Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7769
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7769, 450 aa
1>>>pF1KB7769 450 - 450 aa - 450 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8550+/-0.00101; mu= -4.7745+/- 0.061
mean_var=451.1594+/-94.905, 0's: 0 Z-trim(117.6): 572 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.060382
statistics sampled from 17683 (18330) to 17683 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.836), E-opt: 0.2 (0.563), width: 16
Scan time: 3.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12982.1 ZNF446 gene_id:55663|Hs108|chr19 ( 450) 3222 294.6 1.4e-79
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CCDS12971.1 ZSCAN18 gene_id:65982|Hs108|chr19 ( 510) 626 68.5 1.8e-11
CCDS46214.1 ZSCAN18 gene_id:65982|Hs108|chr19 ( 566) 626 68.6 1.9e-11
>>CCDS12982.1 ZNF446 gene_id:55663|Hs108|chr19 (450 aa)
initn: 3222 init1: 3222 opt: 3222 Z-score: 1542.4 bits: 294.6 E(32554): 1.4e-79
Smith-Waterman score: 3222; 99.8% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:1-450)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SKEQMLEMLVLEQFLGTLPPEIQAWVRGQRPGSPEEAAALVEGLQHDPGQLLGWITAHVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQEVLPAAQKTEEPLGSPHPSGTVESPGEGPQDTRIEGSVQLSCSVKEEPNVDGQEVAPS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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CCDS12 SPPLAAQSPEGNHGHQEPASTSFHPPRIQEEWGLLDRSQKELYWDAMLEKYGTVVSLGLP
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CCDS12 PHQPEAQAQSELGMLLTGTGVCRSLRSGNESEGPPGCPEAQPPQGPGPAAWEGLSGAATP
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 APTVRPGTPPVPTQPTPAETRLEPAATPRKPYTCEQCGRGFDWKSVFVIHHRTHTSGPGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QSPGLATGESTEKPPQGEVAFPHHPRRSLTGPRSYPCEECGCSFSWKSQLVIHRKSHTGQ
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CCDS12 QSPGLATGESTEKPPQGEVAFPHHPRRSLTGPRSYPCEECGCSFSWKSQLVIHRKSHTGQ
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430 440 450
pF1KB7 RRHFCSDCGRAFDWKSQLVIHRKGHRPEVP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRHFCSDCGRAFDWKSQLVIHRKGHRPEVP
430 440 450
>>CCDS76957.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 (548 aa)
initn: 886 init1: 433 opt: 713 Z-score: 360.2 bits: 76.1 E(32554): 9.7e-14
Smith-Waterman score: 713; 35.0% identity (56.6% similar) in 449 aa overlap (19-450:34-462)
10 20 30 40
pF1KB7 MPSPLGPPCLPVMDPETTLEEPETARLRFRGFCYQEVAGPREALARLR
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CCDS76 DLGQALGLLPSLAKAEDSQFSESDAALQEELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLKQLR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ELCCQWLQPEAHSKEQMLEMLVLEQFLGTLPPEIQAWVRGQRPGSPEEAAALVEGLQHDP
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CCDS76 KLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDP
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110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GQLLGWITAHVLKQEVLPAAQKTEEPLGSPHPSGTVESPGEG-PQDTRIEGSVQ-----L
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CCDS76 QRLWQWISIQVLGQDIL--SEKMESP---SCQVGEVEPHLEVVPQELGLENSSSGPGELL
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 SCSVKEEPNVDGQEVAPSSPPLAAQSPEGHHGHQEPASTSFHPPRIQEEWGLLDRSQKEL
: :::: ..... . .: : :. : :. ..:. : ::.: :: .:::
CCDS76 SHIVKEESDTEAELALAASQP--ARLEERLIRDQD-LGASLLPAAPQEQWRQLDSTQKEQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 YWDAMLEKYGTVVSLGLPPHQPEAQAQSELGMLLTGTGVCRSLRSGNESEGPPGCPEAQP
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CCDS76 YWDLMLETYGKMVSGGISHPKSDLTNSIEFGEELAGIYL-----HVNEKIPRPTCIGDRQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB7 PQGPGPAAWEGLSGAATPAPTVRPGTPPVPTQPT--PAETRLEPAA------TPRKPYTC
. :. . . .. ::.: . :. ::. :. .
CCDS76 ENDKENLNLENHRDQELLHASCQ-ASGEVPSQASLRGFFTEDEPGCFGEGENLPEALQNI
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 EQCGRGFDWKSVFVIHHRTHTSGPGVQSPGLATGESTEK--PPQGEVAFPHHPRRSLTGP
.. : : . . ..: . : . :. .:: . . :.. .:: ..
CCDS76 QDEGTGEQLSP----QERISEKQLGQHLPNPHSGEMSTMWLEEKRETSQKGQPRAPMA--
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 RSYP-CEECGCSFSWKSQLVIHRKSHTGQRRHFCSDCGRAFDWKSQLVIHRKGHRPEVP
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CCDS76 QKLPTCRECGKTFYRNSQLIFHQRTHTGETYFQCTICKKAFLRSSDFVKHQRTHTGEKPC
410 420 430 440 450 460
CCDS76 KCDYCGKGFSDFSGLRHHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNFNRHQRVHTGEKPYKCSH
470 480 490 500 510 520
>>CCDS32568.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 (549 aa)
initn: 752 init1: 433 opt: 703 Z-score: 355.5 bits: 75.3 E(32554): 1.8e-13
Smith-Waterman score: 703; 34.9% identity (56.4% similar) in 450 aa overlap (19-450:34-463)
10 20 30 40
pF1KB7 MPSPLGPPCLPVMDPETTLEEPETARLRFRGFCYQEVAGPREALARLR
: ::::: :: : :: ..::.:.: .::
CCDS32 DLGQALGLLPSLAKAEDSQFSESDAALQEELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLKQLR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ELCCQWLQPEAHSKEQMLEMLVLEQFLGTLPPEIQAWVRGQRPGSPEEAAALVEGLQHDP
.:: ::::::.:.:::.::.:.::::: :: ::: ::: : ::: :::..:::.:. ::
CCDS32 KLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLKGDP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GQLLGWITAHVLKQEVLPAAQKTEEPLGSPHPSGTVESPGEG-PQDTRIEGSVQ-----L
.: ::. .:: :..: ..: : : : :: : ::. .:.: . :
CCDS32 QRLWQWISIQVLGQDIL--SEKMESP---SCQVGEVEPHLEVVPQELGLENSSSGPGELL
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 SCSVKEEPNVDGQEVAPSSPPLAAQSPEGHHGHQEPASTSFHPPRIQEEWGLLDRSQKEL
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CCDS32 SHIVKEESDTEAELALAASQP--ARLEERLIRDQD-LGASLLPAAPQEQWRQLDSTQKEQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 YWDAMLEKYGTVVS-LGLPPHQPEAQAQSELGMLLTGTGVCRSLRSGNESEGPPGCPEAQ
::: ::: :: .:: :. . . . :.: :.: . ::. : : .
CCDS32 YWDLMLETYGKMVSGAGISHPKSDLTNSIEFGEELAGIYL-----HVNEKIPRPTCIGDR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB7 PPQGPGPAAWEGLSGAATPAPTVRPGTPPVPTQPT--PAETRLEPAA------TPRKPYT
. :. . . .. ::.: . :. ::. :. .
CCDS32 QENDKENLNLENHRDQELLHASCQ-ASGEVPSQASLRGFFTEDEPGCFGEGENLPEALQN
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 CEQCGRGFDWKSVFVIHHRTHTSGPGVQSPGLATGESTEK--PPQGEVAFPHHPRRSLTG
.. : : . . ..: . : . :. .:: . . :.. .:: ..
CCDS32 IQDEGTGEQLSP----QERISEKQLGQHLPNPHSGEMSTMWLEEKRETSQKGQPRAPMA-
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 PRSYP-CEECGCSFSWKSQLVIHRKSHTGQRRHFCSDCGRAFDWKSQLVIHRKGHRPEVP
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CCDS32 -QKLPTCRECGKTFYRNSQLIFHQRTHTGETYFQCTICKKAFLRSSDFVKHQRTHTGEKP
410 420 430 440 450 460
CCDS32 CKCDYCGKGFSDFSGLRHHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNFNRHQRVHTGEKPYKCS
470 480 490 500 510 520
>>CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 (734 aa)
initn: 1990 init1: 504 opt: 688 Z-score: 346.9 bits: 74.1 E(32554): 5.3e-13
Smith-Waterman score: 732; 36.7% identity (56.3% similar) in 460 aa overlap (2-450:14-439)
10 20 30 40
pF1KB7 MPSPLGPPCLPVMDPETTLEE------PETARLRFRGFCYQEVAGPRE
: :: . . : : : ::.:::::: : :.:..::.:
CCDS12 MRPAVLGSPDRAPPEDEGPVMVKLEDSEEEGEAALWDPGPEAARLRFRCFRYEEATGPQE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ALARLRELCCQWLQPEAHSKEQMLEMLVLEQFLGTLPPEIQAWVRGQRPGSPEEAAALVE
:::.::::: :::.::..:::::::.::::::::.::::::: :.::::::::::::::.
CCDS12 ALAQLRELCRQWLRPEVRSKEQMLELLVLEQFLGALPPEIQARVQGQRPGSPEEAAALVD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GLQHDPGQLLGWITAHVLKQEVLPAAQKTEEPLGSPHPSGTVESPGEGPQDT-RIEGSVQ
::...:: :.:..: :::: ..: : .: : .: ::. :
CCDS12 GLRREPGGPRRWVTVQVQGQEVL--SEKMEPSSFQPLPETEPPTPEPGPKTPPRTMQESP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 LSCSVKEEPNVDGQEVAPSSPPLAAQSPEGHHGHQEPASTSFHPPRIQEEWGLLDRSQKE
:. .:::: .: . : :::: :: . : . : . :. .:: .
CCDS12 LGLQVKEESEVTEDSDFLESGPLAAT--------QESVPT-LLPEEAQRCGTVLD----Q
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LYWDAMLEKYGTVVSLGLPPHQPEAQAQSELGMLLTGTGVCRSLRSGNESEGPPGC-PEA
.. . : ..:.: . : : ... : .:. :. : :: . :.
CCDS12 IFPHSKTGPEGPSWR-----EHPRALWHEEAGGIFS-PGF--ALQLGSISAGPGSVSPHL
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 QPPQGPGPAAWEGLSGAATPAPTVRPGTPPVPTQPTPAETRLEPAATPRKPYTCEQCGRG
. : : : :::: .:. . : . :. ... .: : . : :. : .
CCDS12 HVPWDLGMA---GLSGQIQ-SPSREGGFAHALLLPSDLRSEQDP--TDEDP--CRGVGPA
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KB7 F---DWKSVFVIHHRTHTSGPGVQSPGLATGESTEKPPQGEVAFPHHPRRSLTGPRSYPC
. :.: . ..: :: : . : . . . .: .. :: : . :
CCDS12 LITTRWRSPRGRSRGRPSTGGGVVRGGRC--DVCGKVFSQRSNLLRH-QKIHTGERPFVC
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 EECGCSFSWKSQLVIHRKSHTGQRRHFCSDCGRAFDWKSQLVIHRKGHRPEVP
::: ::: .:.:. :. .:: .: :.:::..: ...: ::. : : :
CCDS12 SECGRSFSRSSHLLRHQLTHTEERPFVCGDCGQGFVRSARLEEHRRVHTGEQPFRCAECG
390 400 410 420 430 440
CCDS12 QSFRQRSNLLQHQRIHGDPPGPGAKPPAPPGAPEPPGPFPCSECRESFARRAVLLEHQAV
450 460 470 480 490 500
>>CCDS12971.1 ZSCAN18 gene_id:65982|Hs108|chr19 (510 aa)
initn: 564 init1: 377 opt: 626 Z-score: 319.6 bits: 68.5 E(32554): 1.8e-11
Smith-Waterman score: 639; 33.1% identity (55.8% similar) in 471 aa overlap (1-448:20-466)
10 20 30
pF1KB7 MPSPLGPPCLPVMDPETTLEE-P---ETARLRFRGFCYQEV
.:.: . . .::: :. : : .::::: : :::.
CCDS12 MLPLEKAFASPRSSPAPPDLPTPGSAAGVQQEEPETIPERTPADLEFSRLRFREFVYQEA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 AGPREALARLRELCCQWLQPEAHSKEQMLEMLVLEQFLGTLPPEIQAWVRGQRPGSPEEA
:::...::::.::: :::.:::.:::::::.:::::::: :: ... :: .: : : ..:
CCDS12 AGPHQTLARLHELCRQWLMPEARSKEQMLELLVLEQFLGILPDKVRPWVVAQYPESCKKA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB7 AALVEGLQ---HDPGQLLGWI--TAHVLKQEVLPAAQKTEEPLGSP----HPS-----GT
:.::::: ..::.::: .. .:.. : .. .:: : :: :
CCDS12 ASLVEGLADVLEEPGMLLGSPAGSSSILSDGVY---ERHMDPLLLPGELASPSQALGAGE
130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 VESPGEGPQ---DTRIEGSVQLSCSVKEEPNVDGQEVAPSSPPLAAQSPEGHHGHQEPAS
. .:.: : : . . .. . :: . . : .: : : :. :: .::
CCDS12 IPAPSETPWLSPDPLFLEQRRVREAKTEEDGPANTEQKLKSFPEDPQH-LGEWGHLDPAE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 TSFHPPRIQEEWGLLDRSQKELYWDAMLEKYGTVVSLGLPPHQPEAQAQSELGMLLTGTG
... : :: . :: :: . : : : ..:.... : : ..:
CCDS12 ENLKSYRKLLLWGY-QLSQP----DAA-SRLDTE-ELRLVERDPQGSSLPEGGRRQESAG
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310
pF1KB7 VCRSLRSGNESEGPPGC-PEAQPPQGPGPAAWEGLSGAATPAPTVRPGTPPVPTQPTPAE
: . : .: : :: :: : . ::. : .:: : : .: ::
CCDS12 -C-----ACEEAAPAGVLPELPTEAPPGDALADPPSGT-TEEEEEQPGKAPDPQDPQDAE
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 TRLEPAATPRKPYTCEQCGRGFDWKSVFVIHHRTHT-SGPGVQSPGLATGESTEKPPQGE
. . :. .. . .: . : .. . .: : .: : . :.... .. :.
CCDS12 S--DSATGSQRQSVIQQPAP--DRGTAKLGTKRPHPEDGDGQSLEGVSSSGDSAGLEAGQ
350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 VAFPHHPRRSLTGPRSYPCEECGCSFSWKSQLVIHRKSHTGQRRHFCSDCGRAFDWKSQL
.: .:. . : : ::: .:.: :.:. :..:: :..:. :. : ..: .. :
CCDS12 GPGADEP--GLSRGKPYACGECGEAFAWLSHLMEHHSSHGGRKRYACQGCWKTFHFSLAL
400 410 420 430 440 450
440 450
pF1KB7 VIHRKGHRPEVP
. :.: :. :
CCDS12 AEHQKTHEKEKSYALGGARGPQPSTREAQAGARAGGPPESVEGEAPPAPPEAQR
460 470 480 490 500 510
>>CCDS46214.1 ZSCAN18 gene_id:65982|Hs108|chr19 (566 aa)
initn: 600 init1: 377 opt: 626 Z-score: 319.1 bits: 68.6 E(32554): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 639; 33.1% identity (55.8% similar) in 471 aa overlap (1-448:76-522)
10 20
pF1KB7 MPSPLGPPCLPVMDPETTLEE-P---ETAR
.:.: . . .::: :. : : .:
CCDS46 DSHIFQCRFGKMLPLEKAFASPRSSPAPPDLPTPGSAAGVQQEEPETIPERTPADLEFSR
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 LRFRGFCYQEVAGPREALARLRELCCQWLQPEAHSKEQMLEMLVLEQFLGTLPPEIQAWV
:::: : :::.:::...::::.::: :::.:::.:::::::.:::::::: :: ... ::
CCDS46 LRFREFVYQEAAGPHQTLARLHELCRQWLMPEARSKEQMLELLVLEQFLGILPDKVRPWV
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130
pF1KB7 RGQRPGSPEEAAALVEGLQ---HDPGQLLGWI--TAHVLKQEVLPAAQKTEEPLGSP---
.: : : ..::.::::: ..::.::: .. .:.. : .. .:: :
CCDS46 VAQYPESCKKAASLVEGLADVLEEPGMLLGSPAGSSSILSDGVY---ERHMDPLLLPGEL
170 180 190 200 210 220
140 150 160 170 180
pF1KB7 -HPS-----GTVESPGEGPQ---DTRIEGSVQLSCSVKEEPNVDGQEVAPSSPPLAAQSP
:: : . .:.: : : . . .. . :: . . : .: : :
CCDS46 ASPSQALGAGEIPAPSETPWLSPDPLFLEQRRVREAKTEEDGPANTEQKLKSFPEDPQH-
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EGHHGHQEPASTSFHPPRIQEEWGLLDRSQKELYWDAMLEKYGTVVSLGLPPHQPEAQAQ
:. :: .:: ... : :: . :: :: . : : : ..:....
CCDS46 LGEWGHLDPAEENLKSYRKLLLWGY-QLSQP----DAA-SRLDTE-ELRLVERDPQGSSL
290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SELGMLLTGTGVCRSLRSGNESEGPPGC-PEAQPPQGPGPAAWEGLSGAATPAPTVRPGT
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