Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5207, 529 aa
1>>>pF1KB5207 529 - 529 aa - 529 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2318+/-0.000973; mu= 13.8651+/- 0.058
mean_var=73.7808+/-14.566, 0's: 0 Z-trim(105.4): 14 B-trim: 77 in 1/49
Lambda= 0.149315
statistics sampled from 8412 (8420) to 8412 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8924.1 ATP5B gene_id:506|Hs108|chr12 ( 529) 3376 736.7 1.5e-212
CCDS58620.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 ( 503) 377 90.7 4.4e-18
CCDS11927.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 ( 553) 377 90.7 4.8e-18
CCDS6014.1 ATP6V1B2 gene_id:526|Hs108|chr8 ( 511) 368 88.7 1.7e-17
CCDS1912.1 ATP6V1B1 gene_id:525|Hs108|chr2 ( 513) 361 87.2 4.9e-17
CCDS2976.1 ATP6V1A gene_id:523|Hs108|chr3 ( 617) 337 82.1 2.1e-15
CCDS59315.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 ( 531) 280 69.8 9e-12
>>CCDS8924.1 ATP5B gene_id:506|Hs108|chr12 (529 aa)
initn: 3376 init1: 3376 opt: 3376 Z-score: 3929.2 bits: 736.7 E(32554): 1.5e-212
Smith-Waterman score: 3376; 100.0% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAAT
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CCDS89 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQ
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CCDS89 RGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERT
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CCDS89 EILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 REGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 REGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAI
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CCDS89 VLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDV
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CCDS89 YVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 LVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS
490 500 510 520
>>CCDS58620.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 (503 aa)
initn: 277 init1: 214 opt: 377 Z-score: 438.2 bits: 90.7 E(32554): 4.4e-18
Smith-Waterman score: 394; 25.1% identity (56.3% similar) in 435 aa overlap (115-526:70-485)
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 ALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGR
:.. :.. :. : .:: . .::: : :::
CCDS58 VQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 IMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIG
.....:. :: .::: .: . .:: .. .: . ::::.:: :.: ..: .
CCDS58 VVDALGNAIDGKGPIGSKTRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQREL
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KB5 LFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVI
..: .::: . .. : : . . : : .....:.. .: ... ..
CCDS58 IIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA---
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 NLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGS
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CCDS58 ---DAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 EVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAP
..: :: : :. .: . . . :: . . ::.:.. .: . : :.. :
CCDS58 QMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIP
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 ATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDY
..... :. : . :: ::.. :.::. . . .. . . :..:. : .:
CCDS58 TNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQY
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480
pF1KB5 KSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVP
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CCDS58 REVA-AFAQFGSD-LDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDK
400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KB5 LKET-IKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS
:. . : :.. . .:. : ..: : .:: :..:.
CCDS58 LEPSKITKFENAF---LSHVVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAG
450 460 470 480 490 500
CCDS58 FEA
>>CCDS11927.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 (553 aa)
initn: 277 init1: 214 opt: 377 Z-score: 437.5 bits: 90.7 E(32554): 4.8e-18
Smith-Waterman score: 397; 24.1% identity (55.2% similar) in 560 aa overlap (7-526:5-535)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAA-PTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAA
::::: . . :: : :. : : .. .:.. :... :.:.:
CCDS11 MLSVRVAAAVVRALPRR---------AGLVSRNALGSSFIAARNFHASNTHLQKTGTA
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB5 TGRIVA---VIGAVVDVQFDE---------GLPPILNALEVQGRE----TRLVLEVAQHL
. ..:: ..:...: :. . . .::..: . . .. .:
CCDS11 EMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQ
..: .... :.. :.. :. : .:: . .::: : :::.....:. :: .::: .:
CCDS11 EPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN
. .:: .. .: . ::::.:: :.: ..: . ..: .::: . .. : :
CCDS11 RRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIIN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB5 VAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEP
. . : : .....:.. .: ... .. :: . . .: . ..
CCDS11 QKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA------DAMKYTIVVSATASDA
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 PGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTL
. . .: ...:::::. :. .:.. :.. . . : ..: :: : :. .: .
CCDS11 APLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDV
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAE
. . :: . . ::.:.. .: . : :.. :..... :. : .
CCDS11 FYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFY
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 LGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDYKSLQDIIAILGMDELSEED
:: ::.. :.::. . . .. . . :..:. : .:. . .: .: : :.
CCDS11 KGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVA-AFAQFGSD-LDAAT
410 420 430 440 450
460 470 480 490 500
pF1KB5 KLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVPLKET-IKGFQQILAGEYDH
. .::. .. ..:.: :. ::: ...: : : :. . : :.. . .:
CCDS11 QQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAF---LSH
460 470 480 490 500 510
510 520
pF1KB5 LPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS
. : ..: : .:: :..:.
CCDS11 VVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAGFEA
520 530 540 550
>>CCDS6014.1 ATP6V1B2 gene_id:526|Hs108|chr8 (511 aa)
initn: 384 init1: 140 opt: 368 Z-score: 427.6 bits: 88.7 E(32554): 1.7e-17
Smith-Waterman score: 445; 25.7% identity (54.8% similar) in 513 aa overlap (15-499:8-503)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKA-GAA
: . .: .: . . : :. :.: .: . :. ...
CCDS60 MALRAMRGIVNGAAPELPVPTGGPAVGAREQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TGRIVAVIGAVVD-VQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEG
.: .: ..: :.: . . .: ... ::::. : ..: . ..:: :
CCDS60 NGPLV-----ILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVS---GSKAVVQV-FEGTSG
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LVRGQKVLD-SGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIK-TKQFAPIHAEAPEFMEM
. . . .: .. ::. . :::..: :.::: :::. ...: : .. . .
CCDS60 IDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-RGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN---VAKAHG--GYS
.:.. :::...: . :.: :: .:..::. .. . .. . : :.. ::
CCDS60 IYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB5 ------VFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALT
:::..: . . . .. :.: .. .: : . :.: : .
CCDS60 EENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMD------NVCLFLNLANDPTIERIITPRL
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQER
.::.::.. : . ::... .. ...: :::: ..:. :. . ::..:. ::
CCDS60 ALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYER
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 ITTT--KKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDS
. ..::::.. . .: ::.: : : : .. ..: . . ::: .. : :
CCDS60 AGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPS
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KB5 TSRIMDPNI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARK
::.: : . ..: ::. . :..: . :..: . :. .: : . .:
CCDS60 LSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQK
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 IQR-FLSQ-PFQVAEVF-TGHMG----KLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGP
..: :..: :.. :: : .: .. : :: .: . : .:.
CCDS60 FERNFIAQGPYENRTVFETLDIGWQLLRIFP-KEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH
460 470 480 490 500 510
520
pF1KB5 IEEAVAKADKLAEEHSS
>>CCDS1912.1 ATP6V1B1 gene_id:525|Hs108|chr2 (513 aa)
initn: 373 init1: 147 opt: 361 Z-score: 419.4 bits: 87.2 E(32554): 4.9e-17
Smith-Waterman score: 442; 26.2% identity (55.5% similar) in 503 aa overlap (26-499:12-497)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPV-RDYAAQTSPSPKAGAA
:: .. : :: .. : :.: .. :..
CCDS19 MAMEIDSRPGGLPGSSCNLGAAREHMQAVTRNYITH----PRVTYR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TGRIVAVIG--AVVD-VQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGT
: . .: : .:.: :.: . . .: ... ::::: : ... . ..::
CCDS19 T--VCSVNGPLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVA---GTKAIVQV-FEGT
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EGL-VRGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPI-KTKQFAPIHAEAPEFM
:. .: .: .. ::. . :::..: :.::: .::. ...: :... .
CCDS19 SGIDARKTTCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-KGPVVMAEDFLDINGQPINPH
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KB5 EMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNV-----AKAHGG
.:.. :::. .:.. :.: :: .:..::. .. . .. .. .::
CCDS19 SRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLD
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 YS------VFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVA
: :::..: . . . .. ..:.. ..: : . :.: : .
CCDS19 YHDDNFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTM------GNVCLFLNLANDPTIERIITP
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQ
.::.::.. : . ::... .. ...: :::: ..:. :. . ::..:.
CCDS19 RLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIY
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 ERITTT--KKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPL
:: . . ::::.. . .: ::.: : : : .. ..: . . ::: .. :
CCDS19 ERAGRVEGRGGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVL
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KB5 DSTSRIMDPNI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRA
: ::.: : . ..: ::. . :..: . :..: . :. :: : .
CCDS19 PSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFL
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RKIQR-FLSQ-PFQVAEVFTG-HMG-KLVPL--KETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVG
.:... :..: :.. :: . .: ::. . :: .: . : . :.
CCDS19 QKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRIFPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAP
450 460 470 480 490 500
520
pF1KB5 PIEEAVAKADKLAEEHSS
CCDS19 DTAL
510
>>CCDS2976.1 ATP6V1A gene_id:523|Hs108|chr3 (617 aa)
initn: 147 init1: 147 opt: 337 Z-score: 390.1 bits: 82.1 E(32554): 2.1e-15
Smith-Waterman score: 395; 26.6% identity (59.4% similar) in 394 aa overlap (97-466:141-522)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL
:.:..:. . . :. ... :.. . .:
CCDS29 SQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPCKNLRVGSHITGGDIYGIVSENS--LIKHKIML
120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ---DSGAPIKI-PVGP-ETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQE
. :. : : : .: .... : . :. . : :.. : .. ...
CCDS29 PPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEK--FTMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHP
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