Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5402
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5402, 384 aa
1>>>pF1KB5402 384 - 384 aa - 384 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2294+/-0.000826; mu= 12.7308+/- 0.050
mean_var=93.4284+/-18.531, 0's: 0 Z-trim(109.4): 65 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.132689
statistics sampled from 10818 (10884) to 10818 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 ( 384) 2552 498.6 3.9e-141
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 394) 960 193.8 2.2e-49
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 ( 367) 949 191.7 9e-49
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 303) 749 153.4 2.6e-37
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 ( 314) 676 139.4 4.3e-33
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 ( 482) 456 97.4 2.9e-20
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX ( 384) 424 91.2 1.7e-18
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 ( 419) 424 91.2 1.8e-18
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 ( 381) 408 88.2 1.4e-17
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12 ( 665) 368 80.6 4.4e-15
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11 ( 625) 334 74.1 3.8e-13
CCDS11320.1 DUSP14 gene_id:11072|Hs108|chr17 ( 198) 322 71.5 7.3e-13
CCDS55882.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 692) 329 73.2 8.1e-13
CCDS53825.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 703) 329 73.2 8.2e-13
CCDS9121.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 (1049) 329 73.3 1.1e-12
CCDS11253.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1423) 324 72.4 2.9e-12
CCDS74024.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1450) 324 72.4 2.9e-12
CCDS13193.1 DUSP15 gene_id:128853|Hs108|chr20 ( 235) 305 68.3 8e-12
CCDS2289.1 DUSP19 gene_id:142679|Hs108|chr2 ( 217) 299 67.1 1.7e-11
CCDS82607.1 DUSP15 gene_id:128853|Hs108|chr20 ( 232) 299 67.2 1.8e-11
CCDS13883.1 DUSP18 gene_id:150290|Hs108|chr22 ( 188) 297 66.7 1.9e-11
CCDS82606.1 DUSP15 gene_id:128853|Hs108|chr20 ( 295) 299 67.2 2.1e-11
CCDS6092.1 DUSP26 gene_id:78986|Hs108|chr8 ( 211) 296 66.6 2.4e-11
CCDS4468.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6 ( 184) 294 66.1 2.8e-11
CCDS69035.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6 ( 205) 294 66.2 3.1e-11
CCDS33418.1 DUSP28 gene_id:285193|Hs108|chr2 ( 176) 288 65.0 6e-11
CCDS14264.1 DUSP21 gene_id:63904|Hs108|chrX ( 190) 287 64.8 7.3e-11
>>CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 (384 aa)
initn: 2552 init1: 2552 opt: 2552 Z-score: 2647.2 bits: 498.6 E(32554): 3.9e-141
Smith-Waterman score: 2552; 99.5% identity (99.5% similar) in 384 aa overlap (1-384:1-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLNSVVLRRARGGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLNSVVLRRARGGAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SARYVLPDEAARARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARVVLTPLLACLPAGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS75 SARYVLPDEAARARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARVVLTSLLACLPAGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVKPISQEKIESERALISQCGKPVVNVSYRPAYDQGGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVKPISQEKIESERALISQCGKPVVNVSYRPAYDQGGPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACMTHLHYKWIPVEDSHTADISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS75 EILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACATHLHYKWIPVEDSHTADISS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKTKQFRLKEAFDYIKQRRSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKTKQFRLKEAFDYIKQRRSMV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPSCQGEAAGSSLIGHLQTLSPDMQGAYCTFPASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPSCQGEAAGSSLIGHLQTLSPDMQGAYCTFPASV
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB5 LAPVPTHSTVSELSRSPVATATSC
::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LAPVPTHSTVSELSRSPVATATSC
370 380
>>CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (394 aa)
initn: 900 init1: 634 opt: 960 Z-score: 1000.0 bits: 193.8 E(32554): 2.2e-49
Smith-Waterman score: 968; 46.7% identity (67.5% similar) in 381 aa overlap (19-384:41-394)
10 20 30 40
pF1KB5 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLN
....:..:::::.:: .:. . ::.:: :
CCDS60 DCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVRCN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 SVVLRRARGGAVSARYVLP-DEAARARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARV
..: :::.: .:: . .:: .: .:::: . : .::.: :. : . ..:::.:.. .
CCDS60 TIVRRRAKG-SVSLEQILPAEEEVRARLRS---GLYSAVIVYDERSPRAESLREDSTVSL
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VLTPLLACLPAGPRVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVK-------PISQEKIESERALISQ
:. : . .:::::: : ::::: : .: :. : :.
CCDS60 VVQALRRNAERTD-ICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 CGKPVVNVSYRPAYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACM
:: :. .::::::::::::::::::::.. ..: : :::::::: .
CCDS60 CGTPL--------HDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 THLHYKWIPVEDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMK
: .:: :::::.: ::::: :.:::..:: :.. :.:::::.:::::: :::.::::
CCDS60 GHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TKQFRLKEAFDYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPSCQGEAAGSSLIG
:. ::.:::...:::::..::::.:::::::.::..: . :: .:::. : :
CCDS60 KKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAT-------SCAAEAASPS--G
300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KB5 HLQT-----LSPDMQGAYCTFPASVLAPVPTHSTVSELS--RSPVATATSC
:. .: : .. .::.:: .::. : : .::..:. ::
CCDS60 PLRERGKTPATPTSQFVF-SFPVSV----GVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
350 360 370 380 390
>>CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 (367 aa)
initn: 898 init1: 657 opt: 949 Z-score: 989.1 bits: 191.7 E(32554): 9e-49
Smith-Waterman score: 1003; 45.4% identity (69.5% similar) in 394 aa overlap (1-384:3-367)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLNSVVLRRARGG
:.: .::. :: .: : ::.:..:::: ..:: :... ::.:: ....: :::.:
CCDS43 MVMEVGTLDAGGLRALL-GERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRRRAKG-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 AVSARYVLPDEAARARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARVVLTPLLACLPA
:.. ....:. :.::: .:. :::.::. : . ..... ..:. : :
CCDS43 AMGLEHIVPNAELRGRLL---AGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGT--LALAAGALCREA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 -GPRVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVK-------PISQEKIESERALISQCGKPVVNVSY
. .:.:::::::.: . :: : . :.: .: .. :.:. :.
CCDS43 RAAQVFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPL-----
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RPAYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACMTHLHYKWIPV
::::::::::::::::::::::. ..: : ::::.::: . : .:: :::
CCDS43 ---YDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKTKQFRLKEAF
::.: ::::: :.::::::: ... ::.:.:::.:::::: :::.::::.:.. .: :::
CCDS43 EDNHKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPSCQGEAAGSSLIGHLQTLSPDMQ
...:::::..::::.:::::::.::..: : :..:: :: .. :. .
CCDS43 EFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLA-------PHCSAEA-GSPAMAVLDRGTSTT-
290 300 310 320 330
360 370 380
pF1KB5 GAYCTFPASVLAPVPTHSTVSELS--RSPVATATSC
. .::.:. :.::: : :: .::..:. ::
CCDS43 -TVFNFPVSI----PVHSTNSALSYLQSPITTSPSC
340 350 360
>>CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (303 aa)
initn: 734 init1: 634 opt: 749 Z-score: 783.4 bits: 153.4 E(32554): 2.6e-37
Smith-Waterman score: 757; 49.8% identity (67.0% similar) in 273 aa overlap (126-384:53-303)
100 110 120 130 140
pF1KB5 WQKLREESAARVVLTPLLACLPAGPRVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVK-------PISQ
.:::: : ::::: : .: :.
CCDS60 GRDCKPVRAPSMALGVSQLAGRSRCLCSESQGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPP
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 EKIESERALISQCGKPVVNVSYRPAYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITAL
: :.:: :. .::::::::::::::::::::.. ..: : ::::
CCDS60 SATEPLDLGCSSCGTPL--------HDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITAL
90 100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 LNVSRRTSEACMTHLHYKWIPVEDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGIS
:::: . : .:: :::::.: ::::: :.:::..:: :.. :.:::::.::::
CCDS60 LNVSSDCPNHFEGHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGIS
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 RSPTICMAYLMKTKQFRLKEAFDYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPS
:: :::.:::: :. ::.:::...:::::..::::.:::::::.::..: . :
CCDS60 RSATICLAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAT-------S
200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 CQGEAAGSSLIGHLQT-----LSPDMQGAYCTFPASVLAPVPTHSTVSELS--RSPVATA
: .:::. : : :. .: : .. .::.: : .::. : : .::..:.
CCDS60 CAAEAASPS--GPLRERGKTPATPTSQFVF-SFPVS----VGVHSAPSSLPYLHSPITTS
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TSC
::
CCDS60 PSC
>>CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 (314 aa)
initn: 865 init1: 591 opt: 676 Z-score: 707.7 bits: 139.4 E(32554): 4.3e-33
Smith-Waterman score: 858; 48.3% identity (69.8% similar) in 321 aa overlap (6-318:9-312)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKVTSLDGRQLRKMLRK-EAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLNSVVLRRAR
:. : .:: . : : ..:::::.::: .::.. : :... ::::
CCDS20 MGLEAARELECAALGTLLRDPREAERTLLLDCRPFLAFCRRHVRAARPVPWNALLRRRAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 G--GAVSARYVLPDEAARARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARVVLTPLLA
: .:: : .:::.: :.::.. : .: .::::.:: .:: .: :.:.:. ::
CCDS20 GPPAAVLA-CLLPDRALRTRLVR---GELARAVVLDEGSASVAELRPDSPAHVLLAALLH
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 CLPAGPR-VYFLKGGYETFYSEYPECCVDVKPISQEKIESERALISQCGKPVVNVSYRPA
::: ::::.::.. : . :. : .. : :: : . : :.
CCDS20 ETRAGPTAVYFLRGGFDGFQGCCPDLCSEA-PAP--------ALPPTGDKTSRSDSRAPV
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB5 YDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACMTHLH----YKWIP
:::::::::::.:.::: :.: . : :::.:::: .: .:.. :: ::
CCDS20 YDQGGPVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLQACGITAVLNVS----ASCPNHFEGLFRYKSIP
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VEDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKTKQFRLKEA
:::.. ..::. ::::: ::: :...::.:::::.:::::: :::.::::.... :: ::
CCDS20 VEDNQMVEISAWFQEAIGFIDWVKNSGGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMQSRRVRLDEA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 FDYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPSCQGEAAGSSLIGHLQTLSPDM
::..::::...::::.:::::::.:...:
CCDS20 FDFVKQRRGVISPNFSFMGQLLQFETQVLCH
290 300 310
>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 (482 aa)
initn: 473 init1: 301 opt: 456 Z-score: 477.3 bits: 97.4 E(32554): 2.9e-20
Smith-Waterman score: 456; 27.7% identity (61.1% similar) in 321 aa overlap (24-331:173-477)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNL-NSVVL
:..::::.. . :...:....: ...
CCDS15 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100
pF1KB5 RRARGGAVSARYVLPDEAAR---ARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARVVL
:: . : ... .. . .. :.... ..: :... . ... . ..::
CCDS15 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSK------EIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVL
210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 TPLLACLPAGPRVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVKPISQEKIE---SERALISQCGKPVV
: : . :::: .: ... . : : . :: : . : : .:.
CCDS15 ESLKR---EGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLC-DNSLQLQECREVGGGASAASSLLPQPIP
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 NVSYRPAYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACMTH----
.. : ... . :::::.::. :. . . :.: ..:: :.. . :
CCDS15 TT---PDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINV---TTHLPLYHYEKG
320 330 340 350 360
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 -LHYKWIPVEDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKT
..:: .:. ::. .. ..:.::..::. ... : .:.::.::.::: :: .:::::
CCDS15 LFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKH
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KQFRLKEAFDYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPS-TPNPQPPSCQGEAAGSSLIG
.. . .:. ..: .: ..:::..::::::..: .. . :: :. .:
CCDS15 TRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
430 440 450 460 470 480
350 360 370 380
pF1KB5 HLQTLSPDMQGAYCTFPASVLAPVPTHSTVSELSRSPVATATSC
>>CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX (384 aa)
initn: 538 init1: 315 opt: 424 Z-score: 445.7 bits: 91.2 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 545; 33.0% identity (57.1% similar) in 382 aa overlap (15-357:11-383)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAA---RCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLNSVVLRRARG
::.: . : ..:::: . .. . :.:.: : ...::: :
CCDS14 MEGLGRSCLWLRRELSPPRPRLLLLDCRSRELYESARIGGALSVALPALLLRRLRR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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:..:.: .:: :: : :.. :::. . .. . :: :. :: :
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60 70 80 90 100
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: : : .:.:.::. : .: :. : .. :.
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150 160 170 180 190 200
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:. . :..: .: :: ... :. ... ::.::: :::::: ... : ::.:
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210 220 230 240 250 260
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: .:::. . . .::: ::. : . ..: : :::.::: . .. :::
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:: ::.::: :. .::::. .. :..:.: .:...: .::::.::::::..: .
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. : . :.:...: . : .: .::. :
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..:. . ...::: : : . : ..:..: . :. . . :.:.. :... .::
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:..: . :.: :...:.. .:
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CCDS90 PCDNRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]