGLKDHIKEIQRCRRLILIACGTSYHAGVATRQVLEEL
        360       370       380       390       400       410      

            400       410       420       430       440       450  
pF1KE6 TELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFFISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVG
       ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::..:::::.:::::::.:::::
XP_016 TELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFFLSQSGETADTLMGLRYCKERGALTVGITNTVG
        420       430       440       450       460       470      

            460       470       480       490       500       510  
pF1KE6 SSISRETDCGVHINAGPEVGVASTKAYTSQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLR
       ::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::.::: .::::.:.::.::. ::.
XP_016 SSISRETDCGVHINAGPEIGVASTKAYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLK
        480       490       500       510       520       530      

            520       530       540       550       560       570  
pF1KE6 SLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRSLLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGIL
        ::.:::::::....:. :: ::: :.:.:.:::::.:::::::::::::::::::::::
XP_016 RLPDLIKEVLSMDDEIQKLATELYHQKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGIL
        540       550       560       570       580       590      

            580       590       600       610       620       630  
pF1KE6 AGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCFAKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFA
       :::::::::::.:: :::::.::.:  .::::::::::.::::::...:.:.:::. : .
XP_016 AGELKHGPLALVDKLMPVIMIIMRDHTYAKCQNALQQVVARQGRPVVICDKEDTETIKNT
        600       610       620       630       640       650      

            640       650       660       670       680  
pF1KE6 YKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLLSFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
        .::..::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_016 KRTIKVPHSVDCLQGILSVIPLQLLAFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
        660       670       680       690       700      

>>XP_016865589 (OMIM: 603865) PREDICTED: glutamine--fruc  (507 aa)
 initn: 3124 init1: 3124 opt: 3124  Z-score: 3832.6  bits: 719.1 E(85289): 9.8e-207
Smith-Waterman score: 3124; 98.8% identity (99.6% similar) in 489 aa overlap (194-682:19-507)

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE6 DITFSTLVERVIQQLEGAFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILY
                                     :. .. ::::::::::::::::::::::::
XP_016             MCSTTEKLRTLRFQRWSRESFSSWRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILY
                           10        20        30        40        

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE6 RTCTLENVKNICKTRMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTCTLENVKNICKTRMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIA
       50        60        70        80        90       100        

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE6 AVADGKLSIHRVKRSASDDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVADGKLSIHRVKRSASDDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRG
      110       120       130       140       150       160        

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE6 RVNFETNTVLLGGLKDHLKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNFETNTVLLGGLKDHLKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELAS
      170       180       190       200       210       220        

           410       420       430       440       450       460   
pF1KE6 DFLDRNTPVFRDDVCFFISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFLDRNTPVFRDDVCFFISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGV
      230       240       250       260       270       280        

           470       480       490       500       510       520   
pF1KE6 HINAGPEVGVASTKAYTSQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLS
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HINAGPEIGVASTKAYTSQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLS
      290       300       310       320       330       340        

           530       540       550       560       570       580   
pF1KE6 LEEKIHDLALELYTQRSLLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEEKIHDLALELYTQRSLLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLAL
      350       360       370       380       390       400        

           590       600       610       620       630       640   
pF1KE6 IDKQMPVIMVIMKDPCFAKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IDKQMPVIMVIMKDPCFAKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVD
      410       420       430       440       450       460        

           650       660       670       680  
pF1KE6 CLQGILSVIPLQLLSFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLQGILSVIPLQLLSFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
      470       480       490       500       

>>NP_001231639 (OMIM: 138292,608931,610542) glutamine--f  (699 aa)
 initn: 3640 init1: 2440 opt: 2442  Z-score: 2993.6  bits: 564.4 E(85289): 5.2e-160
Smith-Waterman score: 3610; 77.2% identity (92.4% similar) in 701 aa overlap (1-682:1-699)

               10        20        30        40           50       
pF1KE6 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNH---EVKERHIQLV
       :::::::.::.:::::.::.::::::::::::::::::::..::.:    :..  .:::.
NP_001 MCGIFAYLNYHVPRTRREILETLIKGLQRLEYRGYDSAGVGFDGGNDKDWEANACKIQLI
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE6 KKRGKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVV
       ::.:::::::::..::..::: .::..:.::::::::::: :: ::::::::::.:::.:
NP_001 KKKGKVKALDEEVHKQQDMDLDIEFDVHLGIAHTRWATHGEPSPVNSHPQRSDKNNEFIV
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE6 IHNGIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQ
       ::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::..::::..: .:.:::::::::
NP_001 IHNGIITNYKDLKKFLESKGYDFESETDTETIAKLVKYMYDNRESQDTSFTTLVERVIQQ
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220                 
pF1KE6 LEGAFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLE--------
       :::::::::::::.::.::.:::::::::::::..::::..:::::::   .        
NP_001 LEGAFALVFKSVHFPGQAVGTRRGSPLLIGVRSEHKLSTDHIPILYRTARTQIGSKFTRW
              190       200       210       220       230       240

             230       240       250       260       270       280 
pF1KE6 --------NVKNICKTRMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDD
               . :. :.  ..:.::..::  : .::::..:::::::.::::::::::::::
NP_001 GSQGERGKDKKGSCN--LSRVDSTTCLFPVEEKAVEYYFASDASAVIEHTNRVIFLEDDD
              250         260       270       280       290        

             290       300       310       320       330       340 
pF1KE6 IAAVADGKLSIHRVKRSASDDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTM
       .:::.::.:::::.::.:.: :.::.::::::::::::::::.::::::::::::: :::
NP_001 VAAVVDGRLSIHRIKRTAGDHPGRAVQTLQMELQQIMKGNFSSFMQKEIFEQPESVVNTM
      300       310       320       330       340       350        

             350       360       370       380       390       400 
pF1KE6 RGRVNFETNTVLLGGLKDHLKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVEL
       ::::::.  :: :::::::.:::.::::::.:.:::::::.:::::::::::::::::::
NP_001 RGRVNFDDYTVNLGGLKDHIKEIQRCRRLILIACGTSYHAGVATRQVLEELTELPVMVEL
      360       370       380       390       400       410        

             410       420       430       440       450       460 
pF1KE6 ASDFLDRNTPVFRDDVCFFISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDC
       :::::::::::::::::::.::::::::::..:::::.:::::::.::::::::::::::
NP_001 ASDFLDRNTPVFRDDVCFFLSQSGETADTLMGLRYCKERGALTVGITNTVGSSISRETDC
      420       430       440       450       460       470        

             470       480       490       500       510       520 
pF1KE6 GVHINAGPEVGVASTKAYTSQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEV
       :::::::::.::::::::::::.:::::.::: .::::.:.::.::. ::. ::.:::::
NP_001 GVHINAGPEIGVASTKAYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEV
      480       490       500       510       520       530        

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE6 LSLEEKIHDLALELYTQRSLLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPL
       ::....:. :: ::: :.:.:.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSMDDEIQKLATELYHQKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPL
      540       550       560       570       580       590        

             590       600       610       620       630       640 
pF1KE6 ALIDKQMPVIMVIMKDPCFAKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHT
       ::.:: :::::.::.:  .::::::::::.::::::...:.:.:::. : . .::..::.
NP_001 ALVDKLMPVIMIIMRDHTYAKCQNALQQVVARQGRPVVICDKEDTETIKNTKRTIKVPHS
      600       610       620       630       640       650        

             650       660       670       680  
pF1KE6 VDCLQGILSVIPLQLLSFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
       ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDCLQGILSVIPLQLLAFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
      660       670       680       690         

>>XP_016859290 (OMIM: 138292,608931,610542) PREDICTED: g  (724 aa)
 initn: 3620 init1: 2440 opt: 2442  Z-score: 2993.4  bits: 564.4 E(85289): 5.4e-160
Smith-Waterman score: 3590; 77.1% identity (92.4% similar) in 699 aa overlap (3-682:28-724)

                                        10        20        30     
pF1KE6                          MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGY
                                  :::::.::.:::::.::.:::::::::::::::
XP_016 MTKIRELPSRNCCLIRGKKMNAHATASGIFAYLNYHVPRTRREILETLIKGLQRLEYRGY
               10        20        30        40        50        60

          40           50        60        70        80        90  
pF1KE6 DSAGVAIDGNNH---EVKERHIQLVKKRGKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTR
       :::::..::.:    :..  .:::.::.:::::::::..::..::: .::..:.::::::
XP_016 DSAGVGFDGGNDKDWEANACKIQLIKKKGKVKALDEEVHKQQDMDLDIEFDVHLGIAHTR
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KE6 WATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHNGIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKL
       ::::: :: ::::::::::.:::.:::::::::::::.::::::::.:::::::::::::
XP_016 WATHGEPSPVNSHPQRSDKNNEFIVIHNGIITNYKDLKKFLESKGYDFESETDTETIAKL
              130       140       150       160       170       180

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE6 IKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEGAFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKY
       .::..::::..: .:.::::::::::::::::::::::.::.::.:::::::::::::..
XP_016 VKYMYDNRESQDTSFTTLVERVIQQLEGAFALVFKSVHFPGQAVGTRRGSPLLIGVRSEH
              190       200       210       220       230       240

            220                       230       240       250      
pF1KE6 KLSTEQIPILYRTCTLE----------------NVKNICKTRMKRLDSSACLHAVGDKAV
       ::::..:::::::   .                . :. :.  ..:.::..::  : .:::
XP_016 KLSTDHIPILYRTARTQIGSKFTRWGSQGERGKDKKGSCN--LSRVDSTTCLFPVEEKAV
              250       260       270       280         290        

        260       270       280       290       300       310      
pF1KE6 EFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSASDDPSRAIQTLQMELQQ
       :..:::::::.::::::::::::::.:::.::.:::::.::.:.: :.::.:::::::::
XP_016 EYYFASDASAVIEHTNRVIFLEDDDVAAVVDGRLSIHRIKRTAGDHPGRAVQTLQMELQQ
      300       310       320       330       340       350        

        320       330       340       350       360       370      
pF1KE6 IMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDHLKEIRRCRRLIVIGCG
       :::::::.::::::::::::: :::::::::.  :: :::::::.:::.::::::.:.::
XP_016 IMKGNFSSFMQKEIFEQPESVVNTMRGRVNFDDYTVNLGGLKDHIKEIQRCRRLILIACG
      360       370       380       390       400       410        

        380       390       400       410       420       430      
pF1KE6 TSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFFISQSGETADTLLALRY
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::..:::
XP_016 TSYHAGVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFFLSQSGETADTLMGLRY
      420       430       440       450       460       470        

        440       450       460       470       480       490      
pF1KE6 CKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEVGVASTKAYTSQFISLVMFGLMMSED
       ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::.::: .:
XP_016 CKERGALTVGITNTVGSSISRETDCGVHINAGPEIGVASTKAYTSQFVSLVMFALMMCDD
      480       490       500       510       520       530        

        500       510       520       530       540       550      
pF1KE6 RISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRSLLVMGRGYNYATCLEG
       :::.:.::.::. ::. ::.:::::::....:. :: ::: :.:.:.:::::.:::::::
XP_016 RISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEVLSMDDEIQKLATELYHQKSVLIMGRGYHYATCLEG
      540       550       560       570       580       590        

        560       570       580       590       600       610      
pF1KE6 ALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCFAKCQNALQQVTARQGR
       :::::::::::::::::::::::::::.:: :::::.::.:  .::::::::::.:::::
XP_016 ALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALVDKLMPVIMIIMRDHTYAKCQNALQQVVARQGR
      600       610       620       630       640       650        

        620       630       640       650       660       670      
pF1KE6 PIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLLSFHLAVLRGYDVDFPRNLA
       :...:.:.:::. : . .::..::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::
XP_016 PVVICDKEDTETIKNTKRTIKVPHSVDCLQGILSVIPLQLLAFHLAVLRGYDVDFPRNLA
      660       670       680       690       700       710        

        680  
pF1KE6 KSVTVE
       ::::::
XP_016 KSVTVE
      720    

>>NP_002694 (OMIM: 172450) amidophosphoribosyltransferas  (517 aa)
 initn: 207 init1:  99 opt: 200  Z-score: 244.3  bits: 55.2 E(85289): 7.3e-07
Smith-Waterman score: 209; 27.0% identity (58.3% similar) in 211 aa overlap (2-207:12-209)

                         10        20        30        40          
pF1KE6           MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAI-DGNNHEV
                  ::.:. .      :. .. ...  ::  :..:: .:::..  ::..  .
NP_002 MELEELGIREECGVFGCIASGEWPTQLDVPHVITLGLVGLQHRGQESAGIVTSDGSSVPT
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE6 KERHIQLVKKRGKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRS
        . :    :  : :.    ... .:  .::  . ...::.:::.:: :     : .:   
NP_002 FKSH----KGMGLVN----HVFTED--NLKKLYVSNLGIGHTRYATTGKCELENCQPFVV
                   70              80        90       100       110

     110        120       130       140       150       160        
pF1KE6 DK-GNEFVVIHNGIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFS
       .   ....: ::: ..:   ::: :  .:  . . .:.: :..:. :.  ... .   . 
NP_002 ETLHGKIAVAHNGELVNAARLRKKLLRHGIGLSTSSDSEMITQLLAYTPPQEQDDTPDWV
              120       130       140       150       160       170

      170       180         190       200        210       220     
pF1KE6 TLVERVIQQLEGAFALVF--KSVHYPGEAVATRRGS-PLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRT
       . .. ....   :..:..  ..: :   ::    :. :: ::                  
NP_002 ARIKNLMKEAPTAYSLLIMHRDVIY---AVRDPYGNRPLCIGRLIPVSDINDKEKKTSET
              180       190          200       210       220       

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE6 CTLENVKNICKTRMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAV
                                                                   
NP_002 EGWVVSSESCSFLSIGARYYREVLPGEIVEISRHNVQTLDIISRSEGNPVAFCIFEYVYF
       230       240       250       260       270       280       




682 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 15:40:58 2016 done: Tue Nov  8 15:41:00 2016
 Total Scan time:  8.850 Total Display time:  0.130

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com